MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloquadratum walsbyi C23 complete genome

Total Repeats: 67781

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_017459	CGTC	2	8	743713	743720	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16002	NC_017459	TG	3	6	743772	743777	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16003	NC_017459	CCA	2	6	743812	743817	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16004	NC_017459	CGG	2	6	743909	743914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16005	NC_017459	TCG	2	6	743952	743957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16006	NC_017459	AGC	2	6	743984	743989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16007	NC_017459	TCG	2	6	744004	744009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16008	NC_017459	GGA	2	6	744028	744033	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16009	NC_017459	TGT	2	6	744073	744078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16010	NC_017459	CTA	3	9	744166	744174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16011	NC_017459	TGG	2	6	744210	744215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16012	NC_017459	ATG	2	6	744221	744226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16013	NC_017459	AAAAT	2	10	744232	744241	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
16014	NC_017459	GCCG	2	8	744276	744283	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16015	NC_017459	ACC	2	6	744333	744338	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16016	NC_017459	TGC	2	6	744345	744350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16017	NC_017459	TCTCT	2	10	744422	744431	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
16018	NC_017459	TG	3	6	744438	744443	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16019	NC_017459	TCGTCA	2	12	744529	744540	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
16020	NC_017459	ATA	2	6	744553	744558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16021	NC_017459	TAA	2	6	744566	744571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16022	NC_017459	A	6	6	744600	744605	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16023	NC_017459	GAA	2	6	744606	744611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16024	NC_017459	ACG	2	6	744613	744618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16025	NC_017459	AG	3	6	744637	744642	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16026	NC_017459	CGA	2	6	744644	744649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16027	NC_017459	GTC	2	6	744659	744664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802991
16028	NC_017459	TGG	2	6	744668	744673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802991
16029	NC_017459	CAG	2	6	744703	744708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802991
16030	NC_017459	CTGGTG	2	12	744715	744726	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	385802991
16031	NC_017459	CGG	2	6	744734	744739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385802991
16032	NC_017459	CCT	2	6	744748	744753	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385802991
16033	NC_017459	ATG	2	6	744757	744762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802991
16034	NC_017459	TTC	2	6	744833	744838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802991
16035	NC_017459	GC	3	6	744889	744894	0 %	0 %	50 %	50 %	385802991
16036	NC_017459	AC	3	6	744952	744957	50 %	0 %	0 %	50 %	385802991
16037	NC_017459	GTT	2	6	744966	744971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802991
16038	NC_017459	CAT	2	6	745000	745005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802991
16039	NC_017459	TAT	2	6	745042	745047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802991
16040	NC_017459	TCGAAT	2	12	745101	745112	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385802991
16041	NC_017459	CCAT	2	8	745121	745128	25 %	25 %	0 %	50 %	385802991
16042	NC_017459	CAA	2	6	745162	745167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802991
16043	NC_017459	GTT	2	6	745189	745194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802991
16044	NC_017459	TCA	2	6	745221	745226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802991
16045	NC_017459	CAT	2	6	745246	745251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802991
16046	NC_017459	ATC	2	6	745269	745274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802991
16047	NC_017459	CAA	2	6	745324	745329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802991
16048	NC_017459	TGG	2	6	745385	745390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802991
16049	NC_017459	CAT	2	6	745477	745482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802991
16050	NC_017459	CCA	2	6	745524	745529	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385802991
16051	NC_017459	CAT	2	6	745616	745621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802991
16052	NC_017459	TGC	2	6	745622	745627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802991
16053	NC_017459	ACC	3	9	745631	745639	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385802991
16054	NC_017459	CAA	2	6	745645	745650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802991
16055	NC_017459	CGT	2	6	745673	745678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802991
16056	NC_017459	TAT	2	6	745766	745771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16057	NC_017459	CGGA	2	8	745778	745785	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16058	NC_017459	TG	4	8	745801	745808	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16059	NC_017459	GAC	2	6	745822	745827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16060	NC_017459	CTG	2	6	745837	745842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16061	NC_017459	AT	3	6	745861	745866	50 %	50 %	0 %	0 %	385802992
16062	NC_017459	CAT	2	6	745891	745896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802992
16063	NC_017459	CAT	2	6	745954	745959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802992
16064	NC_017459	CTG	2	6	745997	746002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802992
16065	NC_017459	GAT	3	9	746016	746024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802992
16066	NC_017459	CAT	4	12	746044	746055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802992
16067	NC_017459	ATT	2	6	746063	746068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802992
16068	NC_017459	T	7	7	746106	746112	0 %	100 %	0 %	0 %	385802992
16069	NC_017459	CGCCA	2	10	746125	746134	20 %	0 %	20 %	60 %	385802992
16070	NC_017459	CTA	2	6	746247	746252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802992
16071	NC_017459	TCA	2	6	746253	746258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802992
16072	NC_017459	TAG	2	6	746275	746280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802992
16073	NC_017459	TCA	2	6	746325	746330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802992
16074	NC_017459	TGG	2	6	746350	746355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802992
16075	NC_017459	TAT	2	6	746359	746364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802992
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16080	NC_017459	AGTG	2	8	746666	746673	25 %	25 %	50 %	0 %	385802992
16081	NC_017459	ATC	2	6	746804	746809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802992
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16083	NC_017459	TGAT	2	8	746940	746947	25 %	50 %	25 %	0 %	385802992
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16087	NC_017459	CAT	2	6	747121	747126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802992
16088	NC_017459	GAC	2	6	747137	747142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802992
16089	NC_017459	ACGC	2	8	747163	747170	25 %	0 %	25 %	50 %	385802992
16090	NC_017459	CAT	2	6	747193	747198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802992
16091	NC_017459	GCT	2	6	747271	747276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802992
16092	NC_017459	CCG	2	6	747321	747326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385802992
16093	NC_017459	CAG	2	6	747328	747333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802992
16094	NC_017459	CGAATT	2	12	747387	747398	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385802992
16095	NC_017459	CGT	2	6	747452	747457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802993
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16097	NC_017459	GCAA	2	8	747554	747561	50 %	0 %	25 %	25 %	385802993
16098	NC_017459	ATCA	2	8	747565	747572	50 %	25 %	0 %	25 %	385802993
16099	NC_017459	TCG	2	6	747661	747666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802993
16100	NC_017459	AG	3	6	747691	747696	50 %	0 %	50 %	0 %	385802993
16101	NC_017459	GAC	2	6	747730	747735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802993
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16104	NC_017459	TGACTC	2	12	747829	747840	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385802993
16105	NC_017459	GCA	2	6	747935	747940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802993
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16107	NC_017459	TGT	2	6	748002	748007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802993
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16115	NC_017459	TGAT	2	8	748258	748265	25 %	50 %	25 %	0 %	385802993
16116	NC_017459	CAA	2	6	748317	748322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802993
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