MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haemophilus influenzae R2846 chromosome

Total Repeats: 38718

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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21502	NC_017452	AAT	2	6	1014112	1014117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386265930
21503	NC_017452	TGT	2	6	1014209	1014214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386265930
21504	NC_017452	T	7	7	1014223	1014229	0 %	100 %	0 %	0 %	386265930
21505	NC_017452	ATT	2	6	1014275	1014280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386265930
21506	NC_017452	ATTA	2	8	1014292	1014299	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21507	NC_017452	GATA	2	8	1014307	1014314	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21508	NC_017452	AAG	2	6	1014318	1014323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21509	NC_017452	A	6	6	1014325	1014330	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21510	NC_017452	AGA	2	6	1014407	1014412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21511	NC_017452	T	6	6	1014413	1014418	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21512	NC_017452	GAT	2	6	1014427	1014432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21513	NC_017452	TA	4	8	1014462	1014469	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21514	NC_017452	TTA	2	6	1014478	1014483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21515	NC_017452	ATA	2	6	1014490	1014495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386265931
21516	NC_017452	A	6	6	1014644	1014649	100 %	0 %	0 %	0 %	386265931
21517	NC_017452	GAA	3	9	1014660	1014668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386265931
21518	NC_017452	TGA	2	6	1014671	1014676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386265931
21519	NC_017452	AAG	2	6	1014712	1014717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386265931
21520	NC_017452	TAT	2	6	1014764	1014769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386265931
21521	NC_017452	AAGTCT	2	12	1014789	1014800	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386265931
21522	NC_017452	CAA	2	6	1014802	1014807	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386265931
21523	NC_017452	A	6	6	1014925	1014930	100 %	0 %	0 %	0 %	386265931
21524	NC_017452	TCA	2	6	1014939	1014944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386265931
21525	NC_017452	ACA	2	6	1015016	1015021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386265931
21526	NC_017452	ATG	2	6	1015024	1015029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386265931
21527	NC_017452	GTC	2	6	1015269	1015274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386265931
21528	NC_017452	ATC	2	6	1015279	1015284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386265931
21529	NC_017452	TAA	2	6	1015298	1015303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386265931
21530	NC_017452	GTTT	2	8	1015351	1015358	0 %	75 %	25 %	0 %	386265931
21531	NC_017452	GCA	2	6	1015398	1015403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386265931
21532	NC_017452	TTA	2	6	1015410	1015415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386265931
21533	NC_017452	TTA	2	6	1015450	1015455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386265931
21534	NC_017452	TTA	2	6	1015459	1015464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386265931
21535	NC_017452	TATC	2	8	1015524	1015531	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
21536	NC_017452	TAA	2	6	1015543	1015548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21537	NC_017452	A	6	6	1015547	1015552	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21538	NC_017452	TTTA	2	8	1015553	1015560	25 %	75 %	0 %	0 %	386265932
21539	NC_017452	CTA	2	6	1015580	1015585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386265932
21540	NC_017452	ACC	2	6	1015623	1015628	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386265932
21541	NC_017452	A	6	6	1015629	1015634	100 %	0 %	0 %	0 %	386265932
21542	NC_017452	AGA	2	6	1015673	1015678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386265932
21543	NC_017452	A	6	6	1015725	1015730	100 %	0 %	0 %	0 %	386265932
21544	NC_017452	AAG	2	6	1015735	1015740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386265932
21545	NC_017452	ATA	2	6	1015768	1015773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386265932
21546	NC_017452	CAC	2	6	1015814	1015819	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386265932
21547	NC_017452	AC	3	6	1015828	1015833	50 %	0 %	0 %	50 %	386265932
21548	NC_017452	ATTGA	2	10	1015892	1015901	40 %	40 %	20 %	0 %	386265932
21549	NC_017452	ATTG	2	8	1015917	1015924	25 %	50 %	25 %	0 %	386265932
21550	NC_017452	CAC	2	6	1016000	1016005	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386265932
21551	NC_017452	TAG	2	6	1016023	1016028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386265932
21552	NC_017452	ATC	2	6	1016145	1016150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386265932
21553	NC_017452	TCA	2	6	1016161	1016166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386265932
21554	NC_017452	TCC	2	6	1016223	1016228	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386265932
21555	NC_017452	T	6	6	1016247	1016252	0 %	100 %	0 %	0 %	386265932
21556	NC_017452	ATT	2	6	1016269	1016274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386265932
21557	NC_017452	ATT	2	6	1016283	1016288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386265933
21558	NC_017452	TCT	2	6	1016318	1016323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386265933
21559	NC_017452	AAT	2	6	1016397	1016402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386265933
21560	NC_017452	ATG	2	6	1016414	1016419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386265933
21561	NC_017452	TCT	2	6	1016427	1016432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386265933
21562	NC_017452	TAT	2	6	1016499	1016504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386265933
21563	NC_017452	AAT	2	6	1016533	1016538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386265933
21564	NC_017452	ATTT	2	8	1016556	1016563	25 %	75 %	0 %	0 %	386265933
21565	NC_017452	TCT	2	6	1016597	1016602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386265933
21566	NC_017452	TAAA	2	8	1016752	1016759	75 %	25 %	0 %	0 %	386265933
21567	NC_017452	TCA	2	6	1016794	1016799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21568	NC_017452	TAA	2	6	1016878	1016883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386265934
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21571	NC_017452	ACA	2	6	1017059	1017064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386265934
21572	NC_017452	A	6	6	1017118	1017123	100 %	0 %	0 %	0 %	386265934
21573	NC_017452	TCT	2	6	1017164	1017169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386265934
21574	NC_017452	TCA	2	6	1017206	1017211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386265934
21575	NC_017452	TTTA	2	8	1017226	1017233	25 %	75 %	0 %	0 %	386265934
21576	NC_017452	ATC	2	6	1017283	1017288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386265934
21577	NC_017452	TGA	2	6	1017300	1017305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386265934
21578	NC_017452	CAT	2	6	1017312	1017317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386265934
21579	NC_017452	GCT	2	6	1017365	1017370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386265934
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21581	NC_017452	TGCCC	2	10	1017461	1017470	0 %	20 %	20 %	60 %	386265934
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21583	NC_017452	ATC	2	6	1017653	1017658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386265935
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21585	NC_017452	ATG	2	6	1017689	1017694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386265935
21586	NC_017452	AATC	2	8	1017701	1017708	50 %	25 %	0 %	25 %	386265935
21587	NC_017452	TTC	2	6	1017731	1017736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386265935
21588	NC_017452	AAT	2	6	1017742	1017747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386265935
21589	NC_017452	GGAT	2	8	1017779	1017786	25 %	25 %	50 %	0 %	386265935
21590	NC_017452	T	6	6	1017824	1017829	0 %	100 %	0 %	0 %	386265935
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21592	NC_017452	TCA	2	6	1017897	1017902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386265935
21593	NC_017452	CTTG	2	8	1017919	1017926	0 %	50 %	25 %	25 %	386265935
21594	NC_017452	TTC	2	6	1017999	1018004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386265935
21595	NC_017452	CT	3	6	1018016	1018021	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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21600	NC_017452	TTG	2	6	1018440	1018445	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386265936
21601	NC_017452	A	6	6	1018550	1018555	100 %	0 %	0 %	0 %	386265936
21602	NC_017452	GATT	2	8	1018562	1018569	25 %	50 %	25 %	0 %	386265936
21603	NC_017452	TAA	2	6	1018578	1018583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386265936
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21605	NC_017452	T	6	6	1018635	1018640	0 %	100 %	0 %	0 %	386265936
21606	NC_017452	AGCA	2	8	1018737	1018744	50 %	0 %	25 %	25 %	386265936
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21609	NC_017452	A	7	7	1019037	1019043	100 %	0 %	0 %	0 %	386265936
21610	NC_017452	A	6	6	1019051	1019056	100 %	0 %	0 %	0 %	386265936
21611	NC_017452	GAA	2	6	1019136	1019141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386265937
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21617	NC_017452	CCG	2	6	1019388	1019393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386265937
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21980	NC_017452	TGT	2	6	1036739	1036744	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21981	NC_017452	ATG	2	6	1036807	1036812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21982	NC_017452	TTA	2	6	1036819	1036824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21983	NC_017452	TAT	2	6	1036955	1036960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21984	NC_017452	GGA	2	6	1036965	1036970	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21985	NC_017452	GTT	2	6	1036995	1037000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21986	NC_017452	T	6	6	1037109	1037114	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21987	NC_017452	ATA	2	6	1037143	1037148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21988	NC_017452	TTA	3	9	1037155	1037163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21989	NC_017452	CTG	2	6	1037176	1037181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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21991	NC_017452	AAAC	2	8	1037258	1037265	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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21993	NC_017452	TTG	2	6	1037314	1037319	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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