MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haemophilus influenzae R2846 chromosome

Total Repeats: 38718

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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38502	NC_017452	TAG	2	6	1808693	1808698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386266661
38503	NC_017452	ATC	2	6	1808710	1808715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386266661
38504	NC_017452	TATT	2	8	1808840	1808847	25 %	75 %	0 %	0 %	386266661
38505	NC_017452	TTC	2	6	1808871	1808876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386266661
38506	NC_017452	GTA	2	6	1809109	1809114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386266661
38507	NC_017452	TA	3	6	1809125	1809130	50 %	50 %	0 %	0 %	386266661
38508	NC_017452	CAA	2	6	1809218	1809223	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38509	NC_017452	ATC	2	6	1809242	1809247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38510	NC_017452	CTA	2	6	1809258	1809263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38511	NC_017452	AAG	2	6	1809271	1809276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38512	NC_017452	ATG	2	6	1809287	1809292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38513	NC_017452	CCA	2	6	1809320	1809325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38514	NC_017452	TTGT	2	8	1809339	1809346	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
38515	NC_017452	TGG	2	6	1809347	1809352	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38516	NC_017452	ACT	2	6	1809371	1809376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38517	NC_017452	ACT	2	6	1809392	1809397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38518	NC_017452	CAA	2	6	1809403	1809408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38519	NC_017452	ATA	2	6	1809454	1809459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38520	NC_017452	GA	3	6	1809511	1809516	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38521	NC_017452	AT	3	6	1809532	1809537	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38522	NC_017452	ATT	4	12	1809544	1809555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38523	NC_017452	T	7	7	1809554	1809560	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38524	NC_017452	AACC	28	112	1809646	1809757	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
38525	NC_017452	AAC	2	6	1809776	1809781	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38526	NC_017452	AAAT	2	8	1809788	1809795	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38527	NC_017452	ACA	2	6	1809890	1809895	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38528	NC_017452	TGT	2	6	1809930	1809935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38529	NC_017452	TGA	2	6	1809981	1809986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38530	NC_017452	TCT	2	6	1810036	1810041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38531	NC_017452	AAG	2	6	1810118	1810123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38532	NC_017452	TCAA	2	8	1810147	1810154	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
38533	NC_017452	AGTGGT	2	12	1810156	1810167	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
38534	NC_017452	GA	3	6	1810206	1810211	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38535	NC_017452	AATC	2	8	1810270	1810277	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
38536	NC_017452	ACA	2	6	1810333	1810338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38537	NC_017452	A	7	7	1810402	1810408	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38538	NC_017452	ATT	2	6	1810449	1810454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38539	NC_017452	ATC	2	6	1810481	1810486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38540	NC_017452	CAAC	2	8	1810652	1810659	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
38541	NC_017452	ACTT	2	8	1810680	1810687	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
38542	NC_017452	CAAAA	2	10	1810691	1810700	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
38543	NC_017452	A	6	6	1810697	1810702	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38544	NC_017452	ACT	2	6	1810853	1810858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38545	NC_017452	AAACTA	2	12	1810906	1810917	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38546	NC_017452	A	7	7	1810964	1810970	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38547	NC_017452	TTC	2	6	1811001	1811006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38548	NC_017452	AGA	2	6	1811046	1811051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38549	NC_017452	AGGA	2	8	1811086	1811093	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38550	NC_017452	ATA	2	6	1811108	1811113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38551	NC_017452	AAAAT	2	10	1811116	1811125	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
38552	NC_017452	TTC	2	6	1811129	1811134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38553	NC_017452	CAA	2	6	1811194	1811199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38554	NC_017452	ATA	2	6	1811270	1811275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38555	NC_017452	ATG	2	6	1811309	1811314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38556	NC_017452	TGG	2	6	1811329	1811334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38557	NC_017452	A	6	6	1811356	1811361	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38558	NC_017452	TAC	2	6	1811406	1811411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38559	NC_017452	TTC	2	6	1811412	1811417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38560	NC_017452	CTTA	2	8	1811459	1811466	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
38561	NC_017452	TGT	2	6	1811511	1811516	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38562	NC_017452	ATT	2	6	1811525	1811530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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38564	NC_017452	TGA	2	6	1811610	1811615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38565	NC_017452	ATT	2	6	1811628	1811633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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38569	NC_017452	TACAT	2	10	1811949	1811958	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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38572	NC_017452	AATT	2	8	1812132	1812139	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38573	NC_017452	ATGG	2	8	1812172	1812179	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
38574	NC_017452	GAA	2	6	1812215	1812220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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38577	NC_017452	TA	3	6	1812482	1812487	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38578	NC_017452	AT	3	6	1812504	1812509	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38579	NC_017452	TCAGT	2	10	1812622	1812631	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
38580	NC_017452	AAAAT	2	10	1812652	1812661	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
38581	NC_017452	T	6	6	1812720	1812725	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38582	NC_017452	AT	4	8	1812800	1812807	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38583	NC_017452	TGTA	2	8	1812910	1812917	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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38597	NC_017452	TGAT	2	8	1813570	1813577	25 %	50 %	25 %	0 %	386266662
38598	NC_017452	TTGG	2	8	1813615	1813622	0 %	50 %	50 %	0 %	386266662
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38603	NC_017452	TTA	2	6	1813955	1813960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386266662
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38607	NC_017452	A	6	6	1814042	1814047	100 %	0 %	0 %	0 %	386266663
38608	NC_017452	TAA	2	6	1814082	1814087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386266663
38609	NC_017452	ATTA	2	8	1814155	1814162	50 %	50 %	0 %	0 %	386266663
38610	NC_017452	TTAC	2	8	1814234	1814241	25 %	50 %	0 %	25 %	386266663
38611	NC_017452	TTC	2	6	1814264	1814269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386266663
38612	NC_017452	TCA	2	6	1814301	1814306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386266663
38613	NC_017452	TGC	3	9	1814335	1814343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386266663
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38615	NC_017452	ATG	2	6	1814435	1814440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386266663
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38620	NC_017452	GTT	2	6	1814645	1814650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386266663
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.