MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haemophilus influenzae R2866 chromosome

Total Repeats: 40949

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017451	GC	3	6	47225	47230	0 %	0 %	50 %	50 %	386263282
1002	NC_017451	ACA	2	6	47322	47327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_017451	A	6	6	47349	47354	100 %	0 %	0 %	0 %	386263283
1004	NC_017451	ATT	2	6	47377	47382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386263283
1005	NC_017451	TGCT	2	8	47408	47415	0 %	50 %	25 %	25 %	386263283
1006	NC_017451	TTG	2	6	47482	47487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386263283
1007	NC_017451	TTG	2	6	47500	47505	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386263283
1008	NC_017451	GAT	2	6	47539	47544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386263283
1009	NC_017451	CGCT	2	8	47555	47562	0 %	25 %	25 %	50 %	386263283
1010	NC_017451	TGG	3	9	47649	47657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386263283
1011	NC_017451	TGGAA	2	10	47688	47697	40 %	20 %	40 %	0 %	386263283
1012	NC_017451	ATT	2	6	47719	47724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386263283
1013	NC_017451	GGT	2	6	47733	47738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386263283
1014	NC_017451	TTAT	2	8	47794	47801	25 %	75 %	0 %	0 %	386263283
1015	NC_017451	ATG	2	6	47836	47841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386263283
1016	NC_017451	T	6	6	47917	47922	0 %	100 %	0 %	0 %	386263283
1017	NC_017451	CTT	2	6	47924	47929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386263283
1018	NC_017451	TTA	2	6	47942	47947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386263283
1019	NC_017451	GCT	2	6	48028	48033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386263283
1020	NC_017451	GT	3	6	48176	48181	0 %	50 %	50 %	0 %	386263283
1021	NC_017451	TCA	2	6	48184	48189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386263283
1022	NC_017451	CTT	2	6	48203	48208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386263283
1023	NC_017451	AAT	2	6	48274	48279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386263283
1024	NC_017451	TTA	2	6	48347	48352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386263283
1025	NC_017451	TG	3	6	48377	48382	0 %	50 %	50 %	0 %	386263283
1026	NC_017451	TTA	2	6	48490	48495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386263283
1027	NC_017451	CGT	2	6	48501	48506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386263283
1028	NC_017451	GTG	2	6	48550	48555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386263283
1029	NC_017451	GAA	2	6	48568	48573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_017451	T	6	6	48626	48631	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_017451	ATA	2	6	48633	48638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_017451	AGA	2	6	48670	48675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_017451	TAA	2	6	48676	48681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_017451	ATG	2	6	48721	48726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386263284
1035	NC_017451	TTC	2	6	48754	48759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386263284
1036	NC_017451	GATC	2	8	48864	48871	25 %	25 %	25 %	25 %	386263284
1037	NC_017451	TGA	2	6	48951	48956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386263284
1038	NC_017451	AG	3	6	48980	48985	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_017451	GCG	2	6	48992	48997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_017451	TTGA	2	8	49017	49024	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_017451	A	6	6	49047	49052	100 %	0 %	0 %	0 %	386263285
1042	NC_017451	TTCT	2	8	49063	49070	0 %	75 %	0 %	25 %	386263285
1043	NC_017451	ATCA	2	8	49132	49139	50 %	25 %	0 %	25 %	386263285
1044	NC_017451	CAAA	2	8	49167	49174	75 %	0 %	0 %	25 %	386263285
1045	NC_017451	CGGA	2	8	49239	49246	25 %	0 %	50 %	25 %	386263285
1046	NC_017451	A	6	6	49252	49257	100 %	0 %	0 %	0 %	386263285
1047	NC_017451	A	6	6	49265	49270	100 %	0 %	0 %	0 %	386263285
1048	NC_017451	ATG	2	6	49291	49296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386263285
1049	NC_017451	ATT	2	6	49345	49350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386263285
1050	NC_017451	GGTTG	2	10	49461	49470	0 %	40 %	60 %	0 %	386263285
1051	NC_017451	AAATGC	2	12	49490	49501	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386263285
1052	NC_017451	ATC	2	6	49516	49521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386263285
1053	NC_017451	TTA	2	6	49563	49568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386263285
1054	NC_017451	CGAG	2	8	49591	49598	25 %	0 %	50 %	25 %	386263285
1055	NC_017451	ATT	2	6	49601	49606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386263285
1056	NC_017451	ATT	2	6	49679	49684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386263285
1057	NC_017451	TTGG	2	8	49732	49739	0 %	50 %	50 %	0 %	386263285
1058	NC_017451	A	6	6	49763	49768	100 %	0 %	0 %	0 %	386263285
1059	NC_017451	ATT	2	6	49796	49801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386263285
1060	NC_017451	A	6	6	49815	49820	100 %	0 %	0 %	0 %	386263285
1061	NC_017451	AATTTT	2	12	49913	49924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_017451	GATTTA	2	12	49967	49978	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386263286
1063	NC_017451	GTC	2	6	50127	50132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386263286
1064	NC_017451	AGA	2	6	50155	50160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386263286
1065	NC_017451	GTT	2	6	50174	50179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386263286
1066	NC_017451	A	6	6	50188	50193	100 %	0 %	0 %	0 %	386263286
1067	NC_017451	ATT	2	6	50223	50228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386263286
1068	NC_017451	AAG	2	6	50247	50252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386263286
1069	NC_017451	GTT	2	6	50261	50266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386263286
1070	NC_017451	GAAAA	2	10	50294	50303	80 %	0 %	20 %	0 %	386263286
1071	NC_017451	A	6	6	50321	50326	100 %	0 %	0 %	0 %	386263286
1072	NC_017451	ATT	2	6	50437	50442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386263286
1073	NC_017451	GCT	2	6	50444	50449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386263286
1074	NC_017451	TGG	2	6	50496	50501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386263286
1075	NC_017451	GGT	2	6	50510	50515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386263286
1076	NC_017451	ATT	2	6	50573	50578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386263286
1077	NC_017451	GGT	2	6	50585	50590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386263286
1078	NC_017451	GCA	2	6	50612	50617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386263286
1079	NC_017451	TTCCAG	2	12	50694	50705	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386263286
1080	NC_017451	GCA	3	9	50741	50749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386263286
1081	NC_017451	GAT	2	6	50777	50782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386263286
1082	NC_017451	CAG	2	6	50811	50816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386263286
1083	NC_017451	GGC	3	9	50957	50965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386263286
1084	NC_017451	ATTT	2	8	50985	50992	25 %	75 %	0 %	0 %	386263286
1085	NC_017451	GTG	3	9	51027	51035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386263286
1086	NC_017451	TGG	2	6	51134	51139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_017451	CAT	2	6	51152	51157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1088	NC_017451	TTC	2	6	51167	51172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1089	NC_017451	ATT	2	6	51225	51230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386263287
1090	NC_017451	TG	3	6	51325	51330	0 %	50 %	50 %	0 %	386263287
1091	NC_017451	CTG	2	6	51362	51367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386263287
1092	NC_017451	TGG	2	6	51405	51410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386263287
1093	NC_017451	TTC	2	6	51533	51538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386263287
1094	NC_017451	A	6	6	51556	51561	100 %	0 %	0 %	0 %	386263287
1095	NC_017451	TTA	2	6	51562	51567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386263287
1096	NC_017451	TTA	2	6	51583	51588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386263287
1097	NC_017451	GTC	2	6	51620	51625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386263287
1098	NC_017451	TGAT	2	8	51644	51651	25 %	50 %	25 %	0 %	386263287
1099	NC_017451	GAA	2	6	51670	51675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386263287
1100	NC_017451	TGG	2	6	51753	51758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386263287
1101	NC_017451	GAA	2	6	51760	51765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386263287
1102	NC_017451	TGA	2	6	51789	51794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386263287
1103	NC_017451	TA	3	6	51803	51808	50 %	50 %	0 %	0 %	386263287
1104	NC_017451	TGC	3	9	51873	51881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386263287
1105	NC_017451	AATT	2	8	51993	52000	50 %	50 %	0 %	0 %	386263287
1106	NC_017451	GGT	2	6	52012	52017	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386263287
1107	NC_017451	GAA	2	6	52033	52038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386263287
1108	NC_017451	TGATAC	2	12	52080	52091	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386263287
1109	NC_017451	CAAA	2	8	52187	52194	75 %	0 %	0 %	25 %	386263287
1110	NC_017451	A	6	6	52192	52197	100 %	0 %	0 %	0 %	386263287
1111	NC_017451	TAC	2	6	52198	52203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386263287
1112	NC_017451	GAA	2	6	52231	52236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386263287
1113	NC_017451	T	7	7	52340	52346	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_017451	TGA	2	6	52519	52524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386263288
1115	NC_017451	TTA	2	6	52527	52532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386263288
1116	NC_017451	A	8	8	52541	52548	100 %	0 %	0 %	0 %	386263288
1117	NC_017451	GCA	2	6	52591	52596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386263288
1118	NC_017451	CGTTCT	2	12	52730	52741	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	386263288
1119	NC_017451	T	6	6	52783	52788	0 %	100 %	0 %	0 %	386263288
1120	NC_017451	ATA	2	6	52797	52802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386263288
1121	NC_017451	GTT	2	6	52808	52813	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386263288
1122	NC_017451	T	7	7	52869	52875	0 %	100 %	0 %	0 %	386263288
1123	NC_017451	AG	3	6	52879	52884	50 %	0 %	50 %	0 %	386263288
1124	NC_017451	A	6	6	52904	52909	100 %	0 %	0 %	0 %	386263288
1125	NC_017451	TGG	2	6	52933	52938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386263288
1126	NC_017451	TCTT	2	8	52951	52958	0 %	75 %	0 %	25 %	386263288
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1128	NC_017451	CAG	2	6	53022	53027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386263288
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1252	NC_017451	A	6	6	59133	59138	100 %	0 %	0 %	0 %	386263294
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