MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Helicobacter pylori Shi169 chromosome

Total Repeats: 33625

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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24009	NC_017740	CAAAA	2	10	1148373	1148382	80 %	0 %	0 %	20 %	386753051
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24121	NC_017740	GCA	2	6	1153278	1153283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386753058
24122	NC_017740	AAT	2	6	1153304	1153309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386753058
24123	NC_017740	AAG	2	6	1153327	1153332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386753058
24124	NC_017740	ACC	2	6	1153377	1153382	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386753058
24125	NC_017740	CAAA	2	8	1153387	1153394	75 %	0 %	0 %	25 %	386753058
24126	NC_017740	AGA	2	6	1153412	1153417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386753058
24127	NC_017740	TGCTT	2	10	1153447	1153456	0 %	60 %	20 %	20 %	386753058
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24129	NC_017740	T	7	7	1153519	1153525	0 %	100 %	0 %	0 %	386753058
24130	NC_017740	TCA	2	6	1153645	1153650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386753058
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24132	NC_017740	AGCA	2	8	1153761	1153768	50 %	0 %	25 %	25 %	386753059
24133	NC_017740	CAT	2	6	1153832	1153837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386753059
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24135	NC_017740	TCAATC	2	12	1153957	1153968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386753059
24136	NC_017740	CAA	2	6	1154103	1154108	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386753059
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24140	NC_017740	CAA	2	6	1154343	1154348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386753060
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24142	NC_017740	CTG	2	6	1154428	1154433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386753060
24143	NC_017740	CCG	2	6	1154514	1154519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386753060
24144	NC_017740	GTCA	2	8	1154599	1154606	25 %	25 %	25 %	25 %	386753060
24145	NC_017740	CTG	2	6	1154613	1154618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386753060
24146	NC_017740	GC	3	6	1154745	1154750	0 %	0 %	50 %	50 %	386753060
24147	NC_017740	TCA	2	6	1154819	1154824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386753060
24148	NC_017740	ATGCG	2	10	1154856	1154865	20 %	20 %	40 %	20 %	386753060
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24155	NC_017740	TCGC	2	8	1155357	1155364	0 %	25 %	25 %	50 %	386753060
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24164	NC_017740	T	6	6	1155971	1155976	0 %	100 %	0 %	0 %	386753061
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24175	NC_017740	TCT	2	6	1156562	1156567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386753062
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24177	NC_017740	CACGCT	2	12	1156633	1156644	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386753062
24178	NC_017740	ATAA	2	8	1156669	1156676	75 %	25 %	0 %	0 %	386753062
24179	NC_017740	CT	3	6	1156810	1156815	0 %	50 %	0 %	50 %	386753062
24180	NC_017740	TTTGA	2	10	1156864	1156873	20 %	60 %	20 %	0 %	386753062
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24182	NC_017740	TCT	2	6	1157146	1157151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386753062
24183	NC_017740	ATC	2	6	1157197	1157202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386753062
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24189	NC_017740	TTG	2	6	1157741	1157746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386753062
24190	NC_017740	TCT	3	9	1157777	1157785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386753062
24191	NC_017740	T	6	6	1157937	1157942	0 %	100 %	0 %	0 %	386753062
24192	NC_017740	TTC	2	6	1157962	1157967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386753062
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24194	NC_017740	GATT	2	8	1158002	1158009	25 %	50 %	25 %	0 %	386753063
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24196	NC_017740	T	6	6	1158107	1158112	0 %	100 %	0 %	0 %	386753063
24197	NC_017740	TGC	2	6	1158168	1158173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386753063
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24204	NC_017740	CT	4	8	1158609	1158616	0 %	50 %	0 %	50 %	386753064
24205	NC_017740	CTT	2	6	1158754	1158759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386753064
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24207	NC_017740	TCT	2	6	1158864	1158869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386753064
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24211	NC_017740	CATC	2	8	1159064	1159071	25 %	25 %	0 %	50 %	386753064
24212	NC_017740	GCTT	2	8	1159152	1159159	0 %	50 %	25 %	25 %	386753065
24213	NC_017740	TTGA	2	8	1159196	1159203	25 %	50 %	25 %	0 %	386753065
24214	NC_017740	GTTC	2	8	1159204	1159211	0 %	50 %	25 %	25 %	386753065
24215	NC_017740	CTT	2	6	1159294	1159299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386753065
24216	NC_017740	AAG	2	6	1159301	1159306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386753065
24217	NC_017740	CTGC	2	8	1159381	1159388	0 %	25 %	25 %	50 %	386753065
24218	NC_017740	CAA	2	6	1159406	1159411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386753065
24219	NC_017740	CAA	2	6	1159442	1159447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386753065
24220	NC_017740	AT	3	6	1159495	1159500	50 %	50 %	0 %	0 %	386753065
24221	NC_017740	TTTC	2	8	1159511	1159518	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
24222	NC_017740	A	6	6	1159581	1159586	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24223	NC_017740	CAT	2	6	1159621	1159626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386753066
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24225	NC_017740	T	6	6	1159786	1159791	0 %	100 %	0 %	0 %	386753066
24226	NC_017740	TCT	2	6	1159832	1159837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386753066
24227	NC_017740	TTC	2	6	1159894	1159899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386753066
24228	NC_017740	CCA	2	6	1159908	1159913	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386753066
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24230	NC_017740	AGA	2	6	1159969	1159974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386753066
24231	NC_017740	T	6	6	1160017	1160022	0 %	100 %	0 %	0 %	386753066
24232	NC_017740	AG	3	6	1160032	1160037	50 %	0 %	50 %	0 %	386753066
24233	NC_017740	CTT	2	6	1160040	1160045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386753066
24234	NC_017740	TCAA	2	8	1160126	1160133	50 %	25 %	0 %	25 %	386753066
24235	NC_017740	T	6	6	1160148	1160153	0 %	100 %	0 %	0 %	386753066
24236	NC_017740	CAA	2	6	1160169	1160174	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386753066
24237	NC_017740	GCTC	2	8	1160206	1160213	0 %	25 %	25 %	50 %	386753066
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