MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Helicobacter pylori Gambia94/24 chromosome

Total Repeats: 35502

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3002	NC_017371	TTTTC	2	10	145019	145028	0 %	80 %	0 %	20 %	385218397
3003	NC_017371	CAC	2	6	145107	145112	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385218397
3004	NC_017371	T	6	6	145113	145118	0 %	100 %	0 %	0 %	385218397
3005	NC_017371	TAG	2	6	145219	145224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385218398
3006	NC_017371	T	6	6	145395	145400	0 %	100 %	0 %	0 %	385218398
3007	NC_017371	TGA	2	6	145424	145429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385218398
3008	NC_017371	GAA	2	6	145456	145461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385218398
3009	NC_017371	AAC	2	6	145528	145533	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385218398
3010	NC_017371	T	6	6	145629	145634	0 %	100 %	0 %	0 %	385218398
3011	NC_017371	TTC	2	6	145734	145739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385218398
3012	NC_017371	CTT	2	6	145817	145822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385218398
3013	NC_017371	ATT	2	6	146224	146229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385218399
3014	NC_017371	G	6	6	146244	146249	0 %	0 %	100 %	0 %	385218399
3015	NC_017371	ACC	2	6	146252	146257	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385218399
3016	NC_017371	CAAG	2	8	146329	146336	50 %	0 %	25 %	25 %	385218399
3017	NC_017371	TCA	2	6	146375	146380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385218399
3018	NC_017371	GTT	2	6	146398	146403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385218399
3019	NC_017371	TAA	2	6	146407	146412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385218399
3020	NC_017371	ATG	2	6	146414	146419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385218399
3021	NC_017371	CTT	2	6	146424	146429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385218399
3022	NC_017371	TCG	2	6	146444	146449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385218399
3023	NC_017371	T	6	6	146450	146455	0 %	100 %	0 %	0 %	385218399
3024	NC_017371	TGA	2	6	146466	146471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385218399
3025	NC_017371	CGC	2	6	146533	146538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385218399
3026	NC_017371	ATC	2	6	146539	146544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385218399
3027	NC_017371	CTA	2	6	146553	146558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385218399
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3029	NC_017371	CTT	2	6	146751	146756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385218399
3030	NC_017371	GCG	2	6	146762	146767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385218399
3031	NC_017371	TTC	2	6	146776	146781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385218399
3032	NC_017371	TTGC	2	8	146797	146804	0 %	50 %	25 %	25 %	385218399
3033	NC_017371	ATGG	2	8	146812	146819	25 %	25 %	50 %	0 %	385218399
3034	NC_017371	TGA	2	6	146850	146855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385218399
3035	NC_017371	TCGC	2	8	146936	146943	0 %	25 %	25 %	50 %	385218399
3036	NC_017371	TTCTT	2	10	146975	146984	0 %	80 %	0 %	20 %	385218399
3037	NC_017371	T	7	7	147062	147068	0 %	100 %	0 %	0 %	385218399
3038	NC_017371	TCA	2	6	147086	147091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385218399
3039	NC_017371	TGA	2	6	147249	147254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385218399
3040	NC_017371	TTC	2	6	147256	147261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385218399
3041	NC_017371	ATT	2	6	147293	147298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_017371	T	6	6	147382	147387	0 %	100 %	0 %	0 %	385218400
3043	NC_017371	TCA	2	6	147406	147411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385218400
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3045	NC_017371	TCTTT	2	10	147469	147478	0 %	80 %	0 %	20 %	385218400
3046	NC_017371	C	6	6	147521	147526	0 %	0 %	0 %	100 %	385218400
3047	NC_017371	GCA	2	6	147533	147538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385218400
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3049	NC_017371	TGA	2	6	147586	147591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385218400
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3052	NC_017371	CAT	2	6	147797	147802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385218400
3053	NC_017371	ATA	2	6	147828	147833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385218400
3054	NC_017371	T	7	7	147878	147884	0 %	100 %	0 %	0 %	385218400
3055	NC_017371	TTC	2	6	147887	147892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385218400
3056	NC_017371	TGGC	2	8	147914	147921	0 %	25 %	50 %	25 %	385218400
3057	NC_017371	T	6	6	147938	147943	0 %	100 %	0 %	0 %	385218400
3058	NC_017371	GCT	2	6	148011	148016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385218400
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3060	NC_017371	ATA	2	6	148096	148101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_017371	T	6	6	148220	148225	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_017371	TAAG	2	8	148230	148237	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_017371	A	7	7	148240	148246	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_017371	ATT	2	6	148255	148260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_017371	T	6	6	148351	148356	0 %	100 %	0 %	0 %	385218401
3066	NC_017371	TC	3	6	148358	148363	0 %	50 %	0 %	50 %	385218401
3067	NC_017371	T	6	6	148473	148478	0 %	100 %	0 %	0 %	385218401
3068	NC_017371	AAAG	2	8	148579	148586	75 %	0 %	25 %	0 %	385218401
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3072	NC_017371	GTG	2	6	148816	148821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385218401
3073	NC_017371	TGG	2	6	148850	148855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385218401
3074	NC_017371	T	6	6	148871	148876	0 %	100 %	0 %	0 %	385218401
3075	NC_017371	T	6	6	148890	148895	0 %	100 %	0 %	0 %	385218401
3076	NC_017371	ATGG	2	8	148909	148916	25 %	25 %	50 %	0 %	385218401
3077	NC_017371	ATT	2	6	148997	149002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385218401
3078	NC_017371	ATT	2	6	149023	149028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385218401
3079	NC_017371	ATTG	2	8	149043	149050	25 %	50 %	25 %	0 %	385218401
3080	NC_017371	GGT	2	6	149148	149153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385218401
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3082	NC_017371	AAG	2	6	149231	149236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385218401
3083	NC_017371	AATTC	2	10	149270	149279	40 %	40 %	0 %	20 %	385218401
3084	NC_017371	TTG	2	6	149410	149415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385218401
3085	NC_017371	GCGAT	2	10	149429	149438	20 %	20 %	40 %	20 %	385218401
3086	NC_017371	CGCT	2	8	149543	149550	0 %	25 %	25 %	50 %	385218401
3087	NC_017371	TTAGCG	2	12	149551	149562	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385218401
3088	NC_017371	CTTT	2	8	149582	149589	0 %	75 %	0 %	25 %	385218401
3089	NC_017371	GCTTG	2	10	149685	149694	0 %	40 %	40 %	20 %	385218401
3090	NC_017371	TATCGC	2	12	149763	149774	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385218401
3091	NC_017371	AG	3	6	149802	149807	50 %	0 %	50 %	0 %	385218401
3092	NC_017371	TAT	2	6	149898	149903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385218401
3093	NC_017371	T	6	6	149952	149957	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_017371	TCA	2	6	149982	149987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385218402
3095	NC_017371	TAT	2	6	150047	150052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385218402
3096	NC_017371	TAT	2	6	150123	150128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385218402
3097	NC_017371	TGG	2	6	150161	150166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385218402
3098	NC_017371	CTTT	2	8	150186	150193	0 %	75 %	0 %	25 %	385218402
3099	NC_017371	ATT	2	6	150220	150225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385218402
3100	NC_017371	GCG	2	6	150226	150231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385218402
3101	NC_017371	T	7	7	150233	150239	0 %	100 %	0 %	0 %	385218402
3102	NC_017371	AAAG	2	8	150280	150287	75 %	0 %	25 %	0 %	385218402
3103	NC_017371	GTTTT	2	10	150336	150345	0 %	80 %	20 %	0 %	385218402
3104	NC_017371	GCG	2	6	150397	150402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385218402
3105	NC_017371	T	6	6	150568	150573	0 %	100 %	0 %	0 %	385218402
3106	NC_017371	ATGG	2	8	150610	150617	25 %	25 %	50 %	0 %	385218402
3107	NC_017371	TTTC	2	8	150665	150672	0 %	75 %	0 %	25 %	385218402
3108	NC_017371	GC	3	6	150677	150682	0 %	0 %	50 %	50 %	385218402
3109	NC_017371	ATT	2	6	150698	150703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385218402
3110	NC_017371	TAT	2	6	150723	150728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385218402
3111	NC_017371	CAT	2	6	150835	150840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385218402
3112	NC_017371	TTTTAG	2	12	150878	150889	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385218402
3113	NC_017371	T	7	7	150912	150918	0 %	100 %	0 %	0 %	385218402
3114	NC_017371	T	7	7	151088	151094	0 %	100 %	0 %	0 %	385218402
3115	NC_017371	TTA	2	6	151103	151108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385218402
3116	NC_017371	GAAA	2	8	151167	151174	75 %	0 %	25 %	0 %	385218402
3117	NC_017371	TTC	2	6	151242	151247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385218402
3118	NC_017371	T	6	6	151290	151295	0 %	100 %	0 %	0 %	385218402
3119	NC_017371	GGGT	2	8	151309	151316	0 %	25 %	75 %	0 %	385218402
3120	NC_017371	TTTG	2	8	151356	151363	0 %	75 %	25 %	0 %	385218402
3121	NC_017371	GAT	2	6	151452	151457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385218402
3122	NC_017371	ATCGCT	2	12	151471	151482	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385218402
3123	NC_017371	AG	3	6	151509	151514	50 %	0 %	50 %	0 %	385218402
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3125	NC_017371	TAAA	2	8	151658	151665	75 %	25 %	0 %	0 %	385218403
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3242	NC_017371	A	6	6	157750	157755	100 %	0 %	0 %	0 %	385218409
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3249	NC_017371	GCGT	2	8	158010	158017	0 %	25 %	50 %	25 %	385218411
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