MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Helicobacter pylori v225d chromosome

Total Repeats: 33223

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017355	GAGC	2	8	18	25	25 %	0 %	50 %	25 %	384888658
2	NC_017355	CATT	2	8	104	111	25 %	50 %	0 %	25 %	384888658
3	NC_017355	GAT	3	9	112	120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384888658
4	NC_017355	T	6	6	249	254	0 %	100 %	0 %	0 %	384888658
5	NC_017355	AAAGCA	2	12	278	289	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384888658
6	NC_017355	GTT	2	6	295	300	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384888658
7	NC_017355	T	7	7	308	314	0 %	100 %	0 %	0 %	384888658
8	NC_017355	T	7	7	336	342	0 %	100 %	0 %	0 %	384888658
9	NC_017355	TTC	2	6	346	351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384888658
10	NC_017355	ACA	2	6	372	377	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384888658
11	NC_017355	ACC	2	6	383	388	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384888658
12	NC_017355	C	6	6	390	395	0 %	0 %	0 %	100 %	384888658
13	NC_017355	AAT	2	6	447	452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384888659
14	NC_017355	TTA	2	6	483	488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384888659
15	NC_017355	TAA	2	6	640	645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384888659
16	NC_017355	AAC	2	6	687	692	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384888659
17	NC_017355	CT	3	6	693	698	0 %	50 %	0 %	50 %	384888659
18	NC_017355	CTT	2	6	790	795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384888659
19	NC_017355	TCTG	2	8	800	807	0 %	50 %	25 %	25 %	384888659
20	NC_017355	TGA	2	6	808	813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384888659
21	NC_017355	AAAT	2	8	902	909	75 %	25 %	0 %	0 %	384888660
22	NC_017355	CTA	2	6	931	936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384888660
23	NC_017355	AAC	2	6	1014	1019	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384888660
24	NC_017355	CCG	4	12	1033	1044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384888660
25	NC_017355	CCA	2	6	1177	1182	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384888660
26	NC_017355	GCT	2	6	1202	1207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384888660
27	NC_017355	CA	3	6	1216	1221	50 %	0 %	0 %	50 %	384888660
28	NC_017355	T	6	6	1233	1238	0 %	100 %	0 %	0 %	384888660
29	NC_017355	CTA	2	6	1269	1274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384888660
30	NC_017355	TC	3	6	1275	1280	0 %	50 %	0 %	50 %	384888660
31	NC_017355	T	6	6	1337	1342	0 %	100 %	0 %	0 %	384888660
32	NC_017355	ATA	2	6	1350	1355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384888660
33	NC_017355	GGC	2	6	1393	1398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384888660
34	NC_017355	GCTT	2	8	1445	1452	0 %	50 %	25 %	25 %	384888660
35	NC_017355	CT	3	6	1551	1556	0 %	50 %	0 %	50 %	384888660
36	NC_017355	TAAAA	2	10	1591	1600	80 %	20 %	0 %	0 %	384888660
37	NC_017355	GTT	2	6	1613	1618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384888660
38	NC_017355	TAG	2	6	1636	1641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384888660
39	NC_017355	CTT	2	6	1647	1652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384888660
40	NC_017355	TTC	2	6	1752	1757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384888661
41	NC_017355	A	7	7	1767	1773	100 %	0 %	0 %	0 %	384888661
42	NC_017355	ATTATA	2	12	1785	1796	50 %	50 %	0 %	0 %	384888661
43	NC_017355	CCTG	2	8	1800	1807	0 %	25 %	25 %	50 %	384888661
44	NC_017355	ATG	2	6	1813	1818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384888661
45	NC_017355	CCAA	2	8	1824	1831	50 %	0 %	0 %	50 %	384888661
46	NC_017355	TCA	2	6	1850	1855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384888661
47	NC_017355	TGAA	2	8	1864	1871	50 %	25 %	25 %	0 %	384888661
48	NC_017355	GTT	2	6	1887	1892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384888661
49	NC_017355	CA	3	6	1903	1908	50 %	0 %	0 %	50 %	384888661
50	NC_017355	T	6	6	1966	1971	0 %	100 %	0 %	0 %	384888661
51	NC_017355	CTT	2	6	1976	1981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384888661
52	NC_017355	TGG	2	6	2033	2038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384888661
53	NC_017355	TCA	2	6	2041	2046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384888661
54	NC_017355	TTAA	2	8	2047	2054	50 %	50 %	0 %	0 %	384888661
55	NC_017355	AAT	2	6	2094	2099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384888661
56	NC_017355	TAG	2	6	2147	2152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384888661
57	NC_017355	AGG	2	6	2178	2183	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384888661
58	NC_017355	GATTA	2	10	2238	2247	40 %	40 %	20 %	0 %	384888661
59	NC_017355	ATTC	2	8	2339	2346	25 %	50 %	0 %	25 %	384888661
60	NC_017355	A	8	8	2532	2539	100 %	0 %	0 %	0 %	384888662
61	NC_017355	TCTT	2	8	2548	2555	0 %	75 %	0 %	25 %	384888662
62	NC_017355	T	7	7	2628	2634	0 %	100 %	0 %	0 %	384888662
63	NC_017355	T	7	7	2670	2676	0 %	100 %	0 %	0 %	384888662
64	NC_017355	GC	3	6	2781	2786	0 %	0 %	50 %	50 %	384888662
65	NC_017355	A	6	6	2819	2824	100 %	0 %	0 %	0 %	384888662
66	NC_017355	AG	3	6	2938	2943	50 %	0 %	50 %	0 %	384888662
67	NC_017355	GTG	2	6	2957	2962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384888662
68	NC_017355	AGA	2	6	3055	3060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384888662
69	NC_017355	GTG	2	6	3116	3121	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384888662
70	NC_017355	GCC	2	6	3123	3128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384888662
71	NC_017355	GAAA	2	8	3238	3245	75 %	0 %	25 %	0 %	384888663
72	NC_017355	GAAA	2	8	3313	3320	75 %	0 %	25 %	0 %	384888663
73	NC_017355	AGTG	2	8	3334	3341	25 %	25 %	50 %	0 %	384888663
74	NC_017355	TG	3	6	3420	3425	0 %	50 %	50 %	0 %	384888663
75	NC_017355	GTT	2	6	3569	3574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384888663
76	NC_017355	ATC	2	6	3653	3658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384888663
77	NC_017355	GCGATA	2	12	3717	3728	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384888663
78	NC_017355	CAAG	2	8	3814	3821	50 %	0 %	25 %	25 %	384888663
79	NC_017355	A	6	6	3857	3862	100 %	0 %	0 %	0 %	384888663
80	NC_017355	ATT	2	6	3897	3902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384888663
81	NC_017355	GGC	2	6	3970	3975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384888663
82	NC_017355	GGT	2	6	4076	4081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017355	TAT	2	6	4124	4129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017355	TGG	2	6	4168	4173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017355	ATGC	2	8	4272	4279	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_017355	TGG	2	6	4288	4293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017355	GTG	2	6	4404	4409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017355	ACC	2	6	4436	4441	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_017355	GGT	2	6	4449	4454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017355	A	7	7	4570	4576	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017355	T	8	8	4590	4597	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017355	AAT	2	6	4611	4616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384888664
93	NC_017355	TAAA	2	8	4679	4686	75 %	25 %	0 %	0 %	384888664
94	NC_017355	TAA	2	6	4701	4706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384888664
95	NC_017355	TGT	2	6	4738	4743	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384888664
96	NC_017355	A	7	7	4768	4774	100 %	0 %	0 %	0 %	384888664
97	NC_017355	ATT	2	6	4803	4808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017355	T	8	8	4821	4828	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017355	A	6	6	4833	4838	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017355	A	7	7	4849	4855	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017355	TGT	2	6	4889	4894	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017355	TTTTA	2	10	4913	4922	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017355	TC	3	6	4958	4963	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_017355	A	8	8	4991	4998	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017355	A	8	8	5007	5014	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017355	A	6	6	5025	5030	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017355	CTTT	2	8	5227	5234	0 %	75 %	0 %	25 %	384888665
108	NC_017355	CATT	2	8	5293	5300	25 %	50 %	0 %	25 %	384888665
109	NC_017355	ATT	2	6	5315	5320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384888665
110	NC_017355	TGG	2	6	5413	5418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384888665
111	NC_017355	A	6	6	5525	5530	100 %	0 %	0 %	0 %	384888665
112	NC_017355	C	6	6	5545	5550	0 %	0 %	0 %	100 %	384888665
113	NC_017355	A	6	6	5567	5572	100 %	0 %	0 %	0 %	384888665
114	NC_017355	GTT	2	6	5615	5620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384888665
115	NC_017355	TAA	2	6	5684	5689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384888665
116	NC_017355	TTA	2	6	5742	5747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384888665
117	NC_017355	GTG	2	6	5811	5816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384888665
118	NC_017355	GTT	2	6	5831	5836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384888665
119	NC_017355	GTGC	2	8	5871	5878	0 %	25 %	50 %	25 %	384888665
120	NC_017355	ATG	2	6	6031	6036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384888665
121	NC_017355	AGT	2	6	6040	6045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384888665
122	NC_017355	GCTTGC	2	12	6114	6125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384888665
123	NC_017355	GC	3	6	6124	6129	0 %	0 %	50 %	50 %	384888665
124	NC_017355	AGA	2	6	6161	6166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384888665
125	NC_017355	AC	3	6	6302	6307	50 %	0 %	0 %	50 %	384888665
126	NC_017355	CTT	2	6	6409	6414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384888665
127	NC_017355	TAG	7	21	6436	6456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384888665
128	NC_017355	TGT	2	6	6485	6490	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384888665
129	NC_017355	GTT	2	6	6518	6523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384888665
130	NC_017355	TTG	2	6	6551	6556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384888665
131	NC_017355	CAT	2	6	6571	6576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384888665
132	NC_017355	TGGT	2	8	6668	6675	0 %	50 %	50 %	0 %	384888665
133	NC_017355	TTG	2	6	6692	6697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384888665
134	NC_017355	CCG	2	6	6754	6759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384888665
135	NC_017355	T	6	6	6802	6807	0 %	100 %	0 %	0 %	384888665
136	NC_017355	ATCG	2	8	6842	6849	25 %	25 %	25 %	25 %	384888665
137	NC_017355	CGTT	2	8	6877	6884	0 %	50 %	25 %	25 %	384888665
138	NC_017355	A	6	6	7016	7021	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017355	GA	6	12	7055	7066	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017355	T	7	7	7076	7082	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017355	TGT	2	6	7204	7209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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451	NC_017355	A	6	6	22296	22301	100 %	0 %	0 %	0 %	384888679
452	NC_017355	CAA	3	9	22305	22313	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384888679
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456	NC_017355	ATCA	2	8	22479	22486	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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499	NC_017355	ATACC	2	10	24937	24946	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
500	NC_017355	ATTA	2	8	24989	24996	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

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