MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloquadratum walsbyi C23 complete genome

Total Repeats: 67781

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9501	NC_017459	CAT	2	6	451235	451240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9502	NC_017459	TCA	2	6	451264	451269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9503	NC_017459	ACC	2	6	451299	451304	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9504	NC_017459	GTG	2	6	451391	451396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9505	NC_017459	TAT	2	6	451420	451425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9506	NC_017459	CAG	2	6	451442	451447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9507	NC_017459	CAGA	2	8	451484	451491	50 %	0 %	25 %	25 %	385802749
9508	NC_017459	AC	3	6	451492	451497	50 %	0 %	0 %	50 %	385802749
9509	NC_017459	CAC	2	6	451521	451526	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385802749
9510	NC_017459	TTA	2	6	451544	451549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802749
9511	NC_017459	TCC	2	6	451556	451561	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385802749
9512	NC_017459	TCA	2	6	451619	451624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802749
9513	NC_017459	CATA	2	8	451713	451720	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9514	NC_017459	CTG	3	9	451740	451748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9515	NC_017459	CAT	2	6	451749	451754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9516	NC_017459	ATTT	2	8	451763	451770	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9517	NC_017459	CA	3	6	451783	451788	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9518	NC_017459	CGA	2	6	451819	451824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802750
9519	NC_017459	CG	3	6	451840	451845	0 %	0 %	50 %	50 %	385802750
9520	NC_017459	CTT	2	6	451864	451869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802750
9521	NC_017459	ACCTGA	3	18	451913	451930	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385802750
9522	NC_017459	CCCAGA	3	18	451931	451948	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	385802750
9523	NC_017459	GCAT	2	8	451964	451971	25 %	25 %	25 %	25 %	385802750
9524	NC_017459	TCG	2	6	451987	451992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802750
9525	NC_017459	TGG	2	6	452036	452041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802750
9526	NC_017459	TTG	2	6	452077	452082	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802750
9527	NC_017459	TTCG	2	8	452091	452098	0 %	50 %	25 %	25 %	385802750
9528	NC_017459	TGAGAC	2	12	452267	452278	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385802750
9529	NC_017459	AAC	2	6	452501	452506	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9530	NC_017459	CTA	2	6	452588	452593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9531	NC_017459	GCC	2	6	452630	452635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9532	NC_017459	CTC	2	6	452648	452653	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9533	NC_017459	CAG	2	6	452928	452933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9534	NC_017459	GTT	2	6	452942	452947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9535	NC_017459	AAT	2	6	453020	453025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9536	NC_017459	GTT	2	6	453089	453094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9537	NC_017459	CGA	2	6	453158	453163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9538	NC_017459	GTCC	2	8	453173	453180	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9539	NC_017459	AGTC	2	8	453203	453210	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9540	NC_017459	GAC	2	6	453293	453298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9541	NC_017459	ACA	2	6	453327	453332	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9542	NC_017459	ACC	2	6	453372	453377	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9543	NC_017459	CCCG	2	8	453384	453391	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
9544	NC_017459	GAA	2	6	453496	453501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9545	NC_017459	TCAC	2	8	453556	453563	25 %	25 %	0 %	50 %	385802751
9546	NC_017459	TG	3	6	453607	453612	0 %	50 %	50 %	0 %	385802751
9547	NC_017459	TGA	2	6	453646	453651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802751
9548	NC_017459	TCA	2	6	453679	453684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802751
9549	NC_017459	CAG	2	6	453692	453697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802751
9550	NC_017459	CAA	2	6	453716	453721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802751
9551	NC_017459	AGC	3	9	453732	453740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802751
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9553	NC_017459	GAT	2	6	453962	453967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802751
9554	NC_017459	TA	3	6	454007	454012	50 %	50 %	0 %	0 %	385802751
9555	NC_017459	GA	3	6	454159	454164	50 %	0 %	50 %	0 %	385802751
9556	NC_017459	GCG	2	6	454181	454186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385802751
9557	NC_017459	CAT	2	6	454196	454201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802751
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9559	NC_017459	A	6	6	454250	454255	100 %	0 %	0 %	0 %	385802751
9560	NC_017459	TCA	2	6	454276	454281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802751
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9564	NC_017459	GAA	2	6	454514	454519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802751
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9567	NC_017459	TCGT	2	8	454755	454762	0 %	50 %	25 %	25 %	385802751
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9577	NC_017459	GA	3	6	455280	455285	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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9581	NC_017459	TCGT	2	8	455502	455509	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9582	NC_017459	TCAC	2	8	455511	455518	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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9597	NC_017459	C	6	6	455991	455996	0 %	0 %	0 %	100 %	385802752
9598	NC_017459	CAG	2	6	456062	456067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802752
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9612	NC_017459	CAA	2	6	456491	456496	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802752
9613	NC_017459	CAT	2	6	456497	456502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802752
9614	NC_017459	TCG	2	6	456540	456545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802752
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9618	NC_017459	GTGA	2	8	456670	456677	25 %	25 %	50 %	0 %	385802752
9619	NC_017459	TG	3	6	456699	456704	0 %	50 %	50 %	0 %	385802752
9620	NC_017459	GATGT	2	10	456801	456810	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
9621	NC_017459	AGT	2	6	456852	456857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802753
9622	NC_017459	GTT	2	6	456928	456933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802753
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9995	NC_017459	TAA	2	6	473171	473176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9996	NC_017459	TCG	2	6	473194	473199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9997	NC_017459	TCG	2	6	473203	473208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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