MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloquadratum walsbyi C23 complete genome

Total Repeats: 67781

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12502	NC_017459	CG	3	6	589586	589591	0 %	0 %	50 %	50 %	385802864
12503	NC_017459	GCT	2	6	589612	589617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802864
12504	NC_017459	GA	3	6	589618	589623	50 %	0 %	50 %	0 %	385802864
12505	NC_017459	CAT	2	6	589655	589660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802864
12506	NC_017459	CGAC	2	8	589675	589682	25 %	0 %	25 %	50 %	385802864
12507	NC_017459	TCA	2	6	589684	589689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802864
12508	NC_017459	GAA	2	6	589721	589726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802864
12509	NC_017459	GACC	2	8	589762	589769	25 %	0 %	25 %	50 %	385802864
12510	NC_017459	GGC	2	6	589830	589835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385802864
12511	NC_017459	TGC	2	6	589836	589841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802864
12512	NC_017459	AAG	2	6	589866	589871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802864
12513	NC_017459	TAA	2	6	589874	589879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802864
12514	NC_017459	TCT	2	6	589951	589956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802864
12515	NC_017459	TGT	2	6	589983	589988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802864
12516	NC_017459	GAGT	2	8	590085	590092	25 %	25 %	50 %	0 %	385802864
12517	NC_017459	CTGT	2	8	590126	590133	0 %	50 %	25 %	25 %	385802864
12518	NC_017459	AAC	2	6	590176	590181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802864
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12520	NC_017459	CGCTCA	2	12	590227	590238	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	385802864
12521	NC_017459	TA	3	6	590334	590339	50 %	50 %	0 %	0 %	385802864
12522	NC_017459	TCGA	2	8	590358	590365	25 %	25 %	25 %	25 %	385802864
12523	NC_017459	TC	3	6	590396	590401	0 %	50 %	0 %	50 %	385802864
12524	NC_017459	TCCA	2	8	590416	590423	25 %	25 %	0 %	50 %	385802864
12525	NC_017459	CAT	2	6	590468	590473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802864
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12528	NC_017459	GCT	2	6	590530	590535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802864
12529	NC_017459	AAC	2	6	590550	590555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802864
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12533	NC_017459	CGT	2	6	590962	590967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802864
12534	NC_017459	GTC	2	6	590968	590973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802864
12535	NC_017459	GCG	2	6	591025	591030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385802864
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12539	NC_017459	A	6	6	591333	591338	100 %	0 %	0 %	0 %	385802864
12540	NC_017459	GTT	2	6	591346	591351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802864
12541	NC_017459	GTC	2	6	591376	591381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802864
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12543	NC_017459	GCATCA	2	12	591442	591453	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385802864
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12545	NC_017459	CGA	2	6	591496	591501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802864
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12550	NC_017459	GTCT	2	8	591735	591742	0 %	50 %	25 %	25 %	385802864
12551	NC_017459	CCG	3	9	591799	591807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12552	NC_017459	ACC	2	6	591843	591848	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12553	NC_017459	TCTCTA	2	12	591883	591894	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12554	NC_017459	TC	3	6	591954	591959	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12555	NC_017459	ACGTT	2	10	591974	591983	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
12556	NC_017459	AAT	2	6	592034	592039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12557	NC_017459	AAT	2	6	592046	592051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12558	NC_017459	GAT	2	6	592065	592070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12559	NC_017459	TTA	2	6	592081	592086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12560	NC_017459	CCG	2	6	592120	592125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385802865
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12577	NC_017459	GTAT	2	8	593003	593010	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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12581	NC_017459	TA	3	6	593304	593309	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12582	NC_017459	GTG	2	6	593376	593381	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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12585	NC_017459	TGCTG	2	10	593594	593603	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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12587	NC_017459	TGTGGA	2	12	593662	593673	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	385802866
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12602	NC_017459	CAA	2	6	594318	594323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802866
12603	NC_017459	CTT	2	6	594398	594403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802866
12604	NC_017459	GGT	2	6	594532	594537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12605	NC_017459	CTCG	2	8	594589	594596	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12606	NC_017459	ATC	2	6	594681	594686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12607	NC_017459	ACT	2	6	594723	594728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12608	NC_017459	TTAC	2	8	594737	594744	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12609	NC_017459	TA	3	6	594790	594795	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12610	NC_017459	TTGC	2	8	594926	594933	0 %	50 %	25 %	25 %	385802867
12611	NC_017459	TTGT	2	8	594956	594963	0 %	75 %	25 %	0 %	385802867
12612	NC_017459	AGT	2	6	594997	595002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802867
12613	NC_017459	TGGA	2	8	595003	595010	25 %	25 %	50 %	0 %	385802867
12614	NC_017459	CGC	2	6	595038	595043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385802867
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12987	NC_017459	TTG	2	6	612484	612489	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802880
12988	NC_017459	TCCA	2	8	612493	612500	25 %	25 %	0 %	50 %	385802880
12989	NC_017459	GCA	2	6	612519	612524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802880
12990	NC_017459	CCTG	2	8	612627	612634	0 %	25 %	25 %	50 %	385802880
12991	NC_017459	GAC	2	6	612652	612657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12992	NC_017459	ATA	2	6	612694	612699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12997	NC_017459	TGA	2	6	612933	612938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802881
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