MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haemophilus influenzae R2866 chromosome

Total Repeats: 40949

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13002	NC_017451	AACAA	2	10	616688	616697	80 %	0 %	0 %	20 %	386263825
13003	NC_017451	TTC	2	6	616754	616759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386263825
13004	NC_017451	AAAG	2	8	616821	616828	75 %	0 %	25 %	0 %	386263825
13005	NC_017451	ATC	2	6	616844	616849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386263825
13006	NC_017451	CCT	2	6	616897	616902	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386263825
13007	NC_017451	TG	3	6	616933	616938	0 %	50 %	50 %	0 %	386263825
13008	NC_017451	ATT	2	6	616973	616978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386263825
13009	NC_017451	AAT	2	6	616986	616991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386263825
13010	NC_017451	T	6	6	617054	617059	0 %	100 %	0 %	0 %	386263825
13011	NC_017451	TAT	2	6	617161	617166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386263825
13012	NC_017451	TAA	2	6	617202	617207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386263826
13013	NC_017451	AT	3	6	617296	617301	50 %	50 %	0 %	0 %	386263826
13014	NC_017451	CTA	2	6	617315	617320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386263826
13015	NC_017451	CAA	2	6	617384	617389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386263826
13016	NC_017451	AGGA	2	8	617416	617423	50 %	0 %	50 %	0 %	386263826
13017	NC_017451	TAA	2	6	617493	617498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386263826
13018	NC_017451	CAA	2	6	617603	617608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386263826
13019	NC_017451	GCTC	2	8	617645	617652	0 %	25 %	25 %	50 %	386263826
13020	NC_017451	TAC	2	6	617654	617659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386263826
13021	NC_017451	T	6	6	617680	617685	0 %	100 %	0 %	0 %	386263827
13022	NC_017451	TAAT	2	8	617787	617794	50 %	50 %	0 %	0 %	386263827
13023	NC_017451	AAG	2	6	617808	617813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386263827
13024	NC_017451	AAG	2	6	617866	617871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386263827
13025	NC_017451	TCA	2	6	617894	617899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386263827
13026	NC_017451	CAA	2	6	618054	618059	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386263827
13027	NC_017451	ACC	2	6	618127	618132	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386263827
13028	NC_017451	CCA	2	6	618212	618217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386263827
13029	NC_017451	A	6	6	618217	618222	100 %	0 %	0 %	0 %	386263827
13030	NC_017451	GAT	2	6	618223	618228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386263827
13031	NC_017451	TCTT	2	8	618278	618285	0 %	75 %	0 %	25 %	386263827
13032	NC_017451	ATTG	2	8	618302	618309	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13033	NC_017451	AAT	2	6	618310	618315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13034	NC_017451	ATAAA	2	10	618337	618346	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13035	NC_017451	TGA	2	6	618358	618363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13036	NC_017451	TGA	2	6	618430	618435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13037	NC_017451	CTT	2	6	618465	618470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386263828
13038	NC_017451	GGGC	2	8	618491	618498	0 %	0 %	75 %	25 %	386263828
13039	NC_017451	GACA	2	8	618535	618542	50 %	0 %	25 %	25 %	386263828
13040	NC_017451	CAAA	2	8	618575	618582	75 %	0 %	0 %	25 %	386263828
13041	NC_017451	GT	3	6	618642	618647	0 %	50 %	50 %	0 %	386263828
13042	NC_017451	GTA	2	6	618655	618660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386263828
13043	NC_017451	CA	3	6	618686	618691	50 %	0 %	0 %	50 %	386263828
13044	NC_017451	CCG	2	6	618749	618754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386263828
13045	NC_017451	CTTT	2	8	618807	618814	0 %	75 %	0 %	25 %	386263828
13046	NC_017451	GTA	2	6	618841	618846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386263828
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13049	NC_017451	TA	3	6	619053	619058	50 %	50 %	0 %	0 %	386263828
13050	NC_017451	T	6	6	619240	619245	0 %	100 %	0 %	0 %	386263828
13051	NC_017451	TCT	2	6	619283	619288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386263828
13052	NC_017451	CAC	2	6	619330	619335	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386263828
13053	NC_017451	ATT	2	6	619342	619347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386263828
13054	NC_017451	CAT	2	6	619353	619358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386263828
13055	NC_017451	TCT	2	6	619373	619378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386263828
13056	NC_017451	ATAC	2	8	619468	619475	50 %	25 %	0 %	25 %	386263828
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13059	NC_017451	T	6	6	619592	619597	0 %	100 %	0 %	0 %	386263828
13060	NC_017451	T	6	6	619616	619621	0 %	100 %	0 %	0 %	386263828
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13063	NC_017451	TCA	2	6	619865	619870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386263828
13064	NC_017451	TGGC	2	8	619901	619908	0 %	25 %	50 %	25 %	386263828
13065	NC_017451	GAA	2	6	620115	620120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386263828
13066	NC_017451	AGCA	2	8	620155	620162	50 %	0 %	25 %	25 %	386263828
13067	NC_017451	CGTTG	2	10	620168	620177	0 %	40 %	40 %	20 %	386263828
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13070	NC_017451	TGA	2	6	620396	620401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386263828
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13074	NC_017451	TGA	2	6	620541	620546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386263828
13075	NC_017451	AT	3	6	620575	620580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13076	NC_017451	TA	4	8	620606	620613	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13077	NC_017451	AC	3	6	620632	620637	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13078	NC_017451	GATT	2	8	620685	620692	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13079	NC_017451	TTA	2	6	620693	620698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13080	NC_017451	GTT	2	6	620716	620721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13081	NC_017451	A	6	6	620796	620801	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13082	NC_017451	ATG	2	6	620843	620848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386263829
13083	NC_017451	TGC	2	6	620878	620883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386263829
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13089	NC_017451	TTGA	2	8	621116	621123	25 %	50 %	25 %	0 %	386263829
13090	NC_017451	GTT	2	6	621140	621145	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386263829
13091	NC_017451	TGA	2	6	621217	621222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386263829
13092	NC_017451	T	6	6	621223	621228	0 %	100 %	0 %	0 %	386263829
13093	NC_017451	GAA	2	6	621309	621314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386263830
13094	NC_017451	ACA	2	6	621338	621343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386263830
13095	NC_017451	A	7	7	621398	621404	100 %	0 %	0 %	0 %	386263830
13096	NC_017451	T	6	6	621449	621454	0 %	100 %	0 %	0 %	386263830
13097	NC_017451	AAG	2	6	621472	621477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386263830
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13101	NC_017451	ACCG	2	8	621605	621612	25 %	0 %	25 %	50 %	386263830
13102	NC_017451	CCA	2	6	621641	621646	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386263831
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13105	NC_017451	TCT	2	6	621880	621885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386263831
13106	NC_017451	ACG	3	9	621996	622004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386263831
13107	NC_017451	CTT	2	6	622061	622066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386263831
13108	NC_017451	GCT	2	6	622082	622087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386263831
13109	NC_017451	CTT	2	6	622115	622120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386263831
13110	NC_017451	TTG	2	6	622152	622157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386263831
13111	NC_017451	CTT	2	6	622160	622165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386263831
13112	NC_017451	CTT	3	9	622175	622183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386263831
13113	NC_017451	TGTTCT	2	12	622213	622224	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	386263831
13114	NC_017451	T	7	7	622229	622235	0 %	100 %	0 %	0 %	386263831
13115	NC_017451	A	6	6	622281	622286	100 %	0 %	0 %	0 %	386263831
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13119	NC_017451	TGG	2	6	622547	622552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386263832
13120	NC_017451	GC	3	6	622571	622576	0 %	0 %	50 %	50 %	386263832
13121	NC_017451	ATTG	2	8	622604	622611	25 %	50 %	25 %	0 %	386263832
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13123	NC_017451	GAA	2	6	622710	622715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386263832
13124	NC_017451	T	6	6	622718	622723	0 %	100 %	0 %	0 %	386263832
13125	NC_017451	TGAT	2	8	622816	622823	25 %	50 %	25 %	0 %	386263832
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13128	NC_017451	TTG	3	9	623002	623010	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386263832
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13136	NC_017451	A	6	6	623265	623270	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13137	NC_017451	TAAAT	2	10	623281	623290	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13220	NC_017451	CTTGAT	2	12	627227	627238	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386263834
13221	NC_017451	TGC	2	6	627252	627257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386263834
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13223	NC_017451	A	6	6	627378	627383	100 %	0 %	0 %	0 %	386263834
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13232	NC_017451	T	6	6	628037	628042	0 %	100 %	0 %	0 %	386263834
13233	NC_017451	TTTC	2	8	628081	628088	0 %	75 %	0 %	25 %	386263835
13234	NC_017451	TTG	2	6	628091	628096	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386263835
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13237	NC_017451	AAGGC	2	10	628417	628426	40 %	0 %	40 %	20 %	386263835
13238	NC_017451	TCAG	2	8	628440	628447	25 %	25 %	25 %	25 %	386263835
13239	NC_017451	GTGA	2	8	628452	628459	25 %	25 %	50 %	0 %	386263835
13240	NC_017451	A	6	6	628474	628479	100 %	0 %	0 %	0 %	386263835
13241	NC_017451	GATT	2	8	628492	628499	25 %	50 %	25 %	0 %	386263835
13242	NC_017451	TGC	2	6	628568	628573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386263835
13243	NC_017451	TTG	2	6	628580	628585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386263835
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