MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloquadratum walsbyi C23 complete genome

Total Repeats: 67781

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_017459	T	6	6	656754	656759	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14002	NC_017459	TAT	2	6	656777	656782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14003	NC_017459	AT	3	6	656789	656794	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14004	NC_017459	ATC	2	6	656918	656923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14005	NC_017459	ACC	2	6	656969	656974	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14006	NC_017459	GT	3	6	657092	657097	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14007	NC_017459	GCGGT	2	10	657141	657150	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
14008	NC_017459	AGG	2	6	657178	657183	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14009	NC_017459	TCA	2	6	657229	657234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14010	NC_017459	GGT	2	6	657285	657290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14011	NC_017459	GTT	2	6	657295	657300	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14012	NC_017459	AG	3	6	657307	657312	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14013	NC_017459	TGT	2	6	657357	657362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14014	NC_017459	TAAT	2	8	657401	657408	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14015	NC_017459	AT	3	6	657410	657415	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14016	NC_017459	TAGC	2	8	657489	657496	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14017	NC_017459	ATC	2	6	657567	657572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14018	NC_017459	CTA	2	6	657576	657581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14019	NC_017459	TAG	2	6	657598	657603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14020	NC_017459	GTT	2	6	657724	657729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802921
14021	NC_017459	CTC	2	6	657885	657890	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385802921
14022	NC_017459	GCT	2	6	657892	657897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802921
14023	NC_017459	TCA	2	6	657934	657939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802921
14024	NC_017459	TCT	2	6	658006	658011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802921
14025	NC_017459	ATCC	2	8	658054	658061	25 %	25 %	0 %	50 %	385802921
14026	NC_017459	ACA	2	6	658105	658110	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802921
14027	NC_017459	CTG	2	6	658184	658189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802921
14028	NC_017459	TCG	2	6	658201	658206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802921
14029	NC_017459	GAC	2	6	658233	658238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802921
14030	NC_017459	TGC	2	6	658275	658280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802921
14031	NC_017459	CAT	2	6	658355	658360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802921
14032	NC_017459	CGG	2	6	658509	658514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385802921
14033	NC_017459	CTG	2	6	658565	658570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802921
14034	NC_017459	GAT	2	6	658623	658628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802921
14035	NC_017459	GTT	2	6	658642	658647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802921
14036	NC_017459	CAG	2	6	658679	658684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802921
14037	NC_017459	ATT	2	6	658699	658704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802921
14038	NC_017459	T	6	6	658703	658708	0 %	100 %	0 %	0 %	385802921
14039	NC_017459	TGG	2	6	658764	658769	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802921
14040	NC_017459	AAC	2	6	658836	658841	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802921
14041	NC_017459	CAG	3	9	658889	658897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802921
14042	NC_017459	TCC	2	6	658948	658953	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385802921
14043	NC_017459	GCA	2	6	658957	658962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802921
14044	NC_017459	GC	4	8	658973	658980	0 %	0 %	50 %	50 %	385802921
14045	NC_017459	ATG	2	6	658997	659002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802921
14046	NC_017459	CGT	2	6	659010	659015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802921
14047	NC_017459	CAC	2	6	659024	659029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385802921
14048	NC_017459	ATTA	2	8	659058	659065	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14049	NC_017459	ACT	2	6	659147	659152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14050	NC_017459	AAT	2	6	659174	659179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14051	NC_017459	GGGT	2	8	659311	659318	0 %	25 %	75 %	0 %	385802922
14052	NC_017459	TGA	2	6	659328	659333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802922
14053	NC_017459	GTG	2	6	659391	659396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802922
14054	NC_017459	AGATC	2	10	659486	659495	40 %	20 %	20 %	20 %	385802922
14055	NC_017459	CAG	2	6	659598	659603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14056	NC_017459	TGAAT	2	10	659623	659632	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
14057	NC_017459	CAC	2	6	659654	659659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14058	NC_017459	GGA	3	9	659664	659672	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14059	NC_017459	GA	3	6	659706	659711	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14060	NC_017459	CCG	2	6	659715	659720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14061	NC_017459	CGG	2	6	659725	659730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14062	NC_017459	TAC	2	6	659765	659770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802923
14063	NC_017459	ATG	2	6	659775	659780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802923
14064	NC_017459	ATA	2	6	659786	659791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802923
14065	NC_017459	TCA	2	6	659870	659875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802923
14066	NC_017459	TCT	2	6	659963	659968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802923
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14068	NC_017459	AAT	2	6	660040	660045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802923
14069	NC_017459	ATC	2	6	660055	660060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802923
14070	NC_017459	CAA	2	6	660087	660092	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802923
14071	NC_017459	GTG	2	6	660141	660146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802923
14072	NC_017459	ACA	2	6	660187	660192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802923
14073	NC_017459	TGT	2	6	660199	660204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802923
14074	NC_017459	TA	3	6	660224	660229	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14075	NC_017459	TA	3	6	660257	660262	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14076	NC_017459	ATT	2	6	660263	660268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14077	NC_017459	TC	3	6	660290	660295	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14078	NC_017459	CCCA	2	8	660327	660334	25 %	0 %	0 %	75 %	385802924
14079	NC_017459	CAA	3	9	660426	660434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802924
14080	NC_017459	TA	3	6	660473	660478	50 %	50 %	0 %	0 %	385802924
14081	NC_017459	AACG	2	8	660485	660492	50 %	0 %	25 %	25 %	385802924
14082	NC_017459	AGC	2	6	660505	660510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802924
14083	NC_017459	TGT	2	6	660526	660531	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802924
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14085	NC_017459	TTGGGT	2	12	660606	660617	0 %	50 %	50 %	0 %	385802924
14086	NC_017459	GCA	2	6	660641	660646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802924
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14088	NC_017459	GAA	2	6	660671	660676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802924
14089	NC_017459	CAA	2	6	660696	660701	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802924
14090	NC_017459	ATC	2	6	660715	660720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802924
14091	NC_017459	CTG	2	6	660723	660728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802924
14092	NC_017459	CCGTG	2	10	660730	660739	0 %	20 %	40 %	40 %	385802924
14093	NC_017459	GGA	2	6	660865	660870	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385802924
14094	NC_017459	CAT	2	6	660926	660931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802924
14095	NC_017459	GATGC	2	10	660938	660947	20 %	20 %	40 %	20 %	385802924
14096	NC_017459	ATG	2	6	660960	660965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802924
14097	NC_017459	CAG	2	6	661017	661022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802924
14098	NC_017459	CTG	2	6	661038	661043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802924
14099	NC_017459	CGTGAG	2	12	661100	661111	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385802924
14100	NC_017459	CCG	2	6	661167	661172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385802924
14101	NC_017459	CT	3	6	661256	661261	0 %	50 %	0 %	50 %	385802924
14102	NC_017459	CAG	2	6	661368	661373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802925
14103	NC_017459	ATC	2	6	661379	661384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802925
14104	NC_017459	GAT	2	6	661416	661421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802925
14105	NC_017459	CCG	2	6	661463	661468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385802925
14106	NC_017459	TAC	2	6	661502	661507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802925
14107	NC_017459	CG	3	6	661518	661523	0 %	0 %	50 %	50 %	385802925
14108	NC_017459	ACAGC	2	10	661569	661578	40 %	0 %	20 %	40 %	385802925
14109	NC_017459	GAC	2	6	661589	661594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802925
14110	NC_017459	AC	3	6	661593	661598	50 %	0 %	0 %	50 %	385802925
14111	NC_017459	CTG	2	6	661747	661752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802925
14112	NC_017459	TCC	2	6	661755	661760	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385802925
14113	NC_017459	CAG	2	6	661782	661787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802925
14114	NC_017459	CAA	2	6	661815	661820	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802925
14115	NC_017459	ATG	2	6	661822	661827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802925
14116	NC_017459	ACGA	2	8	661836	661843	50 %	0 %	25 %	25 %	385802925
14117	NC_017459	GTT	2	6	661863	661868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802925
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14119	NC_017459	GCA	2	6	661911	661916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802925
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14122	NC_017459	GCG	3	9	662271	662279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385802925
14123	NC_017459	TC	4	8	662312	662319	0 %	50 %	0 %	50 %	385802925
14124	NC_017459	CGGTGG	2	12	662342	662353	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	385802925
14125	NC_017459	GGAT	2	8	662394	662401	25 %	25 %	50 %	0 %	385802925
14126	NC_017459	TGA	2	6	662414	662419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802925
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14131	NC_017459	ATG	2	6	662716	662721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802926
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14374	NC_017459	CAT	3	9	672908	672916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802932
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14385	NC_017459	TAC	2	6	673406	673411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14494	NC_017459	GCT	2	6	678585	678590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802936
14495	NC_017459	TAT	2	6	678634	678639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802936
14496	NC_017459	TGA	2	6	678651	678656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802936
14497	NC_017459	TGG	2	6	678679	678684	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802936
14498	NC_017459	CAGA	2	8	678685	678692	50 %	0 %	25 %	25 %	385802936
14499	NC_017459	ATG	2	6	678703	678708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802936
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