MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Helicobacter pylori Gambia94/24 chromosome

Total Repeats: 35502

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017371	G	6	6	242119	242124	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_017371	ATG	2	6	242176	242181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_017371	A	6	6	242316	242321	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_017371	GAA	2	6	242352	242357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_017371	AACC	2	8	242410	242417	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5006	NC_017371	ACAA	2	8	242466	242473	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5007	NC_017371	GAT	2	6	242527	242532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385218503
5008	NC_017371	A	6	6	242567	242572	100 %	0 %	0 %	0 %	385218503
5009	NC_017371	GTT	2	6	242685	242690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385218503
5010	NC_017371	TGAG	2	8	242726	242733	25 %	25 %	50 %	0 %	385218503
5011	NC_017371	CAT	2	6	242764	242769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385218503
5012	NC_017371	TCT	2	6	242780	242785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385218503
5013	NC_017371	CAT	2	6	242850	242855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385218503
5014	NC_017371	GCC	2	6	242965	242970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385218503
5015	NC_017371	ATC	2	6	243008	243013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385218503
5016	NC_017371	AAT	2	6	243114	243119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_017371	TATT	2	8	243141	243148	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_017371	TGG	2	6	243151	243156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_017371	A	8	8	243226	243233	100 %	0 %	0 %	0 %	385218504
5020	NC_017371	GTT	2	6	243242	243247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385218504
5021	NC_017371	CCACA	2	10	243271	243280	40 %	0 %	0 %	60 %	385218504
5022	NC_017371	AAG	2	6	243346	243351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385218504
5023	NC_017371	GAA	2	6	243354	243359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385218504
5024	NC_017371	CAAG	2	8	243410	243417	50 %	0 %	25 %	25 %	385218504
5025	NC_017371	A	6	6	243429	243434	100 %	0 %	0 %	0 %	385218504
5026	NC_017371	A	6	6	243522	243527	100 %	0 %	0 %	0 %	385218504
5027	NC_017371	TG	3	6	243557	243562	0 %	50 %	50 %	0 %	385218504
5028	NC_017371	CAA	2	6	243576	243581	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385218504
5029	NC_017371	G	6	6	243582	243587	0 %	0 %	100 %	0 %	385218504
5030	NC_017371	A	6	6	243624	243629	100 %	0 %	0 %	0 %	385218504
5031	NC_017371	TAA	2	6	243642	243647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_017371	T	6	6	243693	243698	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_017371	ATTT	2	8	243816	243823	25 %	75 %	0 %	0 %	385218505
5034	NC_017371	T	6	6	243878	243883	0 %	100 %	0 %	0 %	385218505
5035	NC_017371	ACCC	2	8	243933	243940	25 %	0 %	0 %	75 %	385218505
5036	NC_017371	GAT	2	6	243996	244001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385218505
5037	NC_017371	ATC	2	6	244005	244010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385218505
5038	NC_017371	CTT	2	6	244012	244017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385218505
5039	NC_017371	TGA	2	6	244061	244066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385218505
5040	NC_017371	A	6	6	244074	244079	100 %	0 %	0 %	0 %	385218505
5041	NC_017371	CAC	2	6	244097	244102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385218505
5042	NC_017371	CGG	2	6	244117	244122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385218505
5043	NC_017371	T	6	6	244139	244144	0 %	100 %	0 %	0 %	385218505
5044	NC_017371	TTAC	2	8	244165	244172	25 %	50 %	0 %	25 %	385218505
5045	NC_017371	CCG	2	6	244201	244206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385218505
5046	NC_017371	AAG	2	6	244216	244221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385218505
5047	NC_017371	A	6	6	244231	244236	100 %	0 %	0 %	0 %	385218505
5048	NC_017371	AAT	2	6	244263	244268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385218505
5049	NC_017371	GAA	2	6	244293	244298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385218505
5050	NC_017371	GTT	2	6	244328	244333	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385218505
5051	NC_017371	CTTT	2	8	244401	244408	0 %	75 %	0 %	25 %	385218505
5052	NC_017371	GC	3	6	244411	244416	0 %	0 %	50 %	50 %	385218505
5053	NC_017371	G	6	6	244443	244448	0 %	0 %	100 %	0 %	385218505
5054	NC_017371	GTGGG	2	10	244462	244471	0 %	20 %	80 %	0 %	385218505
5055	NC_017371	AAG	2	6	244597	244602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385218505
5056	NC_017371	AGA	2	6	244628	244633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385218505
5057	NC_017371	TGATG	2	10	244652	244661	20 %	40 %	40 %	0 %	385218505
5058	NC_017371	CGC	2	6	244763	244768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385218505
5059	NC_017371	GTGC	2	8	244780	244787	0 %	25 %	50 %	25 %	385218505
5060	NC_017371	TGG	2	6	244819	244824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385218505
5061	NC_017371	TC	3	6	244921	244926	0 %	50 %	0 %	50 %	385218505
5062	NC_017371	TTA	2	6	244961	244966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385218505
5063	NC_017371	AAG	2	6	245038	245043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385218506
5064	NC_017371	TCA	2	6	245080	245085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385218506
5065	NC_017371	ATT	2	6	245199	245204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385218506
5066	NC_017371	ATG	2	6	245256	245261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385218506
5067	NC_017371	CGG	2	6	245353	245358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385218506
5068	NC_017371	A	6	6	245368	245373	100 %	0 %	0 %	0 %	385218506
5069	NC_017371	A	6	6	245406	245411	100 %	0 %	0 %	0 %	385218506
5070	NC_017371	GAA	3	9	245451	245459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385218506
5071	NC_017371	ATC	2	6	245460	245465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385218506
5072	NC_017371	GAA	2	6	245538	245543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385218506
5073	NC_017371	A	6	6	245605	245610	100 %	0 %	0 %	0 %	385218506
5074	NC_017371	ATT	2	6	245614	245619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385218506
5075	NC_017371	TGG	2	6	245623	245628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385218506
5076	NC_017371	AAG	2	6	245638	245643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385218506
5077	NC_017371	GAA	2	6	245649	245654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385218506
5078	NC_017371	TGA	2	6	245762	245767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385218506
5079	NC_017371	ATG	2	6	245787	245792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385218506
5080	NC_017371	AAAG	2	8	245823	245830	75 %	0 %	25 %	0 %	385218506
5081	NC_017371	GAT	2	6	245832	245837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385218506
5082	NC_017371	ATT	2	6	245933	245938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385218506
5083	NC_017371	GATTT	2	10	245963	245972	20 %	60 %	20 %	0 %	385218506
5084	NC_017371	AGCG	2	8	246003	246010	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5085	NC_017371	TAA	2	6	246012	246017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5086	NC_017371	GAT	3	9	246108	246116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5087	NC_017371	TGA	2	6	246127	246132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385218507
5088	NC_017371	TAA	2	6	246209	246214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385218507
5089	NC_017371	A	7	7	246213	246219	100 %	0 %	0 %	0 %	385218507
5090	NC_017371	TGA	2	6	246245	246250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385218507
5091	NC_017371	GAA	4	12	246282	246293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385218507
5092	NC_017371	GGT	2	6	246351	246356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385218507
5093	NC_017371	A	6	6	246460	246465	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_017371	GA	3	6	246466	246471	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5095	NC_017371	A	7	7	246482	246488	100 %	0 %	0 %	0 %	385218508
5096	NC_017371	CTT	2	6	246489	246494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385218508
5097	NC_017371	A	6	6	246617	246622	100 %	0 %	0 %	0 %	385218508
5098	NC_017371	A	6	6	246639	246644	100 %	0 %	0 %	0 %	385218508
5099	NC_017371	GAA	2	6	246671	246676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385218508
5100	NC_017371	TCA	2	6	246678	246683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385218508
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5102	NC_017371	G	6	6	246725	246730	0 %	0 %	100 %	0 %	385218508
5103	NC_017371	G	6	6	246740	246745	0 %	0 %	100 %	0 %	385218508
5104	NC_017371	G	7	7	246757	246763	0 %	0 %	100 %	0 %	385218508
5105	NC_017371	TGGGG	2	10	246769	246778	0 %	20 %	80 %	0 %	385218508
5106	NC_017371	AG	3	6	246853	246858	50 %	0 %	50 %	0 %	385218508
5107	NC_017371	GC	3	6	246877	246882	0 %	0 %	50 %	50 %	385218508
5108	NC_017371	GATTG	2	10	246888	246897	20 %	40 %	40 %	0 %	385218508
5109	NC_017371	ATT	2	6	246969	246974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385218508
5110	NC_017371	TTGC	2	8	246975	246982	0 %	50 %	25 %	25 %	385218508
5111	NC_017371	TGAT	2	8	246984	246991	25 %	50 %	25 %	0 %	385218508
5112	NC_017371	TTC	2	6	247021	247026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385218508
5113	NC_017371	GA	3	6	247053	247058	50 %	0 %	50 %	0 %	385218508
5114	NC_017371	ATC	2	6	247109	247114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385218508
5115	NC_017371	AAGG	2	8	247127	247134	50 %	0 %	50 %	0 %	385218508
5116	NC_017371	AAG	2	6	247302	247307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385218508
5117	NC_017371	T	7	7	247319	247325	0 %	100 %	0 %	0 %	385218508
5118	NC_017371	AGA	2	6	247330	247335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385218508
5119	NC_017371	A	7	7	247494	247500	100 %	0 %	0 %	0 %	385218508
5120	NC_017371	ATG	2	6	247524	247529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385218508
5121	NC_017371	TTA	2	6	247533	247538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385218508
5122	NC_017371	GAAA	2	8	247705	247712	75 %	0 %	25 %	0 %	385218508
5123	NC_017371	A	6	6	247748	247753	100 %	0 %	0 %	0 %	385218508
5124	NC_017371	A	6	6	247761	247766	100 %	0 %	0 %	0 %	385218508
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5254	NC_017371	TGG	2	6	253047	253052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385218514
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5257	NC_017371	TTTCA	2	10	253418	253427	20 %	60 %	0 %	20 %	385218514
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