MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haemophilus influenzae R2846 chromosome

Total Repeats: 38718

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_017452	CAAC	2	8	518610	518617	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11002	NC_017452	CTTTT	2	10	518651	518660	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
11003	NC_017452	ATG	2	6	518677	518682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11004	NC_017452	ATC	2	6	518694	518699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11005	NC_017452	ATT	2	6	518754	518759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386265519
11006	NC_017452	GAA	2	6	518782	518787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386265519
11007	NC_017452	TTA	2	6	518788	518793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386265519
11008	NC_017452	TGA	2	6	518862	518867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386265519
11009	NC_017452	CTTTG	2	10	518885	518894	0 %	60 %	20 %	20 %	386265519
11010	NC_017452	TTGA	2	8	518926	518933	25 %	50 %	25 %	0 %	386265519
11011	NC_017452	TGA	2	6	519000	519005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386265519
11012	NC_017452	CTT	2	6	519015	519020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386265519
11013	NC_017452	AACC	2	8	519036	519043	50 %	0 %	0 %	50 %	386265519
11014	NC_017452	ACGT	2	8	519152	519159	25 %	25 %	25 %	25 %	386265519
11015	NC_017452	ACATT	2	10	519217	519226	40 %	40 %	0 %	20 %	386265519
11016	NC_017452	GCG	2	6	519277	519282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386265519
11017	NC_017452	TAG	2	6	519323	519328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386265519
11018	NC_017452	TG	3	6	519335	519340	0 %	50 %	50 %	0 %	386265519
11019	NC_017452	GATTT	2	10	519416	519425	20 %	60 %	20 %	0 %	386265519
11020	NC_017452	AATC	2	8	519439	519446	50 %	25 %	0 %	25 %	386265519
11021	NC_017452	A	6	6	519462	519467	100 %	0 %	0 %	0 %	386265519
11022	NC_017452	AGA	2	6	519486	519491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386265519
11023	NC_017452	AAC	2	6	519494	519499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386265519
11024	NC_017452	A	6	6	519549	519554	100 %	0 %	0 %	0 %	386265519
11025	NC_017452	A	6	6	519570	519575	100 %	0 %	0 %	0 %	386265519
11026	NC_017452	TTAA	2	8	519592	519599	50 %	50 %	0 %	0 %	386265519
11027	NC_017452	CAA	2	6	519604	519609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386265519
11028	NC_017452	AAC	2	6	519693	519698	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386265519
11029	NC_017452	A	6	6	519742	519747	100 %	0 %	0 %	0 %	386265519
11030	NC_017452	TAG	2	6	519777	519782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386265519
11031	NC_017452	A	6	6	519837	519842	100 %	0 %	0 %	0 %	386265519
11032	NC_017452	TG	3	6	519856	519861	0 %	50 %	50 %	0 %	386265519
11033	NC_017452	A	7	7	519971	519977	100 %	0 %	0 %	0 %	386265519
11034	NC_017452	CAA	2	6	520006	520011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386265519
11035	NC_017452	ATG	2	6	520034	520039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386265519
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11037	NC_017452	TGA	2	6	520122	520127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386265519
11038	NC_017452	TGAA	2	8	520280	520287	50 %	25 %	25 %	0 %	386265519
11039	NC_017452	GC	3	6	520292	520297	0 %	0 %	50 %	50 %	386265519
11040	NC_017452	ATT	2	6	520319	520324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386265519
11041	NC_017452	ATT	2	6	520335	520340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386265519
11042	NC_017452	GCA	2	6	520438	520443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386265519
11043	NC_017452	TGG	2	6	520446	520451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386265519
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11045	NC_017452	AATT	2	8	520547	520554	50 %	50 %	0 %	0 %	386265519
11046	NC_017452	ATTTG	2	10	520596	520605	20 %	60 %	20 %	0 %	386265519
11047	NC_017452	AG	3	6	520650	520655	50 %	0 %	50 %	0 %	386265519
11048	NC_017452	TGA	2	6	520685	520690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386265519
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11050	NC_017452	T	6	6	520730	520735	0 %	100 %	0 %	0 %	386265519
11051	NC_017452	AAT	2	6	520738	520743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386265519
11052	NC_017452	GAA	2	6	520777	520782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386265519
11053	NC_017452	TAA	2	6	520839	520844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386265519
11054	NC_017452	TTG	2	6	520857	520862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386265519
11055	NC_017452	GAT	2	6	520863	520868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386265519
11056	NC_017452	AT	3	6	520874	520879	50 %	50 %	0 %	0 %	386265519
11057	NC_017452	A	6	6	520909	520914	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11058	NC_017452	AAAC	2	8	520926	520933	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11059	NC_017452	A	6	6	520939	520944	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11060	NC_017452	T	8	8	520959	520966	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11061	NC_017452	TTA	2	6	520988	520993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11062	NC_017452	ACG	2	6	521017	521022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11063	NC_017452	GC	3	6	521099	521104	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11064	NC_017452	AAC	2	6	521119	521124	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11065	NC_017452	TGG	2	6	521131	521136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11066	NC_017452	ATCTT	2	10	521208	521217	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
11067	NC_017452	AT	3	6	521327	521332	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11068	NC_017452	TG	3	6	521342	521347	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11069	NC_017452	TTG	2	6	521353	521358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11070	NC_017452	T	6	6	521379	521384	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11071	NC_017452	TCA	2	6	521420	521425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11072	NC_017452	T	6	6	521430	521435	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11073	NC_017452	AGT	2	6	521437	521442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11074	NC_017452	TTTA	2	8	521445	521452	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11075	NC_017452	TTGAA	2	10	521482	521491	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
11076	NC_017452	GGC	2	6	521521	521526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11077	NC_017452	GCTT	2	8	521565	521572	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11078	NC_017452	ACG	2	6	521635	521640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11079	NC_017452	TAT	2	6	521663	521668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11080	NC_017452	TGG	2	6	521736	521741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11081	NC_017452	GCA	2	6	521834	521839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11082	NC_017452	G	6	6	521859	521864	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11083	NC_017452	TGAA	2	8	521888	521895	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11084	NC_017452	AGA	2	6	521976	521981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11085	NC_017452	CAG	2	6	522002	522007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11086	NC_017452	AGGG	2	8	522146	522153	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
11087	NC_017452	GGA	2	6	522193	522198	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11088	NC_017452	CGAAGG	2	12	522203	522214	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
11089	NC_017452	GGGGTT	2	12	522313	522324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11090	NC_017452	GAA	2	6	522454	522459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11091	NC_017452	AAG	2	6	522482	522487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11092	NC_017452	TGC	2	6	522530	522535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11093	NC_017452	GTC	2	6	522542	522547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11094	NC_017452	TTG	2	6	522603	522608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11095	NC_017452	GGA	2	6	522655	522660	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11096	NC_017452	TCA	2	6	522680	522685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11097	NC_017452	AC	3	6	522706	522711	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11098	NC_017452	GAAGC	2	10	522736	522745	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
11099	NC_017452	AC	3	6	522875	522880	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11100	NC_017452	CCT	2	6	523016	523021	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11101	NC_017452	GA	3	6	523032	523037	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11102	NC_017452	CA	3	6	523049	523054	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11103	NC_017452	AGA	2	6	523084	523089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11104	NC_017452	GGT	2	6	523117	523122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11105	NC_017452	GGT	2	6	523152	523157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11106	NC_017452	CAC	2	6	523175	523180	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11107	NC_017452	GAGT	2	8	523186	523193	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11108	NC_017452	GTGTA	2	10	523204	523213	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
11109	NC_017452	TAA	2	6	523220	523225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11110	NC_017452	TTA	2	6	523245	523250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11111	NC_017452	ATG	2	6	523255	523260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11112	NC_017452	GCCT	2	8	523290	523297	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11113	NC_017452	AGG	2	6	523305	523310	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11114	NC_017452	CCA	2	6	523335	523340	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11115	NC_017452	ATC	2	6	523344	523349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11116	NC_017452	TAA	2	6	523376	523381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11117	NC_017452	TTATT	2	10	523420	523429	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11118	NC_017452	TTTAAA	2	12	523442	523453	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11119	NC_017452	TTTA	2	8	523470	523477	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11120	NC_017452	GAT	2	6	523480	523485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11121	NC_017452	A	6	6	523514	523519	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11122	NC_017452	GA	3	6	523550	523555	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11123	NC_017452	AGGCA	2	10	523566	523575	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
11124	NC_017452	AAC	2	6	523614	523619	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11125	NC_017452	TTGA	2	8	523639	523646	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11126	NC_017452	TGAA	2	8	523670	523677	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11127	NC_017452	GAA	2	6	523793	523798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11128	NC_017452	GAA	2	6	523882	523887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11129	NC_017452	CTA	2	6	523889	523894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11131	NC_017452	TTG	2	6	523915	523920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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