MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloquadratum walsbyi C23 complete genome

Total Repeats: 67781

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13502	NC_017459	CGA	2	6	634691	634696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802897
13503	NC_017459	AG	3	6	634734	634739	50 %	0 %	50 %	0 %	385802897
13504	NC_017459	ACC	2	6	634748	634753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385802897
13505	NC_017459	CAG	2	6	634760	634765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802897
13506	NC_017459	AGT	2	6	634777	634782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802897
13507	NC_017459	ACG	2	6	634851	634856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13508	NC_017459	ACTA	2	8	634865	634872	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13509	NC_017459	AC	3	6	634882	634887	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13510	NC_017459	CTATAT	2	12	634953	634964	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385802898
13511	NC_017459	TGA	2	6	634971	634976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802898
13512	NC_017459	TTG	2	6	635033	635038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802898
13513	NC_017459	GT	3	6	635103	635108	0 %	50 %	50 %	0 %	385802898
13514	NC_017459	CTGT	2	8	635145	635152	0 %	50 %	25 %	25 %	385802898
13515	NC_017459	CAT	2	6	635162	635167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802898
13516	NC_017459	A	6	6	635182	635187	100 %	0 %	0 %	0 %	385802898
13517	NC_017459	T	6	6	635204	635209	0 %	100 %	0 %	0 %	385802898
13518	NC_017459	CAG	2	6	635216	635221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802898
13519	NC_017459	GAA	2	6	635267	635272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802898
13520	NC_017459	TCA	2	6	635411	635416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802898
13521	NC_017459	GA	3	6	635500	635505	50 %	0 %	50 %	0 %	385802898
13522	NC_017459	TAT	2	6	635510	635515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802898
13523	NC_017459	CAT	2	6	635531	635536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802898
13524	NC_017459	TAG	2	6	635762	635767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802898
13525	NC_017459	CGA	3	9	635878	635886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802898
13526	NC_017459	TGA	2	6	635922	635927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802898
13527	NC_017459	CAT	2	6	635937	635942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802898
13528	NC_017459	ATA	2	6	635964	635969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13529	NC_017459	TAC	2	6	636008	636013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13530	NC_017459	TA	3	6	636017	636022	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13531	NC_017459	TCAT	2	8	636059	636066	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13532	NC_017459	CAG	2	6	636070	636075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13533	NC_017459	TA	3	6	636122	636127	50 %	50 %	0 %	0 %	385802899
13534	NC_017459	TACT	2	8	636171	636178	25 %	50 %	0 %	25 %	385802899
13535	NC_017459	CGA	2	6	636200	636205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802899
13536	NC_017459	CGA	2	6	636260	636265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802899
13537	NC_017459	AGT	2	6	636302	636307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802899
13538	NC_017459	AGT	2	6	636341	636346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802899
13539	NC_017459	TGT	2	6	636361	636366	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802899
13540	NC_017459	GTC	2	6	636392	636397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802899
13541	NC_017459	GA	4	8	636414	636421	50 %	0 %	50 %	0 %	385802899
13542	NC_017459	CAA	2	6	636435	636440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802899
13543	NC_017459	GCA	2	6	636476	636481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802899
13544	NC_017459	TAC	2	6	636493	636498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802899
13545	NC_017459	CATG	2	8	636502	636509	25 %	25 %	25 %	25 %	385802899
13546	NC_017459	AAT	2	6	636547	636552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802899
13547	NC_017459	ACC	2	6	636569	636574	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13548	NC_017459	ATG	2	6	636575	636580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13549	NC_017459	AGTACA	2	12	636647	636658	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13550	NC_017459	ATA	2	6	636695	636700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13551	NC_017459	TGA	2	6	636782	636787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802900
13552	NC_017459	CTG	2	6	636811	636816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802900
13553	NC_017459	TGG	2	6	636860	636865	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802900
13554	NC_017459	AAT	2	6	636885	636890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802900
13555	NC_017459	TTTGAT	2	12	636899	636910	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385802900
13556	NC_017459	CGTT	2	8	637097	637104	0 %	50 %	25 %	25 %	385802900
13557	NC_017459	AGC	2	6	637142	637147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802900
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13560	NC_017459	GAA	2	6	637241	637246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802900
13561	NC_017459	GACG	2	8	637276	637283	25 %	0 %	50 %	25 %	385802900
13562	NC_017459	GTT	2	6	637417	637422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802900
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13564	NC_017459	TAT	2	6	637620	637625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13565	NC_017459	CAA	2	6	637626	637631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13566	NC_017459	GC	3	6	637710	637715	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13567	NC_017459	CA	3	6	637723	637728	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13568	NC_017459	AT	4	8	637731	637738	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13569	NC_017459	TCA	2	6	637742	637747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13571	NC_017459	TCG	2	6	637789	637794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13575	NC_017459	TAT	2	6	637895	637900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13576	NC_017459	TTA	2	6	637915	637920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13577	NC_017459	AAAT	2	8	638003	638010	75 %	25 %	0 %	0 %	385802901
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13587	NC_017459	CTG	2	6	638363	638368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802901
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13589	NC_017459	ACAG	2	8	638409	638416	50 %	0 %	25 %	25 %	385802901
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13591	NC_017459	TATC	2	8	638493	638500	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13592	NC_017459	CTT	2	6	638545	638550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13593	NC_017459	AAT	2	6	638691	638696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13598	NC_017459	GAAC	2	8	638926	638933	50 %	0 %	25 %	25 %	385802902
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13600	NC_017459	CCG	2	6	638995	639000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13601	NC_017459	CTG	2	6	639081	639086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13602	NC_017459	TA	4	8	639125	639132	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13603	NC_017459	ACTC	2	8	639172	639179	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13604	NC_017459	TTAAA	2	10	639320	639329	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13605	NC_017459	CGT	2	6	639365	639370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13606	NC_017459	CTC	2	6	639377	639382	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13607	NC_017459	TAT	2	6	639457	639462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13608	NC_017459	TGA	2	6	639590	639595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802903
13609	NC_017459	ATG	2	6	639625	639630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802903
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13612	NC_017459	GCT	2	6	639738	639743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802903
13613	NC_017459	TACA	2	8	639744	639751	50 %	25 %	0 %	25 %	385802903
13614	NC_017459	TCT	2	6	639752	639757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802903
13615	NC_017459	TGA	2	6	639876	639881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802904
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13617	NC_017459	TA	3	6	639937	639942	50 %	50 %	0 %	0 %	385802904
13618	NC_017459	CAG	2	6	639971	639976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802904
13619	NC_017459	A	6	6	639989	639994	100 %	0 %	0 %	0 %	385802904
13620	NC_017459	ATA	2	6	640016	640021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13621	NC_017459	TCA	2	6	640033	640038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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