MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Helicobacter pylori Lithuania75 chromosome

Total Repeats: 33924

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_017362	TTGTAA	2	12	520638	520649	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11002	NC_017362	CCA	2	6	520686	520691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384897240
11003	NC_017362	CCAT	2	8	520737	520744	25 %	25 %	0 %	50 %	384897240
11004	NC_017362	AAT	2	6	520790	520795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384897240
11005	NC_017362	AAAT	2	8	520816	520823	75 %	25 %	0 %	0 %	384897240
11006	NC_017362	TTGA	2	8	520868	520875	25 %	50 %	25 %	0 %	384897240
11007	NC_017362	AAT	2	6	520920	520925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384897240
11008	NC_017362	ATT	2	6	520976	520981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384897240
11009	NC_017362	CAA	2	6	521095	521100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384897240
11010	NC_017362	GTT	2	6	521192	521197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384897240
11011	NC_017362	A	6	6	521209	521214	100 %	0 %	0 %	0 %	384897240
11012	NC_017362	A	6	6	521275	521280	100 %	0 %	0 %	0 %	384897240
11013	NC_017362	AAAT	2	8	521316	521323	75 %	25 %	0 %	0 %	384897240
11014	NC_017362	AAT	2	6	521391	521396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384897240
11015	NC_017362	C	6	6	521399	521404	0 %	0 %	0 %	100 %	384897240
11016	NC_017362	ATA	2	6	521550	521555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384897240
11017	NC_017362	GAA	2	6	521584	521589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384897240
11018	NC_017362	CAG	2	6	521590	521595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384897240
11019	NC_017362	ACA	2	6	521610	521615	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384897240
11020	NC_017362	AGCA	2	8	521633	521640	50 %	0 %	25 %	25 %	384897240
11021	NC_017362	GTT	2	6	521651	521656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384897240
11022	NC_017362	ATT	2	6	521748	521753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384897240
11023	NC_017362	TTG	2	6	521814	521819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384897240
11024	NC_017362	TTTA	2	8	521861	521868	25 %	75 %	0 %	0 %	384897240
11025	NC_017362	CCAA	2	8	521879	521886	50 %	0 %	0 %	50 %	384897240
11026	NC_017362	CCCTG	2	10	522045	522054	0 %	20 %	20 %	60 %	384897240
11027	NC_017362	TTG	2	6	522117	522122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384897240
11028	NC_017362	A	7	7	522227	522233	100 %	0 %	0 %	0 %	384897240
11029	NC_017362	A	6	6	522249	522254	100 %	0 %	0 %	0 %	384897240
11030	NC_017362	T	6	6	522298	522303	0 %	100 %	0 %	0 %	384897241
11031	NC_017362	CTT	2	6	522311	522316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384897241
11032	NC_017362	TGA	2	6	522401	522406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384897241
11033	NC_017362	ATA	2	6	522444	522449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384897241
11034	NC_017362	T	6	6	522462	522467	0 %	100 %	0 %	0 %	384897241
11035	NC_017362	AT	3	6	522472	522477	50 %	50 %	0 %	0 %	384897241
11036	NC_017362	AT	3	6	522845	522850	50 %	50 %	0 %	0 %	384897241
11037	NC_017362	TTC	2	6	522856	522861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384897241
11038	NC_017362	CAT	3	9	522867	522875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384897241
11039	NC_017362	CGA	2	6	522893	522898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384897241
11040	NC_017362	AG	3	6	522912	522917	50 %	0 %	50 %	0 %	384897241
11041	NC_017362	CCAA	2	8	522988	522995	50 %	0 %	0 %	50 %	384897241
11042	NC_017362	TCA	2	6	523000	523005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384897241
11043	NC_017362	T	8	8	523021	523028	0 %	100 %	0 %	0 %	384897241
11044	NC_017362	ATT	2	6	523057	523062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11045	NC_017362	GTTG	2	8	523068	523075	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11046	NC_017362	T	6	6	523101	523106	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11047	NC_017362	TATAG	2	10	523136	523145	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
11048	NC_017362	AT	4	8	523162	523169	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11049	NC_017362	A	6	6	523173	523178	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11050	NC_017362	TAA	2	6	523227	523232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11051	NC_017362	AAG	2	6	523258	523263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11052	NC_017362	AG	4	8	523375	523382	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11053	NC_017362	TAA	2	6	523390	523395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11054	NC_017362	ACA	2	6	523443	523448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384897242
11055	NC_017362	CAC	2	6	523480	523485	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384897242
11056	NC_017362	AAG	2	6	523585	523590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384897242
11057	NC_017362	ATAGAA	2	12	523608	523619	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384897242
11058	NC_017362	A	6	6	523633	523638	100 %	0 %	0 %	0 %	384897242
11059	NC_017362	AAT	2	6	523679	523684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384897242
11060	NC_017362	TCAT	2	8	523697	523704	25 %	50 %	0 %	25 %	384897242
11061	NC_017362	AT	3	6	523712	523717	50 %	50 %	0 %	0 %	384897242
11062	NC_017362	TATG	2	8	523744	523751	25 %	50 %	25 %	0 %	384897242
11063	NC_017362	TTTGT	2	10	523761	523770	0 %	80 %	20 %	0 %	384897242
11064	NC_017362	TGG	2	6	523816	523821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384897242
11065	NC_017362	AAAACT	2	12	523835	523846	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384897242
11066	NC_017362	GTTTT	2	10	523881	523890	0 %	80 %	20 %	0 %	384897242
11067	NC_017362	T	6	6	523887	523892	0 %	100 %	0 %	0 %	384897242
11068	NC_017362	TA	3	6	523926	523931	50 %	50 %	0 %	0 %	384897242
11069	NC_017362	TTTTG	2	10	523964	523973	0 %	80 %	20 %	0 %	384897242
11070	NC_017362	TTA	2	6	524017	524022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384897242
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11072	NC_017362	AAT	2	6	524093	524098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384897243
11073	NC_017362	TGCA	2	8	524153	524160	25 %	25 %	25 %	25 %	384897243
11074	NC_017362	A	6	6	524172	524177	100 %	0 %	0 %	0 %	384897243
11075	NC_017362	GTG	2	6	524178	524183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384897243
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11080	NC_017362	ATG	2	6	524608	524613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384897243
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11083	NC_017362	ACAAG	2	10	524705	524714	60 %	0 %	20 %	20 %	384897243
11084	NC_017362	AGA	3	9	524852	524860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384897243
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11087	NC_017362	ATCAG	2	10	524908	524917	40 %	20 %	20 %	20 %	384897243
11088	NC_017362	GAA	2	6	524943	524948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11089	NC_017362	A	6	6	524947	524952	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11090	NC_017362	GA	3	6	524955	524960	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11091	NC_017362	AAC	2	6	524975	524980	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11092	NC_017362	T	6	6	525050	525055	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11093	NC_017362	T	6	6	525116	525121	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11094	NC_017362	GTTT	2	8	525122	525129	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11095	NC_017362	CTC	2	6	525150	525155	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384897244
11096	NC_017362	TTTC	2	8	525156	525163	0 %	75 %	0 %	25 %	384897244
11097	NC_017362	TCA	2	6	525186	525191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384897244
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11099	NC_017362	TCA	2	6	525264	525269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384897244
11100	NC_017362	GAA	2	6	525361	525366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384897244
11101	NC_017362	GATC	2	8	525389	525396	25 %	25 %	25 %	25 %	384897244
11102	NC_017362	A	6	6	525584	525589	100 %	0 %	0 %	0 %	384897244
11103	NC_017362	CATG	2	8	525591	525598	25 %	25 %	25 %	25 %	384897244
11104	NC_017362	T	7	7	525623	525629	0 %	100 %	0 %	0 %	384897244
11105	NC_017362	GTTC	2	8	525645	525652	0 %	50 %	25 %	25 %	384897244
11106	NC_017362	TCTT	2	8	525677	525684	0 %	75 %	0 %	25 %	384897244
11107	NC_017362	TTA	2	6	525725	525730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384897244
11108	NC_017362	TGT	2	6	525818	525823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11109	NC_017362	T	6	6	525867	525872	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11110	NC_017362	A	6	6	525924	525929	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11111	NC_017362	A	6	6	525961	525966	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11112	NC_017362	TAA	2	6	526058	526063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11113	NC_017362	TTG	2	6	526095	526100	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11114	NC_017362	A	6	6	526128	526133	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11115	NC_017362	GA	3	6	526175	526180	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11116	NC_017362	TTATT	2	10	526184	526193	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11117	NC_017362	TGC	2	6	526211	526216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11118	NC_017362	ACCA	2	8	526230	526237	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11119	NC_017362	TTC	2	6	526273	526278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11120	NC_017362	T	6	6	526326	526331	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11121	NC_017362	CAT	2	6	526353	526358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11122	NC_017362	AAG	2	6	526366	526371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11123	NC_017362	A	6	6	526375	526380	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11124	NC_017362	CAA	2	6	526440	526445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11125	NC_017362	CTTG	2	8	526499	526506	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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