MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haemophilus influenzae R2846 chromosome

Total Repeats: 38718

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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33002	NC_017452	TTAT	2	8	1551036	1551043	25 %	75 %	0 %	0 %	386266417
33003	NC_017452	TCC	2	6	1551063	1551068	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386266417
33004	NC_017452	GTT	2	6	1551166	1551171	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386266417
33005	NC_017452	CCA	2	6	1551232	1551237	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386266417
33006	NC_017452	TGA	2	6	1551243	1551248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386266417
33007	NC_017452	CAAA	2	8	1551255	1551262	75 %	0 %	0 %	25 %	386266417
33008	NC_017452	GTG	2	6	1551310	1551315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386266417
33009	NC_017452	GAT	2	6	1551331	1551336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386266417
33010	NC_017452	A	6	6	1551376	1551381	100 %	0 %	0 %	0 %	386266417
33011	NC_017452	AGTT	2	8	1551416	1551423	25 %	50 %	25 %	0 %	386266417
33012	NC_017452	TCA	2	6	1551440	1551445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386266417
33013	NC_017452	AAT	2	6	1551454	1551459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386266417
33014	NC_017452	ATT	2	6	1551514	1551519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386266417
33015	NC_017452	A	6	6	1551581	1551586	100 %	0 %	0 %	0 %	386266417
33016	NC_017452	TAC	2	6	1551599	1551604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386266417
33017	NC_017452	GTG	2	6	1551668	1551673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386266417
33018	NC_017452	A	6	6	1551676	1551681	100 %	0 %	0 %	0 %	386266417
33019	NC_017452	ATT	2	6	1551693	1551698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386266417
33020	NC_017452	TCTT	2	8	1551720	1551727	0 %	75 %	0 %	25 %	386266417
33021	NC_017452	TGA	2	6	1551774	1551779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386266417
33022	NC_017452	TTG	2	6	1551781	1551786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386266417
33023	NC_017452	ATCG	2	8	1551973	1551980	25 %	25 %	25 %	25 %	386266417
33024	NC_017452	ACTC	2	8	1551999	1552006	25 %	25 %	0 %	50 %	386266417
33025	NC_017452	ACAG	2	8	1552072	1552079	50 %	0 %	25 %	25 %	386266417
33026	NC_017452	TA	3	6	1552087	1552092	50 %	50 %	0 %	0 %	386266417
33027	NC_017452	ATT	2	6	1552163	1552168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386266417
33028	NC_017452	TGA	2	6	1552269	1552274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386266417
33029	NC_017452	GTC	2	6	1552358	1552363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386266417
33030	NC_017452	ATA	2	6	1552364	1552369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386266417
33031	NC_017452	GCA	2	6	1552489	1552494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386266417
33032	NC_017452	ACA	2	6	1552521	1552526	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386266417
33033	NC_017452	AAG	2	6	1552547	1552552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386266417
33034	NC_017452	TTG	2	6	1552562	1552567	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386266417
33035	NC_017452	TTGA	2	8	1552633	1552640	25 %	50 %	25 %	0 %	386266417
33036	NC_017452	CCA	2	6	1552742	1552747	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386266417
33037	NC_017452	A	6	6	1552796	1552801	100 %	0 %	0 %	0 %	386266417
33038	NC_017452	CAA	2	6	1552820	1552825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386266417
33039	NC_017452	GAA	2	6	1552828	1552833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386266417
33040	NC_017452	GAA	2	6	1552840	1552845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386266417
33041	NC_017452	ATC	2	6	1552973	1552978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386266417
33042	NC_017452	ATC	2	6	1553004	1553009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386266417
33043	NC_017452	GAA	2	6	1553047	1553052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386266417
33044	NC_017452	GTC	2	6	1553054	1553059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386266417
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33046	NC_017452	TTAA	2	8	1553164	1553171	50 %	50 %	0 %	0 %	386266417
33047	NC_017452	GCAAG	2	10	1553181	1553190	40 %	0 %	40 %	20 %	386266417
33048	NC_017452	AATT	2	8	1553274	1553281	50 %	50 %	0 %	0 %	386266417
33049	NC_017452	ACA	2	6	1553391	1553396	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386266417
33050	NC_017452	GCAAT	2	10	1553489	1553498	40 %	20 %	20 %	20 %	386266417
33051	NC_017452	CGT	2	6	1553500	1553505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386266417
33052	NC_017452	ATT	2	6	1553560	1553565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386266417
33053	NC_017452	GAT	2	6	1553574	1553579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386266417
33054	NC_017452	TGA	2	6	1553586	1553591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386266417
33055	NC_017452	ATG	2	6	1553636	1553641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386266417
33056	NC_017452	ACA	2	6	1553697	1553702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386266417
33057	NC_017452	GCT	2	6	1553713	1553718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386266417
33058	NC_017452	ATTG	2	8	1553733	1553740	25 %	50 %	25 %	0 %	386266417
33059	NC_017452	TAA	2	6	1553791	1553796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386266418
33060	NC_017452	ATG	2	6	1553851	1553856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386266418
33061	NC_017452	TGA	2	6	1553971	1553976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386266418
33062	NC_017452	A	6	6	1554037	1554042	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33063	NC_017452	ATTTCA	2	12	1554050	1554061	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33064	NC_017452	ATT	2	6	1554133	1554138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386266419
33065	NC_017452	CTTT	2	8	1554144	1554151	0 %	75 %	0 %	25 %	386266419
33066	NC_017452	ATCA	2	8	1554200	1554207	50 %	25 %	0 %	25 %	386266419
33067	NC_017452	AAATCA	2	12	1554264	1554275	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	386266419
33068	NC_017452	CAT	2	6	1554307	1554312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386266419
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33074	NC_017452	CA	3	6	1554590	1554595	50 %	0 %	0 %	50 %	386266419
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33083	NC_017452	TGA	3	9	1554852	1554860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386266419
33084	NC_017452	TCAT	2	8	1554861	1554868	25 %	50 %	0 %	25 %	386266419
33085	NC_017452	TAA	2	6	1554874	1554879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386266419
33086	NC_017452	AATT	2	8	1554915	1554922	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33087	NC_017452	TAT	2	6	1554925	1554930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33088	NC_017452	AAT	2	6	1554954	1554959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33089	NC_017452	AAGTTA	2	12	1554976	1554987	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33090	NC_017452	T	6	6	1554997	1555002	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33091	NC_017452	AAT	2	6	1555007	1555012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33092	NC_017452	ATAA	2	8	1555018	1555025	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33093	NC_017452	ATT	2	6	1555070	1555075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386266420
33094	NC_017452	TTC	2	6	1555239	1555244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386266420
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33097	NC_017452	ACCA	2	8	1555382	1555389	50 %	0 %	0 %	50 %	386266420
33098	NC_017452	TAAT	2	8	1555493	1555500	50 %	50 %	0 %	0 %	386266420
33099	NC_017452	TGGATT	2	12	1555515	1555526	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	386266420
33100	NC_017452	AAT	2	6	1555536	1555541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386266420
33101	NC_017452	GTT	2	6	1555598	1555603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386266420
33102	NC_017452	TCA	2	6	1555639	1555644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386266420
33103	NC_017452	TTG	2	6	1555658	1555663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386266420
33104	NC_017452	AAT	2	6	1555713	1555718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386266420
33105	NC_017452	T	6	6	1555722	1555727	0 %	100 %	0 %	0 %	386266420
33106	NC_017452	GTT	2	6	1555927	1555932	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386266420
33107	NC_017452	AAT	2	6	1555985	1555990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386266420
33108	NC_017452	AATA	2	8	1556123	1556130	75 %	25 %	0 %	0 %	386266420
33109	NC_017452	CAA	2	6	1556226	1556231	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386266420
33110	NC_017452	GAT	2	6	1556291	1556296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386266420
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33112	NC_017452	TGT	2	6	1556370	1556375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386266420
33113	NC_017452	CAT	2	6	1556420	1556425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386266420
33114	NC_017452	T	6	6	1556475	1556480	0 %	100 %	0 %	0 %	386266420
33115	NC_017452	TTG	2	6	1556505	1556510	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386266420
33116	NC_017452	AAG	2	6	1556525	1556530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386266420
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33224	NC_017452	A	9	9	1561562	1561570	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33225	NC_017452	GCCT	2	8	1561582	1561589	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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33230	NC_017452	T	6	6	1561710	1561715	0 %	100 %	0 %	0 %	386266426
33231	NC_017452	AAAG	2	8	1561717	1561724	75 %	0 %	25 %	0 %	386266426
33232	NC_017452	CTG	2	6	1561728	1561733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386266426
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33238	NC_017452	GGCA	2	8	1561976	1561983	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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33477	NC_017452	GCAA	2	8	1573583	1573590	50 %	0 %	25 %	25 %	386266439
33478	NC_017452	TGA	2	6	1573722	1573727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386266439
33479	NC_017452	TTAG	2	8	1573796	1573803	25 %	50 %	25 %	0 %	386266439
33480	NC_017452	TTAGTT	2	12	1573814	1573825	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	386266439
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33498	NC_017452	GTTT	2	8	1574263	1574270	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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