MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Helicobacter pylori 2017 chromosome

Total Repeats: 31988

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017374	CAT	2	6	24	29	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017374	T	6	6	29	34	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017374	GAGC	2	8	72	79	25 %	0 %	50 %	25 %	385223049
4	NC_017374	CATT	2	8	158	165	25 %	50 %	0 %	25 %	385223049
5	NC_017374	GAT	3	9	166	174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385223049
6	NC_017374	TG	3	6	182	187	0 %	50 %	50 %	0 %	385223049
7	NC_017374	TTCT	2	8	303	310	0 %	75 %	0 %	25 %	385223049
8	NC_017374	GTT	2	6	349	354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385223049
9	NC_017374	T	7	7	362	368	0 %	100 %	0 %	0 %	385223049
10	NC_017374	T	7	7	390	396	0 %	100 %	0 %	0 %	385223049
11	NC_017374	TTC	2	6	400	405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385223049
12	NC_017374	ACA	2	6	426	431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385223049
13	NC_017374	C	6	6	444	449	0 %	0 %	0 %	100 %	385223049
14	NC_017374	AAT	2	6	501	506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385223050
15	NC_017374	C	6	6	686	691	0 %	0 %	0 %	100 %	385223050
16	NC_017374	TAA	2	6	694	699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385223050
17	NC_017374	CT	3	6	735	740	0 %	50 %	0 %	50 %	385223050
18	NC_017374	CTT	2	6	844	849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385223050
19	NC_017374	TGA	2	6	862	867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385223050
20	NC_017374	AAAT	2	8	956	963	75 %	25 %	0 %	0 %	385223051
21	NC_017374	TG	3	6	1054	1059	0 %	50 %	50 %	0 %	385223051
22	NC_017374	AAC	2	6	1068	1073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385223051
23	NC_017374	CCGCAG	2	12	1087	1098	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	385223051
24	NC_017374	CCA	2	6	1231	1236	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385223051
25	NC_017374	GCT	2	6	1256	1261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385223051
26	NC_017374	CA	3	6	1270	1275	50 %	0 %	0 %	50 %	385223051
27	NC_017374	T	6	6	1287	1292	0 %	100 %	0 %	0 %	385223051
28	NC_017374	T	6	6	1391	1396	0 %	100 %	0 %	0 %	385223051
29	NC_017374	GGC	2	6	1447	1452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385223051
30	NC_017374	GTT	2	6	1667	1672	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385223051
31	NC_017374	TAG	2	6	1690	1695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385223051
32	NC_017374	CTT	2	6	1701	1706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385223051
33	NC_017374	TTC	2	6	1806	1811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385223052
34	NC_017374	A	7	7	1821	1827	100 %	0 %	0 %	0 %	385223052
35	NC_017374	ATTATA	2	12	1839	1850	50 %	50 %	0 %	0 %	385223052
36	NC_017374	CCTG	2	8	1854	1861	0 %	25 %	25 %	50 %	385223052
37	NC_017374	GCCA	2	8	1877	1884	25 %	0 %	25 %	50 %	385223052
38	NC_017374	TCA	2	6	1904	1909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385223052
39	NC_017374	TGAA	2	8	1918	1925	50 %	25 %	25 %	0 %	385223052
40	NC_017374	GTT	2	6	1941	1946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385223052
41	NC_017374	TTC	2	6	2028	2033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385223052
42	NC_017374	TGG	2	6	2087	2092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385223052
43	NC_017374	TCA	2	6	2095	2100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385223052
44	NC_017374	AATG	2	8	2108	2115	50 %	25 %	25 %	0 %	385223052
45	NC_017374	GATTA	2	10	2292	2301	40 %	40 %	20 %	0 %	385223052
46	NC_017374	ATTC	2	8	2393	2400	25 %	50 %	0 %	25 %	385223052
47	NC_017374	TTC	2	6	2504	2509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017374	A	8	8	2586	2593	100 %	0 %	0 %	0 %	385223053
49	NC_017374	CTTT	2	8	2603	2610	0 %	75 %	0 %	25 %	385223053
50	NC_017374	T	7	7	2682	2688	0 %	100 %	0 %	0 %	385223053
51	NC_017374	TGA	2	6	2707	2712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385223053
52	NC_017374	AGC	2	6	2822	2827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385223053
53	NC_017374	A	6	6	2873	2878	100 %	0 %	0 %	0 %	385223053
54	NC_017374	AG	3	6	2992	2997	50 %	0 %	50 %	0 %	385223053
55	NC_017374	GTG	2	6	3011	3016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385223053
56	NC_017374	T	6	6	3064	3069	0 %	100 %	0 %	0 %	385223053
57	NC_017374	AGA	2	6	3109	3114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385223053
58	NC_017374	GTG	2	6	3170	3175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385223053
59	NC_017374	GCC	2	6	3177	3182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385223053
60	NC_017374	GAAA	2	8	3292	3299	75 %	0 %	25 %	0 %	385223054
61	NC_017374	GAAA	2	8	3367	3374	75 %	0 %	25 %	0 %	385223054
62	NC_017374	TG	3	6	3474	3479	0 %	50 %	50 %	0 %	385223054
63	NC_017374	GTT	2	6	3623	3628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385223054
64	NC_017374	ATC	2	6	3707	3712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385223054
65	NC_017374	AGAA	2	8	3823	3830	75 %	0 %	25 %	0 %	385223054
66	NC_017374	A	6	6	3861	3866	100 %	0 %	0 %	0 %	385223054
67	NC_017374	CAG	2	6	3869	3874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385223054
68	NC_017374	A	6	6	3911	3916	100 %	0 %	0 %	0 %	385223054
69	NC_017374	ATT	2	6	3951	3956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385223054
70	NC_017374	TGT	2	6	3962	3967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385223054
71	NC_017374	GGC	2	6	4024	4029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385223054
72	NC_017374	GGT	2	6	4130	4135	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017374	TAT	2	6	4178	4183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017374	TGG	2	6	4218	4223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017374	TGG	2	6	4348	4353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017374	GTG	2	6	4460	4465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017374	ACC	2	6	4492	4497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_017374	GGT	2	6	4505	4510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017374	T	8	8	4646	4653	0 %	100 %	0 %	0 %	385223055
80	NC_017374	TAA	2	6	4852	4857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385223056
81	NC_017374	TTA	2	6	4861	4866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385223056
82	NC_017374	T	7	7	4878	4884	0 %	100 %	0 %	0 %	385223056
83	NC_017374	A	6	6	4889	4894	100 %	0 %	0 %	0 %	385223056
84	NC_017374	A	6	6	4905	4910	100 %	0 %	0 %	0 %	385223056
85	NC_017374	TGT	2	6	4944	4949	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017374	TCATT	2	10	4955	4964	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_017374	GTTT	2	8	4967	4974	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017374	C	6	6	5054	5059	0 %	0 %	0 %	100 %	385223057
89	NC_017374	AAG	2	6	5062	5067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385223057
90	NC_017374	T	7	7	5071	5077	0 %	100 %	0 %	0 %	385223057
91	NC_017374	ACTA	2	8	5112	5119	50 %	25 %	0 %	25 %	385223057
92	NC_017374	ATC	2	6	5120	5125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017374	A	7	7	5163	5169	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017374	A	6	6	5178	5183	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017374	T	7	7	5206	5212	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017374	T	15	15	5295	5309	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017374	T	6	6	5340	5345	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017374	GTTT	2	8	5350	5357	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017374	GGT	2	6	5359	5364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017374	TTTTA	2	10	5383	5392	20 %	80 %	0 %	0 %	385223058
101	NC_017374	T	6	6	5431	5436	0 %	100 %	0 %	0 %	385223058
102	NC_017374	C	8	8	5478	5485	0 %	0 %	0 %	100 %	385223058
103	NC_017374	AAG	2	6	5486	5491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385223058
104	NC_017374	A	6	6	5503	5508	100 %	0 %	0 %	0 %	385223058
105	NC_017374	CAT	2	6	5531	5536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385223059
106	NC_017374	GCC	2	6	5537	5542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385223059
107	NC_017374	TCT	2	6	5598	5603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385223059
108	NC_017374	GAAACC	2	12	5646	5657	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	385223059
109	NC_017374	AAT	2	6	5696	5701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385223059
110	NC_017374	CTT	2	6	5704	5709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385223059
111	NC_017374	TTCA	2	8	5774	5781	25 %	50 %	0 %	25 %	385223059
112	NC_017374	CAT	2	6	5794	5799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385223059
113	NC_017374	ATG	2	6	5847	5852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385223059
114	NC_017374	TCA	2	6	5871	5876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385223059
115	NC_017374	CG	3	6	5906	5911	0 %	0 %	50 %	50 %	385223059
116	NC_017374	CTT	2	6	5944	5949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385223059
117	NC_017374	CCG	2	6	5953	5958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385223059
118	NC_017374	T	6	6	5993	5998	0 %	100 %	0 %	0 %	385223059
119	NC_017374	AG	3	6	6053	6058	50 %	0 %	50 %	0 %	385223059
120	NC_017374	GTG	2	6	6180	6185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385223059
121	NC_017374	TTC	2	6	6260	6265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385223059
122	NC_017374	CCG	2	6	6279	6284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385223059
123	NC_017374	TTTCT	2	10	6310	6319	0 %	80 %	0 %	20 %	385223059
124	NC_017374	CAC	2	6	6380	6385	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385223059
125	NC_017374	GAT	2	6	6422	6427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385223059
126	NC_017374	T	6	6	6454	6459	0 %	100 %	0 %	0 %	385223059
127	NC_017374	GGA	2	6	6469	6474	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385223059
128	NC_017374	T	7	7	6493	6499	0 %	100 %	0 %	0 %	385223059
129	NC_017374	CGTT	2	8	6550	6557	0 %	50 %	25 %	25 %	385223059
130	NC_017374	GA	3	6	6570	6575	50 %	0 %	50 %	0 %	385223059
131	NC_017374	CTT	2	6	6634	6639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385223059
132	NC_017374	TCT	2	6	6744	6749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385223059
133	NC_017374	T	6	6	6761	6766	0 %	100 %	0 %	0 %	385223059
134	NC_017374	T	6	6	6773	6778	0 %	100 %	0 %	0 %	385223059
135	NC_017374	CTT	2	6	6865	6870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385223059
136	NC_017374	GCA	2	6	6918	6923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385223059
137	NC_017374	CTT	2	6	6943	6948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385223059
138	NC_017374	T	6	6	7045	7050	0 %	100 %	0 %	0 %	385223059
139	NC_017374	AATTT	2	10	7149	7158	40 %	60 %	0 %	0 %	385223059
140	NC_017374	TAA	3	9	7179	7187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017374	T	7	7	7190	7196	0 %	100 %	0 %	0 %	385223060
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