MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloquadratum walsbyi C23 complete genome

Total Repeats: 67781

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_017459	TCG	2	6	613259	613264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802882
13002	NC_017459	TGACAG	2	12	613288	613299	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385802882
13003	NC_017459	GTC	2	6	613312	613317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802882
13004	NC_017459	CTG	2	6	613487	613492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802882
13005	NC_017459	ATC	2	6	613542	613547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802882
13006	NC_017459	ACGA	2	8	613617	613624	50 %	0 %	25 %	25 %	385802882
13007	NC_017459	GTT	2	6	613654	613659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802882
13008	NC_017459	GAT	2	6	613667	613672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802882
13009	NC_017459	TGG	2	6	613746	613751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802882
13010	NC_017459	ATT	2	6	613876	613881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802882
13011	NC_017459	ATA	2	6	613892	613897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802882
13012	NC_017459	AT	3	6	613913	613918	50 %	50 %	0 %	0 %	385802882
13013	NC_017459	ACT	2	6	613924	613929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802882
13014	NC_017459	TCA	2	6	613981	613986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802882
13015	NC_017459	TCA	2	6	614038	614043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802882
13016	NC_017459	ACC	2	6	614103	614108	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385802882
13017	NC_017459	AGT	2	6	614164	614169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802882
13018	NC_017459	ACG	2	6	614184	614189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802882
13019	NC_017459	GAT	2	6	614232	614237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802882
13020	NC_017459	GACTC	2	10	614264	614273	20 %	20 %	20 %	40 %	385802882
13021	NC_017459	TCAG	2	8	614311	614318	25 %	25 %	25 %	25 %	385802882
13022	NC_017459	CTG	2	6	614369	614374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802882
13023	NC_017459	CAA	2	6	614435	614440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802882
13024	NC_017459	CAC	2	6	614453	614458	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385802882
13025	NC_017459	TGG	2	6	614496	614501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802882
13026	NC_017459	CCA	2	6	614521	614526	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385802882
13027	NC_017459	TCTGTC	2	12	614663	614674	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	385802883
13028	NC_017459	ACG	3	9	614680	614688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802883
13029	NC_017459	CG	3	6	614700	614705	0 %	0 %	50 %	50 %	385802883
13030	NC_017459	TTC	2	6	614710	614715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802883
13031	NC_017459	AGA	2	6	614732	614737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802883
13032	NC_017459	ATC	2	6	614761	614766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802883
13033	NC_017459	TGT	2	6	614777	614782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802883
13034	NC_017459	GGC	2	6	614783	614788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385802883
13035	NC_017459	CAT	2	6	614892	614897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802883
13036	NC_017459	CCG	2	6	614905	614910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385802883
13037	NC_017459	AGC	2	6	614927	614932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802883
13038	NC_017459	TGT	2	6	614948	614953	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802883
13039	NC_017459	CAA	2	6	614988	614993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802883
13040	NC_017459	TGT	2	6	615086	615091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802883
13041	NC_017459	AG	3	6	615097	615102	50 %	0 %	50 %	0 %	385802883
13042	NC_017459	GTT	2	6	615143	615148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802883
13043	NC_017459	TCA	2	6	615152	615157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802883
13044	NC_017459	CAT	2	6	615187	615192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802883
13045	NC_017459	CGGG	2	8	615254	615261	0 %	0 %	75 %	25 %	385802883
13046	NC_017459	CCT	2	6	615309	615314	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385802883
13047	NC_017459	CAC	2	6	615315	615320	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385802883
13048	NC_017459	TTG	2	6	615388	615393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802883
13049	NC_017459	CAC	2	6	615423	615428	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385802883
13050	NC_017459	TCA	2	6	615443	615448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802883
13051	NC_017459	TTG	2	6	615473	615478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802883
13052	NC_017459	ACG	2	6	615595	615600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802883
13053	NC_017459	AATC	2	8	615609	615616	50 %	25 %	0 %	25 %	385802883
13054	NC_017459	CGT	2	6	615658	615663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802883
13055	NC_017459	AGAA	2	8	615676	615683	75 %	0 %	25 %	0 %	385802883
13056	NC_017459	CAT	3	9	615687	615695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802883
13057	NC_017459	CTG	2	6	615759	615764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802883
13058	NC_017459	CAC	2	6	615779	615784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385802884
13059	NC_017459	AAG	2	6	615876	615881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802884
13060	NC_017459	ATC	2	6	615886	615891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802884
13061	NC_017459	CCGC	2	8	615953	615960	0 %	0 %	25 %	75 %	385802884
13062	NC_017459	TGG	2	6	615975	615980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802884
13063	NC_017459	GGC	2	6	616014	616019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385802884
13064	NC_017459	AAT	3	9	616026	616034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802884
13065	NC_017459	GA	4	8	616045	616052	50 %	0 %	50 %	0 %	385802884
13066	NC_017459	AGC	2	6	616134	616139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802884
13067	NC_017459	AAG	2	6	616230	616235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802884
13068	NC_017459	CCA	2	6	616240	616245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385802884
13069	NC_017459	TAAT	2	8	616292	616299	50 %	50 %	0 %	0 %	385802884
13070	NC_017459	AAT	3	9	616297	616305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802884
13071	NC_017459	ACA	2	6	616321	616326	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802884
13072	NC_017459	CAT	2	6	616380	616385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802884
13073	NC_017459	GCA	2	6	616396	616401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802884
13074	NC_017459	ACT	2	6	616407	616412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802884
13075	NC_017459	CAT	2	6	616461	616466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802884
13076	NC_017459	TCA	2	6	616525	616530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802884
13077	NC_017459	CAG	2	6	616595	616600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802884
13078	NC_017459	ATA	2	6	616663	616668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802884
13079	NC_017459	TGGT	2	8	616682	616689	0 %	50 %	50 %	0 %	385802884
13080	NC_017459	ATA	4	12	616732	616743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802884
13081	NC_017459	AG	3	6	616767	616772	50 %	0 %	50 %	0 %	385802884
13082	NC_017459	ATC	2	6	616785	616790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802884
13083	NC_017459	AGA	2	6	616856	616861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802884
13084	NC_017459	AAT	2	6	616864	616869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802884
13085	NC_017459	AAT	2	6	616878	616883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802884
13086	NC_017459	AAT	2	6	616885	616890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802884
13087	NC_017459	TC	3	6	616985	616990	0 %	50 %	0 %	50 %	385802884
13088	NC_017459	CAA	2	6	617066	617071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802884
13089	NC_017459	ACA	2	6	617137	617142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802884
13090	NC_017459	CCA	2	6	617164	617169	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385802884
13091	NC_017459	GCAA	2	8	617191	617198	50 %	0 %	25 %	25 %	385802884
13092	NC_017459	CAA	2	6	617207	617212	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802884
13093	NC_017459	TCA	2	6	617287	617292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802884
13094	NC_017459	GTC	2	6	617296	617301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802884
13095	NC_017459	TG	3	6	617316	617321	0 %	50 %	50 %	0 %	385802884
13096	NC_017459	TGAAT	2	10	617350	617359	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
13097	NC_017459	TA	3	6	617407	617412	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13098	NC_017459	GTA	2	6	617454	617459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13099	NC_017459	CAA	2	6	617514	617519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802885
13100	NC_017459	TG	3	6	617537	617542	0 %	50 %	50 %	0 %	385802885
13101	NC_017459	AAT	2	6	617549	617554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802885
13102	NC_017459	GAT	2	6	617560	617565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802885
13103	NC_017459	AAAGAC	2	12	617569	617580	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	385802885
13104	NC_017459	TCA	2	6	617586	617591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802885
13105	NC_017459	GAA	2	6	617623	617628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802885
13106	NC_017459	CCG	2	6	617678	617683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385802885
13107	NC_017459	GTA	2	6	617715	617720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802885
13108	NC_017459	ATTGC	2	10	617729	617738	20 %	40 %	20 %	20 %	385802885
13109	NC_017459	ATT	2	6	617756	617761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802885
13110	NC_017459	CGT	2	6	617762	617767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802885
13111	NC_017459	CTG	2	6	617826	617831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802885
13112	NC_017459	TGC	2	6	617881	617886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802885
13113	NC_017459	GGA	2	6	617889	617894	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385802885
13114	NC_017459	AAT	2	6	617938	617943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802885
13115	NC_017459	TGC	2	6	617962	617967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802885
13116	NC_017459	ACC	2	6	618064	618069	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385802885
13117	NC_017459	ATC	2	6	618089	618094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802885
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13119	NC_017459	CCA	2	6	618137	618142	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385802885
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13482	NC_017459	CTG	2	6	633954	633959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802896
13483	NC_017459	CAC	2	6	633990	633995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385802896
13484	NC_017459	CTG	2	6	633996	634001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802896
13485	NC_017459	AAC	2	6	634012	634017	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802896
13486	NC_017459	ATA	2	6	634040	634045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802896
13487	NC_017459	GA	3	6	634050	634055	50 %	0 %	50 %	0 %	385802896
13488	NC_017459	CGA	2	6	634073	634078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802896
13489	NC_017459	GA	4	8	634101	634108	50 %	0 %	50 %	0 %	385802896
13490	NC_017459	GTC	2	6	634136	634141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802896
13491	NC_017459	CGA	2	6	634182	634187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802896
13492	NC_017459	CAA	2	6	634233	634238	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802896
13493	NC_017459	CCT	2	6	634268	634273	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385802896
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13495	NC_017459	TCA	2	6	634371	634376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802896
13496	NC_017459	GATTG	2	10	634399	634408	20 %	40 %	40 %	0 %	385802897
13497	NC_017459	C	6	6	634478	634483	0 %	0 %	0 %	100 %	385802897
13498	NC_017459	CAG	2	6	634490	634495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802897
13499	NC_017459	TA	3	6	634496	634501	50 %	50 %	0 %	0 %	385802897
13500	NC_017459	TGCT	2	8	634508	634515	0 %	50 %	25 %	25 %	385802897

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