MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloquadratum walsbyi C23 complete genome

Total Repeats: 67781

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_017459	GGAA	2	8	305114	305121	50 %	0 %	50 %	0 %	385802622
6502	NC_017459	AAC	2	6	305148	305153	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802622
6503	NC_017459	CAA	2	6	305158	305163	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802622
6504	NC_017459	TAC	2	6	305178	305183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802622
6505	NC_017459	TCGGC	2	10	305216	305225	0 %	20 %	40 %	40 %	385802622
6506	NC_017459	GAA	2	6	305230	305235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802622
6507	NC_017459	TGC	2	6	305274	305279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802622
6508	NC_017459	GACG	2	8	305355	305362	25 %	0 %	50 %	25 %	385802622
6509	NC_017459	GAGT	2	8	305371	305378	25 %	25 %	50 %	0 %	385802622
6510	NC_017459	TATG	2	8	305477	305484	25 %	50 %	25 %	0 %	385802623
6511	NC_017459	TGG	2	6	305516	305521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802623
6512	NC_017459	TGA	2	6	305624	305629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802623
6513	NC_017459	AAT	2	6	305643	305648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802623
6514	NC_017459	TGA	2	6	305651	305656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802623
6515	NC_017459	CT	3	6	305670	305675	0 %	50 %	0 %	50 %	385802623
6516	NC_017459	GTT	2	6	305733	305738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802623
6517	NC_017459	GTG	2	6	305761	305766	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802623
6518	NC_017459	CGG	2	6	305823	305828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385802623
6519	NC_017459	CTTC	2	8	305844	305851	0 %	50 %	0 %	50 %	385802623
6520	NC_017459	GTGA	2	8	305907	305914	25 %	25 %	50 %	0 %	385802623
6521	NC_017459	CGA	2	6	305918	305923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802623
6522	NC_017459	T	6	6	305979	305984	0 %	100 %	0 %	0 %	385802623
6523	NC_017459	TGC	2	6	306065	306070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802623
6524	NC_017459	GAG	2	6	306072	306077	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385802623
6525	NC_017459	GAA	2	6	306129	306134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802623
6526	NC_017459	CAC	2	6	306212	306217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385802623
6527	NC_017459	AGCA	2	8	306226	306233	50 %	0 %	25 %	25 %	385802623
6528	NC_017459	TAC	2	6	306314	306319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6529	NC_017459	TA	3	6	306357	306362	50 %	50 %	0 %	0 %	385802624
6530	NC_017459	ATGA	2	8	306369	306376	50 %	25 %	25 %	0 %	385802624
6531	NC_017459	CAG	2	6	306439	306444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802624
6532	NC_017459	ACG	2	6	306453	306458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802624
6533	NC_017459	TGA	2	6	306482	306487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802624
6534	NC_017459	TTG	2	6	306493	306498	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802624
6535	NC_017459	TGTC	2	8	306578	306585	0 %	50 %	25 %	25 %	385802624
6536	NC_017459	CTGA	2	8	306696	306703	25 %	25 %	25 %	25 %	385802624
6537	NC_017459	AATG	2	8	306705	306712	50 %	25 %	25 %	0 %	385802624
6538	NC_017459	TTC	2	6	306752	306757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802624
6539	NC_017459	CTT	2	6	306844	306849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6540	NC_017459	ACA	2	6	306874	306879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6541	NC_017459	T	6	6	306880	306885	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6542	NC_017459	A	7	7	306972	306978	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6543	NC_017459	TAG	2	6	306979	306984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6544	NC_017459	CGG	2	6	307026	307031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6545	NC_017459	ATCCC	2	10	307044	307053	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
6546	NC_017459	TGT	2	6	307101	307106	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6547	NC_017459	AAG	2	6	307150	307155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802625
6548	NC_017459	AATTGG	2	12	307198	307209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802625
6549	NC_017459	CCA	2	6	307298	307303	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385802625
6550	NC_017459	A	6	6	307324	307329	100 %	0 %	0 %	0 %	385802625
6551	NC_017459	TTG	2	6	307338	307343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802625
6552	NC_017459	TCGT	2	8	307381	307388	0 %	50 %	25 %	25 %	385802625
6553	NC_017459	AAT	2	6	307405	307410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802625
6554	NC_017459	TCA	2	6	307442	307447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802625
6555	NC_017459	GTC	2	6	307478	307483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802625
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6557	NC_017459	CGAAT	2	10	307530	307539	40 %	20 %	20 %	20 %	385802625
6558	NC_017459	A	6	6	307545	307550	100 %	0 %	0 %	0 %	385802625
6559	NC_017459	CACGAC	3	18	307572	307589	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	385802625
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6561	NC_017459	TCAGCC	3	18	307654	307671	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	385802626
6562	NC_017459	CT	3	6	307697	307702	0 %	50 %	0 %	50 %	385802626
6563	NC_017459	TGA	3	9	307752	307760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802626
6564	NC_017459	AAG	2	6	307776	307781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802626
6565	NC_017459	CTGC	2	8	307997	308004	0 %	25 %	25 %	50 %	385802626
6566	NC_017459	TCA	2	6	308056	308061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802626
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6572	NC_017459	GTT	2	6	308278	308283	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802626
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6580	NC_017459	GCAATT	2	12	308461	308472	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385802626
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6583	NC_017459	AAG	2	6	308534	308539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802626
6584	NC_017459	TG	3	6	308584	308589	0 %	50 %	50 %	0 %	385802626
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6587	NC_017459	A	6	6	308694	308699	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6588	NC_017459	ATA	2	6	308728	308733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6589	NC_017459	AT	3	6	308843	308848	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6590	NC_017459	AGCA	2	8	308888	308895	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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6595	NC_017459	CGA	2	6	309276	309281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802627
6596	NC_017459	TCG	2	6	309307	309312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802627
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6601	NC_017459	TAT	2	6	309471	309476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802627
6602	NC_017459	CAA	2	6	309490	309495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802627
6603	NC_017459	CTT	2	6	309498	309503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802627
6604	NC_017459	ACC	2	6	309521	309526	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385802627
6605	NC_017459	GTG	2	6	309595	309600	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802627
6606	NC_017459	CG	3	6	309623	309628	0 %	0 %	50 %	50 %	385802627
6607	NC_017459	CTTT	2	8	309652	309659	0 %	75 %	0 %	25 %	385802627
6608	NC_017459	GCC	2	6	309687	309692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385802627
6609	NC_017459	GCTTC	2	10	309705	309714	0 %	40 %	20 %	40 %	385802627
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6611	NC_017459	A	6	6	309960	309965	100 %	0 %	0 %	0 %	385802627
6612	NC_017459	CGA	2	6	309966	309971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802627
6613	NC_017459	CCG	2	6	310006	310011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385802627
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6615	NC_017459	TTG	2	6	310078	310083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802627
6616	NC_017459	ACT	2	6	310103	310108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802627
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6618	NC_017459	TAT	2	6	310167	310172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802627
6619	NC_017459	TGGA	2	8	310187	310194	25 %	25 %	50 %	0 %	385802627
6620	NC_017459	GCA	2	6	310239	310244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802627
6621	NC_017459	TAT	2	6	310352	310357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802627
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6623	NC_017459	CTG	2	6	310446	310451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802627
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6969	NC_017459	AT	3	6	326012	326017	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6975	NC_017459	GAATAA	2	12	326218	326229	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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6980	NC_017459	A	6	6	326591	326596	100 %	0 %	0 %	0 %	385802642
6981	NC_017459	TAT	3	9	326598	326606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802642
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6985	NC_017459	AC	3	6	326782	326787	50 %	0 %	0 %	50 %	385802642
6986	NC_017459	CAG	2	6	326854	326859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802642
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6989	NC_017459	CGT	2	6	327288	327293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802642
6990	NC_017459	AGC	2	6	327407	327412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802642
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6992	NC_017459	TGA	2	6	327476	327481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802642
6993	NC_017459	CGA	2	6	327488	327493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802642
6994	NC_017459	CA	3	6	327497	327502	50 %	0 %	0 %	50 %	385802642
6995	NC_017459	TTGA	2	8	327504	327511	25 %	50 %	25 %	0 %	385802642
6996	NC_017459	GAT	2	6	327519	327524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802642
6997	NC_017459	TAC	2	6	327533	327538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802642
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6999	NC_017459	TCC	2	6	327559	327564	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385802642
7000	NC_017459	TGA	3	9	327575	327583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802642

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