MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloquadratum walsbyi C23 complete genome

Total Repeats: 67781

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18002	NC_017459	GAA	2	6	833257	833262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385803069
18003	NC_017459	GTCT	2	8	833272	833279	0 %	50 %	25 %	25 %	385803069
18004	NC_017459	GAC	2	6	833321	833326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385803069
18005	NC_017459	ACA	2	6	833375	833380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18006	NC_017459	AT	4	8	833406	833413	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18007	NC_017459	CCA	2	6	833454	833459	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385803070
18008	NC_017459	ATT	2	6	833479	833484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385803070
18009	NC_017459	GAC	2	6	833495	833500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385803070
18010	NC_017459	ACA	2	6	833550	833555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385803070
18011	NC_017459	ACA	2	6	833574	833579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385803070
18012	NC_017459	ACA	2	6	833607	833612	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385803070
18013	NC_017459	CAA	2	6	833635	833640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385803070
18014	NC_017459	TGA	2	6	833711	833716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385803070
18015	NC_017459	TGA	2	6	833768	833773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385803070
18016	NC_017459	TAT	2	6	833837	833842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385803070
18017	NC_017459	AAC	2	6	833892	833897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385803071
18018	NC_017459	TCCG	2	8	833901	833908	0 %	25 %	25 %	50 %	385803071
18019	NC_017459	CAT	2	6	833936	833941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385803071
18020	NC_017459	TCA	2	6	833950	833955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385803071
18021	NC_017459	T	6	6	833973	833978	0 %	100 %	0 %	0 %	385803071
18022	NC_017459	CAA	2	6	833996	834001	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385803071
18023	NC_017459	CCGC	2	8	834035	834042	0 %	0 %	25 %	75 %	385803071
18024	NC_017459	CAT	2	6	834065	834070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385803071
18025	NC_017459	CTCG	2	8	834083	834090	0 %	25 %	25 %	50 %	385803071
18026	NC_017459	CAT	2	6	834101	834106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385803071
18027	NC_017459	TGTT	2	8	834135	834142	0 %	75 %	25 %	0 %	385803071
18028	NC_017459	TGA	2	6	834185	834190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385803071
18029	NC_017459	TCA	2	6	834209	834214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385803071
18030	NC_017459	GCT	2	6	834247	834252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385803071
18031	NC_017459	AAT	2	6	834294	834299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385803071
18032	NC_017459	AAT	2	6	834390	834395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385803071
18033	NC_017459	AGC	2	6	834406	834411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385803071
18034	NC_017459	AT	3	6	834451	834456	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18035	NC_017459	TC	3	6	834496	834501	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18036	NC_017459	TGA	2	6	834525	834530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18037	NC_017459	TCC	2	6	834595	834600	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18038	NC_017459	AT	3	6	834662	834667	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18039	NC_017459	ACT	2	6	834670	834675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18040	NC_017459	TC	3	6	834804	834809	0 %	50 %	0 %	50 %	385803072
18041	NC_017459	GTT	2	6	834891	834896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385803072
18042	NC_017459	TCA	2	6	834944	834949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385803072
18043	NC_017459	AT	3	6	834950	834955	50 %	50 %	0 %	0 %	385803072
18044	NC_017459	CCA	2	6	835019	835024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385803072
18045	NC_017459	GCAA	2	8	835034	835041	50 %	0 %	25 %	25 %	385803072
18046	NC_017459	ATC	2	6	835055	835060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385803072
18047	NC_017459	TGAT	2	8	835099	835106	25 %	50 %	25 %	0 %	385803072
18048	NC_017459	TATT	2	8	835143	835150	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18049	NC_017459	CT	3	6	835151	835156	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18050	NC_017459	GATTC	2	10	835158	835167	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
18051	NC_017459	ATC	2	6	835206	835211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18052	NC_017459	CAA	2	6	835258	835263	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18053	NC_017459	ACC	2	6	835293	835298	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18054	NC_017459	TAA	2	6	835321	835326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385803073
18055	NC_017459	CGC	2	6	835421	835426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385803073
18056	NC_017459	A	6	6	835441	835446	100 %	0 %	0 %	0 %	385803073
18057	NC_017459	TC	3	6	835478	835483	0 %	50 %	0 %	50 %	385803073
18058	NC_017459	TAA	2	6	835514	835519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385803073
18059	NC_017459	TGA	2	6	835532	835537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385803073
18060	NC_017459	TG	3	6	835556	835561	0 %	50 %	50 %	0 %	385803073
18061	NC_017459	CAG	2	6	835609	835614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385803073
18062	NC_017459	TAT	2	6	835646	835651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385803073
18063	NC_017459	GAC	2	6	835661	835666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385803073
18064	NC_017459	GGA	2	6	835785	835790	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385803073
18065	NC_017459	GAG	2	6	835845	835850	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385803073
18066	NC_017459	TGA	2	6	835903	835908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385803073
18067	NC_017459	ATCA	2	8	835961	835968	50 %	25 %	0 %	25 %	385803073
18068	NC_017459	TGC	2	6	836006	836011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385803073
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18070	NC_017459	TCT	2	6	836105	836110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385803073
18071	NC_017459	ATC	2	6	836148	836153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385803073
18072	NC_017459	TCCA	2	8	836155	836162	25 %	25 %	0 %	50 %	385803073
18073	NC_017459	G	6	6	836209	836214	0 %	0 %	100 %	0 %	385803073
18074	NC_017459	GTCA	2	8	836219	836226	25 %	25 %	25 %	25 %	385803073
18075	NC_017459	CACT	2	8	836248	836255	25 %	25 %	0 %	50 %	385803073
18076	NC_017459	GTTGAT	2	12	836271	836282	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385803073
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18078	NC_017459	CA	3	6	836301	836306	50 %	0 %	0 %	50 %	385803073
18079	NC_017459	TGG	2	6	836339	836344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385803073
18080	NC_017459	GCC	2	6	836385	836390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385803073
18081	NC_017459	CTGAGT	2	12	836437	836448	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385803073
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18084	NC_017459	CTGA	2	8	836564	836571	25 %	25 %	25 %	25 %	385803074
18085	NC_017459	GCT	2	6	836597	836602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385803074
18086	NC_017459	TCATTC	2	12	836604	836615	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	385803074
18087	NC_017459	CAG	2	6	836619	836624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385803074
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18089	NC_017459	GTC	2	6	836708	836713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385803074
18090	NC_017459	GCA	2	6	836729	836734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385803074
18091	NC_017459	TGA	2	6	836790	836795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385803074
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18094	NC_017459	TTC	2	6	836891	836896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385803075
18095	NC_017459	TTG	2	6	836901	836906	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385803075
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18100	NC_017459	GCA	2	6	837104	837109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385803075
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18103	NC_017459	CGT	2	6	837219	837224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385803076
18104	NC_017459	GCT	2	6	837232	837237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385803076
18105	NC_017459	CTT	2	6	837244	837249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385803076
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18111	NC_017459	CTT	2	6	837427	837432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385803076
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18482	NC_017459	CAT	3	9	853573	853581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385803089
18483	NC_017459	AGG	2	6	853608	853613	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385803089
18484	NC_017459	TGA	2	6	853626	853631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385803089
18485	NC_017459	CTG	2	6	853727	853732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385803089
18486	NC_017459	ATG	2	6	853769	853774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385803089
18487	NC_017459	TCA	2	6	853803	853808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385803089
18488	NC_017459	TAT	2	6	853825	853830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385803089
18489	NC_017459	GAC	2	6	853917	853922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385803089
18490	NC_017459	TGC	2	6	853971	853976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385803089
18491	NC_017459	ATC	2	6	854001	854006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385803089
18492	NC_017459	TCA	2	6	854134	854139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18493	NC_017459	AATG	2	8	854168	854175	50 %	25 %	25 %	0 %	385803090
18494	NC_017459	ATG	2	6	854191	854196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385803090
18495	NC_017459	TCG	2	6	854203	854208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385803090
18496	NC_017459	ATCC	2	8	854214	854221	25 %	25 %	0 %	50 %	385803090
18497	NC_017459	TTC	2	6	854276	854281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385803090
18498	NC_017459	CAC	2	6	854349	854354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385803090
18499	NC_017459	GAA	2	6	854406	854411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385803090
18500	NC_017459	CCG	2	6	854432	854437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385803090

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