MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloquadratum walsbyi C23 complete genome

Total Repeats: 67781

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15502	NC_017459	GGGACT	2	12	722364	722375	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385802971
15503	NC_017459	TGA	2	6	722441	722446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802971
15504	NC_017459	GAG	2	6	722460	722465	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385802971
15505	NC_017459	GAA	2	6	722469	722474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802971
15506	NC_017459	CTCG	2	8	722532	722539	0 %	25 %	25 %	50 %	385802971
15507	NC_017459	GTT	2	6	722544	722549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802971
15508	NC_017459	AAC	2	6	722563	722568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802971
15509	NC_017459	TGA	2	6	722606	722611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802971
15510	NC_017459	GTT	2	6	722628	722633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802971
15511	NC_017459	TTG	2	6	722635	722640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802971
15512	NC_017459	TTGC	2	8	722688	722695	0 %	50 %	25 %	25 %	385802971
15513	NC_017459	CTT	2	6	722715	722720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802971
15514	NC_017459	ATC	2	6	722786	722791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15515	NC_017459	GTTA	2	8	722959	722966	25 %	50 %	25 %	0 %	385802972
15516	NC_017459	TCGA	2	8	722967	722974	25 %	25 %	25 %	25 %	385802972
15517	NC_017459	CGT	2	6	723054	723059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802972
15518	NC_017459	GATTC	2	10	723091	723100	20 %	40 %	20 %	20 %	385802972
15519	NC_017459	ACC	2	6	723101	723106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385802972
15520	NC_017459	TGA	2	6	723109	723114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802972
15521	NC_017459	TC	3	6	723136	723141	0 %	50 %	0 %	50 %	385802972
15522	NC_017459	TGA	2	6	723184	723189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802972
15523	NC_017459	TCGAA	2	10	723193	723202	40 %	20 %	20 %	20 %	385802972
15524	NC_017459	GGT	2	6	723266	723271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802972
15525	NC_017459	CCT	2	6	723313	723318	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385802972
15526	NC_017459	TGC	2	6	723349	723354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802972
15527	NC_017459	CGC	2	6	723376	723381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385802972
15528	NC_017459	TCGT	2	8	723383	723390	0 %	50 %	25 %	25 %	385802972
15529	NC_017459	TGT	2	6	723454	723459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802972
15530	NC_017459	GC	3	6	723472	723477	0 %	0 %	50 %	50 %	385802972
15531	NC_017459	TGA	2	6	723496	723501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802972
15532	NC_017459	GTG	2	6	723537	723542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802972
15533	NC_017459	GAG	2	6	723566	723571	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385802972
15534	NC_017459	TAT	2	6	723592	723597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802972
15535	NC_017459	TCA	2	6	723627	723632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802972
15536	NC_017459	TGT	2	6	723775	723780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802972
15537	NC_017459	CTG	2	6	723858	723863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802972
15538	NC_017459	CACG	2	8	723873	723880	25 %	0 %	25 %	50 %	385802972
15539	NC_017459	TTG	2	6	723936	723941	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802972
15540	NC_017459	TCG	2	6	724030	724035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802972
15541	NC_017459	ATG	2	6	724100	724105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802972
15542	NC_017459	TTG	2	6	724161	724166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802972
15543	NC_017459	GAT	2	6	724177	724182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802972
15544	NC_017459	ACA	2	6	724205	724210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802972
15545	NC_017459	GTT	2	6	724229	724234	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802972
15546	NC_017459	GTT	2	6	724262	724267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802972
15547	NC_017459	CTG	2	6	724278	724283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802972
15548	NC_017459	TGA	2	6	724315	724320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802972
15549	NC_017459	CTG	2	6	724350	724355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802972
15550	NC_017459	ATG	2	6	724377	724382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802972
15551	NC_017459	TGG	2	6	724393	724398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802972
15552	NC_017459	ATT	2	6	724400	724405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802972
15553	NC_017459	CTG	2	6	724434	724439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802972
15554	NC_017459	GAT	2	6	724465	724470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802972
15555	NC_017459	TAA	2	6	724646	724651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15556	NC_017459	TCC	2	6	724676	724681	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15557	NC_017459	GGA	3	9	724692	724700	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15558	NC_017459	CAG	2	6	724743	724748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15559	NC_017459	AT	3	6	724751	724756	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15560	NC_017459	TCT	2	6	724762	724767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15561	NC_017459	TC	3	6	724774	724779	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15562	NC_017459	ACACTA	2	12	724800	724811	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15563	NC_017459	CAGA	2	8	724817	724824	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15564	NC_017459	TGA	2	6	724856	724861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802973
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15567	NC_017459	TGA	2	6	724974	724979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802973
15568	NC_017459	TTG	2	6	725057	725062	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802973
15569	NC_017459	ACT	2	6	725088	725093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802973
15570	NC_017459	AATCT	2	10	725113	725122	40 %	40 %	0 %	20 %	385802973
15571	NC_017459	TCG	2	6	725159	725164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15572	NC_017459	T	6	6	725165	725170	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15573	NC_017459	CTA	2	6	725295	725300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802974
15574	NC_017459	CGT	2	6	725320	725325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802974
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15580	NC_017459	CTT	2	6	725534	725539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802974
15581	NC_017459	AT	3	6	725558	725563	50 %	50 %	0 %	0 %	385802974
15582	NC_017459	AACA	2	8	725580	725587	75 %	0 %	0 %	25 %	385802974
15583	NC_017459	TAC	2	6	725687	725692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802974
15584	NC_017459	GCTC	2	8	725696	725703	0 %	25 %	25 %	50 %	385802974
15585	NC_017459	TGA	3	9	725707	725715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802974
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15587	NC_017459	GTC	2	6	725735	725740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802974
15588	NC_017459	GTT	2	6	725741	725746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802974
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15590	NC_017459	TTG	2	6	725784	725789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802974
15591	NC_017459	GTG	2	6	725790	725795	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802974
15592	NC_017459	TGA	2	6	725797	725802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802974
15593	NC_017459	ATCG	2	8	725804	725811	25 %	25 %	25 %	25 %	385802974
15594	NC_017459	AGCA	2	8	725826	725833	50 %	0 %	25 %	25 %	385802974
15595	NC_017459	GA	3	6	725838	725843	50 %	0 %	50 %	0 %	385802974
15596	NC_017459	GACCC	2	10	725864	725873	20 %	0 %	20 %	60 %	385802974
15597	NC_017459	CGACCC	3	18	725868	725885	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	385802974
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15599	NC_017459	TGA	2	6	725923	725928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802974
15600	NC_017459	GAGCGC	2	12	725972	725983	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	385802974
15601	NC_017459	TGA	2	6	726029	726034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15602	NC_017459	ATT	2	6	726045	726050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15603	NC_017459	CGA	2	6	726053	726058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15604	NC_017459	TAA	2	6	726063	726068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15605	NC_017459	TTAT	2	8	726085	726092	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15606	NC_017459	CAC	2	6	726138	726143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15607	NC_017459	CGAC	2	8	726181	726188	25 %	0 %	25 %	50 %	385802975
15608	NC_017459	GCA	2	6	726268	726273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802975
15609	NC_017459	AC	3	6	726335	726340	50 %	0 %	0 %	50 %	385802975
15610	NC_017459	GCA	2	6	726379	726384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802975
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15614	NC_017459	CAA	2	6	726614	726619	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802975
15615	NC_017459	GTTT	2	8	726660	726667	0 %	75 %	25 %	0 %	385802975
15616	NC_017459	AAG	2	6	726789	726794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802975
15617	NC_017459	GAAT	2	8	726922	726929	50 %	25 %	25 %	0 %	385802976
15618	NC_017459	GCA	2	6	726935	726940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802976
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15984	NC_017459	ATC	2	6	742927	742932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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