MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haemophilus influenzae R2866 chromosome

Total Repeats: 40949

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017451	ATG	2	6	20	25	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386263234
2	NC_017451	GGT	3	9	37	45	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386263234
3	NC_017451	TTA	2	6	100	105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386263234
4	NC_017451	TGG	2	6	153	158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386263234
5	NC_017451	AAG	2	6	182	187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386263234
6	NC_017451	TGC	2	6	216	221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386263234
7	NC_017451	CAG	2	6	269	274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386263234
8	NC_017451	CAA	2	6	364	369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386263234
9	NC_017451	CCG	2	6	604	609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386263234
10	NC_017451	ACA	2	6	651	656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386263234
11	NC_017451	TGA	2	6	699	704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386263234
12	NC_017451	CAA	2	6	712	717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386263234
13	NC_017451	TA	3	6	727	732	50 %	50 %	0 %	0 %	386263234
14	NC_017451	TAA	2	6	768	773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386263234
15	NC_017451	CCAT	2	8	832	839	25 %	25 %	0 %	50 %	386263234
16	NC_017451	ATTT	2	8	883	890	25 %	75 %	0 %	0 %	386263234
17	NC_017451	ATT	2	6	1037	1042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386263234
18	NC_017451	GAA	2	6	1132	1137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386263234
19	NC_017451	TGG	2	6	1238	1243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386263234
20	NC_017451	TAC	2	6	1313	1318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386263234
21	NC_017451	TGAT	2	8	1370	1377	25 %	50 %	25 %	0 %	386263234
22	NC_017451	TCAA	2	8	1397	1404	50 %	25 %	0 %	25 %	386263234
23	NC_017451	A	6	6	1403	1408	100 %	0 %	0 %	0 %	386263234
24	NC_017451	GCA	2	6	1442	1447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386263234
25	NC_017451	AGA	2	6	1476	1481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386263234
26	NC_017451	CGT	2	6	1540	1545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386263234
27	NC_017451	CTT	2	6	1571	1576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386263234
28	NC_017451	CAA	2	6	1663	1668	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386263234
29	NC_017451	GAA	2	6	1669	1674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386263234
30	NC_017451	AAAAAC	2	12	1679	1690	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	386263234
31	NC_017451	AAC	2	6	1772	1777	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386263234
32	NC_017451	GCA	2	6	1828	1833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386263234
33	NC_017451	ATT	2	6	1840	1845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386263234
34	NC_017451	A	6	6	1858	1863	100 %	0 %	0 %	0 %	386263234
35	NC_017451	T	6	6	1893	1898	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017451	A	7	7	1901	1907	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017451	ATT	2	6	1959	1964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017451	TA	3	6	2006	2011	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017451	T	6	6	2020	2025	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017451	AAC	2	6	2027	2032	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017451	TAT	2	6	2037	2042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017451	T	6	6	2065	2070	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017451	GTG	2	6	2163	2168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386263235
44	NC_017451	TA	3	6	2181	2186	50 %	50 %	0 %	0 %	386263235
45	NC_017451	A	6	6	2198	2203	100 %	0 %	0 %	0 %	386263235
46	NC_017451	TAAC	2	8	2241	2248	50 %	25 %	0 %	25 %	386263235
47	NC_017451	CTT	2	6	2262	2267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386263235
48	NC_017451	GGT	2	6	2273	2278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386263235
49	NC_017451	GTG	2	6	2319	2324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386263235
50	NC_017451	CA	3	6	2357	2362	50 %	0 %	0 %	50 %	386263235
51	NC_017451	TAAG	2	8	2458	2465	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017451	CGT	3	9	2609	2617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386263236
53	NC_017451	TTC	2	6	2637	2642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386263236
54	NC_017451	TTA	2	6	2679	2684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386263236
55	NC_017451	A	6	6	2705	2710	100 %	0 %	0 %	0 %	386263236
56	NC_017451	AATC	2	8	2721	2728	50 %	25 %	0 %	25 %	386263236
57	NC_017451	ACGT	2	8	2805	2812	25 %	25 %	25 %	25 %	386263236
58	NC_017451	TCG	2	6	2833	2838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386263236
59	NC_017451	TGG	2	6	2842	2847	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386263236
60	NC_017451	CGT	2	6	2885	2890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386263236
61	NC_017451	AGC	2	6	2920	2925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386263236
62	NC_017451	GTG	2	6	2934	2939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386263236
63	NC_017451	ATA	2	6	2988	2993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386263236
64	NC_017451	GCA	2	6	2999	3004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386263236
65	NC_017451	A	6	6	3008	3013	100 %	0 %	0 %	0 %	386263236
66	NC_017451	TAA	2	6	3071	3076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386263236
67	NC_017451	TCA	2	6	3097	3102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017451	TGA	2	6	3104	3109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017451	TA	3	6	3121	3126	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017451	TAAA	2	8	3136	3143	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017451	TAA	2	6	3152	3157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386263237
72	NC_017451	ACT	4	12	3226	3237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386263237
73	NC_017451	GCA	2	6	3295	3300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386263237
74	NC_017451	TGGA	2	8	3310	3317	25 %	25 %	50 %	0 %	386263237
75	NC_017451	ACAAGA	2	12	3318	3329	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	386263237
76	NC_017451	GCA	2	6	3352	3357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386263237
77	NC_017451	TCTGG	2	10	3368	3377	0 %	40 %	40 %	20 %	386263237
78	NC_017451	CAA	2	6	3385	3390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386263237
79	NC_017451	TGG	2	6	3504	3509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386263237
80	NC_017451	CTT	2	6	3606	3611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386263237
81	NC_017451	GTT	2	6	3616	3621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386263237
82	NC_017451	AGA	2	6	3681	3686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386263237
83	NC_017451	TTGAT	2	10	3704	3713	20 %	60 %	20 %	0 %	386263237
84	NC_017451	GAA	2	6	3769	3774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386263237
85	NC_017451	GAA	2	6	3802	3807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386263237
86	NC_017451	TTG	2	6	3821	3826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386263237
87	NC_017451	AGA	2	6	3846	3851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386263237
88	NC_017451	GAA	3	9	3889	3897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386263237
89	NC_017451	ATT	2	6	3937	3942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386263237
90	NC_017451	GTT	2	6	4000	4005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386263237
91	NC_017451	TACC	2	8	4009	4016	25 %	25 %	0 %	50 %	386263237
92	NC_017451	TGA	2	6	4086	4091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386263237
93	NC_017451	TTC	2	6	4153	4158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386263237
94	NC_017451	TCGTA	2	10	4233	4242	20 %	40 %	20 %	20 %	386263237
95	NC_017451	TAA	2	6	4254	4259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386263237
96	NC_017451	GAA	2	6	4264	4269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386263237
97	NC_017451	AAG	2	6	4274	4279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386263237
98	NC_017451	GCT	2	6	4300	4305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386263237
99	NC_017451	ACT	2	6	4324	4329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386263237
100	NC_017451	A	6	6	4436	4441	100 %	0 %	0 %	0 %	386263237
101	NC_017451	AAG	2	6	4469	4474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386263237
102	NC_017451	CA	3	6	4492	4497	50 %	0 %	0 %	50 %	386263237
103	NC_017451	ATT	2	6	4519	4524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386263237
104	NC_017451	TTG	2	6	4556	4561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386263237
105	NC_017451	ATG	2	6	4646	4651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386263237
106	NC_017451	TGG	2	6	4677	4682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386263237
107	NC_017451	TGT	2	6	4701	4706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386263237
108	NC_017451	AAC	2	6	4820	4825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386263237
109	NC_017451	AGT	2	6	4854	4859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386263237
110	NC_017451	ATG	2	6	4895	4900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386263237
111	NC_017451	TGC	2	6	4929	4934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386263237
112	NC_017451	AGTTGA	2	12	4998	5009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386263237
113	NC_017451	CGT	3	9	5053	5061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386263237
114	NC_017451	AAG	2	6	5078	5083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386263237
115	NC_017451	TGT	2	6	5094	5099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386263237
116	NC_017451	CAT	2	6	5177	5182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386263237
117	NC_017451	CAA	2	6	5216	5221	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386263237
118	NC_017451	A	6	6	5251	5256	100 %	0 %	0 %	0 %	386263237
119	NC_017451	CTT	2	6	5304	5309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_017451	AAC	2	6	5398	5403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386263238
121	NC_017451	CAG	2	6	5409	5414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386263238
122	NC_017451	GGT	2	6	5444	5449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386263238
123	NC_017451	AGA	2	6	5485	5490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386263238
124	NC_017451	GCG	2	6	5609	5614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386263238
125	NC_017451	ATGG	2	8	5618	5625	25 %	25 %	50 %	0 %	386263238
126	NC_017451	TAG	3	9	5634	5642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386263238
127	NC_017451	TTA	2	6	5684	5689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386263238
128	NC_017451	CAT	2	6	5713	5718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386263238
129	NC_017451	TTA	2	6	5759	5764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386263238
130	NC_017451	TAG	2	6	5769	5774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386263238
131	NC_017451	GAA	2	6	5879	5884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386263238
132	NC_017451	A	6	6	5883	5888	100 %	0 %	0 %	0 %	386263238
133	NC_017451	ACT	2	6	5904	5909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386263238
134	NC_017451	CCAGAA	2	12	5924	5935	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	386263238
135	NC_017451	CTT	2	6	5957	5962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386263238
136	NC_017451	GTA	2	6	6002	6007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386263238
137	NC_017451	ATC	2	6	6029	6034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386263238
138	NC_017451	TGA	2	6	6043	6048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386263238
139	NC_017451	TCG	2	6	6057	6062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386263238
140	NC_017451	ACT	2	6	6083	6088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386263238
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142	NC_017451	GAA	2	6	6176	6181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386263238
143	NC_017451	CACAC	2	10	6220	6229	40 %	0 %	0 %	60 %	386263238
144	NC_017451	TAT	2	6	6255	6260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386263238
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148	NC_017451	GTT	2	6	6485	6490	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386263238
149	NC_017451	ATC	2	6	6497	6502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386263238
150	NC_017451	ATA	2	6	6505	6510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386263238
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152	NC_017451	AAAAG	2	10	6554	6563	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017451	T	7	7	6584	6590	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_017451	ATT	2	6	6627	6632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_017451	AAT	2	6	6659	6664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386263239
156	NC_017451	CAA	2	6	6677	6682	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386263239
157	NC_017451	TTC	2	6	6684	6689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386263239
158	NC_017451	AAT	2	6	6794	6799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386263239
159	NC_017451	AC	3	6	6821	6826	50 %	0 %	0 %	50 %	386263239
160	NC_017451	AT	3	6	6862	6867	50 %	50 %	0 %	0 %	386263239
161	NC_017451	ATA	2	6	6925	6930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386263239
162	NC_017451	T	6	6	6994	6999	0 %	100 %	0 %	0 %	386263240
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168	NC_017451	GTT	2	6	7135	7140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386263240
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176	NC_017451	AGTTA	2	10	7396	7405	40 %	40 %	20 %	0 %	386263241
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189	NC_017451	ATTGAT	2	12	7980	7991	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386263242
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191	NC_017451	TTA	2	6	8020	8025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386263242
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195	NC_017451	CG	3	6	8403	8408	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
196	NC_017451	TGG	2	6	8485	8490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386263243
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209	NC_017451	TCTA	2	8	9206	9213	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
210	NC_017451	T	8	8	9222	9229	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
211	NC_017451	CAA	2	6	9257	9262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386263244
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231	NC_017451	T	6	6	10289	10294	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
232	NC_017451	GTT	2	6	10304	10309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
233	NC_017451	TAT	2	6	10330	10335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
234	NC_017451	AATT	2	8	10363	10370	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
235	NC_017451	TTG	2	6	10434	10439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386263246
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258	NC_017451	TTTCTG	2	12	11579	11590	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	386263247
259	NC_017451	T	6	6	11599	11604	0 %	100 %	0 %	0 %	386263247
260	NC_017451	TTA	2	6	11609	11614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386263247
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262	NC_017451	TGA	2	6	11712	11717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386263247
263	NC_017451	AT	3	6	11727	11732	50 %	50 %	0 %	0 %	386263247
264	NC_017451	AATT	2	8	11952	11959	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
265	NC_017451	TCG	2	6	12068	12073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386263248
266	NC_017451	TCA	2	6	12146	12151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386263248
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268	NC_017451	CTT	2	6	12183	12188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386263248
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396	NC_017451	TAA	2	6	18262	18267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
397	NC_017451	AGA	2	6	18417	18422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386263252
398	NC_017451	GC	3	6	18449	18454	0 %	0 %	50 %	50 %	386263252
399	NC_017451	A	6	6	18487	18492	100 %	0 %	0 %	0 %	386263252
400	NC_017451	TAT	2	6	18553	18558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386263252
401	NC_017451	GAAA	2	8	18621	18628	75 %	0 %	25 %	0 %	386263252
402	NC_017451	GTT	2	6	18646	18651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386263252
403	NC_017451	GCA	2	6	18688	18693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386263252
404	NC_017451	ATTT	2	8	18707	18714	25 %	75 %	0 %	0 %	386263252
405	NC_017451	TGCC	2	8	18740	18747	0 %	25 %	25 %	50 %	386263252
406	NC_017451	TAT	2	6	18772	18777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386263252
407	NC_017451	GTT	2	6	18871	18876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386263252
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410	NC_017451	TGA	2	6	18939	18944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386263252
411	NC_017451	TAA	2	6	18983	18988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
412	NC_017451	TTC	2	6	19055	19060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386263253
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429	NC_017451	T	6	6	20040	20045	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
430	NC_017451	GAG	2	6	20049	20054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
431	NC_017451	TAT	2	6	20068	20073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
432	NC_017451	AAT	2	6	20080	20085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
433	NC_017451	TATTT	2	10	20100	20109	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
434	NC_017451	CTTT	2	8	20111	20118	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
435	NC_017451	ATC	2	6	20131	20136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
436	NC_017451	A	6	6	20149	20154	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
437	NC_017451	TAAA	2	8	20156	20163	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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439	NC_017451	A	6	6	20208	20213	100 %	0 %	0 %	0 %	386263254
440	NC_017451	A	6	6	20307	20312	100 %	0 %	0 %	0 %	386263254
441	NC_017451	ATT	2	6	20327	20332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386263254
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450	NC_017451	CA	4	8	20514	20521	50 %	0 %	0 %	50 %	386263254
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453	NC_017451	T	6	6	20709	20714	0 %	100 %	0 %	0 %	386263255
454	NC_017451	CGA	2	6	20722	20727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386263255
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465	NC_017451	TTA	2	6	21114	21119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
466	NC_017451	TTA	2	6	21145	21150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
467	NC_017451	A	8	8	21155	21162	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
468	NC_017451	A	7	7	21211	21217	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
469	NC_017451	T	7	7	21260	21266	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
470	NC_017451	ATT	2	6	21324	21329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386263256
471	NC_017451	ATA	2	6	21475	21480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386263256
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497	NC_017451	AAAT	2	8	22802	22809	75 %	25 %	0 %	0 %	386263256
498	NC_017451	A	6	6	22878	22883	100 %	0 %	0 %	0 %	386263256
499	NC_017451	CAA	2	6	22889	22894	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386263256
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