MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Helicobacter cetorum MIT 00-7128 chromosome

Total Repeats: 43000

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017737	GTTT	2	8	30	37	0 %	75 %	25 %	0 %	386748727
2	NC_017737	T	6	6	259	264	0 %	100 %	0 %	0 %	386748727
3	NC_017737	AC	3	6	268	273	50 %	0 %	0 %	50 %	386748727
4	NC_017737	T	7	7	318	324	0 %	100 %	0 %	0 %	386748727
5	NC_017737	TTG	2	6	337	342	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386748727
6	NC_017737	T	7	7	346	352	0 %	100 %	0 %	0 %	386748727
7	NC_017737	AAT	2	6	384	389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386748727
8	NC_017737	TAG	2	6	456	461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386748728
9	NC_017737	GTATT	2	10	571	580	20 %	60 %	20 %	0 %	386748728
10	NC_017737	C	6	6	642	647	0 %	0 %	0 %	100 %	386748728
11	NC_017737	TAA	2	6	650	655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386748728
12	NC_017737	CA	4	8	666	673	50 %	0 %	0 %	50 %	386748728
13	NC_017737	CAT	2	6	677	682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386748728
14	NC_017737	T	6	6	684	689	0 %	100 %	0 %	0 %	386748728
15	NC_017737	CT	3	6	691	696	0 %	50 %	0 %	50 %	386748728
16	NC_017737	AAT	2	6	697	702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386748728
17	NC_017737	TAAAA	2	10	708	717	80 %	20 %	0 %	0 %	386748728
18	NC_017737	AAT	2	6	744	749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386748728
19	NC_017737	CAAT	2	8	787	794	50 %	25 %	0 %	25 %	386748728
20	NC_017737	CTT	2	6	800	805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386748728
21	NC_017737	TCTG	2	8	810	817	0 %	50 %	25 %	25 %	386748728
22	NC_017737	TAA	2	6	818	823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386748728
23	NC_017737	T	6	6	854	859	0 %	100 %	0 %	0 %	386748728
24	NC_017737	TTGTAA	2	12	867	878	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386748728
25	NC_017737	TAAA	2	8	922	929	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017737	TACC	2	8	1060	1067	25 %	25 %	0 %	50 %	386748729
27	NC_017737	CAC	2	6	1129	1134	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386748729
28	NC_017737	CA	3	6	1249	1254	50 %	0 %	0 %	50 %	386748729
29	NC_017737	CA	3	6	1257	1262	50 %	0 %	0 %	50 %	386748729
30	NC_017737	T	6	6	1370	1375	0 %	100 %	0 %	0 %	386748729
31	NC_017737	CTTG	2	8	1397	1404	0 %	50 %	25 %	25 %	386748729
32	NC_017737	GAC	2	6	1426	1431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386748729
33	NC_017737	CTT	2	6	1474	1479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386748729
34	NC_017737	TGA	2	6	1485	1490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386748729
35	NC_017737	T	7	7	1559	1565	0 %	100 %	0 %	0 %	386748729
36	NC_017737	TAAAA	2	10	1624	1633	80 %	20 %	0 %	0 %	386748729
37	NC_017737	TG	3	6	1796	1801	0 %	50 %	50 %	0 %	386748730
38	NC_017737	AAT	2	6	1834	1839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386748730
39	NC_017737	T	6	6	1868	1873	0 %	100 %	0 %	0 %	386748730
40	NC_017737	A	6	6	1874	1879	100 %	0 %	0 %	0 %	386748730
41	NC_017737	TAA	2	6	1887	1892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386748730
42	NC_017737	T	6	6	1910	1915	0 %	100 %	0 %	0 %	386748730
43	NC_017737	TAT	2	6	1965	1970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386748730
44	NC_017737	TGG	2	6	1979	1984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386748730
45	NC_017737	TTC	2	6	1996	2001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386748730
46	NC_017737	AAT	2	6	2116	2121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386748730
47	NC_017737	TGG	2	6	2203	2208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386748730
48	NC_017737	ACT	2	6	2276	2281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386748730
49	NC_017737	CA	3	6	2290	2295	50 %	0 %	0 %	50 %	386748730
50	NC_017737	ATTC	2	8	2364	2371	25 %	50 %	0 %	25 %	386748730
51	NC_017737	TTA	2	6	2435	2440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017737	TTGTT	2	10	2444	2453	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017737	TTTA	2	8	2513	2520	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017737	AGA	2	6	2560	2565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386748731
55	NC_017737	ATT	2	6	2584	2589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386748731
56	NC_017737	TTA	2	6	2640	2645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386748731
57	NC_017737	T	6	6	2659	2664	0 %	100 %	0 %	0 %	386748731
58	NC_017737	TGA	2	6	2683	2688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386748731
59	NC_017737	T	7	7	2700	2706	0 %	100 %	0 %	0 %	386748731
60	NC_017737	CATT	2	8	2788	2795	25 %	50 %	0 %	25 %	386748731
61	NC_017737	AGT	2	6	2798	2803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386748731
62	NC_017737	A	6	6	2849	2854	100 %	0 %	0 %	0 %	386748731
63	NC_017737	AAAG	2	8	2966	2973	75 %	0 %	25 %	0 %	386748731
64	NC_017737	GTG	2	6	2987	2992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386748731
65	NC_017737	AG	3	6	3022	3027	50 %	0 %	50 %	0 %	386748731
66	NC_017737	CTT	2	6	3040	3045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386748731
67	NC_017737	AAG	2	6	3084	3089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386748731
68	NC_017737	GTG	2	6	3146	3151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386748731
69	NC_017737	TAA	2	6	3172	3177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386748731
70	NC_017737	GAAA	2	8	3269	3276	75 %	0 %	25 %	0 %	386748732
71	NC_017737	CAA	2	6	3331	3336	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386748732
72	NC_017737	CGAA	2	8	3400	3407	50 %	0 %	25 %	25 %	386748732
73	NC_017737	GAA	2	6	3456	3461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386748732
74	NC_017737	TGA	2	6	3494	3499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386748732
75	NC_017737	GTG	2	6	3600	3605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386748732
76	NC_017737	TCATC	2	10	3626	3635	20 %	40 %	0 %	40 %	386748732
77	NC_017737	CAA	2	6	3672	3677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386748732
78	NC_017737	TGAA	2	8	3790	3797	50 %	25 %	25 %	0 %	386748732
79	NC_017737	GAAA	2	8	3801	3808	75 %	0 %	25 %	0 %	386748732
80	NC_017737	CAAG	2	8	3845	3852	50 %	0 %	25 %	25 %	386748732
81	NC_017737	ATT	2	6	3928	3933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386748732
82	NC_017737	T	6	6	4071	4076	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017737	TTTA	2	8	4086	4093	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017737	TAA	2	6	4156	4161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017737	A	6	6	4171	4176	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017737	A	7	7	4186	4192	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017737	TAAGA	2	10	4236	4245	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017737	A	6	6	4267	4272	100 %	0 %	0 %	0 %	386748733
89	NC_017737	A	6	6	4313	4318	100 %	0 %	0 %	0 %	386748733
90	NC_017737	AT	3	6	4346	4351	50 %	50 %	0 %	0 %	386748733
91	NC_017737	ATC	2	6	4425	4430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386748733
92	NC_017737	GT	3	6	4446	4451	0 %	50 %	50 %	0 %	386748733
93	NC_017737	ATG	2	6	4489	4494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386748733
94	NC_017737	TTG	2	6	4522	4527	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386748733
95	NC_017737	CAA	2	6	4549	4554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386748733
96	NC_017737	ATCA	2	8	4566	4573	50 %	25 %	0 %	25 %	386748733
97	NC_017737	CT	3	6	4589	4594	0 %	50 %	0 %	50 %	386748733
98	NC_017737	CCCCTA	2	12	4645	4656	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	386748733
99	NC_017737	CAAG	2	8	4679	4686	50 %	0 %	25 %	25 %	386748733
100	NC_017737	A	6	6	4701	4706	100 %	0 %	0 %	0 %	386748733
101	NC_017737	TTA	2	6	4836	4841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386748733
102	NC_017737	TTC	2	6	4873	4878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386748733
103	NC_017737	CTG	2	6	4906	4911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386748733
104	NC_017737	ATC	2	6	4918	4923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386748733
105	NC_017737	GTA	2	6	5010	5015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386748733
106	NC_017737	TTA	2	6	5064	5069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386748733
107	NC_017737	GGA	2	6	5100	5105	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386748733
108	NC_017737	A	6	6	5131	5136	100 %	0 %	0 %	0 %	386748733
109	NC_017737	AG	3	6	5175	5180	50 %	0 %	50 %	0 %	386748733
110	NC_017737	TTA	2	6	5181	5186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386748733
111	NC_017737	A	6	6	5186	5191	100 %	0 %	0 %	0 %	386748733
112	NC_017737	ACA	2	6	5323	5328	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_017737	TGG	2	6	5362	5367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017737	C	8	8	5386	5393	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
115	NC_017737	CAAG	2	8	5397	5404	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_017737	AG	3	6	5420	5425	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017737	ATC	2	6	5509	5514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_017737	CAA	2	6	5522	5527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_017737	AGCA	2	8	5543	5550	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_017737	TTTG	2	8	5691	5698	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017737	TAG	2	6	5727	5732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017737	T	6	6	5745	5750	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017737	TAA	2	6	5778	5783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017737	TGAA	2	8	5800	5807	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017737	TGCT	2	8	5813	5820	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_017737	ATTTT	2	10	5894	5903	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017737	AT	3	6	5936	5941	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017737	ATTT	2	8	5944	5951	25 %	75 %	0 %	0 %	386748734
129	NC_017737	TTG	2	6	5974	5979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386748734
130	NC_017737	T	6	6	6027	6032	0 %	100 %	0 %	0 %	386748734
131	NC_017737	T	6	6	6064	6069	0 %	100 %	0 %	0 %	386748734
132	NC_017737	T	6	6	6085	6090	0 %	100 %	0 %	0 %	386748734
133	NC_017737	TTGT	2	8	6138	6145	0 %	75 %	25 %	0 %	386748734
134	NC_017737	TCT	2	6	6148	6153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386748734
135	NC_017737	T	6	6	6160	6165	0 %	100 %	0 %	0 %	386748734
136	NC_017737	TTG	2	6	6189	6194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386748734
137	NC_017737	GTTTTT	2	12	6200	6211	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	386748734
138	NC_017737	AAT	2	6	6276	6281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386748734
139	NC_017737	TAA	2	6	6305	6310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386748734
140	NC_017737	TTGA	2	8	6366	6373	25 %	50 %	25 %	0 %	386748734
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