MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloquadratum walsbyi C23 complete genome

Total Repeats: 67781

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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14502	NC_017459	ATG	2	6	678881	678886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802936
14503	NC_017459	TGA	2	6	678897	678902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802936
14504	NC_017459	GAG	2	6	678910	678915	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385802936
14505	NC_017459	CGA	2	6	678972	678977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802936
14506	NC_017459	TA	3	6	678985	678990	50 %	50 %	0 %	0 %	385802936
14507	NC_017459	TGA	2	6	679008	679013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802936
14508	NC_017459	TCG	2	6	679067	679072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802936
14509	NC_017459	AGC	2	6	679092	679097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802936
14510	NC_017459	TCA	2	6	679148	679153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802936
14511	NC_017459	AATC	2	8	679190	679197	50 %	25 %	0 %	25 %	385802936
14512	NC_017459	GAG	2	6	679258	679263	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385802936
14513	NC_017459	CTT	2	6	679300	679305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802936
14514	NC_017459	GAG	2	6	679306	679311	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385802936
14515	NC_017459	GAA	2	6	679324	679329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802936
14516	NC_017459	ACA	3	9	679339	679347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802936
14517	NC_017459	TTG	2	6	679364	679369	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802936
14518	NC_017459	GTG	2	6	679490	679495	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14519	NC_017459	AAC	2	6	679525	679530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14520	NC_017459	GGA	2	6	679557	679562	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14521	NC_017459	TAT	2	6	679585	679590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14522	NC_017459	TG	3	6	679592	679597	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14523	NC_017459	TTG	3	9	679607	679615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802937
14524	NC_017459	TTG	2	6	679622	679627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802937
14525	NC_017459	TG	3	6	679644	679649	0 %	50 %	50 %	0 %	385802937
14526	NC_017459	GTT	2	6	679771	679776	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802937
14527	NC_017459	ATC	2	6	679810	679815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802937
14528	NC_017459	TTG	2	6	679835	679840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802937
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14530	NC_017459	GCA	2	6	679888	679893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802937
14531	NC_017459	TGA	2	6	679986	679991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802937
14532	NC_017459	ACAT	2	8	680029	680036	50 %	25 %	0 %	25 %	385802937
14533	NC_017459	CAG	2	6	680054	680059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802937
14534	NC_017459	GCA	3	9	680086	680094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802937
14535	NC_017459	AACGCA	2	12	680110	680121	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	385802937
14536	NC_017459	AAG	2	6	680148	680153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802937
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14538	NC_017459	TGC	2	6	680253	680258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802937
14539	NC_017459	TGA	2	6	680276	680281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802937
14540	NC_017459	TCG	2	6	680308	680313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802937
14541	NC_017459	TCG	2	6	680333	680338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802937
14542	NC_017459	AG	3	6	680604	680609	50 %	0 %	50 %	0 %	385802937
14543	NC_017459	TCC	2	6	680611	680616	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385802937
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14545	NC_017459	CAT	2	6	680655	680660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802937
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14550	NC_017459	TGG	2	6	680934	680939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802937
14551	NC_017459	AAG	2	6	680952	680957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802937
14552	NC_017459	TCGT	2	8	681011	681018	0 %	50 %	25 %	25 %	385802937
14553	NC_017459	GTT	2	6	681045	681050	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802937
14554	NC_017459	GTGA	2	8	681077	681084	25 %	25 %	50 %	0 %	385802937
14555	NC_017459	CAT	2	6	681180	681185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802937
14556	NC_017459	ATC	2	6	681310	681315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802937
14557	NC_017459	GGC	2	6	681385	681390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385802937
14558	NC_017459	TGA	2	6	681420	681425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802937
14559	NC_017459	CAC	2	6	681440	681445	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385802937
14560	NC_017459	ATCG	2	8	681473	681480	25 %	25 %	25 %	25 %	385802937
14561	NC_017459	GAT	2	6	681501	681506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802937
14562	NC_017459	GTC	2	6	681508	681513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802937
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14564	NC_017459	CTG	2	6	681690	681695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802937
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14575	NC_017459	TGC	2	6	682211	682216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802938
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14584	NC_017459	TGTCAC	2	12	682694	682705	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385802938
14585	NC_017459	AATCG	2	10	682718	682727	40 %	20 %	20 %	20 %	385802938
14586	NC_017459	ACAT	2	8	682728	682735	50 %	25 %	0 %	25 %	385802938
14587	NC_017459	GCA	2	6	682869	682874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802938
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14591	NC_017459	TA	3	6	683192	683197	50 %	50 %	0 %	0 %	385802938
14592	NC_017459	CAG	2	6	683287	683292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802938
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14598	NC_017459	CGG	2	6	683584	683589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385802938
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14602	NC_017459	AC	3	6	683675	683680	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14603	NC_017459	TGT	2	6	683702	683707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14604	NC_017459	AATAA	2	10	683732	683741	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14605	NC_017459	GCTG	2	8	683742	683749	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14606	NC_017459	CTT	2	6	683773	683778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802939
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14609	NC_017459	GCT	2	6	683923	683928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802939
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14611	NC_017459	TGT	2	6	684029	684034	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802939
14612	NC_017459	ATA	2	6	684068	684073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14613	NC_017459	AT	3	6	684086	684091	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14614	NC_017459	ATT	2	6	684103	684108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14615	NC_017459	ATA	2	6	684115	684120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14616	NC_017459	TTAT	2	8	684121	684128	25 %	75 %	0 %	0 %	385802940
14617	NC_017459	TCCA	2	8	684156	684163	25 %	25 %	0 %	50 %	385802940
14618	NC_017459	GCA	2	6	684170	684175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802940
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14620	NC_017459	GTT	2	6	684287	684292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802940
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14623	NC_017459	CCGA	2	8	684431	684438	25 %	0 %	25 %	50 %	385802940
14624	NC_017459	GTC	2	6	684443	684448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802940
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14988	NC_017459	CAA	2	6	700213	700218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802954
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