MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloquadratum walsbyi C23 complete genome

Total Repeats: 67781

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017459	AT	3	6	142635	142640	50 %	50 %	0 %	0 %	385802480
3002	NC_017459	TGT	2	6	142646	142651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802480
3003	NC_017459	TCC	2	6	142661	142666	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385802480
3004	NC_017459	GA	3	6	142794	142799	50 %	0 %	50 %	0 %	385802480
3005	NC_017459	TTG	2	6	142805	142810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802480
3006	NC_017459	TCA	2	6	142816	142821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3007	NC_017459	TGA	2	6	142863	142868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_017459	CCT	2	6	142881	142886	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3009	NC_017459	A	6	6	142890	142895	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_017459	GGA	2	6	142948	142953	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_017459	TA	3	6	142970	142975	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_017459	CAA	2	6	142993	142998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3013	NC_017459	CTGAT	2	10	143002	143011	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3014	NC_017459	CACT	2	8	143027	143034	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3015	NC_017459	ATT	2	6	143097	143102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_017459	GTA	2	6	143120	143125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_017459	TAT	2	6	143126	143131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_017459	GGT	2	6	143148	143153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_017459	CT	3	6	143224	143229	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3020	NC_017459	GAC	2	6	143230	143235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3021	NC_017459	TGCA	2	8	143274	143281	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3022	NC_017459	AAG	2	6	143284	143289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_017459	TCC	2	6	143300	143305	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3024	NC_017459	AGT	2	6	143349	143354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_017459	ATTC	2	8	143380	143387	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3026	NC_017459	ATG	2	6	143438	143443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_017459	CAACTC	2	12	143445	143456	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
3028	NC_017459	ATA	2	6	143496	143501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_017459	TCG	2	6	143524	143529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802481
3030	NC_017459	GAT	2	6	143579	143584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802481
3031	NC_017459	GT	3	6	143641	143646	0 %	50 %	50 %	0 %	385802481
3032	NC_017459	ACG	2	6	143654	143659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802481
3033	NC_017459	CCG	2	6	143674	143679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385802481
3034	NC_017459	TCA	2	6	143687	143692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802481
3035	NC_017459	ACTC	2	8	143697	143704	25 %	25 %	0 %	50 %	385802481
3036	NC_017459	TTA	2	6	143710	143715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_017459	ACT	2	6	143753	143758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3038	NC_017459	TTAT	2	8	143759	143766	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_017459	GTC	2	6	143814	143819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3040	NC_017459	CCA	2	6	143825	143830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3041	NC_017459	TGT	2	6	143838	143843	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_017459	GTA	2	6	143936	143941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_017459	ATG	2	6	143951	143956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_017459	TGT	2	6	143967	143972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_017459	TAAG	2	8	144050	144057	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_017459	GCAT	2	8	144060	144067	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3047	NC_017459	GTC	2	6	144140	144145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802482
3048	NC_017459	TGG	2	6	144155	144160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802482
3049	NC_017459	TGA	2	6	144298	144303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802482
3050	NC_017459	TAA	2	6	144340	144345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802482
3051	NC_017459	CGT	2	6	144410	144415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802482
3052	NC_017459	GAA	2	6	144521	144526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802482
3053	NC_017459	TGGC	2	8	144572	144579	0 %	25 %	50 %	25 %	385802482
3054	NC_017459	CAA	2	6	144693	144698	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802482
3055	NC_017459	CTCA	2	8	144717	144724	25 %	25 %	0 %	50 %	385802482
3056	NC_017459	TGA	2	6	144772	144777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802482
3057	NC_017459	A	6	6	144822	144827	100 %	0 %	0 %	0 %	385802482
3058	NC_017459	TGA	3	9	144853	144861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802482
3059	NC_017459	CTC	2	6	144893	144898	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385802482
3060	NC_017459	ATG	2	6	144903	144908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802482
3061	NC_017459	GAA	2	6	144995	145000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802482
3062	NC_017459	CT	3	6	145001	145006	0 %	50 %	0 %	50 %	385802482
3063	NC_017459	ATC	2	6	145012	145017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802482
3064	NC_017459	GAT	2	6	145049	145054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802482
3065	NC_017459	TGC	2	6	145099	145104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802482
3066	NC_017459	TAA	2	6	145111	145116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802482
3067	NC_017459	CAT	2	6	145146	145151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802482
3068	NC_017459	AGAA	2	8	145245	145252	75 %	0 %	25 %	0 %	385802483
3069	NC_017459	TCA	2	6	145285	145290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802483
3070	NC_017459	ATC	2	6	145369	145374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802483
3071	NC_017459	TCTG	2	8	145378	145385	0 %	50 %	25 %	25 %	385802483
3072	NC_017459	C	6	6	145413	145418	0 %	0 %	0 %	100 %	385802483
3073	NC_017459	TTC	2	6	145500	145505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802483
3074	NC_017459	ACA	2	6	145519	145524	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802483
3075	NC_017459	AAAT	2	8	145538	145545	75 %	25 %	0 %	0 %	385802483
3076	NC_017459	ACA	2	6	145588	145593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802483
3077	NC_017459	GTGTTT	4	24	145804	145827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802483
3078	NC_017459	TGT	2	6	145845	145850	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802483
3079	NC_017459	TCT	2	6	145891	145896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802483
3080	NC_017459	CCG	2	6	145912	145917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385802483
3081	NC_017459	ATC	2	6	146190	146195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802483
3082	NC_017459	C	6	6	146210	146215	0 %	0 %	0 %	100 %	385802483
3083	NC_017459	ATC	2	6	146223	146228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802483
3084	NC_017459	CTTG	2	8	146252	146259	0 %	50 %	25 %	25 %	385802483
3085	NC_017459	CAT	2	6	146301	146306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802483
3086	NC_017459	GCTC	2	8	146311	146318	0 %	25 %	25 %	50 %	385802483
3087	NC_017459	GTCG	2	8	146590	146597	0 %	25 %	50 %	25 %	385802483
3088	NC_017459	GT	3	6	146601	146606	0 %	50 %	50 %	0 %	385802483
3089	NC_017459	GAG	2	6	146650	146655	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385802483
3090	NC_017459	GT	3	6	146730	146735	0 %	50 %	50 %	0 %	385802483
3091	NC_017459	CGG	2	6	146805	146810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385802483
3092	NC_017459	TCT	2	6	146869	146874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3093	NC_017459	TAT	2	6	146885	146890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_017459	ATT	2	6	147045	147050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802484
3095	NC_017459	TTG	2	6	147058	147063	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802484
3096	NC_017459	AAC	2	6	147116	147121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802484
3097	NC_017459	GAA	2	6	147139	147144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802484
3098	NC_017459	TCC	2	6	147149	147154	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385802484
3099	NC_017459	ACTCC	2	10	147243	147252	20 %	20 %	0 %	60 %	385802484
3100	NC_017459	AAC	2	6	147332	147337	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802484
3101	NC_017459	GTG	2	6	147379	147384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802484
3102	NC_017459	ACC	2	6	147422	147427	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385802484
3103	NC_017459	AAT	2	6	147492	147497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802484
3104	NC_017459	AT	3	6	147514	147519	50 %	50 %	0 %	0 %	385802484
3105	NC_017459	GTTGT	2	10	147625	147634	0 %	60 %	40 %	0 %	385802484
3106	NC_017459	CTG	2	6	147643	147648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802484
3107	NC_017459	ACA	2	6	147666	147671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802484
3108	NC_017459	CAG	2	6	147769	147774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802484
3109	NC_017459	CG	3	6	147790	147795	0 %	0 %	50 %	50 %	385802484
3110	NC_017459	TCAAT	2	10	147802	147811	40 %	40 %	0 %	20 %	385802484
3111	NC_017459	CCA	2	6	147930	147935	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385802484
3112	NC_017459	CAA	2	6	147946	147951	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802484
3113	NC_017459	CAT	2	6	148006	148011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802484
3114	NC_017459	TC	3	6	148027	148032	0 %	50 %	0 %	50 %	385802484
3115	NC_017459	TC	3	6	148040	148045	0 %	50 %	0 %	50 %	385802484
3116	NC_017459	ATT	2	6	148055	148060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802484
3117	NC_017459	TGC	2	6	148133	148138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802484
3118	NC_017459	TCA	2	6	148146	148151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802484
3119	NC_017459	TTGT	2	8	148245	148252	0 %	75 %	25 %	0 %	385802484
3120	NC_017459	CTG	2	6	148258	148263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802484
3121	NC_017459	TCC	2	6	148280	148285	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385802484
3122	NC_017459	TCGC	2	8	148298	148305	0 %	25 %	25 %	50 %	385802484
3123	NC_017459	TCA	2	6	148311	148316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802484
3124	NC_017459	TCAATC	2	12	148371	148382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802484
3125	NC_017459	AAC	2	6	148421	148426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802484
3126	NC_017459	CAA	2	6	148432	148437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802484
3127	NC_017459	AAT	2	6	148448	148453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802484
3128	NC_017459	CCG	2	6	148525	148530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385802484
3129	NC_017459	GAA	2	6	148549	148554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802484
3130	NC_017459	TAAG	2	8	148570	148577	50 %	25 %	25 %	0 %	385802484
3131	NC_017459	GAAC	2	8	148723	148730	50 %	0 %	25 %	25 %	385802484
3132	NC_017459	GCA	2	6	148735	148740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802484
3133	NC_017459	GA	4	8	148750	148757	50 %	0 %	50 %	0 %	385802484
3134	NC_017459	CTG	2	6	148768	148773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802484
3135	NC_017459	GCA	2	6	148779	148784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802484
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3138	NC_017459	A	6	6	148823	148828	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3139	NC_017459	CTGT	2	8	148879	148886	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3140	NC_017459	TGA	2	6	148975	148980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3141	NC_017459	ACC	2	6	149046	149051	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3142	NC_017459	TAT	2	6	149074	149079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802485
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3144	NC_017459	TGA	2	6	149250	149255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802485
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3146	NC_017459	ATT	2	6	149272	149277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802485
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3148	NC_017459	AC	3	6	149345	149350	50 %	0 %	0 %	50 %	385802485
3149	NC_017459	ATG	3	9	149357	149365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802485
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3154	NC_017459	GTT	2	6	149529	149534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802485
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3156	NC_017459	ATA	2	6	149674	149679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3157	NC_017459	ATC	2	6	149767	149772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3158	NC_017459	AAT	2	6	149789	149794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3159	NC_017459	ATTGAT	2	12	149813	149824	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3160	NC_017459	GAT	2	6	149832	149837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3164	NC_017459	GAA	2	6	149968	149973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802486
3165	NC_017459	CAA	2	6	150051	150056	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802486
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3198	NC_017459	GTC	2	6	151898	151903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802487
3199	NC_017459	AT	3	6	151932	151937	50 %	50 %	0 %	0 %	385802487
3200	NC_017459	GCA	2	6	152009	152014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802487
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3210	NC_017459	AG	3	6	152358	152363	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3211	NC_017459	AAT	2	6	152381	152386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3212	NC_017459	CAT	2	6	152571	152576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802488
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3229	NC_017459	TA	3	6	153328	153333	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3230	NC_017459	TTG	2	6	153336	153341	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3231	NC_017459	TA	3	6	153368	153373	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3232	NC_017459	GAC	2	6	153398	153403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3233	NC_017459	AATTT	2	10	153431	153440	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3234	NC_017459	AAT	2	6	153505	153510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3235	NC_017459	CTAT	2	8	153527	153534	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3236	NC_017459	AT	3	6	153574	153579	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3237	NC_017459	AT	3	6	153591	153596	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3238	NC_017459	TAC	2	6	153606	153611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3239	NC_017459	GATC	2	8	153653	153660	25 %	25 %	25 %	25 %	385802489
3240	NC_017459	AGA	2	6	153664	153669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802489
3241	NC_017459	GAA	2	6	153676	153681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802489
3242	NC_017459	TGA	2	6	153739	153744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802489
3243	NC_017459	GAAA	2	8	153760	153767	75 %	0 %	25 %	0 %	385802489
3244	NC_017459	ACC	2	6	153860	153865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385802489
3245	NC_017459	TC	3	6	153922	153927	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3246	NC_017459	AT	3	6	153930	153935	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3247	NC_017459	CATA	2	8	153936	153943	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3248	NC_017459	ATG	2	6	153962	153967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3249	NC_017459	ATC	2	6	154045	154050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3494	NC_017459	GGA	3	9	165619	165627	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3495	NC_017459	CGG	2	6	165678	165683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385802501
3496	NC_017459	TCG	3	9	165702	165710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802501
3497	NC_017459	CG	3	6	165896	165901	0 %	0 %	50 %	50 %	385802501
3498	NC_017459	CAC	2	6	166013	166018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385802501
3499	NC_017459	GCTT	2	8	166033	166040	0 %	50 %	25 %	25 %	385802501
3500	NC_017459	GCA	2	6	166066	166071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802501

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