MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloquadratum walsbyi C23 complete genome

Total Repeats: 67781

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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9002	NC_017459	TGTT	2	8	426185	426192	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
9003	NC_017459	ATG	2	6	426274	426279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9004	NC_017459	AATCG	2	10	426291	426300	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
9005	NC_017459	TC	3	6	426302	426307	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9006	NC_017459	GCA	2	6	426325	426330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9007	NC_017459	T	6	6	426344	426349	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9008	NC_017459	CT	3	6	426360	426365	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9009	NC_017459	ATA	2	6	426410	426415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9010	NC_017459	TC	3	6	426425	426430	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9011	NC_017459	GGA	2	6	426476	426481	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9012	NC_017459	CGG	2	6	426541	426546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9013	NC_017459	GAA	2	6	426607	426612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9014	NC_017459	CGA	3	9	426635	426643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802726
9015	NC_017459	CAA	2	6	426711	426716	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802726
9016	NC_017459	GCTT	2	8	426727	426734	0 %	50 %	25 %	25 %	385802726
9017	NC_017459	CAGTTG	2	12	426840	426851	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
9018	NC_017459	ATT	2	6	426864	426869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9019	NC_017459	TTC	2	6	426890	426895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9020	NC_017459	ACC	2	6	426901	426906	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9021	NC_017459	TA	3	6	426910	426915	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9022	NC_017459	AACG	2	8	426933	426940	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
9023	NC_017459	TAAC	2	8	427001	427008	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9024	NC_017459	TC	3	6	427025	427030	0 %	50 %	0 %	50 %	385802727
9025	NC_017459	GCACC	2	10	427052	427061	20 %	0 %	20 %	60 %	385802727
9026	NC_017459	ATAA	2	8	427137	427144	75 %	25 %	0 %	0 %	385802727
9027	NC_017459	GTT	2	6	427158	427163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802727
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9029	NC_017459	GCA	2	6	427311	427316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802727
9030	NC_017459	TGA	2	6	427351	427356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9031	NC_017459	ATT	2	6	427367	427372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9032	NC_017459	TAG	2	6	427387	427392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9033	NC_017459	GT	4	8	427426	427433	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9034	NC_017459	TG	3	6	427500	427505	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9035	NC_017459	CATC	2	8	427509	427516	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
9036	NC_017459	TAT	2	6	427535	427540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802728
9037	NC_017459	GCA	2	6	427572	427577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802728
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9039	NC_017459	GGT	2	6	427647	427652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802728
9040	NC_017459	GC	3	6	427721	427726	0 %	0 %	50 %	50 %	385802728
9041	NC_017459	GTT	2	6	427809	427814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802728
9042	NC_017459	CCG	2	6	427819	427824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385802728
9043	NC_017459	TCA	2	6	427901	427906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802728
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9045	NC_017459	GTCT	2	8	427926	427933	0 %	50 %	25 %	25 %	385802728
9046	NC_017459	ATC	2	6	427969	427974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802728
9047	NC_017459	GTC	2	6	427975	427980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802728
9048	NC_017459	TGGA	2	8	428051	428058	25 %	25 %	50 %	0 %	385802728
9049	NC_017459	TGG	2	6	428066	428071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802728
9050	NC_017459	TGT	2	6	428123	428128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802728
9051	NC_017459	GGAT	2	8	428134	428141	25 %	25 %	50 %	0 %	385802728
9052	NC_017459	TTTTCA	2	12	428142	428153	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385802728
9053	NC_017459	TGT	2	6	428198	428203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802728
9054	NC_017459	TGG	2	6	428300	428305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802728
9055	NC_017459	CAA	2	6	428344	428349	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802728
9056	NC_017459	GTG	2	6	428362	428367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802728
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9058	NC_017459	GACA	2	8	428452	428459	50 %	0 %	25 %	25 %	385802728
9059	NC_017459	CTG	2	6	428476	428481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802728
9060	NC_017459	TGA	3	9	428525	428533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802728
9061	NC_017459	CGT	2	6	428618	428623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802728
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9063	NC_017459	TGC	2	6	428714	428719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802728
9064	NC_017459	GCA	2	6	428811	428816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802728
9065	NC_017459	CAA	2	6	428896	428901	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802728
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9067	NC_017459	GGA	2	6	429162	429167	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9068	NC_017459	CCCACC	2	12	429201	429212	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
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9070	NC_017459	GTT	2	6	429241	429246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9071	NC_017459	GGCGGG	4	24	429257	429280	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
9072	NC_017459	CTG	2	6	429286	429291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9073	NC_017459	GCC	2	6	429302	429307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9074	NC_017459	TACTCC	2	12	429310	429321	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
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9081	NC_017459	ATGT	2	8	429601	429608	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9082	NC_017459	ACA	2	6	429631	429636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9083	NC_017459	AATTC	2	10	429703	429712	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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9087	NC_017459	GATTG	2	10	429905	429914	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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9098	NC_017459	CG	3	6	430236	430241	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9099	NC_017459	CAG	2	6	430307	430312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802730
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9108	NC_017459	C	7	7	430801	430807	0 %	0 %	0 %	100 %	385802730
9109	NC_017459	GGT	2	6	430816	430821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802730
9110	NC_017459	ATG	2	6	430847	430852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802730
9111	NC_017459	TGC	2	6	430875	430880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802730
9112	NC_017459	CG	3	6	430909	430914	0 %	0 %	50 %	50 %	385802730
9113	NC_017459	ATC	2	6	430995	431000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9114	NC_017459	TTA	2	6	431002	431007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9115	NC_017459	AGTATC	3	18	431066	431083	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385802731
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9117	NC_017459	CAC	2	6	431230	431235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385802731
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9119	NC_017459	CGAG	2	8	431322	431329	25 %	0 %	50 %	25 %	385802731
9120	NC_017459	CGA	2	6	431470	431475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802731
9121	NC_017459	CTCAG	2	10	431535	431544	20 %	20 %	20 %	40 %	385802731
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9124	NC_017459	GTCT	2	8	431627	431634	0 %	50 %	25 %	25 %	385802731
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