MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Helicobacter pylori 35A chromosome

Total Repeats: 32651

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
25501	NC_017360	AGG	2	6	1219214	1219219	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25502	NC_017360	GCC	2	6	1219347	1219352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25503	NC_017360	TTCAA	2	10	1219365	1219374	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
25504	NC_017360	GGGA	2	8	1219486	1219493	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
25505	NC_017360	TGC	2	6	1219513	1219518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25506	NC_017360	CTCAT	2	10	1219595	1219604	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
25507	NC_017360	GAC	2	6	1219629	1219634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25508	NC_017360	ACG	2	6	1219664	1219669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25509	NC_017360	AGCT	2	8	1219784	1219791	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
25510	NC_017360	C	6	6	1219809	1219814	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
25511	NC_017360	GAC	2	6	1219906	1219911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25512	NC_017360	CGG	2	6	1219937	1219942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25513	NC_017360	AT	3	6	1219954	1219959	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25514	NC_017360	CTTT	2	8	1220141	1220148	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
25515	NC_017360	GCT	2	6	1220157	1220162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25516	NC_017360	CCT	2	6	1220173	1220178	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25517	NC_017360	GTT	2	6	1220180	1220185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25518	NC_017360	CA	3	6	1220194	1220199	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25519	NC_017360	GTT	2	6	1220248	1220253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25520	NC_017360	GATT	2	8	1220265	1220272	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
25521	NC_017360	CACC	2	8	1220277	1220284	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
25522	NC_017360	AGC	2	6	1220346	1220351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25523	NC_017360	TAT	2	6	1220381	1220386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25524	NC_017360	AT	3	6	1220406	1220411	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25525	NC_017360	GTTT	2	8	1220437	1220444	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
25526	NC_017360	TCC	2	6	1220502	1220507	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25527	NC_017360	GCA	2	6	1220565	1220570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25528	NC_017360	AGT	2	6	1220800	1220805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25529	NC_017360	TCGC	2	8	1221015	1221022	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
25530	NC_017360	ACT	2	6	1221024	1221029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25531	NC_017360	TCACT	2	10	1221074	1221083	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
25532	NC_017360	CT	3	6	1221091	1221096	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25533	NC_017360	CT	3	6	1221211	1221216	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25534	NC_017360	TTC	2	6	1221319	1221324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25535	NC_017360	TACTT	2	10	1221372	1221381	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
25536	NC_017360	AGA	2	6	1221471	1221476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25537	NC_017360	T	6	6	1221500	1221505	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25538	NC_017360	TTG	2	6	1221540	1221545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25539	NC_017360	AACTTG	2	12	1221565	1221576	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25540	NC_017360	GTT	2	6	1221611	1221616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25541	NC_017360	GAAA	2	8	1221710	1221717	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
25542	NC_017360	AAAAT	2	10	1221812	1221821	80 %	20 %	0 %	0 %	384896306
25543	NC_017360	CAT	2	6	1221823	1221828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384896306
25544	NC_017360	AAAT	2	8	1221830	1221837	75 %	25 %	0 %	0 %	384896306
25545	NC_017360	CAT	2	6	1221839	1221844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384896306
25546	NC_017360	ACA	2	6	1221871	1221876	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384896306
25547	NC_017360	T	8	8	1221889	1221896	0 %	100 %	0 %	0 %	384896306
25548	NC_017360	ATC	2	6	1221941	1221946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25549	NC_017360	ATC	2	6	1221949	1221954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25550	NC_017360	TGT	2	6	1221974	1221979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25551	NC_017360	T	6	6	1222016	1222021	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25552	NC_017360	ATT	2	6	1222022	1222027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25553	NC_017360	GA	3	6	1222132	1222137	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25554	NC_017360	AGA	2	6	1222151	1222156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384896307
25555	NC_017360	TGT	3	9	1222183	1222191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384896307
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25557	NC_017360	CAT	2	6	1222340	1222345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384896307
25558	NC_017360	CAA	2	6	1222366	1222371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384896307
25559	NC_017360	TGA	2	6	1222436	1222441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384896307
25560	NC_017360	GAA	2	6	1222497	1222502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25561	NC_017360	ATTG	2	8	1222559	1222566	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
25562	NC_017360	A	7	7	1222570	1222576	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25563	NC_017360	ATGGTT	2	12	1222580	1222591	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25564	NC_017360	T	6	6	1222590	1222595	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25565	NC_017360	CAT	2	6	1222606	1222611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25566	NC_017360	GAA	2	6	1222613	1222618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25567	NC_017360	TTG	2	6	1222634	1222639	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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25579	NC_017360	CAA	2	6	1223300	1223305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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25581	NC_017360	TAC	2	6	1223399	1223404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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25589	NC_017360	GCG	2	6	1223655	1223660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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25591	NC_017360	CT	4	8	1223701	1223708	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25592	NC_017360	GC	3	6	1223721	1223726	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25593	NC_017360	ACC	2	6	1223755	1223760	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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25599	NC_017360	AAG	2	6	1224302	1224307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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25603	NC_017360	TATCG	2	10	1224385	1224394	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
25604	NC_017360	TGAA	2	8	1224404	1224411	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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25622	NC_017360	AATA	2	8	1225347	1225354	75 %	25 %	0 %	0 %	384896308
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25625	NC_017360	GCT	2	6	1225414	1225419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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25996	NC_017360	CAA	2	6	1243700	1243705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384896322
25997	NC_017360	CTC	2	6	1243721	1243726	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384896322
25998	NC_017360	TCA	2	6	1243740	1243745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384896322
25999	NC_017360	TCAA	2	8	1243818	1243825	50 %	25 %	0 %	25 %	384896322
26000	NC_017360	GC	3	6	1243927	1243932	0 %	0 %	50 %	50 %	384896322

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