MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halobacillus halophilus DSM 2266

Total Repeats: 87820

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017668	AAAT	2	8	26084	26091	75 %	25 %	0 %	0 %	386712366
502	NC_017668	GAA	2	6	26169	26174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386712366
503	NC_017668	GGC	2	6	26226	26231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386712366
504	NC_017668	CATGA	2	10	26292	26301	40 %	20 %	20 %	20 %	386712366
505	NC_017668	GAA	2	6	26313	26318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386712366
506	NC_017668	GAT	2	6	26421	26426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386712366
507	NC_017668	GAA	2	6	26496	26501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386712366
508	NC_017668	ATGGA	2	10	26560	26569	40 %	20 %	40 %	0 %	386712366
509	NC_017668	A	6	6	26616	26621	100 %	0 %	0 %	0 %	386712366
510	NC_017668	A	6	6	26623	26628	100 %	0 %	0 %	0 %	386712366
511	NC_017668	T	7	7	26654	26660	0 %	100 %	0 %	0 %	386712367
512	NC_017668	TCTT	2	8	26666	26673	0 %	75 %	0 %	25 %	386712367
513	NC_017668	AAC	2	6	26752	26757	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386712367
514	NC_017668	TTCT	3	12	26760	26771	0 %	75 %	0 %	25 %	386712367
515	NC_017668	TTC	2	6	26788	26793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386712367
516	NC_017668	ATC	3	9	26800	26808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386712367
517	NC_017668	TTTC	2	8	26871	26878	0 %	75 %	0 %	25 %	386712367
518	NC_017668	TAA	2	6	26944	26949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386712367
519	NC_017668	AAT	2	6	27006	27011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386712367
520	NC_017668	AAT	2	6	27110	27115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386712367
521	NC_017668	T	6	6	27147	27152	0 %	100 %	0 %	0 %	386712367
522	NC_017668	GGA	2	6	27209	27214	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386712367
523	NC_017668	CAG	2	6	27225	27230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386712367
524	NC_017668	GCC	2	6	27319	27324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386712367
525	NC_017668	CCCAG	2	10	27330	27339	20 %	0 %	20 %	60 %	386712367
526	NC_017668	AGC	2	6	27362	27367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386712367
527	NC_017668	TA	3	6	27393	27398	50 %	50 %	0 %	0 %	386712367
528	NC_017668	TTACCG	2	12	27482	27493	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386712368
529	NC_017668	TCA	2	6	27526	27531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386712368
530	NC_017668	TAG	2	6	27559	27564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386712368
531	NC_017668	TCC	2	6	27602	27607	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386712368
532	NC_017668	AATCA	2	10	27659	27668	60 %	20 %	0 %	20 %	386712368
533	NC_017668	ACTT	2	8	27742	27749	25 %	50 %	0 %	25 %	386712368
534	NC_017668	CCA	2	6	27751	27756	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386712368
535	NC_017668	AAT	2	6	27856	27861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386712368
536	NC_017668	TTC	2	6	28098	28103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_017668	T	6	6	28115	28120	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_017668	TAT	2	6	28173	28178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_017668	T	6	6	28222	28227	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_017668	TAAA	2	8	28282	28289	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_017668	A	6	6	28372	28377	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_017668	CAATT	2	10	28467	28476	40 %	40 %	0 %	20 %	386712369
543	NC_017668	GAT	2	6	28479	28484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386712369
544	NC_017668	AGA	2	6	28556	28561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386712369
545	NC_017668	AGA	2	6	28567	28572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386712369
546	NC_017668	GAA	2	6	28611	28616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386712369
547	NC_017668	A	7	7	28670	28676	100 %	0 %	0 %	0 %	386712369
548	NC_017668	ATA	2	6	28678	28683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386712369
549	NC_017668	TGC	2	6	28736	28741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386712369
550	NC_017668	GGA	2	6	28823	28828	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386712369
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552	NC_017668	GGA	2	6	28920	28925	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386712369
553	NC_017668	GAA	3	9	28953	28961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386712369
554	NC_017668	GAA	2	6	28977	28982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386712369
555	NC_017668	AACG	2	8	29213	29220	50 %	0 %	25 %	25 %	386712369
556	NC_017668	GAA	2	6	29334	29339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386712369
557	NC_017668	TTC	2	6	29360	29365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386712369
558	NC_017668	TTA	2	6	29410	29415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386712369
559	NC_017668	GTG	2	6	29456	29461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386712369
560	NC_017668	TTG	2	6	29548	29553	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386712369
561	NC_017668	CCT	2	6	29586	29591	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386712369
562	NC_017668	AAG	2	6	29617	29622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386712369
563	NC_017668	CCAT	2	8	29628	29635	25 %	25 %	0 %	50 %	386712369
564	NC_017668	AAT	2	6	29652	29657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386712369
565	NC_017668	CTT	2	6	29678	29683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386712369
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567	NC_017668	GAT	2	6	29757	29762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386712369
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569	NC_017668	ATTG	2	8	29813	29820	25 %	50 %	25 %	0 %	386712369
570	NC_017668	GAA	2	6	29916	29921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386712369
571	NC_017668	GAT	2	6	29925	29930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386712369
572	NC_017668	A	6	6	29958	29963	100 %	0 %	0 %	0 %	386712369
573	NC_017668	AG	3	6	29988	29993	50 %	0 %	50 %	0 %	386712369
574	NC_017668	AGA	2	6	30098	30103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386712369
575	NC_017668	TGA	2	6	30119	30124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
576	NC_017668	T	7	7	30154	30160	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_017668	ATA	2	6	30237	30242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_017668	GAA	2	6	30243	30248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
579	NC_017668	T	7	7	30442	30448	0 %	100 %	0 %	0 %	386712370
580	NC_017668	TAT	2	6	30499	30504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386712370
581	NC_017668	CTG	2	6	30513	30518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386712370
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584	NC_017668	TAT	2	6	30636	30641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386712370
585	NC_017668	T	6	6	30703	30708	0 %	100 %	0 %	0 %	386712370
586	NC_017668	TTAC	2	8	30713	30720	25 %	50 %	0 %	25 %	386712370
587	NC_017668	T	6	6	30739	30744	0 %	100 %	0 %	0 %	386712370
588	NC_017668	CAG	2	6	30764	30769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386712370
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592	NC_017668	GGCT	2	8	30896	30903	0 %	25 %	50 %	25 %	386712370
593	NC_017668	TGGC	2	8	30974	30981	0 %	25 %	50 %	25 %	386712370
594	NC_017668	GAATG	2	10	31001	31010	40 %	20 %	40 %	0 %	386712370
595	NC_017668	TACA	2	8	31108	31115	50 %	25 %	0 %	25 %	386712370
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598	NC_017668	GCTT	2	8	31195	31202	0 %	50 %	25 %	25 %	386712370
599	NC_017668	TTA	2	6	31215	31220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386712370
600	NC_017668	T	6	6	31249	31254	0 %	100 %	0 %	0 %	386712370
601	NC_017668	ATG	3	9	31265	31273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386712370
602	NC_017668	GTC	2	6	31274	31279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386712370
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608	NC_017668	AT	3	6	31642	31647	50 %	50 %	0 %	0 %	386712371
609	NC_017668	ATTGGC	2	12	31654	31665	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386712371
610	NC_017668	T	6	6	31729	31734	0 %	100 %	0 %	0 %	386712371
611	NC_017668	GA	3	6	31735	31740	50 %	0 %	50 %	0 %	386712371
612	NC_017668	ACT	2	6	31856	31861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386712371
613	NC_017668	AAGA	2	8	32005	32012	75 %	0 %	25 %	0 %	386712371
614	NC_017668	AGA	2	6	32043	32048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386712371
615	NC_017668	GAAA	2	8	32062	32069	75 %	0 %	25 %	0 %	386712371
616	NC_017668	GGA	2	6	32133	32138	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386712371
617	NC_017668	TTC	2	6	32156	32161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386712371
618	NC_017668	CAG	2	6	32166	32171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386712371
619	NC_017668	AAAAC	2	10	32184	32193	80 %	0 %	0 %	20 %	386712371
620	NC_017668	AAAGC	2	10	32200	32209	60 %	0 %	20 %	20 %	386712371
621	NC_017668	GGT	2	6	32217	32222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386712371
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625	NC_017668	AAG	2	6	32351	32356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386712371
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628	NC_017668	GGAAT	2	10	32441	32450	40 %	20 %	40 %	0 %	386712371
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