MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halobacillus halophilus DSM 2266

Total Repeats: 87820

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017668	T	7	7	1	7	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017668	AAAAT	2	10	21	30	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017668	TG	3	6	54	59	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017668	T	7	7	64	70	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017668	TGT	2	6	138	143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017668	TAT	2	6	207	212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017668	TTA	2	6	286	291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017668	ACA	2	6	426	431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017668	T	7	7	475	481	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017668	A	6	6	564	569	100 %	0 %	0 %	0 %	386712344
11	NC_017668	GAAT	2	8	652	659	50 %	25 %	25 %	0 %	386712344
12	NC_017668	GATT	2	8	693	700	25 %	50 %	25 %	0 %	386712344
13	NC_017668	TAT	2	6	748	753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386712344
14	NC_017668	AGA	2	6	766	771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386712344
15	NC_017668	GATG	2	8	775	782	25 %	25 %	50 %	0 %	386712344
16	NC_017668	AAG	2	6	800	805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386712344
17	NC_017668	GAA	2	6	817	822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386712344
18	NC_017668	GAA	2	6	833	838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386712344
19	NC_017668	GCA	2	6	914	919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386712344
20	NC_017668	TGG	2	6	973	978	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386712344
21	NC_017668	AC	3	6	995	1000	50 %	0 %	0 %	50 %	386712344
22	NC_017668	ATGC	2	8	1004	1011	25 %	25 %	25 %	25 %	386712344
23	NC_017668	TTTA	2	8	1056	1063	25 %	75 %	0 %	0 %	386712344
24	NC_017668	AATTC	2	10	1094	1103	40 %	40 %	0 %	20 %	386712344
25	NC_017668	TAA	2	6	1129	1134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386712344
26	NC_017668	TGA	2	6	1162	1167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386712344
27	NC_017668	TTC	2	6	1208	1213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386712344
28	NC_017668	GCC	2	6	1270	1275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386712344
29	NC_017668	GATT	2	8	1326	1333	25 %	50 %	25 %	0 %	386712344
30	NC_017668	CGC	2	6	1344	1349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386712344
31	NC_017668	GGAG	2	8	1468	1475	25 %	0 %	75 %	0 %	386712344
32	NC_017668	GA	3	6	1614	1619	50 %	0 %	50 %	0 %	386712344
33	NC_017668	TTAGA	2	10	1629	1638	40 %	40 %	20 %	0 %	386712344
34	NC_017668	GAA	2	6	1651	1656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386712344
35	NC_017668	TATC	2	8	1697	1704	25 %	50 %	0 %	25 %	386712344
36	NC_017668	AG	3	6	1706	1711	50 %	0 %	50 %	0 %	386712344
37	NC_017668	GAA	2	6	1742	1747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386712344
38	NC_017668	GGA	2	6	1751	1756	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386712344
39	NC_017668	CAG	2	6	1817	1822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386712344
40	NC_017668	AGC	2	6	1851	1856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386712344
41	NC_017668	AACGT	2	10	1861	1870	40 %	20 %	20 %	20 %	386712344
42	NC_017668	CATC	2	8	1894	1901	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_017668	AAC	2	6	1902	1907	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017668	GTTT	2	8	1931	1938	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017668	TACTAT	2	12	1974	1985	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_017668	TAA	2	6	1996	2001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017668	A	6	6	2000	2005	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017668	AT	3	6	2009	2014	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017668	AGG	2	6	2029	2034	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017668	TCA	2	6	2107	2112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386712345
51	NC_017668	AAG	3	9	2219	2227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386712345
52	NC_017668	TCGT	2	8	2297	2304	0 %	50 %	25 %	25 %	386712345
53	NC_017668	TTGAAA	2	12	2324	2335	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386712345
54	NC_017668	GAA	2	6	2404	2409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386712345
55	NC_017668	TTA	2	6	2464	2469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386712345
56	NC_017668	GTC	2	6	2647	2652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386712345
57	NC_017668	AACTG	2	10	2670	2679	40 %	20 %	20 %	20 %	386712345
58	NC_017668	TGA	2	6	2691	2696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386712345
59	NC_017668	AGA	2	6	2700	2705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386712345
60	NC_017668	AAGT	2	8	2714	2721	50 %	25 %	25 %	0 %	386712345
61	NC_017668	CTT	2	6	2763	2768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386712345
62	NC_017668	CT	3	6	2880	2885	0 %	50 %	0 %	50 %	386712345
63	NC_017668	TAA	2	6	2904	2909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386712345
64	NC_017668	CGT	2	6	2910	2915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386712345
65	NC_017668	GAAA	2	8	2928	2935	75 %	0 %	25 %	0 %	386712345
66	NC_017668	ACC	2	6	2939	2944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386712345
67	NC_017668	GAA	2	6	2986	2991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386712345
68	NC_017668	CAG	2	6	2996	3001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386712345
69	NC_017668	AT	3	6	3045	3050	50 %	50 %	0 %	0 %	386712345
70	NC_017668	GATG	2	8	3051	3058	25 %	25 %	50 %	0 %	386712345
71	NC_017668	CCTG	2	8	3162	3169	0 %	25 %	25 %	50 %	386712345
72	NC_017668	A	6	6	3189	3194	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017668	GTCA	2	8	3215	3222	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_017668	TAAAA	2	10	3343	3352	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017668	TGAA	2	8	3377	3384	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017668	AT	3	6	3415	3420	50 %	50 %	0 %	0 %	386712346
77	NC_017668	TGG	2	6	3463	3468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386712346
78	NC_017668	ATT	2	6	3478	3483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386712346
79	NC_017668	CGT	2	6	3527	3532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386712346
80	NC_017668	AGA	2	6	3568	3573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386712346
81	NC_017668	GAA	2	6	3599	3604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386712346
82	NC_017668	ATT	2	6	3708	3713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386712347
83	NC_017668	TAAAA	2	10	3830	3839	80 %	20 %	0 %	0 %	386712347
84	NC_017668	A	6	6	3900	3905	100 %	0 %	0 %	0 %	386712347
85	NC_017668	CGT	2	6	4017	4022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386712347
86	NC_017668	TATC	2	8	4064	4071	25 %	50 %	0 %	25 %	386712347
87	NC_017668	TCC	2	6	4093	4098	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386712347
88	NC_017668	CTG	2	6	4113	4118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386712347
89	NC_017668	CGA	2	6	4195	4200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386712347
90	NC_017668	GCT	2	6	4229	4234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386712347
91	NC_017668	GAT	2	6	4428	4433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386712347
92	NC_017668	CAG	2	6	4485	4490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386712347
93	NC_017668	AAC	2	6	4493	4498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386712347
94	NC_017668	TCAT	2	8	4531	4538	25 %	50 %	0 %	25 %	386712347
95	NC_017668	CTT	2	6	4563	4568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386712347
96	NC_017668	GAT	2	6	4572	4577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386712347
97	NC_017668	TTCA	2	8	4758	4765	25 %	50 %	0 %	25 %	386712348
98	NC_017668	TGA	2	6	4825	4830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386712348
99	NC_017668	TAT	2	6	4841	4846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386712348
100	NC_017668	GTG	2	6	4884	4889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386712348
101	NC_017668	AGA	3	9	4895	4903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386712348
102	NC_017668	TA	4	8	4935	4942	50 %	50 %	0 %	0 %	386712348
103	NC_017668	AGA	2	6	4972	4977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386712348
104	NC_017668	TAAA	2	8	4999	5006	75 %	25 %	0 %	0 %	386712348
105	NC_017668	AGA	2	6	5021	5026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386712348
106	NC_017668	GAAG	2	8	5103	5110	50 %	0 %	50 %	0 %	386712349
107	NC_017668	ATG	2	6	5132	5137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386712349
108	NC_017668	CGA	2	6	5204	5209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386712349
109	NC_017668	CAC	2	6	5224	5229	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386712349
110	NC_017668	TGA	2	6	5297	5302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386712349
111	NC_017668	TTC	2	6	5405	5410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386712349
112	NC_017668	GGA	3	9	5428	5436	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386712349
113	NC_017668	GGA	2	6	5452	5457	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386712349
114	NC_017668	ATC	2	6	5493	5498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386712349
115	NC_017668	GAA	2	6	5566	5571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386712349
116	NC_017668	GCTT	2	8	5694	5701	0 %	50 %	25 %	25 %	386712349
117	NC_017668	TAT	3	9	5764	5772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386712349
118	NC_017668	GA	3	6	5814	5819	50 %	0 %	50 %	0 %	386712349
119	NC_017668	ATG	2	6	5891	5896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386712349
120	NC_017668	AAT	2	6	5926	5931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386712349
121	NC_017668	TACG	2	8	5937	5944	25 %	25 %	25 %	25 %	386712349
122	NC_017668	AC	3	6	5953	5958	50 %	0 %	0 %	50 %	386712349
123	NC_017668	ACTC	2	8	5979	5986	25 %	25 %	0 %	50 %	386712349
124	NC_017668	ATA	2	6	6014	6019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386712349
125	NC_017668	GAT	2	6	6052	6057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386712349
126	NC_017668	TAT	2	6	6078	6083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386712349
127	NC_017668	GACA	2	8	6116	6123	50 %	0 %	25 %	25 %	386712349
128	NC_017668	AAAG	2	8	6270	6277	75 %	0 %	25 %	0 %	386712349
129	NC_017668	GGA	2	6	6400	6405	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386712349
130	NC_017668	TTC	2	6	6443	6448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386712349
131	NC_017668	ATT	2	6	6463	6468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386712349
132	NC_017668	AAT	2	6	6505	6510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386712349
133	NC_017668	ATT	2	6	6523	6528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386712349
134	NC_017668	CTT	2	6	6637	6642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386712349
135	NC_017668	CTT	2	6	6648	6653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386712349
136	NC_017668	TTGA	2	8	6673	6680	25 %	50 %	25 %	0 %	386712349
137	NC_017668	GCC	2	6	6705	6710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386712349
138	NC_017668	TAT	2	6	6742	6747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386712349
139	NC_017668	AGC	2	6	6761	6766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386712349
140	NC_017668	GA	3	6	6833	6838	50 %	0 %	50 %	0 %	386712349
141	NC_017668	AAC	2	6	6848	6853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386712349
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145	NC_017668	TGG	2	6	7128	7133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386712350
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243	NC_017668	ACA	2	6	11756	11761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
244	NC_017668	TTA	2	6	11814	11819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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400	NC_017668	CAGA	2	8	20793	20800	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
401	NC_017668	AGGA	3	12	20839	20850	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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403	NC_017668	TTCA	2	8	20870	20877	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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406	NC_017668	TGG	2	6	21077	21082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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