MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloquadratum walsbyi C23 complete genome

Total Repeats: 67781

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_017459	TACA	2	8	544437	544444	50 %	25 %	0 %	25 %	385802832
11502	NC_017459	TTG	2	6	544475	544480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802832
11503	NC_017459	CTG	2	6	544495	544500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802832
11504	NC_017459	GCA	2	6	544501	544506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802832
11505	NC_017459	ATTC	2	8	544512	544519	25 %	50 %	0 %	25 %	385802832
11506	NC_017459	GTTGCT	2	12	544555	544566	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	385802832
11507	NC_017459	TGC	2	6	544572	544577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802832
11508	NC_017459	A	6	6	544696	544701	100 %	0 %	0 %	0 %	385802832
11509	NC_017459	TCT	2	6	544758	544763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802832
11510	NC_017459	TATT	2	8	544811	544818	25 %	75 %	0 %	0 %	385802832
11511	NC_017459	GTC	2	6	544822	544827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802832
11512	NC_017459	CTC	2	6	544927	544932	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385802832
11513	NC_017459	ATC	2	6	544942	544947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802832
11514	NC_017459	CCT	2	6	544959	544964	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385802832
11515	NC_017459	ATG	2	6	544978	544983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802832
11516	NC_017459	GCA	2	6	545065	545070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802832
11517	NC_017459	TATAA	2	10	545149	545158	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11518	NC_017459	TCAT	2	8	545210	545217	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11519	NC_017459	TGA	2	6	545224	545229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802833
11520	NC_017459	CGA	2	6	545231	545236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802833
11521	NC_017459	TAT	2	6	545272	545277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802833
11522	NC_017459	ACC	3	9	545304	545312	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385802833
11523	NC_017459	CGT	2	6	545360	545365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802833
11524	NC_017459	ATG	2	6	545476	545481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802833
11525	NC_017459	TCAA	2	8	545533	545540	50 %	25 %	0 %	25 %	385802833
11526	NC_017459	CA	3	6	545570	545575	50 %	0 %	0 %	50 %	385802833
11527	NC_017459	GCA	2	6	545627	545632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802833
11528	NC_017459	CAGATT	2	12	545668	545679	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385802833
11529	NC_017459	ACAAT	2	10	545736	545745	60 %	20 %	0 %	20 %	385802833
11530	NC_017459	TCA	2	6	545769	545774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802833
11531	NC_017459	TC	3	6	545810	545815	0 %	50 %	0 %	50 %	385802833
11532	NC_017459	CGT	2	6	545880	545885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802833
11533	NC_017459	GAA	2	6	545978	545983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802833
11534	NC_017459	GAGTG	2	10	546024	546033	20 %	20 %	60 %	0 %	385802833
11535	NC_017459	ACA	2	6	546039	546044	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802833
11536	NC_017459	GTC	2	6	546078	546083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802833
11537	NC_017459	A	6	6	546110	546115	100 %	0 %	0 %	0 %	385802833
11538	NC_017459	CA	3	6	546131	546136	50 %	0 %	0 %	50 %	385802833
11539	NC_017459	ACG	2	6	546147	546152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802833
11540	NC_017459	ACT	2	6	546260	546265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802833
11541	NC_017459	AAT	3	9	546294	546302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802833
11542	NC_017459	CGA	2	6	546321	546326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802833
11543	NC_017459	GACC	2	8	546392	546399	25 %	0 %	25 %	50 %	385802833
11544	NC_017459	CTGG	2	8	546526	546533	0 %	25 %	50 %	25 %	385802833
11545	NC_017459	TG	3	6	546556	546561	0 %	50 %	50 %	0 %	385802833
11546	NC_017459	CA	4	8	546572	546579	50 %	0 %	0 %	50 %	385802833
11547	NC_017459	CAA	2	6	546585	546590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802833
11548	NC_017459	TGG	2	6	546594	546599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802833
11549	NC_017459	TCA	3	9	546617	546625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802833
11550	NC_017459	AC	3	6	546655	546660	50 %	0 %	0 %	50 %	385802833
11551	NC_017459	AATGT	2	10	546841	546850	40 %	40 %	20 %	0 %	385802833
11552	NC_017459	ATT	2	6	546852	546857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802833
11553	NC_017459	CGT	2	6	546897	546902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802833
11554	NC_017459	CGA	2	6	546927	546932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802833
11555	NC_017459	AGC	2	6	546941	546946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802833
11556	NC_017459	ATA	2	6	547060	547065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802833
11557	NC_017459	TC	3	6	547283	547288	0 %	50 %	0 %	50 %	385802833
11558	NC_017459	GACA	2	8	547292	547299	50 %	0 %	25 %	25 %	385802833
11559	NC_017459	ATA	2	6	547321	547326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802833
11560	NC_017459	AACA	2	8	547357	547364	75 %	0 %	0 %	25 %	385802833
11561	NC_017459	CAT	2	6	547424	547429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11562	NC_017459	AAC	2	6	547464	547469	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11563	NC_017459	AAT	2	6	547472	547477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11564	NC_017459	TATAT	2	10	547503	547512	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
11565	NC_017459	GCT	2	6	547566	547571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802834
11566	NC_017459	ATG	2	6	547603	547608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802834
11567	NC_017459	TAA	2	6	547671	547676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802834
11568	NC_017459	CAT	2	6	547697	547702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11569	NC_017459	TAC	2	6	547821	547826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11570	NC_017459	AAT	2	6	547852	547857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11571	NC_017459	GAT	2	6	548018	548023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802835
11572	NC_017459	ATTGA	2	10	548028	548037	40 %	40 %	20 %	0 %	385802835
11573	NC_017459	GTC	2	6	548077	548082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802835
11574	NC_017459	TCCA	2	8	548085	548092	25 %	25 %	0 %	50 %	385802835
11575	NC_017459	AGT	2	6	548097	548102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802835
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11577	NC_017459	ATT	2	6	548205	548210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802835
11578	NC_017459	TCG	2	6	548322	548327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11579	NC_017459	TCA	2	6	548353	548358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11580	NC_017459	GCT	2	6	548393	548398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11581	NC_017459	TGTTCG	2	12	548467	548478	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	385802836
11582	NC_017459	TTG	2	6	548550	548555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802836
11583	NC_017459	CGCT	2	8	548556	548563	0 %	25 %	25 %	50 %	385802836
11584	NC_017459	GCC	2	6	548616	548621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385802836
11585	NC_017459	ATC	2	6	548629	548634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802836
11586	NC_017459	TTCA	2	8	548686	548693	25 %	50 %	0 %	25 %	385802836
11587	NC_017459	AGC	2	6	548701	548706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802836
11588	NC_017459	CAA	2	6	548718	548723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802836
11589	NC_017459	ATG	2	6	548732	548737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802836
11590	NC_017459	TTG	2	6	548805	548810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802836
11591	NC_017459	TCA	2	6	548850	548855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11592	NC_017459	ATC	2	6	548863	548868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802837
11593	NC_017459	TGA	2	6	548870	548875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802837
11594	NC_017459	TACG	2	8	549013	549020	25 %	25 %	25 %	25 %	385802837
11595	NC_017459	T	6	6	549026	549031	0 %	100 %	0 %	0 %	385802837
11596	NC_017459	CAT	2	6	549104	549109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802837
11597	NC_017459	ACTC	2	8	549200	549207	25 %	25 %	0 %	50 %	385802837
11598	NC_017459	ACG	2	6	549210	549215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802837
11599	NC_017459	GTC	2	6	549276	549281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802837
11600	NC_017459	AGC	2	6	549285	549290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802837
11601	NC_017459	CATCA	2	10	549300	549309	40 %	20 %	0 %	40 %	385802837
11602	NC_017459	TCA	2	6	549331	549336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802837
11603	NC_017459	AAT	2	6	549396	549401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802837
11604	NC_017459	TCA	3	9	549442	549450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802838
11605	NC_017459	GAG	2	6	549460	549465	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385802838
11606	NC_017459	GTA	2	6	549483	549488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802838
11607	NC_017459	AAT	2	6	549523	549528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802838
11608	NC_017459	TCA	3	9	549598	549606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802838
11609	NC_017459	CAAT	2	8	549635	549642	50 %	25 %	0 %	25 %	385802838
11610	NC_017459	AGG	2	6	549659	549664	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385802838
11611	NC_017459	TTA	2	6	549778	549783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11612	NC_017459	AT	4	8	549787	549794	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11613	NC_017459	ATG	2	6	549814	549819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11614	NC_017459	TA	3	6	549826	549831	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11615	NC_017459	CAT	2	6	549866	549871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11616	NC_017459	CAAT	2	8	549916	549923	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11617	NC_017459	ATG	3	9	549933	549941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11618	NC_017459	TGG	2	6	549954	549959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11619	NC_017459	GAC	2	6	549967	549972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11621	NC_017459	TGG	2	6	550081	550086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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11983	NC_017459	GAA	2	6	566283	566288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802852
11984	NC_017459	TCA	2	6	566320	566325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802852
11985	NC_017459	TAA	2	6	566331	566336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802852
11986	NC_017459	GTC	2	6	566349	566354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802852
11987	NC_017459	TGC	2	6	566427	566432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802852
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11990	NC_017459	GA	3	6	566528	566533	50 %	0 %	50 %	0 %	385802852
11991	NC_017459	TGA	2	6	566574	566579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802852
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11993	NC_017459	CAA	2	6	566666	566671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802852
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11998	NC_017459	TGA	2	6	566972	566977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802852
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