MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloquadratum walsbyi C23 complete genome

Total Repeats: 67781

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_017459	TGC	2	6	93564	93569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802455
2002	NC_017459	CTG	2	6	93578	93583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802455
2003	NC_017459	TCAC	2	8	93625	93632	25 %	25 %	0 %	50 %	385802455
2004	NC_017459	CAT	2	6	93650	93655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802455
2005	NC_017459	TGCT	2	8	93756	93763	0 %	50 %	25 %	25 %	385802455
2006	NC_017459	TGTT	2	8	93829	93836	0 %	75 %	25 %	0 %	385802455
2007	NC_017459	GCT	2	6	93847	93852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802455
2008	NC_017459	CAC	2	6	93863	93868	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385802455
2009	NC_017459	CCA	2	6	93901	93906	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385802455
2010	NC_017459	AC	3	6	93914	93919	50 %	0 %	0 %	50 %	385802455
2011	NC_017459	CAG	2	6	93923	93928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802455
2012	NC_017459	CAT	2	6	93929	93934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802455
2013	NC_017459	GTCT	2	8	93969	93976	0 %	50 %	25 %	25 %	385802455
2014	NC_017459	TCA	2	6	94022	94027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802455
2015	NC_017459	GAC	2	6	94101	94106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802455
2016	NC_017459	GAG	2	6	94266	94271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2017	NC_017459	CTC	2	6	94279	94284	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2018	NC_017459	AG	3	6	94285	94290	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2019	NC_017459	TATCA	2	10	94341	94350	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2020	NC_017459	CAA	2	6	94395	94400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2021	NC_017459	ACT	2	6	94433	94438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2022	NC_017459	GAATC	2	10	94447	94456	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2023	NC_017459	GTC	2	6	94475	94480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802456
2024	NC_017459	TTG	2	6	94539	94544	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802456
2025	NC_017459	GCT	2	6	94577	94582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802456
2026	NC_017459	CA	3	6	94693	94698	50 %	0 %	0 %	50 %	385802456
2027	NC_017459	CAT	2	6	94707	94712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802456
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2029	NC_017459	TGG	2	6	94738	94743	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802456
2030	NC_017459	GGT	2	6	94817	94822	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802456
2031	NC_017459	TGA	2	6	94851	94856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802456
2032	NC_017459	ATG	2	6	94878	94883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802456
2033	NC_017459	CTT	2	6	95027	95032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802456
2034	NC_017459	TGATCT	2	12	95047	95058	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385802456
2035	NC_017459	GCAC	2	8	95069	95076	25 %	0 %	25 %	50 %	385802456
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2037	NC_017459	TGG	2	6	95179	95184	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802456
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2040	NC_017459	GTC	2	6	95352	95357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802456
2041	NC_017459	CCG	2	6	95368	95373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385802456
2042	NC_017459	AAT	2	6	95379	95384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802456
2043	NC_017459	CCT	2	6	95469	95474	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385802457
2044	NC_017459	ACCG	2	8	95514	95521	25 %	0 %	25 %	50 %	385802457
2045	NC_017459	AGG	2	6	95534	95539	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385802457
2046	NC_017459	GC	3	6	95550	95555	0 %	0 %	50 %	50 %	385802457
2047	NC_017459	TGG	2	6	95604	95609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802457
2048	NC_017459	G	7	7	95608	95614	0 %	0 %	100 %	0 %	385802457
2049	NC_017459	GGC	2	6	95644	95649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385802457
2050	NC_017459	GAGC	2	8	95682	95689	25 %	0 %	50 %	25 %	385802457
2051	NC_017459	TGA	2	6	95709	95714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802457
2052	NC_017459	CAA	2	6	95756	95761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802457
2053	NC_017459	ACCT	2	8	95816	95823	25 %	25 %	0 %	50 %	385802457
2054	NC_017459	TGA	2	6	95922	95927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802457
2055	NC_017459	GAC	2	6	95977	95982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802457
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2057	NC_017459	CTGATC	2	12	96059	96070	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
2058	NC_017459	ATT	2	6	96082	96087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2059	NC_017459	TA	3	6	96107	96112	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2060	NC_017459	AAT	2	6	96115	96120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2061	NC_017459	AT	3	6	96209	96214	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2062	NC_017459	CGA	2	6	96241	96246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2063	NC_017459	AT	3	6	96280	96285	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2064	NC_017459	TCG	2	6	96396	96401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2065	NC_017459	GAAA	2	8	96404	96411	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2066	NC_017459	GAC	2	6	96415	96420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2067	NC_017459	TGA	2	6	96627	96632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802458
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2072	NC_017459	AGCCA	2	10	96786	96795	40 %	0 %	20 %	40 %	385802458
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2098	NC_017459	GCT	2	6	97707	97712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2101	NC_017459	TCTG	2	8	97890	97897	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2102	NC_017459	TCA	2	6	97906	97911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2108	NC_017459	GCC	2	6	98017	98022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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2110	NC_017459	ACTT	2	8	98183	98190	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2111	NC_017459	ACA	2	6	98288	98293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2112	NC_017459	CAA	2	6	98311	98316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2113	NC_017459	CAA	2	6	98337	98342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2114	NC_017459	AC	3	6	98400	98405	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2115	NC_017459	TC	3	6	98420	98425	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2116	NC_017459	GTCA	2	8	98494	98501	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2117	NC_017459	TAA	2	6	98509	98514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2122	NC_017459	CTC	2	6	98723	98728	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385802461
2123	NC_017459	ACCCA	2	10	98735	98744	40 %	0 %	0 %	60 %	385802461
2124	NC_017459	ATC	2	6	98876	98881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802461
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2130	NC_017459	G	6	6	99261	99266	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2131	NC_017459	GA	3	6	99297	99302	50 %	0 %	50 %	0 %	385802462
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2253	NC_017459	ATT	2	6	105250	105255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2255	NC_017459	ATTG	2	8	105293	105300	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2256	NC_017459	ACA	2	6	105313	105318	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2257	NC_017459	CTTT	2	8	105352	105359	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2258	NC_017459	TTGA	2	8	105371	105378	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2259	NC_017459	AAGT	2	8	105390	105397	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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2262	NC_017459	TCA	2	6	105593	105598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2263	NC_017459	TGA	2	6	105757	105762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2264	NC_017459	ATC	2	6	105790	105795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2266	NC_017459	AC	3	6	105924	105929	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2267	NC_017459	ACAT	2	8	105934	105941	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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