MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haemophilus influenzae R2846 chromosome

Total Repeats: 38718

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_017452	T	6	6	195501	195506	0 %	100 %	0 %	0 %	386265221
4003	NC_017452	TTTTAG	2	12	195515	195526	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	386265221
4004	NC_017452	TAT	2	6	195552	195557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386265221
4005	NC_017452	AAG	2	6	195689	195694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386265221
4006	NC_017452	AGA	2	6	195702	195707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386265221
4007	NC_017452	ATA	3	9	195746	195754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386265221
4008	NC_017452	TAG	2	6	195764	195769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386265221
4009	NC_017452	AAG	2	6	195779	195784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386265221
4010	NC_017452	GAA	2	6	195793	195798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386265221
4011	NC_017452	AAT	2	6	195892	195897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386265222
4012	NC_017452	AAAG	2	8	195903	195910	75 %	0 %	25 %	0 %	386265222
4013	NC_017452	GGA	2	6	196006	196011	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386265222
4014	NC_017452	TTG	2	6	196043	196048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386265222
4015	NC_017452	GCT	2	6	196060	196065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386265222
4016	NC_017452	CAA	3	9	196084	196092	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386265222
4017	NC_017452	A	8	8	196091	196098	100 %	0 %	0 %	0 %	386265222
4018	NC_017452	TGT	2	6	196131	196136	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386265222
4019	NC_017452	GAA	2	6	196138	196143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386265222
4020	NC_017452	ACC	2	6	196146	196151	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386265222
4021	NC_017452	AAG	2	6	196163	196168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386265222
4022	NC_017452	CAA	2	6	196180	196185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386265222
4023	NC_017452	AAG	2	6	196199	196204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386265222
4024	NC_017452	AAC	3	9	196277	196285	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386265222
4025	NC_017452	A	7	7	196299	196305	100 %	0 %	0 %	0 %	386265222
4026	NC_017452	CAA	2	6	196306	196311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386265222
4027	NC_017452	AAG	2	6	196325	196330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386265222
4028	NC_017452	AAGC	2	8	196345	196352	50 %	0 %	25 %	25 %	386265222
4029	NC_017452	AGGCTA	2	12	196358	196369	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386265222
4030	NC_017452	GCT	2	6	196423	196428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386265222
4031	NC_017452	GAA	2	6	196444	196449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386265222
4032	NC_017452	TGC	2	6	196476	196481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386265222
4033	NC_017452	GCC	2	6	196543	196548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386265222
4034	NC_017452	GCAAAA	2	12	196579	196590	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	386265222
4035	NC_017452	GCT	2	6	196618	196623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386265222
4036	NC_017452	GCT	2	6	196639	196644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386265222
4037	NC_017452	CAAG	2	8	196669	196676	50 %	0 %	25 %	25 %	386265222
4038	NC_017452	GAT	2	6	196681	196686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386265222
4039	NC_017452	TGG	2	6	196707	196712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386265222
4040	NC_017452	TGC	2	6	196767	196772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386265222
4041	NC_017452	TGG	2	6	196788	196793	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386265222
4042	NC_017452	AAGA	2	8	196825	196832	75 %	0 %	25 %	0 %	386265222
4043	NC_017452	CGT	2	6	196840	196845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386265222
4044	NC_017452	A	6	6	196928	196933	100 %	0 %	0 %	0 %	386265222
4045	NC_017452	TGA	2	6	196944	196949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386265222
4046	NC_017452	A	6	6	196987	196992	100 %	0 %	0 %	0 %	386265222
4047	NC_017452	ATT	2	6	197041	197046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386265222
4048	NC_017452	ATT	2	6	197111	197116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386265223
4049	NC_017452	TGA	2	6	197198	197203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386265223
4050	NC_017452	GC	3	6	197217	197222	0 %	0 %	50 %	50 %	386265223
4051	NC_017452	TTG	2	6	197242	197247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386265223
4052	NC_017452	AGA	2	6	197258	197263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386265223
4053	NC_017452	GAT	2	6	197283	197288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386265223
4054	NC_017452	CAG	3	9	197350	197358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386265223
4055	NC_017452	AATT	2	8	197452	197459	50 %	50 %	0 %	0 %	386265223
4056	NC_017452	AAAT	2	8	197522	197529	75 %	25 %	0 %	0 %	386265223
4057	NC_017452	GC	3	6	197542	197547	0 %	0 %	50 %	50 %	386265223
4058	NC_017452	TGA	2	6	197558	197563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386265223
4059	NC_017452	GTG	2	6	197590	197595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386265223
4060	NC_017452	TGT	2	6	197618	197623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386265223
4061	NC_017452	A	7	7	197626	197632	100 %	0 %	0 %	0 %	386265223
4062	NC_017452	TGG	2	6	197633	197638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386265223
4063	NC_017452	ATG	2	6	197671	197676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386265223
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4065	NC_017452	A	6	6	197775	197780	100 %	0 %	0 %	0 %	386265223
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4070	NC_017452	TAA	2	6	197975	197980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386265223
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4072	NC_017452	GGT	2	6	198072	198077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386265223
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4078	NC_017452	TAAA	2	8	198383	198390	75 %	25 %	0 %	0 %	386265223
4079	NC_017452	A	6	6	198388	198393	100 %	0 %	0 %	0 %	386265223
4080	NC_017452	ATT	2	6	198433	198438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386265224
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4084	NC_017452	TGC	2	6	198505	198510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386265224
4085	NC_017452	CAA	2	6	198545	198550	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386265224
4086	NC_017452	GCT	2	6	198650	198655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386265224
4087	NC_017452	TAG	2	6	198663	198668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386265224
4088	NC_017452	TGA	2	6	198679	198684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386265224
4089	NC_017452	ACA	2	6	198702	198707	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386265224
4090	NC_017452	CGT	2	6	198722	198727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386265224
4091	NC_017452	GAA	2	6	198800	198805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386265224
4092	NC_017452	ATG	2	6	198825	198830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386265224
4093	NC_017452	CGT	2	6	198851	198856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386265224
4094	NC_017452	T	6	6	198911	198916	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_017452	TGTTT	2	10	198926	198935	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_017452	GAAT	2	8	198969	198976	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_017452	AGC	2	6	199051	199056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4098	NC_017452	CAC	2	6	199100	199105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4099	NC_017452	GTT	2	6	199130	199135	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_017452	TC	3	6	199187	199192	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4101	NC_017452	CCA	2	6	199198	199203	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4102	NC_017452	TAT	2	6	199208	199213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_017452	TGA	2	6	199436	199441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386265225
4104	NC_017452	A	6	6	199481	199486	100 %	0 %	0 %	0 %	386265225
4105	NC_017452	TGA	2	6	199508	199513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386265225
4106	NC_017452	GAT	2	6	199521	199526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386265225
4107	NC_017452	GAA	2	6	199671	199676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386265225
4108	NC_017452	CTG	2	6	199677	199682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386265225
4109	NC_017452	ATT	2	6	199720	199725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386265225
4110	NC_017452	CTT	2	6	199726	199731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386265225
4111	NC_017452	ATA	2	6	199795	199800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386265225
4112	NC_017452	CTTT	2	8	199812	199819	0 %	75 %	0 %	25 %	386265225
4113	NC_017452	CAA	2	6	199837	199842	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386265225
4114	NC_017452	T	7	7	199859	199865	0 %	100 %	0 %	0 %	386265225
4115	NC_017452	TA	3	6	199880	199885	50 %	50 %	0 %	0 %	386265225
4116	NC_017452	AAT	2	6	200031	200036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386265225
4117	NC_017452	AATT	2	8	200070	200077	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_017452	CTTAT	2	10	200205	200214	20 %	60 %	0 %	20 %	386265226
4119	NC_017452	AGG	2	6	200274	200279	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386265226
4120	NC_017452	ATT	2	6	200326	200331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386265226
4121	NC_017452	T	6	6	200448	200453	0 %	100 %	0 %	0 %	386265226
4122	NC_017452	TTA	2	6	200527	200532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386265226
4123	NC_017452	A	6	6	200543	200548	100 %	0 %	0 %	0 %	386265226
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4240	NC_017452	GAAT	2	8	205734	205741	50 %	25 %	25 %	0 %	386265232
4241	NC_017452	TAA	2	6	205750	205755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386265232
4242	NC_017452	AAT	2	6	205817	205822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4243	NC_017452	TAT	2	6	205834	205839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386265233
4244	NC_017452	T	7	7	205851	205857	0 %	100 %	0 %	0 %	386265233
4245	NC_017452	TGC	2	6	205897	205902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386265233
4246	NC_017452	TTA	2	6	205916	205921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386265233
4247	NC_017452	TCA	2	6	205951	205956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386265233
4248	NC_017452	AAG	3	9	206040	206048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386265233
4249	NC_017452	CGT	2	6	206104	206109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386265233
4250	NC_017452	GGC	2	6	206167	206172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386265233
4251	NC_017452	GACA	2	8	206187	206194	50 %	0 %	25 %	25 %	386265234
4252	NC_017452	AATT	2	8	206198	206205	50 %	50 %	0 %	0 %	386265234
4253	NC_017452	AGA	2	6	206208	206213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386265234
4254	NC_017452	TGA	2	6	206298	206303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386265234
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4258	NC_017452	TAT	2	6	206415	206420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4259	NC_017452	T	6	6	206420	206425	0 %	100 %	0 %	0 %	386265235
4260	NC_017452	TGT	2	6	206455	206460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386265235
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4301	NC_017452	ATA	2	6	208533	208538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386265237
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4343	NC_017452	GAA	2	6	210998	211003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4344	NC_017452	ATTA	2	8	211074	211081	50 %	50 %	0 %	0 %	386265240
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4347	NC_017452	CGAT	2	8	211247	211254	25 %	25 %	25 %	25 %	386265240
4348	NC_017452	AATTA	2	10	211306	211315	60 %	40 %	0 %	0 %	386265240
4349	NC_017452	T	6	6	211331	211336	0 %	100 %	0 %	0 %	386265240
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4353	NC_017452	T	6	6	211480	211485	0 %	100 %	0 %	0 %	386265240
4354	NC_017452	TCA	2	6	211502	211507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386265240
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4364	NC_017452	TAAC	2	8	212094	212101	50 %	25 %	0 %	25 %	386265240
4365	NC_017452	A	6	6	212137	212142	100 %	0 %	0 %	0 %	386265240
4366	NC_017452	TTG	2	6	212152	212157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386265240
4367	NC_017452	T	7	7	212181	212187	0 %	100 %	0 %	0 %	386265240
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4369	NC_017452	TTA	2	6	212237	212242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386265240
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