MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Helicobacter pylori Lithuania75 chromosome

Total Repeats: 33924

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017362	GAGC	2	8	28	35	25 %	0 %	50 %	25 %	384896753
2	NC_017362	TGA	3	9	121	129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384896753
3	NC_017362	TTCT	2	8	259	266	0 %	75 %	0 %	25 %	384896753
4	NC_017362	AAAGCG	2	12	288	299	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384896753
5	NC_017362	GTT	2	6	305	310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384896753
6	NC_017362	T	7	7	318	324	0 %	100 %	0 %	0 %	384896753
7	NC_017362	T	7	7	346	352	0 %	100 %	0 %	0 %	384896753
8	NC_017362	TTC	2	6	356	361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384896753
9	NC_017362	ACA	2	6	382	387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384896753
10	NC_017362	C	6	6	400	405	0 %	0 %	0 %	100 %	384896753
11	NC_017362	AAT	2	6	457	462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384896754
12	NC_017362	C	6	6	642	647	0 %	0 %	0 %	100 %	384896754
13	NC_017362	TAA	2	6	650	655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384896754
14	NC_017362	CT	3	6	691	696	0 %	50 %	0 %	50 %	384896754
15	NC_017362	CTT	2	6	800	805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384896754
16	NC_017362	TCTG	2	8	810	817	0 %	50 %	25 %	25 %	384896754
17	NC_017362	TGA	2	6	818	823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384896754
18	NC_017362	TTGCAA	2	12	867	878	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384896754
19	NC_017362	AAAT	2	8	912	919	75 %	25 %	0 %	0 %	384896755
20	NC_017362	CCG	3	9	1043	1051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384896755
21	NC_017362	CCA	2	6	1187	1192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384896755
22	NC_017362	GCT	2	6	1212	1217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384896755
23	NC_017362	CA	3	6	1226	1231	50 %	0 %	0 %	50 %	384896755
24	NC_017362	T	6	6	1243	1248	0 %	100 %	0 %	0 %	384896755
25	NC_017362	CTA	2	6	1279	1284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384896755
26	NC_017362	T	6	6	1347	1352	0 %	100 %	0 %	0 %	384896755
27	NC_017362	ATA	2	6	1360	1365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384896755
28	NC_017362	GGC	2	6	1403	1408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384896755
29	NC_017362	GCC	2	6	1447	1452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384896755
30	NC_017362	GCTT	2	8	1455	1462	0 %	50 %	25 %	25 %	384896755
31	NC_017362	CT	3	6	1561	1566	0 %	50 %	0 %	50 %	384896755
32	NC_017362	TAG	2	6	1646	1651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384896755
33	NC_017362	CTT	2	6	1657	1662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384896755
34	NC_017362	TTC	2	6	1762	1767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384896756
35	NC_017362	A	7	7	1777	1783	100 %	0 %	0 %	0 %	384896756
36	NC_017362	ATTATA	2	12	1795	1806	50 %	50 %	0 %	0 %	384896756
37	NC_017362	CCTG	2	8	1810	1817	0 %	25 %	25 %	50 %	384896756
38	NC_017362	CCAA	2	8	1834	1841	50 %	0 %	0 %	50 %	384896756
39	NC_017362	TGAA	2	8	1874	1881	50 %	25 %	25 %	0 %	384896756
40	NC_017362	GTT	2	6	1897	1902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384896756
41	NC_017362	T	6	6	1976	1981	0 %	100 %	0 %	0 %	384896756
42	NC_017362	TTC	2	6	1984	1989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384896756
43	NC_017362	TCA	2	6	2051	2056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384896756
44	NC_017362	AAT	2	6	2104	2109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384896756
45	NC_017362	GTTT	2	8	2179	2186	0 %	75 %	25 %	0 %	384896756
46	NC_017362	G	6	6	2189	2194	0 %	0 %	100 %	0 %	384896756
47	NC_017362	ATTC	2	8	2349	2356	25 %	50 %	0 %	25 %	384896756
48	NC_017362	T	7	7	2412	2418	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017362	A	8	8	2541	2548	100 %	0 %	0 %	0 %	384896757
50	NC_017362	T	7	7	2559	2565	0 %	100 %	0 %	0 %	384896757
51	NC_017362	T	7	7	2637	2643	0 %	100 %	0 %	0 %	384896757
52	NC_017362	T	7	7	2679	2685	0 %	100 %	0 %	0 %	384896757
53	NC_017362	AGC	2	6	2777	2782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384896757
54	NC_017362	GC	3	6	2790	2795	0 %	0 %	50 %	50 %	384896757
55	NC_017362	A	6	6	2828	2833	100 %	0 %	0 %	0 %	384896757
56	NC_017362	AG	3	6	2947	2952	50 %	0 %	50 %	0 %	384896757
57	NC_017362	GTG	2	6	2966	2971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384896757
58	NC_017362	AGA	2	6	3064	3069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384896757
59	NC_017362	AAG	2	6	3093	3098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384896757
60	NC_017362	GCC	2	6	3132	3137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384896757
61	NC_017362	TGC	2	6	3217	3222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384896758
62	NC_017362	GAA	2	6	3248	3253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384896758
63	NC_017362	GAAA	2	8	3322	3329	75 %	0 %	25 %	0 %	384896758
64	NC_017362	TG	3	6	3429	3434	0 %	50 %	50 %	0 %	384896758
65	NC_017362	AGC	2	6	3498	3503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384896758
66	NC_017362	GGT	2	6	3577	3582	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384896758
67	NC_017362	CTA	2	6	3618	3623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384896758
68	NC_017362	ATC	2	6	3662	3667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384896758
69	NC_017362	AGAA	2	8	3778	3785	75 %	0 %	25 %	0 %	384896758
70	NC_017362	CAG	2	6	3824	3829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384896758
71	NC_017362	ATAG	2	8	3833	3840	50 %	25 %	25 %	0 %	384896758
72	NC_017362	A	6	6	3866	3871	100 %	0 %	0 %	0 %	384896758
73	NC_017362	ATT	2	6	3906	3911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384896758
74	NC_017362	GGC	2	6	3979	3984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384896758
75	NC_017362	GGT	2	6	4085	4090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017362	TAT	2	6	4133	4138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017362	TGG	2	6	4176	4181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017362	ATGC	2	8	4280	4287	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_017362	TGG	2	6	4296	4301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017362	GTG	2	6	4412	4417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017362	ACC	2	6	4444	4449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_017362	GGT	2	6	4457	4462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017362	T	8	8	4596	4603	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017362	AAT	2	6	4617	4622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017362	GAAAC	2	10	4646	4655	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
86	NC_017362	TAAA	2	8	4685	4692	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017362	A	6	6	4771	4776	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017362	T	7	7	4823	4829	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017362	A	6	6	4834	4839	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017362	A	6	6	4850	4855	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017362	GTTTT	2	10	4860	4869	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017362	TGT	2	6	4889	4894	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017362	TTTTA	2	10	4923	4932	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017362	A	6	6	4974	4979	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017362	A	9	9	4988	4996	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017362	A	6	6	5007	5012	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017362	A	6	6	5023	5028	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017362	TCGC	2	8	5189	5196	0 %	25 %	25 %	50 %	384896759
99	NC_017362	CATT	2	8	5262	5269	25 %	50 %	0 %	25 %	384896759
100	NC_017362	ATT	2	6	5284	5289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384896759
101	NC_017362	C	6	6	5347	5352	0 %	0 %	0 %	100 %	384896759
102	NC_017362	TGG	2	6	5382	5387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384896759
103	NC_017362	A	6	6	5494	5499	100 %	0 %	0 %	0 %	384896759
104	NC_017362	A	6	6	5536	5541	100 %	0 %	0 %	0 %	384896759
105	NC_017362	GTT	2	6	5584	5589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384896759
106	NC_017362	ATA	2	6	5603	5608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384896759
107	NC_017362	TAA	2	6	5653	5658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384896759
108	NC_017362	TTA	2	6	5711	5716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384896759
109	NC_017362	GTG	2	6	5780	5785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384896759
110	NC_017362	GC	3	6	5842	5847	0 %	0 %	50 %	50 %	384896759
111	NC_017362	TGT	2	6	5901	5906	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384896759
112	NC_017362	C	6	6	5946	5951	0 %	0 %	0 %	100 %	384896759
113	NC_017362	GTT	2	6	5956	5961	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384896759
114	NC_017362	TTTGA	2	10	6055	6064	20 %	60 %	20 %	0 %	384896759
115	NC_017362	GCTTGC	2	12	6086	6097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384896759
116	NC_017362	CAG	2	6	6132	6137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384896759
117	NC_017362	GCG	2	6	6159	6164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384896759
118	NC_017362	CGA	2	6	6204	6209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384896759
119	NC_017362	ATG	2	6	6371	6376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384896759
120	NC_017362	TTA	3	9	6440	6448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384896759
121	NC_017362	GTG	2	6	6455	6460	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384896759
122	NC_017362	GTG	2	6	6479	6484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384896759
123	NC_017362	CTA	3	9	6494	6502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384896759
124	NC_017362	TAC	3	9	6504	6512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384896759
125	NC_017362	GCTA	2	8	6514	6521	25 %	25 %	25 %	25 %	384896759
126	NC_017362	ATT	2	6	6526	6531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384896759
127	NC_017362	TTA	2	6	6542	6547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384896759
128	NC_017362	CCG	2	6	6563	6568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384896759
129	NC_017362	TAG	2	6	6576	6581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384896759
130	NC_017362	TTTG	2	8	6582	6589	0 %	75 %	25 %	0 %	384896759
131	NC_017362	TGT	2	6	6627	6632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384896759
132	NC_017362	TTG	2	6	6667	6672	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384896759
133	NC_017362	GAT	2	6	6673	6678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384896759
134	NC_017362	TCA	2	6	6707	6712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384896759
135	NC_017362	TGGT	2	8	6781	6788	0 %	50 %	50 %	0 %	384896759
136	NC_017362	CCATTC	2	12	6824	6835	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	384896759
137	NC_017362	CA	3	6	6837	6842	50 %	0 %	0 %	50 %	384896759
138	NC_017362	CCG	2	6	6876	6881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384896759
139	NC_017362	T	6	6	6924	6929	0 %	100 %	0 %	0 %	384896759
140	NC_017362	ATCG	2	8	6964	6971	25 %	25 %	25 %	25 %	384896759
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500	NC_017362	GCT	2	6	24213	24218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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