MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Helicobacter pylori Shi417 chromosome

Total Repeats: 34655

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017739	CATT	2	8	114	121	25 %	50 %	0 %	25 %	386750445
2	NC_017739	GAT	3	9	122	130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386750445
3	NC_017739	T	6	6	259	264	0 %	100 %	0 %	0 %	386750445
4	NC_017739	GTT	2	6	305	310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386750445
5	NC_017739	T	7	7	318	324	0 %	100 %	0 %	0 %	386750445
6	NC_017739	T	7	7	346	352	0 %	100 %	0 %	0 %	386750445
7	NC_017739	TTC	2	6	356	361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386750445
8	NC_017739	ACA	2	6	382	387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386750445
9	NC_017739	ACC	2	6	393	398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386750445
10	NC_017739	AAT	2	6	457	462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386750446
11	NC_017739	C	6	6	642	647	0 %	0 %	0 %	100 %	386750446
12	NC_017739	TAA	2	6	650	655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386750446
13	NC_017739	AAC	2	6	697	702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386750446
14	NC_017739	CT	3	6	703	708	0 %	50 %	0 %	50 %	386750446
15	NC_017739	CTT	2	6	800	805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386750446
16	NC_017739	TCTG	2	8	810	817	0 %	50 %	25 %	25 %	386750446
17	NC_017739	TGA	2	6	818	823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386750446
18	NC_017739	AAAT	2	8	912	919	75 %	25 %	0 %	0 %	386750447
19	NC_017739	CTA	2	6	941	946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386750447
20	NC_017739	AAC	2	6	1024	1029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386750447
21	NC_017739	CCG	4	12	1043	1054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386750447
22	NC_017739	CCA	2	6	1187	1192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386750447
23	NC_017739	GCT	2	6	1212	1217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386750447
24	NC_017739	CA	3	6	1226	1231	50 %	0 %	0 %	50 %	386750447
25	NC_017739	T	6	6	1243	1248	0 %	100 %	0 %	0 %	386750447
26	NC_017739	TC	3	6	1285	1290	0 %	50 %	0 %	50 %	386750447
27	NC_017739	T	6	6	1347	1352	0 %	100 %	0 %	0 %	386750447
28	NC_017739	GGC	2	6	1403	1408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386750447
29	NC_017739	GCTT	2	8	1455	1462	0 %	50 %	25 %	25 %	386750447
30	NC_017739	CT	3	6	1561	1566	0 %	50 %	0 %	50 %	386750447
31	NC_017739	TAAAA	2	10	1601	1610	80 %	20 %	0 %	0 %	386750447
32	NC_017739	TAG	2	6	1646	1651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386750447
33	NC_017739	CTT	2	6	1657	1662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386750447
34	NC_017739	TC	3	6	1674	1679	0 %	50 %	0 %	50 %	386750447
35	NC_017739	TTC	2	6	1762	1767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386750448
36	NC_017739	A	7	7	1777	1783	100 %	0 %	0 %	0 %	386750448
37	NC_017739	ATTATA	2	12	1795	1806	50 %	50 %	0 %	0 %	386750448
38	NC_017739	CCTG	2	8	1810	1817	0 %	25 %	25 %	50 %	386750448
39	NC_017739	ATG	2	6	1823	1828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386750448
40	NC_017739	CCAA	2	8	1834	1841	50 %	0 %	0 %	50 %	386750448
41	NC_017739	ACT	2	6	1862	1867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386750448
42	NC_017739	TGAA	2	8	1874	1881	50 %	25 %	25 %	0 %	386750448
43	NC_017739	GTT	2	6	1897	1902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386750448
44	NC_017739	T	6	6	1976	1981	0 %	100 %	0 %	0 %	386750448
45	NC_017739	CTT	2	6	1986	1991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386750448
46	NC_017739	TGG	2	6	2043	2048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386750448
47	NC_017739	TCA	2	6	2051	2056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386750448
48	NC_017739	TTAA	2	8	2057	2064	50 %	50 %	0 %	0 %	386750448
49	NC_017739	AAT	2	6	2104	2109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386750448
50	NC_017739	TAG	2	6	2157	2162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386750448
51	NC_017739	AGG	2	6	2188	2193	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386750448
52	NC_017739	GATTA	2	10	2248	2257	40 %	40 %	20 %	0 %	386750448
53	NC_017739	ATTC	2	8	2349	2356	25 %	50 %	0 %	25 %	386750448
54	NC_017739	TTC	2	6	2460	2465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017739	A	8	8	2542	2549	100 %	0 %	0 %	0 %	386750449
56	NC_017739	TCTT	2	8	2558	2565	0 %	75 %	0 %	25 %	386750449
57	NC_017739	T	7	7	2638	2644	0 %	100 %	0 %	0 %	386750449
58	NC_017739	T	7	7	2680	2686	0 %	100 %	0 %	0 %	386750449
59	NC_017739	AGC	2	6	2778	2783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386750449
60	NC_017739	GC	3	6	2791	2796	0 %	0 %	50 %	50 %	386750449
61	NC_017739	GTG	2	6	2967	2972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386750449
62	NC_017739	T	6	6	3020	3025	0 %	100 %	0 %	0 %	386750449
63	NC_017739	AGA	2	6	3065	3070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386750449
64	NC_017739	CAAA	2	8	3101	3108	75 %	0 %	0 %	25 %	386750449
65	NC_017739	GTG	2	6	3126	3131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386750449
66	NC_017739	GCC	2	6	3133	3138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386750449
67	NC_017739	TTG	2	6	3217	3222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386750450
68	NC_017739	GAAA	2	8	3248	3255	75 %	0 %	25 %	0 %	386750450
69	NC_017739	GAAA	2	8	3323	3330	75 %	0 %	25 %	0 %	386750450
70	NC_017739	AGTG	2	8	3344	3351	25 %	25 %	50 %	0 %	386750450
71	NC_017739	TG	3	6	3430	3435	0 %	50 %	50 %	0 %	386750450
72	NC_017739	GTT	2	6	3579	3584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386750450
73	NC_017739	ATC	2	6	3663	3668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386750450
74	NC_017739	CAAG	2	8	3824	3831	50 %	0 %	25 %	25 %	386750450
75	NC_017739	A	6	6	3867	3872	100 %	0 %	0 %	0 %	386750450
76	NC_017739	ATT	2	6	3907	3912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386750450
77	NC_017739	TGG	2	6	3976	3981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386750450
78	NC_017739	GGT	2	6	4086	4091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017739	TAT	2	6	4134	4139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017739	TGG	2	6	4178	4183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017739	ATGC	2	8	4282	4289	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_017739	TGG	2	6	4293	4298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017739	GTG	2	6	4409	4414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017739	ACC	2	6	4441	4446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_017739	GGT	2	6	4454	4459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017739	A	7	7	4575	4581	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017739	T	8	8	4595	4602	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017739	AAT	2	6	4616	4621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017739	GAAAC	2	10	4645	4654	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
90	NC_017739	TAAA	2	8	4685	4692	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017739	A	7	7	4690	4696	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017739	CA	3	6	4905	4910	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_017739	G	6	6	4966	4971	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017739	TAC	2	6	4977	4982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_017739	A	6	6	5042	5047	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017739	A	7	7	5113	5119	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017739	A	6	6	5214	5219	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017739	TAAAA	2	10	5249	5258	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017739	ATAAA	2	10	5268	5277	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017739	T	6	6	5279	5284	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017739	TTA	2	6	5325	5330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017739	CAT	2	6	5441	5446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386750451
103	NC_017739	GCC	2	6	5447	5452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386750451
104	NC_017739	TCT	2	6	5508	5513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386750451
105	NC_017739	GAAACC	2	12	5556	5567	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	386750451
106	NC_017739	AAT	2	6	5606	5611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386750451
107	NC_017739	CTT	2	6	5614	5619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386750451
108	NC_017739	TTCA	2	8	5684	5691	25 %	50 %	0 %	25 %	386750451
109	NC_017739	CAT	2	6	5704	5709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386750451
110	NC_017739	GC	3	6	5751	5756	0 %	0 %	50 %	50 %	386750451
111	NC_017739	ATG	2	6	5757	5762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386750451
112	NC_017739	TCA	2	6	5781	5786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386750451
113	NC_017739	CCA	2	6	5838	5843	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386750451
114	NC_017739	CTT	2	6	5854	5859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386750451
115	NC_017739	CAT	2	6	5887	5892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386750451
116	NC_017739	T	6	6	5903	5908	0 %	100 %	0 %	0 %	386750451
117	NC_017739	AG	3	6	5963	5968	50 %	0 %	50 %	0 %	386750451
118	NC_017739	TCTT	2	8	5978	5985	0 %	75 %	0 %	25 %	386750451
119	NC_017739	CAT	2	6	6058	6063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386750451
120	NC_017739	GTG	2	6	6090	6095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386750451
121	NC_017739	TTC	2	6	6170	6175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386750451
122	NC_017739	TAA	2	6	6178	6183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386750451
123	NC_017739	CCG	2	6	6189	6194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386750451
124	NC_017739	TTTCT	2	10	6220	6229	0 %	80 %	0 %	20 %	386750451
125	NC_017739	CAC	2	6	6290	6295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386750451
126	NC_017739	GAT	2	6	6332	6337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386750451
127	NC_017739	T	6	6	6364	6369	0 %	100 %	0 %	0 %	386750451
128	NC_017739	TAG	2	6	6371	6376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386750451
129	NC_017739	T	7	7	6403	6409	0 %	100 %	0 %	0 %	386750451
130	NC_017739	CTT	2	6	6544	6549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386750451
131	NC_017739	TCT	2	6	6654	6659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386750451
132	NC_017739	CTT	2	6	6670	6675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386750451
133	NC_017739	T	6	6	6683	6688	0 %	100 %	0 %	0 %	386750451
134	NC_017739	TAA	2	6	6697	6702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386750451
135	NC_017739	AAGC	2	8	6793	6800	50 %	0 %	25 %	25 %	386750451
136	NC_017739	CGG	2	6	6826	6831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386750451
137	NC_017739	CTT	2	6	6853	6858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386750451
138	NC_017739	T	6	6	6955	6960	0 %	100 %	0 %	0 %	386750451
139	NC_017739	AAT	2	6	7091	7096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017739	T	6	6	7107	7112	0 %	100 %	0 %	0 %	386750452
141	NC_017739	ACA	2	6	7173	7178	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386750452
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273	NC_017739	AG	4	8	12931	12938	50 %	0 %	50 %	0 %	386750459
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