MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haemophilus influenzae R2866 chromosome

Total Repeats: 40949

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017451	GCA	2	6	191617	191622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386263417
4002	NC_017451	GAT	2	6	191629	191634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386263417
4003	NC_017451	TGG	2	6	191642	191647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386263417
4004	NC_017451	AAG	2	6	191786	191791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386263417
4005	NC_017451	AGC	2	6	191796	191801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386263417
4006	NC_017451	TCA	2	6	191805	191810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386263417
4007	NC_017451	AAT	2	6	191816	191821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386263417
4008	NC_017451	GAATT	2	10	191846	191855	40 %	40 %	20 %	0 %	386263418
4009	NC_017451	T	6	6	191854	191859	0 %	100 %	0 %	0 %	386263418
4010	NC_017451	TTG	2	6	191883	191888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386263418
4011	NC_017451	TGATTT	2	12	191904	191915	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	386263418
4012	NC_017451	ATT	3	9	191939	191947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386263418
4013	NC_017451	ACGT	2	8	191986	191993	25 %	25 %	25 %	25 %	386263418
4014	NC_017451	TAAA	2	8	192024	192031	75 %	25 %	0 %	0 %	386263418
4015	NC_017451	TCG	2	6	192052	192057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386263418
4016	NC_017451	ATT	2	6	192149	192154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386263418
4017	NC_017451	GTG	2	6	192309	192314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386263418
4018	NC_017451	TGA	2	6	192469	192474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386263418
4019	NC_017451	ACG	2	6	192479	192484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386263418
4020	NC_017451	GAA	2	6	192549	192554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_017451	AT	3	6	192590	192595	50 %	50 %	0 %	0 %	386263419
4022	NC_017451	TCG	2	6	192599	192604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386263419
4023	NC_017451	T	6	6	192644	192649	0 %	100 %	0 %	0 %	386263419
4024	NC_017451	TTTTAG	2	12	192658	192669	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	386263419
4025	NC_017451	TAT	2	6	192695	192700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386263419
4026	NC_017451	AAG	2	6	192832	192837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386263419
4027	NC_017451	AGA	2	6	192845	192850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386263419
4028	NC_017451	ATA	3	9	192889	192897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386263419
4029	NC_017451	TAG	2	6	192907	192912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386263419
4030	NC_017451	AAG	2	6	192922	192927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386263419
4031	NC_017451	GAA	2	6	192936	192941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386263419
4032	NC_017451	AAT	2	6	193035	193040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386263420
4033	NC_017451	AAAG	2	8	193046	193053	75 %	0 %	25 %	0 %	386263420
4034	NC_017451	GTG	2	6	193147	193152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386263420
4035	NC_017451	TTG	2	6	193186	193191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386263420
4036	NC_017451	GCT	2	6	193203	193208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386263420
4037	NC_017451	CAA	3	9	193227	193235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386263420
4038	NC_017451	A	8	8	193234	193241	100 %	0 %	0 %	0 %	386263420
4039	NC_017451	TGT	2	6	193274	193279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386263420
4040	NC_017451	GAA	2	6	193281	193286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386263420
4041	NC_017451	ACC	2	6	193289	193294	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386263420
4042	NC_017451	AAG	2	6	193306	193311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386263420
4043	NC_017451	CAA	2	6	193323	193328	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386263420
4044	NC_017451	AAG	2	6	193342	193347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386263420
4045	NC_017451	A	6	6	193389	193394	100 %	0 %	0 %	0 %	386263420
4046	NC_017451	CAA	2	6	193395	193400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386263420
4047	NC_017451	AAG	2	6	193414	193419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386263420
4048	NC_017451	AAGC	2	8	193434	193441	50 %	0 %	25 %	25 %	386263420
4049	NC_017451	AGGCTA	2	12	193447	193458	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386263420
4050	NC_017451	GCT	2	6	193512	193517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386263420
4051	NC_017451	GAA	2	6	193533	193538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386263420
4052	NC_017451	AGC	2	6	193553	193558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386263420
4053	NC_017451	TGC	2	6	193565	193570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386263420
4054	NC_017451	GCC	2	6	193632	193637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386263420
4055	NC_017451	GCAAAA	2	12	193668	193679	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	386263420
4056	NC_017451	GCT	2	6	193731	193736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386263420
4057	NC_017451	GCA	2	6	193779	193784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386263420
4058	NC_017451	GCAAAA	2	12	193788	193799	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	386263420
4059	NC_017451	GCT	2	6	193818	193823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386263420
4060	NC_017451	CAAG	2	8	193848	193855	50 %	0 %	25 %	25 %	386263420
4061	NC_017451	GAT	2	6	193860	193865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386263420
4062	NC_017451	TGG	2	6	193886	193891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386263420
4063	NC_017451	TGC	2	6	193946	193951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386263420
4064	NC_017451	TGG	2	6	193967	193972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386263420
4065	NC_017451	AAGA	2	8	194004	194011	75 %	0 %	25 %	0 %	386263420
4066	NC_017451	CGT	2	6	194019	194024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386263420
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4068	NC_017451	TGA	2	6	194123	194128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386263420
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4070	NC_017451	ATT	2	6	194220	194225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386263420
4071	NC_017451	ATT	2	6	194290	194295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386263421
4072	NC_017451	TGA	2	6	194377	194382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386263421
4073	NC_017451	GC	3	6	194396	194401	0 %	0 %	50 %	50 %	386263421
4074	NC_017451	TTG	2	6	194421	194426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386263421
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4079	NC_017451	AAAT	2	8	194701	194708	75 %	25 %	0 %	0 %	386263421
4080	NC_017451	GC	3	6	194721	194726	0 %	0 %	50 %	50 %	386263421
4081	NC_017451	TGA	2	6	194737	194742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386263421
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4085	NC_017451	ATG	2	6	194850	194855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386263421
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4087	NC_017451	A	6	6	194954	194959	100 %	0 %	0 %	0 %	386263421
4088	NC_017451	TTG	2	6	194967	194972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386263421
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4091	NC_017451	CTT	2	6	195072	195077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386263421
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4093	NC_017451	TAA	2	6	195154	195159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386263421
4094	NC_017451	TTTA	2	8	195196	195203	25 %	75 %	0 %	0 %	386263421
4095	NC_017451	GGT	2	6	195251	195256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386263421
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4101	NC_017451	TAAA	2	8	195562	195569	75 %	25 %	0 %	0 %	386263421
4102	NC_017451	A	6	6	195567	195572	100 %	0 %	0 %	0 %	386263421
4103	NC_017451	ATT	2	6	195612	195617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386263422
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4105	NC_017451	AAC	2	6	195661	195666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386263422
4106	NC_017451	TGC	2	6	195669	195674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386263422
4107	NC_017451	TGC	2	6	195684	195689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386263422
4108	NC_017451	CAA	2	6	195724	195729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386263422
4109	NC_017451	GCT	2	6	195829	195834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386263422
4110	NC_017451	TAG	2	6	195842	195847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386263422
4111	NC_017451	TGA	2	6	195858	195863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386263422
4112	NC_017451	ACA	2	6	195881	195886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386263422
4113	NC_017451	CGT	2	6	195901	195906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386263422
4114	NC_017451	GAA	2	6	195979	195984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386263422
4115	NC_017451	ATG	2	6	196004	196009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386263422
4116	NC_017451	CGT	2	6	196030	196035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386263422
4117	NC_017451	T	6	6	196090	196095	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_017451	TGTTT	2	10	196105	196114	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_017451	GAAT	2	8	196148	196155	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_017451	AGC	2	6	196230	196235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4121	NC_017451	CAC	2	6	196279	196284	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4122	NC_017451	GTT	2	6	196309	196314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4364	NC_017451	GAA	2	6	208179	208184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4365	NC_017451	ATTA	2	8	208255	208262	50 %	50 %	0 %	0 %	386263438
4366	NC_017451	CGAT	2	8	208320	208327	25 %	25 %	25 %	25 %	386263438
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4368	NC_017451	ATC	2	6	208364	208369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386263438
4369	NC_017451	T	6	6	208417	208422	0 %	100 %	0 %	0 %	386263438
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4374	NC_017451	ATATT	2	10	208653	208662	40 %	60 %	0 %	0 %	386263438
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4397	NC_017451	TTTA	2	8	209668	209675	25 %	75 %	0 %	0 %	386263439
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4434	NC_017451	ATT	2	6	211900	211905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4437	NC_017451	A	8	8	212019	212026	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4438	NC_017451	TAAA	2	8	212049	212056	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4439	NC_017451	ACA	2	6	212089	212094	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4441	NC_017451	TAT	2	6	212108	212113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4442	NC_017451	AAT	2	6	212122	212127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4443	NC_017451	TGT	2	6	212128	212133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4444	NC_017451	ATT	2	6	212145	212150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4445	NC_017451	ATCT	2	8	212161	212168	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4446	NC_017451	T	6	6	212168	212173	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4447	NC_017451	ATTC	2	8	212196	212203	25 %	50 %	0 %	25 %	386263441
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4494	NC_017451	CTTT	2	8	214295	214302	0 %	75 %	0 %	25 %	386263443
4495	NC_017451	TGA	2	6	214386	214391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386263443
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4497	NC_017451	GTTT	2	8	214423	214430	0 %	75 %	25 %	0 %	386263443
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