MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haemophilus influenzae R2846 chromosome

Total Repeats: 38718

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017452	CTT	2	6	48322	48327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386265080
1002	NC_017452	TCA	2	6	48339	48344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386265080
1003	NC_017452	CAT	2	6	48362	48367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386265080
1004	NC_017452	ATC	2	6	48368	48373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386265080
1005	NC_017452	CAT	2	6	48409	48414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386265080
1006	NC_017452	TTG	2	6	48566	48571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386265080
1007	NC_017452	T	7	7	48573	48579	0 %	100 %	0 %	0 %	386265080
1008	NC_017452	AAGAT	2	10	48615	48624	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_017452	T	6	6	48624	48629	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_017452	T	6	6	48674	48679	0 %	100 %	0 %	0 %	386265081
1011	NC_017452	CTG	2	6	48680	48685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386265081
1012	NC_017452	T	6	6	48718	48723	0 %	100 %	0 %	0 %	386265081
1013	NC_017452	GTTC	2	8	48744	48751	0 %	50 %	25 %	25 %	386265081
1014	NC_017452	TAA	2	6	48845	48850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386265081
1015	NC_017452	GTA	2	6	48924	48929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386265081
1016	NC_017452	CGC	2	6	49006	49011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386265081
1017	NC_017452	AATGA	2	10	49053	49062	60 %	20 %	20 %	0 %	386265081
1018	NC_017452	TCT	2	6	49078	49083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386265081
1019	NC_017452	TTA	2	6	49089	49094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386265081
1020	NC_017452	TGT	2	6	49107	49112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386265081
1021	NC_017452	AGCA	2	8	49184	49191	50 %	0 %	25 %	25 %	386265081
1022	NC_017452	CTT	2	6	49273	49278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386265081
1023	NC_017452	TTC	2	6	49352	49357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386265081
1024	NC_017452	TCT	2	6	49398	49403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386265081
1025	NC_017452	AAAT	2	8	49417	49424	75 %	25 %	0 %	0 %	386265081
1026	NC_017452	TCT	2	6	49440	49445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386265081
1027	NC_017452	GC	3	6	49470	49475	0 %	0 %	50 %	50 %	386265081
1028	NC_017452	AGC	2	6	49478	49483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386265081
1029	NC_017452	AAC	2	6	49510	49515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386265081
1030	NC_017452	AAC	2	6	49517	49522	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386265081
1031	NC_017452	CGAA	2	8	49532	49539	50 %	0 %	25 %	25 %	386265081
1032	NC_017452	TGT	2	6	49562	49567	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386265081
1033	NC_017452	AAG	2	6	49579	49584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386265081
1034	NC_017452	CAA	3	9	49639	49647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386265081
1035	NC_017452	ATG	2	6	49818	49823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386265081
1036	NC_017452	TGT	2	6	49893	49898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386265081
1037	NC_017452	CAGTA	2	10	49925	49934	40 %	20 %	20 %	20 %	386265081
1038	NC_017452	AAT	2	6	49973	49978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386265081
1039	NC_017452	GTT	2	6	49996	50001	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386265081
1040	NC_017452	GTTTG	2	10	50086	50095	0 %	60 %	40 %	0 %	386265081
1041	NC_017452	TTC	2	6	50171	50176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386265081
1042	NC_017452	T	6	6	50296	50301	0 %	100 %	0 %	0 %	386265081
1043	NC_017452	GCA	2	6	50315	50320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386265081
1044	NC_017452	T	7	7	50342	50348	0 %	100 %	0 %	0 %	386265081
1045	NC_017452	CG	3	6	50356	50361	0 %	0 %	50 %	50 %	386265081
1046	NC_017452	ATC	2	6	50399	50404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386265081
1047	NC_017452	GTG	2	6	50453	50458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_017452	GC	3	6	50586	50591	0 %	0 %	50 %	50 %	386265082
1049	NC_017452	GCGTT	2	10	50602	50611	0 %	40 %	40 %	20 %	386265082
1050	NC_017452	ACG	2	6	50730	50735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386265082
1051	NC_017452	TTTAA	2	10	50804	50813	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_017452	ATTTT	2	10	50826	50835	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_017452	TAA	2	6	50867	50872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_017452	TAA	2	6	50996	51001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_017452	TGA	2	6	51044	51049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386265083
1056	NC_017452	ATG	2	6	51067	51072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386265083
1057	NC_017452	TGCA	2	8	51118	51125	25 %	25 %	25 %	25 %	386265083
1058	NC_017452	TGG	2	6	51131	51136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386265083
1059	NC_017452	TTA	2	6	51187	51192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386265083
1060	NC_017452	AGA	2	6	51203	51208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386265083
1061	NC_017452	GCGA	2	8	51222	51229	25 %	0 %	50 %	25 %	386265083
1062	NC_017452	TTG	2	6	51265	51270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386265083
1063	NC_017452	TTG	2	6	51280	51285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386265083
1064	NC_017452	TCA	2	6	51341	51346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386265083
1065	NC_017452	TGA	2	6	51377	51382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386265083
1066	NC_017452	TTG	2	6	51403	51408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386265083
1067	NC_017452	TGA	2	6	51488	51493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386265083
1068	NC_017452	TGC	2	6	51494	51499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386265083
1069	NC_017452	GATTA	2	10	51535	51544	40 %	40 %	20 %	0 %	386265083
1070	NC_017452	GGT	2	6	51755	51760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386265083
1071	NC_017452	GAAA	2	8	51794	51801	75 %	0 %	25 %	0 %	386265083
1072	NC_017452	A	6	6	51846	51851	100 %	0 %	0 %	0 %	386265083
1073	NC_017452	CCTCAA	2	12	51906	51917	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	386265083
1074	NC_017452	A	6	6	52047	52052	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_017452	ACG	2	6	52100	52105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386265084
1076	NC_017452	TGA	2	6	52171	52176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386265084
1077	NC_017452	TTTG	2	8	52252	52259	0 %	75 %	25 %	0 %	386265084
1078	NC_017452	A	7	7	52279	52285	100 %	0 %	0 %	0 %	386265084
1079	NC_017452	TG	3	6	52298	52303	0 %	50 %	50 %	0 %	386265084
1080	NC_017452	TGG	2	6	52305	52310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386265084
1081	NC_017452	ACA	2	6	52333	52338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386265084
1082	NC_017452	TGT	2	6	52357	52362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386265084
1083	NC_017452	GAAG	2	8	52427	52434	50 %	0 %	50 %	0 %	386265084
1084	NC_017452	GAA	2	6	52466	52471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386265084
1085	NC_017452	TTTTG	2	10	52507	52516	0 %	80 %	20 %	0 %	386265084
1086	NC_017452	AAG	2	6	52545	52550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386265084
1087	NC_017452	CAAATT	2	12	52556	52567	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	386265084
1088	NC_017452	ACA	2	6	52648	52653	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1089	NC_017452	A	6	6	52675	52680	100 %	0 %	0 %	0 %	386265085
1090	NC_017452	ATT	2	6	52703	52708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386265085
1091	NC_017452	TGCT	2	8	52734	52741	0 %	50 %	25 %	25 %	386265085
1092	NC_017452	TTG	2	6	52808	52813	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386265085
1093	NC_017452	TTG	2	6	52826	52831	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386265085
1094	NC_017452	GAT	2	6	52865	52870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386265085
1095	NC_017452	CGCT	2	8	52881	52888	0 %	25 %	25 %	50 %	386265085
1096	NC_017452	TGG	3	9	52975	52983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386265085
1097	NC_017452	ATT	3	9	53045	53053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386265085
1098	NC_017452	GGT	2	6	53059	53064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386265085
1099	NC_017452	TTAT	2	8	53120	53127	25 %	75 %	0 %	0 %	386265085
1100	NC_017452	ATG	2	6	53162	53167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386265085
1101	NC_017452	T	6	6	53243	53248	0 %	100 %	0 %	0 %	386265085
1102	NC_017452	CTT	2	6	53250	53255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386265085
1103	NC_017452	TTA	2	6	53268	53273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386265085
1104	NC_017452	TCG	2	6	53317	53322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386265085
1105	NC_017452	GCT	2	6	53354	53359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386265085
1106	NC_017452	TGCG	2	8	53499	53506	0 %	25 %	50 %	25 %	386265085
1107	NC_017452	TCA	2	6	53510	53515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386265085
1108	NC_017452	CTT	2	6	53529	53534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386265085
1109	NC_017452	AAT	2	6	53600	53605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386265085
1110	NC_017452	TTA	2	6	53673	53678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386265085
1111	NC_017452	TG	3	6	53703	53708	0 %	50 %	50 %	0 %	386265085
1112	NC_017452	TTGGC	2	10	53733	53742	0 %	40 %	40 %	20 %	386265085
1113	NC_017452	TTA	2	6	53816	53821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386265085
1114	NC_017452	CGT	2	6	53827	53832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386265085
1115	NC_017452	GTG	2	6	53876	53881	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386265085
1116	NC_017452	TTC	2	6	53920	53925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_017452	GGGAA	2	10	54010	54019	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_017452	ATG	2	6	54043	54048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386265086
1119	NC_017452	TTC	2	6	54076	54081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386265086
1120	NC_017452	GATC	2	8	54186	54193	25 %	25 %	25 %	25 %	386265086
1121	NC_017452	TGA	2	6	54273	54278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386265086
1122	NC_017452	TTGA	2	8	54339	54346	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_017452	A	6	6	54369	54374	100 %	0 %	0 %	0 %	386265087
1124	NC_017452	TTCT	2	8	54385	54392	0 %	75 %	0 %	25 %	386265087
1125	NC_017452	ATCA	2	8	54454	54461	50 %	25 %	0 %	25 %	386265087
1126	NC_017452	CAAA	2	8	54489	54496	75 %	0 %	0 %	25 %	386265087
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1128	NC_017452	A	6	6	54562	54567	100 %	0 %	0 %	0 %	386265087
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