MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haemophilus influenzae R2846 chromosome

Total Repeats: 38718

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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35002	NC_017452	GT	3	6	1643018	1643023	0 %	50 %	50 %	0 %	386266520
35003	NC_017452	CTG	2	6	1643072	1643077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386266520
35004	NC_017452	TTA	2	6	1643088	1643093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386266520
35005	NC_017452	TAA	2	6	1643097	1643102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386266520
35006	NC_017452	TAT	2	6	1643142	1643147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386266520
35007	NC_017452	TGAAT	2	10	1643247	1643256	40 %	40 %	20 %	0 %	386266520
35008	NC_017452	TTA	2	6	1643300	1643305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386266520
35009	NC_017452	CTT	2	6	1643319	1643324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386266520
35010	NC_017452	TAA	2	6	1643331	1643336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386266520
35011	NC_017452	TTA	2	6	1643394	1643399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386266520
35012	NC_017452	AAC	2	6	1643423	1643428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386266520
35013	NC_017452	AAAG	2	8	1643455	1643462	75 %	0 %	25 %	0 %	386266520
35014	NC_017452	TTG	2	6	1643468	1643473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386266520
35015	NC_017452	T	6	6	1643531	1643536	0 %	100 %	0 %	0 %	386266520
35016	NC_017452	TGA	2	6	1643574	1643579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386266520
35017	NC_017452	AGA	2	6	1643607	1643612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386266520
35018	NC_017452	TCTT	2	8	1643691	1643698	0 %	75 %	0 %	25 %	386266520
35019	NC_017452	CAT	2	6	1643718	1643723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35020	NC_017452	CTTT	2	8	1643731	1643738	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
35021	NC_017452	TA	3	6	1643739	1643744	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35022	NC_017452	AAT	2	6	1643834	1643839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386266521
35023	NC_017452	T	6	6	1644057	1644062	0 %	100 %	0 %	0 %	386266521
35024	NC_017452	GCA	2	6	1644135	1644140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386266521
35025	NC_017452	ATC	2	6	1644164	1644169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386266521
35026	NC_017452	ATTG	2	8	1644202	1644209	25 %	50 %	25 %	0 %	386266521
35027	NC_017452	TGC	2	6	1644237	1644242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386266521
35028	NC_017452	CTG	2	6	1644265	1644270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386266521
35029	NC_017452	TAA	2	6	1644313	1644318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386266521
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35032	NC_017452	TTC	3	9	1644608	1644616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386266521
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35034	NC_017452	A	7	7	1644708	1644714	100 %	0 %	0 %	0 %	386266521
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35036	NC_017452	CGA	2	6	1644795	1644800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386266521
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35038	NC_017452	CAT	2	6	1644946	1644951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386266521
35039	NC_017452	GAC	2	6	1645039	1645044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386266521
35040	NC_017452	TTA	2	6	1645050	1645055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386266521
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35042	NC_017452	ACG	2	6	1645104	1645109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386266521
35043	NC_017452	TAATG	2	10	1645158	1645167	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
35044	NC_017452	ATAAC	2	10	1645168	1645177	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
35045	NC_017452	TA	3	6	1645219	1645224	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35046	NC_017452	T	7	7	1645239	1645245	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35047	NC_017452	AAC	2	6	1645269	1645274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35048	NC_017452	TAA	2	6	1645354	1645359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386266522
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35051	NC_017452	TG	3	6	1645680	1645685	0 %	50 %	50 %	0 %	386266522
35052	NC_017452	GC	3	6	1645736	1645741	0 %	0 %	50 %	50 %	386266522
35053	NC_017452	ATA	2	6	1645826	1645831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386266522
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35055	NC_017452	ACG	2	6	1646026	1646031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386266522
35056	NC_017452	ATC	2	6	1646044	1646049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386266522
35057	NC_017452	TTA	2	6	1646069	1646074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386266522
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35094	NC_017452	TTAT	2	8	1647905	1647912	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35095	NC_017452	T	7	7	1647952	1647958	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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35101	NC_017452	A	6	6	1648507	1648512	100 %	0 %	0 %	0 %	386266524
35102	NC_017452	ATAA	2	8	1648514	1648521	75 %	25 %	0 %	0 %	386266524
35103	NC_017452	GCA	2	6	1648559	1648564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386266525
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35112	NC_017452	AT	3	6	1648978	1648983	50 %	50 %	0 %	0 %	386266525
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35120	NC_017452	CTG	2	6	1649314	1649319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386266526
35121	NC_017452	ACCA	2	8	1649380	1649387	50 %	0 %	0 %	50 %	386266526
35122	NC_017452	ACA	2	6	1649408	1649413	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386266526
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35156	NC_017452	T	6	6	1651346	1651351	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35157	NC_017452	TTTG	2	8	1651407	1651414	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
35158	NC_017452	CA	5	10	1651512	1651521	50 %	0 %	0 %	50 %	386266528
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35221	NC_017452	TTG	2	6	1654619	1654624	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386266528
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35224	NC_017452	CTCGTT	2	12	1654703	1654714	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	386266528
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35226	NC_017452	AGTG	2	8	1654797	1654804	25 %	25 %	50 %	0 %	386266528
35227	NC_017452	TAT	2	6	1654828	1654833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386266528
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35229	NC_017452	T	6	6	1654986	1654991	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35230	NC_017452	GTT	2	6	1655093	1655098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386266529
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35232	NC_017452	TAA	2	6	1655199	1655204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386266529
35233	NC_017452	TA	3	6	1655234	1655239	50 %	50 %	0 %	0 %	386266529
35234	NC_017452	CGTT	2	8	1655242	1655249	0 %	50 %	25 %	25 %	386266529
35235	NC_017452	GC	3	6	1655260	1655265	0 %	0 %	50 %	50 %	386266529
35236	NC_017452	C	7	7	1655265	1655271	0 %	0 %	0 %	100 %	386266529
35237	NC_017452	ATC	3	9	1655301	1655309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386266529
35238	NC_017452	AAT	2	6	1655352	1655357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386266529
35239	NC_017452	CAA	2	6	1655393	1655398	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386266529
35240	NC_017452	AC	3	6	1655399	1655404	50 %	0 %	0 %	50 %	386266529
35241	NC_017452	ATC	2	6	1655415	1655420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386266529
35242	NC_017452	GTT	2	6	1655492	1655497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386266529
35243	NC_017452	TAA	2	6	1655514	1655519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386266529
35244	NC_017452	TG	3	6	1655568	1655573	0 %	50 %	50 %	0 %	386266529
35245	NC_017452	GCC	2	6	1655602	1655607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386266529
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35262	NC_017452	CTG	2	6	1656311	1656316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386266529
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35267	NC_017452	GTAA	2	8	1656523	1656530	50 %	25 %	25 %	0 %	386266529
35268	NC_017452	GTTT	2	8	1656543	1656550	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
35269	NC_017452	TGA	3	9	1656551	1656559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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35272	NC_017452	GCTG	2	8	1656719	1656726	0 %	25 %	50 %	25 %	386266530
35273	NC_017452	TGC	2	6	1656757	1656762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386266530
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35308	NC_017452	CAT	2	6	1658214	1658219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386266530
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35328	NC_017452	TGTT	2	8	1659299	1659306	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
35329	NC_017452	TTATTT	2	12	1659312	1659323	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35330	NC_017452	A	8	8	1659379	1659386	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35331	NC_017452	A	6	6	1659389	1659394	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35332	NC_017452	GCTT	2	8	1659410	1659417	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
35333	NC_017452	A	6	6	1659441	1659446	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35334	NC_017452	TTAT	2	8	1659474	1659481	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35335	NC_017452	TGA	2	6	1659486	1659491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35336	NC_017452	T	7	7	1659522	1659528	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35337	NC_017452	GTC	2	6	1659589	1659594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386266532
35338	NC_017452	GCA	2	6	1659609	1659614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386266532
35339	NC_017452	TGG	3	9	1659674	1659682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386266532
35340	NC_017452	ATC	2	6	1659690	1659695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386266532
35341	NC_017452	CCTTA	2	10	1659696	1659705	20 %	40 %	0 %	40 %	386266532
35342	NC_017452	ATT	2	6	1659710	1659715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386266532
35343	NC_017452	GTG	2	6	1659769	1659774	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386266532
35344	NC_017452	CAC	2	6	1659778	1659783	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386266532
35345	NC_017452	TCG	2	6	1659791	1659796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386266532
35346	NC_017452	TGG	2	6	1659825	1659830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386266532
35347	NC_017452	ATG	2	6	1659834	1659839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386266532
35348	NC_017452	TCA	2	6	1659847	1659852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386266532
35349	NC_017452	GTA	2	6	1659870	1659875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386266532
35350	NC_017452	GGC	2	6	1659884	1659889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386266532
35351	NC_017452	TTTC	2	8	1659904	1659911	0 %	75 %	0 %	25 %	386266532
35352	NC_017452	TTC	2	6	1659942	1659947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386266532
35353	NC_017452	TGGTA	2	10	1660004	1660013	20 %	40 %	40 %	0 %	386266532
35354	NC_017452	TTG	2	6	1660039	1660044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386266532
35355	NC_017452	TCG	2	6	1660114	1660119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386266532
35356	NC_017452	ATT	2	6	1660184	1660189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386266532
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35469	NC_017452	A	6	6	1665744	1665749	100 %	0 %	0 %	0 %	386266536
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35473	NC_017452	ATTTA	2	10	1666069	1666078	40 %	60 %	0 %	0 %	386266536
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35475	NC_017452	TGA	2	6	1666117	1666122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386266536
35476	NC_017452	TCA	2	6	1666148	1666153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386266536
35477	NC_017452	TAA	2	6	1666189	1666194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386266536
35478	NC_017452	CAT	2	6	1666242	1666247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386266536
35479	NC_017452	A	7	7	1666278	1666284	100 %	0 %	0 %	0 %	386266536
35480	NC_017452	TAATT	2	10	1666285	1666294	40 %	60 %	0 %	0 %	386266536
35481	NC_017452	AT	3	6	1666324	1666329	50 %	50 %	0 %	0 %	386266536
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35484	NC_017452	AAT	2	6	1666412	1666417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386266536
35485	NC_017452	GTA	2	6	1666424	1666429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386266536
35486	NC_017452	TAT	2	6	1666436	1666441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386266536
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35491	NC_017452	AAAAT	2	10	1666772	1666781	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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35500	NC_017452	T	6	6	1667252	1667257	0 %	100 %	0 %	0 %	386266537

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