MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloquadratum walsbyi C23 complete genome

Total Repeats: 67781

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_017459	TACA	2	8	281679	281686	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6002	NC_017459	TTA	2	6	281693	281698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6003	NC_017459	TCT	2	6	281736	281741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6004	NC_017459	TCA	2	6	281782	281787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6005	NC_017459	CAT	2	6	281788	281793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6006	NC_017459	A	6	6	281804	281809	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6007	NC_017459	CTT	2	6	281892	281897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6008	NC_017459	AGC	2	6	281924	281929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6009	NC_017459	TATT	2	8	281932	281939	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6010	NC_017459	GTC	2	6	282056	282061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802600
6011	NC_017459	GTG	2	6	282103	282108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802600
6012	NC_017459	CGA	2	6	282172	282177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802600
6013	NC_017459	GA	3	6	282192	282197	50 %	0 %	50 %	0 %	385802600
6014	NC_017459	CAT	2	6	282238	282243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802600
6015	NC_017459	A	6	6	282292	282297	100 %	0 %	0 %	0 %	385802600
6016	NC_017459	TGA	2	6	282298	282303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802600
6017	NC_017459	CATTGC	2	12	282359	282370	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385802600
6018	NC_017459	ATC	2	6	282489	282494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802600
6019	NC_017459	GAC	2	6	282497	282502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802600
6020	NC_017459	AATG	2	8	282506	282513	50 %	25 %	25 %	0 %	385802600
6021	NC_017459	CTA	2	6	282622	282627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802600
6022	NC_017459	AGA	2	6	282739	282744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802600
6023	NC_017459	AGA	2	6	282792	282797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802600
6024	NC_017459	ATG	2	6	282818	282823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802600
6025	NC_017459	ATC	2	6	282858	282863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802600
6026	NC_017459	ACA	2	6	282975	282980	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802600
6027	NC_017459	TAGAT	2	10	282981	282990	40 %	40 %	20 %	0 %	385802600
6028	NC_017459	AGTG	2	8	283004	283011	25 %	25 %	50 %	0 %	385802600
6029	NC_017459	GTA	2	6	283078	283083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6030	NC_017459	CTAT	2	8	283175	283182	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6031	NC_017459	AAT	2	6	283237	283242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6032	NC_017459	TGT	2	6	283244	283249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6033	NC_017459	TC	3	6	283287	283292	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6034	NC_017459	CAT	2	6	283331	283336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6035	NC_017459	CAA	2	6	283366	283371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6036	NC_017459	TTC	2	6	283421	283426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6037	NC_017459	ATA	2	6	283431	283436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6038	NC_017459	TAA	2	6	283454	283459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6039	NC_017459	TC	3	6	283477	283482	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6040	NC_017459	GA	3	6	283555	283560	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6041	NC_017459	AGA	2	6	283580	283585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6042	NC_017459	GGCG	2	8	283618	283625	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6043	NC_017459	TTG	2	6	283696	283701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802601
6044	NC_017459	GAC	2	6	283919	283924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802601
6045	NC_017459	CGT	2	6	283930	283935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802601
6046	NC_017459	TCT	2	6	283949	283954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802601
6047	NC_017459	CGA	2	6	283979	283984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802601
6048	NC_017459	CTC	2	6	283987	283992	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385802601
6049	NC_017459	TCA	2	6	284018	284023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802601
6050	NC_017459	CAG	2	6	284046	284051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802601
6051	NC_017459	CT	3	6	284070	284075	0 %	50 %	0 %	50 %	385802601
6052	NC_017459	CTC	2	6	284367	284372	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385802601
6053	NC_017459	CGA	2	6	284412	284417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802601
6054	NC_017459	GAC	2	6	284428	284433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802601
6055	NC_017459	ACA	2	6	284474	284479	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802601
6056	NC_017459	TGA	2	6	284522	284527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802601
6057	NC_017459	ACGA	2	8	284563	284570	50 %	0 %	25 %	25 %	385802601
6058	NC_017459	TCGT	2	8	284588	284595	0 %	50 %	25 %	25 %	385802601
6059	NC_017459	GAGT	2	8	284629	284636	25 %	25 %	50 %	0 %	385802601
6060	NC_017459	AAC	2	6	284698	284703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802601
6061	NC_017459	TCG	2	6	284786	284791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802601
6062	NC_017459	AGC	2	6	284792	284797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802601
6063	NC_017459	CGA	2	6	284814	284819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802601
6064	NC_017459	TCT	2	6	284855	284860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802601
6065	NC_017459	TA	3	6	284928	284933	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6066	NC_017459	ATA	2	6	284950	284955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6067	NC_017459	TTGC	2	8	284992	284999	0 %	50 %	25 %	25 %	385802602
6068	NC_017459	GCA	2	6	285006	285011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802602
6069	NC_017459	TTG	2	6	285013	285018	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802602
6070	NC_017459	ATC	2	6	285107	285112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802602
6071	NC_017459	AAT	2	6	285163	285168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802602
6072	NC_017459	CTG	2	6	285169	285174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802602
6073	NC_017459	GAA	2	6	285184	285189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802602
6074	NC_017459	AGC	2	6	285245	285250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802602
6075	NC_017459	GTT	2	6	285312	285317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802602
6076	NC_017459	TTTCA	2	10	285365	285374	20 %	60 %	0 %	20 %	385802602
6077	NC_017459	CAT	2	6	285508	285513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802602
6078	NC_017459	CAG	2	6	285517	285522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802602
6079	NC_017459	CTG	2	6	285577	285582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802602
6080	NC_017459	CGA	2	6	285618	285623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802602
6081	NC_017459	TCA	2	6	285657	285662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802602
6082	NC_017459	CTG	2	6	285760	285765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802602
6083	NC_017459	GAT	2	6	285823	285828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802602
6084	NC_017459	TCCATC	2	12	285863	285874	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	385802602
6085	NC_017459	GTT	3	9	285906	285914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802602
6086	NC_017459	ATG	2	6	285925	285930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802602
6087	NC_017459	CGC	2	6	285933	285938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385802602
6088	NC_017459	TAA	2	6	285988	285993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802602
6089	NC_017459	TCA	2	6	286005	286010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802602
6090	NC_017459	CCA	2	6	286089	286094	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385802602
6091	NC_017459	ATC	2	6	286139	286144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802602
6092	NC_017459	CGT	2	6	286188	286193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802602
6093	NC_017459	TCAAT	2	10	286345	286354	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
6094	NC_017459	AT	3	6	286353	286358	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6095	NC_017459	T	7	7	286483	286489	0 %	100 %	0 %	0 %	385802603
6096	NC_017459	GCA	2	6	286509	286514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802603
6097	NC_017459	AGC	4	12	286520	286531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802603
6098	NC_017459	GA	3	6	286554	286559	50 %	0 %	50 %	0 %	385802603
6099	NC_017459	TGT	2	6	286574	286579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802603
6100	NC_017459	AAT	2	6	286583	286588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802603
6101	NC_017459	CTT	2	6	286609	286614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802603
6102	NC_017459	GA	3	6	286693	286698	50 %	0 %	50 %	0 %	385802603
6103	NC_017459	CTT	2	6	286777	286782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802603
6104	NC_017459	GGC	2	6	286790	286795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385802603
6105	NC_017459	TCG	2	6	286859	286864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802603
6106	NC_017459	TTG	3	9	287071	287079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802603
6107	NC_017459	GTC	2	6	287106	287111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802603
6108	NC_017459	CGCC	2	8	287156	287163	0 %	0 %	25 %	75 %	385802603
6109	NC_017459	CTT	2	6	287188	287193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802603
6110	NC_017459	ACG	2	6	287196	287201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802603
6111	NC_017459	GTC	2	6	287255	287260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802603
6112	NC_017459	CGTT	2	8	287333	287340	0 %	50 %	25 %	25 %	385802603
6113	NC_017459	TGAG	2	8	287443	287450	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6114	NC_017459	TAA	2	6	287520	287525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6115	NC_017459	ACC	2	6	287542	287547	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6116	NC_017459	AGGC	2	8	287637	287644	25 %	0 %	50 %	25 %	385802604
6117	NC_017459	GC	3	6	287683	287688	0 %	0 %	50 %	50 %	385802604
6118	NC_017459	GCG	2	6	287699	287704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385802604
6119	NC_017459	ATG	2	6	287718	287723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802604
6120	NC_017459	GTT	3	9	287729	287737	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802604
6121	NC_017459	TGA	2	6	287752	287757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802604
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6123	NC_017459	CGG	2	6	287838	287843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385802604
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6232	NC_017459	ATAGC	2	10	293020	293029	40 %	20 %	20 %	20 %	385802611
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6241	NC_017459	TAGTG	2	10	293403	293412	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
6242	NC_017459	TAAT	2	8	293464	293471	50 %	50 %	0 %	0 %	385802612
6243	NC_017459	GCA	2	6	293480	293485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802612
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6246	NC_017459	CTGT	2	8	293583	293590	0 %	50 %	25 %	25 %	385802612
6247	NC_017459	TCG	2	6	293602	293607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802612
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6311	NC_017459	TGA	2	6	296469	296474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802614
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6357	NC_017459	ATA	2	6	298567	298572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6358	NC_017459	CA	3	6	298583	298588	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6359	NC_017459	CCAT	2	8	298597	298604	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6360	NC_017459	TTC	2	6	298625	298630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6361	NC_017459	TA	3	6	298717	298722	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6362	NC_017459	TCA	2	6	298773	298778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6363	NC_017459	GAG	2	6	298786	298791	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6364	NC_017459	ATTA	2	8	298812	298819	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6365	NC_017459	TTTCG	2	10	298828	298837	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
6366	NC_017459	TCA	2	6	299000	299005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802617
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6485	NC_017459	ATA	2	6	304323	304328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6487	NC_017459	TTC	2	6	304400	304405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6489	NC_017459	ATT	2	6	304572	304577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802622
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6491	NC_017459	CAG	3	9	304604	304612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802622
6492	NC_017459	TCA	2	6	304618	304623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802622
6493	NC_017459	ATCC	2	8	304649	304656	25 %	25 %	0 %	50 %	385802622
6494	NC_017459	TGA	2	6	304743	304748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802622
6495	NC_017459	TAT	2	6	304749	304754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802622
6496	NC_017459	GATACC	2	12	304852	304863	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385802622
6497	NC_017459	TGA	2	6	304869	304874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802622
6498	NC_017459	TTG	2	6	304934	304939	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802622
6499	NC_017459	CTA	2	6	304982	304987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802622
6500	NC_017459	CTCA	2	8	305091	305098	25 %	25 %	0 %	50 %	385802622

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