MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloquadratum walsbyi C23 complete genome

Total Repeats: 67781

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_017459	ATC	2	6	700653	700658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802955
15002	NC_017459	TCA	2	6	700741	700746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802955
15003	NC_017459	CAC	2	6	700820	700825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385802955
15004	NC_017459	CAT	2	6	700832	700837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802955
15005	NC_017459	AACGA	2	10	700932	700941	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
15006	NC_017459	GAG	2	6	700987	700992	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15007	NC_017459	CTG	2	6	701017	701022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802956
15008	NC_017459	GCT	2	6	701044	701049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802956
15009	NC_017459	GGA	2	6	701050	701055	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385802956
15010	NC_017459	AGT	2	6	701089	701094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802956
15011	NC_017459	ACA	2	6	701095	701100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802956
15012	NC_017459	GTTT	2	8	701184	701191	0 %	75 %	25 %	0 %	385802956
15013	NC_017459	ATA	2	6	701207	701212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802956
15014	NC_017459	TTG	2	6	701213	701218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802956
15015	NC_017459	CA	3	6	701290	701295	50 %	0 %	0 %	50 %	385802956
15016	NC_017459	CA	3	6	701333	701338	50 %	0 %	0 %	50 %	385802956
15017	NC_017459	GTT	2	6	701368	701373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802956
15018	NC_017459	T	8	8	701482	701489	0 %	100 %	0 %	0 %	385802956
15019	NC_017459	TGG	2	6	701499	701504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802956
15020	NC_017459	CCA	2	6	701535	701540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15021	NC_017459	TTA	2	6	701550	701555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15022	NC_017459	T	6	6	701604	701609	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15023	NC_017459	CAT	2	6	701613	701618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15024	NC_017459	T	6	6	701618	701623	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15025	NC_017459	GGT	2	6	701756	701761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802957
15026	NC_017459	TGA	2	6	701790	701795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802957
15027	NC_017459	GCA	2	6	701806	701811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802957
15028	NC_017459	CAG	2	6	701822	701827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802957
15029	NC_017459	TCGT	2	8	701859	701866	0 %	50 %	25 %	25 %	385802957
15030	NC_017459	CAA	2	6	701909	701914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802957
15031	NC_017459	AGT	2	6	701944	701949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802957
15032	NC_017459	ATC	2	6	702054	702059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802957
15033	NC_017459	CCG	2	6	702119	702124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385802957
15034	NC_017459	TCA	3	9	702184	702192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802957
15035	NC_017459	CGG	2	6	702196	702201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385802957
15036	NC_017459	GATT	2	8	702258	702265	25 %	50 %	25 %	0 %	385802957
15037	NC_017459	CGC	2	6	702293	702298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385802957
15038	NC_017459	GAC	2	6	702372	702377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802957
15039	NC_017459	ATGG	2	8	702380	702387	25 %	25 %	50 %	0 %	385802957
15040	NC_017459	CCA	2	6	702405	702410	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385802957
15041	NC_017459	ACG	2	6	702415	702420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802957
15042	NC_017459	GTG	2	6	702422	702427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802957
15043	NC_017459	CAG	2	6	702443	702448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802957
15044	NC_017459	TGC	2	6	702450	702455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802957
15045	NC_017459	ATGA	2	8	702489	702496	50 %	25 %	25 %	0 %	385802957
15046	NC_017459	CGA	2	6	702511	702516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802957
15047	NC_017459	AT	3	6	702574	702579	50 %	50 %	0 %	0 %	385802957
15048	NC_017459	CAT	2	6	702584	702589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802957
15049	NC_017459	CCA	2	6	702618	702623	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385802957
15050	NC_017459	CAA	2	6	702631	702636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802957
15051	NC_017459	CGA	2	6	702688	702693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802957
15052	NC_017459	TCG	2	6	702715	702720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802957
15053	NC_017459	ACA	2	6	702769	702774	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15054	NC_017459	CAG	2	6	702858	702863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15055	NC_017459	A	6	6	702906	702911	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15056	NC_017459	CA	3	6	703018	703023	50 %	0 %	0 %	50 %	385802958
15057	NC_017459	ATC	2	6	703033	703038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802958
15058	NC_017459	AT	3	6	703066	703071	50 %	50 %	0 %	0 %	385802958
15059	NC_017459	TG	3	6	703083	703088	0 %	50 %	50 %	0 %	385802958
15060	NC_017459	AGA	2	6	703093	703098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802958
15061	NC_017459	GGTGT	2	10	703166	703175	0 %	40 %	60 %	0 %	385802958
15062	NC_017459	AAG	2	6	703254	703259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802958
15063	NC_017459	ATA	2	6	703290	703295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802958
15064	NC_017459	GCC	2	6	703326	703331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385802958
15065	NC_017459	GCT	2	6	703396	703401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802958
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15068	NC_017459	ATA	2	6	703594	703599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802958
15069	NC_017459	CTT	2	6	703738	703743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15070	NC_017459	TAT	2	6	703748	703753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15071	NC_017459	TAA	2	6	703770	703775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15072	NC_017459	TC	3	6	703809	703814	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15073	NC_017459	TTATTT	2	12	703818	703829	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15074	NC_017459	AT	3	6	703830	703835	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15075	NC_017459	TAT	2	6	703843	703848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15076	NC_017459	CAT	2	6	703854	703859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15079	NC_017459	GCT	2	6	703925	703930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802959
15080	NC_017459	TCAC	2	8	703931	703938	25 %	25 %	0 %	50 %	385802959
15081	NC_017459	TGAA	2	8	703994	704001	50 %	25 %	25 %	0 %	385802959
15082	NC_017459	TCA	2	6	704009	704014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802959
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15087	NC_017459	GGA	2	6	704245	704250	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385802959
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15089	NC_017459	T	6	6	704294	704299	0 %	100 %	0 %	0 %	385802959
15090	NC_017459	CAG	2	6	704409	704414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802959
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15093	NC_017459	CAA	2	6	704490	704495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802959
15094	NC_017459	GTG	2	6	704502	704507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802959
15095	NC_017459	GCG	2	6	704513	704518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385802959
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15098	NC_017459	GTCT	2	8	704616	704623	0 %	50 %	25 %	25 %	385802959
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15104	NC_017459	CGT	2	6	704917	704922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802959
15105	NC_017459	TGA	2	6	705006	705011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15106	NC_017459	ATA	2	6	705012	705017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15107	NC_017459	GATC	2	8	705088	705095	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15108	NC_017459	GAC	2	6	705102	705107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15109	NC_017459	TG	3	6	705125	705130	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15110	NC_017459	ATG	2	6	705145	705150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802960
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15112	NC_017459	TTA	2	6	705238	705243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802960
15113	NC_017459	TGA	2	6	705260	705265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802960
15114	NC_017459	CAA	2	6	705341	705346	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802960
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15117	NC_017459	TTC	2	6	705523	705528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802960
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15119	NC_017459	GTATTG	2	12	705583	705594	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385802960
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15241	NC_017459	AT	3	6	710742	710747	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15242	NC_017459	TATC	2	8	710789	710796	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15243	NC_017459	TCG	3	9	710816	710824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15247	NC_017459	TCA	2	6	710918	710923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15283	NC_017459	AT	3	6	712782	712787	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15488	NC_017459	GCA	2	6	721968	721973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802971
15489	NC_017459	GAC	2	6	722037	722042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802971
15490	NC_017459	ACA	2	6	722051	722056	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802971
15491	NC_017459	GTT	2	6	722099	722104	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802971
15492	NC_017459	GCT	2	6	722121	722126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802971
15493	NC_017459	CGAG	2	8	722129	722136	25 %	0 %	50 %	25 %	385802971
15494	NC_017459	CAC	2	6	722200	722205	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385802971
15495	NC_017459	TGA	2	6	722216	722221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802971
15496	NC_017459	GAA	2	6	722250	722255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802971
15497	NC_017459	TGA	2	6	722261	722266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802971
15498	NC_017459	CCGAC	2	10	722296	722305	20 %	0 %	20 %	60 %	385802971
15499	NC_017459	GAT	3	9	722307	722315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802971
15500	NC_017459	GATACA	2	12	722322	722333	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385802971

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