MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haemophilus influenzae R2846 chromosome

Total Repeats: 38718

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_017452	TTG	2	6	218006	218011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386265247
4502	NC_017452	GTTC	2	8	218098	218105	0 %	50 %	25 %	25 %	386265247
4503	NC_017452	T	7	7	218197	218203	0 %	100 %	0 %	0 %	386265247
4504	NC_017452	GTT	2	6	218213	218218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386265247
4505	NC_017452	TTA	2	6	218220	218225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386265247
4506	NC_017452	TCA	2	6	218241	218246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386265247
4507	NC_017452	GAA	2	6	218273	218278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386265247
4508	NC_017452	CTT	2	6	218287	218292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386265247
4509	NC_017452	AAGC	2	8	218302	218309	50 %	0 %	25 %	25 %	386265247
4510	NC_017452	AG	3	6	218367	218372	50 %	0 %	50 %	0 %	386265247
4511	NC_017452	T	6	6	218486	218491	0 %	100 %	0 %	0 %	386265247
4512	NC_017452	T	6	6	218526	218531	0 %	100 %	0 %	0 %	386265247
4513	NC_017452	TTG	2	6	218603	218608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386265247
4514	NC_017452	GCC	2	6	218652	218657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386265247
4515	NC_017452	CGG	2	6	218666	218671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386265247
4516	NC_017452	T	7	7	218715	218721	0 %	100 %	0 %	0 %	386265247
4517	NC_017452	A	7	7	218723	218729	100 %	0 %	0 %	0 %	386265247
4518	NC_017452	CTG	2	6	218735	218740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386265247
4519	NC_017452	AAT	2	6	218747	218752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386265247
4520	NC_017452	GAT	2	6	218858	218863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386265247
4521	NC_017452	T	6	6	218872	218877	0 %	100 %	0 %	0 %	386265247
4522	NC_017452	CAAT	2	8	218925	218932	50 %	25 %	0 %	25 %	386265248
4523	NC_017452	GGC	2	6	218975	218980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386265248
4524	NC_017452	ATC	2	6	219018	219023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386265248
4525	NC_017452	ACC	2	6	219063	219068	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386265248
4526	NC_017452	CAT	2	6	219220	219225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386265248
4527	NC_017452	CAA	2	6	219308	219313	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386265248
4528	NC_017452	CAA	2	6	219398	219403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386265248
4529	NC_017452	AAC	2	6	219432	219437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386265248
4530	NC_017452	CAA	2	6	219455	219460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386265248
4531	NC_017452	TGC	2	6	219474	219479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386265248
4532	NC_017452	GT	3	6	219494	219499	0 %	50 %	50 %	0 %	386265248
4533	NC_017452	CTG	2	6	219506	219511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386265248
4534	NC_017452	ATC	2	6	219579	219584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386265248
4535	NC_017452	AAC	2	6	219585	219590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386265248
4536	NC_017452	CAA	2	6	219595	219600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386265248
4537	NC_017452	AAT	2	6	219653	219658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386265249
4538	NC_017452	TGC	2	6	219662	219667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386265249
4539	NC_017452	CCG	2	6	219726	219731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386265249
4540	NC_017452	TGA	2	6	219743	219748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386265249
4541	NC_017452	AGC	2	6	219818	219823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386265249
4542	NC_017452	TCA	2	6	219902	219907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386265249
4543	NC_017452	AAATC	2	10	219912	219921	60 %	20 %	0 %	20 %	386265249
4544	NC_017452	GTGC	2	8	219938	219945	0 %	25 %	50 %	25 %	386265249
4545	NC_017452	TGC	2	6	220003	220008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386265249
4546	NC_017452	AGT	2	6	220211	220216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386265249
4547	NC_017452	TTCG	2	8	220267	220274	0 %	50 %	25 %	25 %	386265249
4548	NC_017452	TAA	2	6	220380	220385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4549	NC_017452	A	6	6	220384	220389	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4550	NC_017452	GAAAA	2	10	220410	220419	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
4551	NC_017452	ATC	2	6	220478	220483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4552	NC_017452	TTG	2	6	220511	220516	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4553	NC_017452	A	6	6	220540	220545	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4554	NC_017452	ATA	2	6	220638	220643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4555	NC_017452	TA	3	6	220690	220695	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4556	NC_017452	TAT	2	6	220701	220706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4557	NC_017452	T	6	6	220706	220711	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4558	NC_017452	TCAA	26	104	220752	220855	50 %	25 %	0 %	25 %	386265250
4559	NC_017452	ATT	2	6	220864	220869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386265250
4560	NC_017452	ATG	2	6	220925	220930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386265250
4561	NC_017452	CAAT	2	8	220941	220948	50 %	25 %	0 %	25 %	386265250
4562	NC_017452	ATT	2	6	220964	220969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386265250
4563	NC_017452	A	7	7	220986	220992	100 %	0 %	0 %	0 %	386265250
4564	NC_017452	T	6	6	220996	221001	0 %	100 %	0 %	0 %	386265250
4565	NC_017452	ATACT	2	10	221025	221034	40 %	40 %	0 %	20 %	386265250
4566	NC_017452	AATT	2	8	221042	221049	50 %	50 %	0 %	0 %	386265250
4567	NC_017452	ATGAAT	2	12	221057	221068	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386265250
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4569	NC_017452	ATC	2	6	221085	221090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386265250
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4572	NC_017452	TCA	3	9	221346	221354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386265250
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4574	NC_017452	ATT	2	6	221373	221378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386265250
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4583	NC_017452	A	7	7	221611	221617	100 %	0 %	0 %	0 %	386265250
4584	NC_017452	TA	3	6	221622	221627	50 %	50 %	0 %	0 %	386265250
4585	NC_017452	GTT	2	6	221664	221669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386265250
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4587	NC_017452	CA	3	6	221746	221751	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4588	NC_017452	ACA	2	6	221796	221801	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4589	NC_017452	T	6	6	221820	221825	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4590	NC_017452	CA	3	6	221852	221857	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4591	NC_017452	T	6	6	221872	221877	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4592	NC_017452	AAT	2	6	221884	221889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4593	NC_017452	CA	3	6	221948	221953	50 %	0 %	0 %	50 %	386265251
4594	NC_017452	ATT	2	6	221962	221967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386265251
4595	NC_017452	GGT	3	9	221983	221991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386265251
4596	NC_017452	AAG	2	6	222054	222059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386265251
4597	NC_017452	A	6	6	222102	222107	100 %	0 %	0 %	0 %	386265251
4598	NC_017452	A	6	6	222239	222244	100 %	0 %	0 %	0 %	386265251
4599	NC_017452	ATT	2	6	222302	222307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386265251
4600	NC_017452	CGG	2	6	222331	222336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386265251
4601	NC_017452	AT	3	6	222364	222369	50 %	50 %	0 %	0 %	386265251
4602	NC_017452	AAT	2	6	222497	222502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386265251
4603	NC_017452	TTA	2	6	222503	222508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386265251
4604	NC_017452	ATG	2	6	222579	222584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386265251
4605	NC_017452	CAA	2	6	222742	222747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386265251
4606	NC_017452	CGC	2	6	222776	222781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386265251
4607	NC_017452	TTGG	2	8	222834	222841	0 %	50 %	50 %	0 %	386265251
4608	NC_017452	A	6	6	222861	222866	100 %	0 %	0 %	0 %	386265251
4609	NC_017452	AAT	2	6	222896	222901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386265251
4610	NC_017452	T	6	6	222945	222950	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4611	NC_017452	GAA	3	9	222953	222961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4612	NC_017452	TTC	2	6	223078	223083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4613	NC_017452	ATT	2	6	223144	223149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386265252
4614	NC_017452	ATT	2	6	223264	223269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386265252
4615	NC_017452	T	6	6	223288	223293	0 %	100 %	0 %	0 %	386265252
4616	NC_017452	CGT	3	9	223298	223306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386265252
4617	NC_017452	ATT	2	6	223333	223338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386265252
4618	NC_017452	CAT	2	6	223351	223356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386265252
4619	NC_017452	CA	3	6	223375	223380	50 %	0 %	0 %	50 %	386265252
4620	NC_017452	T	7	7	223418	223424	0 %	100 %	0 %	0 %	386265252
4621	NC_017452	TCG	2	6	223456	223461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386265252
4622	NC_017452	GGC	2	6	223561	223566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386265252
4623	NC_017452	GCA	2	6	223666	223671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386265252
4624	NC_017452	T	6	6	223753	223758	0 %	100 %	0 %	0 %	386265252
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4743	NC_017452	CAAG	2	8	230677	230684	50 %	0 %	25 %	25 %	386265259
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4871	NC_017452	T	6	6	237677	237682	0 %	100 %	0 %	0 %	386265268
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4997	NC_017452	AT	3	6	243650	243655	50 %	50 %	0 %	0 %	386265272
4998	NC_017452	CTT	2	6	243706	243711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386265272
4999	NC_017452	GAC	2	6	243751	243756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386265272
5000	NC_017452	A	6	6	243830	243835	100 %	0 %	0 %	0 %	386265272

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