MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloferax mediterranei ATCC 33500 chromosome

Total Repeats: 73186

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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55502	NC_017941	CTC	2	6	2234494	2234499	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389847728
55503	NC_017941	GAAGC	2	10	2234518	2234527	40 %	0 %	40 %	20 %	389847728
55504	NC_017941	CGA	2	6	2234628	2234633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389847728
55505	NC_017941	CGA	2	6	2234778	2234783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389847728
55506	NC_017941	AGC	2	6	2234813	2234818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389847728
55507	NC_017941	TTGCC	2	10	2234829	2234838	0 %	40 %	20 %	40 %	389847728
55508	NC_017941	GAG	2	6	2234857	2234862	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389847728
55509	NC_017941	GGC	2	6	2234956	2234961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55510	NC_017941	GTC	2	6	2234969	2234974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55511	NC_017941	CAG	2	6	2234995	2235000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55512	NC_017941	GAA	2	6	2235013	2235018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55513	NC_017941	CT	3	6	2235026	2235031	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55514	NC_017941	GAG	2	6	2235056	2235061	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55515	NC_017941	TAG	2	6	2235066	2235071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55516	NC_017941	GAC	2	6	2235090	2235095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55517	NC_017941	GTTCG	2	10	2235132	2235141	0 %	40 %	40 %	20 %	389847729
55518	NC_017941	TCG	2	6	2235158	2235163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389847729
55519	NC_017941	CGA	2	6	2235229	2235234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389847729
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55521	NC_017941	CTC	2	6	2235286	2235291	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389847729
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55533	NC_017941	CGT	2	6	2235689	2235694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389847729
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55540	NC_017941	AATT	2	8	2235944	2235951	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55541	NC_017941	TGA	2	6	2235975	2235980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55542	NC_017941	AT	3	6	2236030	2236035	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55543	NC_017941	A	6	6	2236038	2236043	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55544	NC_017941	ACA	3	9	2236073	2236081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55545	NC_017941	AGA	2	6	2236105	2236110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55546	NC_017941	TTGT	2	8	2236117	2236124	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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55548	NC_017941	TCTAC	2	10	2236170	2236179	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
55549	NC_017941	TCTAC	2	10	2236189	2236198	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
55550	NC_017941	TCTAC	2	10	2236208	2236217	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
55551	NC_017941	GTC	2	6	2236286	2236291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389847730
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55553	NC_017941	CGT	2	6	2236330	2236335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389847730
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55555	NC_017941	AGACCG	2	12	2236485	2236496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389847730
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55591	NC_017941	GACA	2	8	2237794	2237801	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
55592	NC_017941	TCG	2	6	2237860	2237865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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55616	NC_017941	TCG	2	6	2238714	2238719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389847732
55617	NC_017941	TCC	2	6	2238729	2238734	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389847732
55618	NC_017941	GAG	2	6	2238752	2238757	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389847732
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55845	NC_017941	TCG	2	6	2248989	2248994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389847741
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