MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Hydrogenobacter thermophilus TK-6 chromosome

Total Repeats: 35504

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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33502	NC_017161	AGCC	2	8	1643628	1643635	25 %	0 %	25 %	50 %	384129852
33503	NC_017161	TCT	2	6	1643687	1643692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384129852
33504	NC_017161	T	6	6	1643698	1643703	0 %	100 %	0 %	0 %	384129852
33505	NC_017161	CAG	2	6	1643706	1643711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384129852
33506	NC_017161	T	7	7	1643751	1643757	0 %	100 %	0 %	0 %	384129852
33507	NC_017161	GTA	2	6	1643941	1643946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384129853
33508	NC_017161	TAC	2	6	1644046	1644051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384129853
33509	NC_017161	GCAG	2	8	1644208	1644215	25 %	0 %	50 %	25 %	384129853
33510	NC_017161	TTA	2	6	1644282	1644287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384129853
33511	NC_017161	ATG	2	6	1644304	1644309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384129854
33512	NC_017161	ATGGG	2	10	1644325	1644334	20 %	20 %	60 %	0 %	384129854
33513	NC_017161	TGG	2	6	1644356	1644361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384129854
33514	NC_017161	TGC	2	6	1644384	1644389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384129854
33515	NC_017161	AG	3	6	1644456	1644461	50 %	0 %	50 %	0 %	384129855
33516	NC_017161	TCC	2	6	1644514	1644519	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384129855
33517	NC_017161	ACC	2	6	1644528	1644533	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384129855
33518	NC_017161	GGA	2	6	1644547	1644552	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384129855
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33520	NC_017161	CGT	2	6	1644595	1644600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384129855
33521	NC_017161	ATG	2	6	1644761	1644766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384129855
33522	NC_017161	TA	3	6	1644799	1644804	50 %	50 %	0 %	0 %	384129855
33523	NC_017161	TGG	2	6	1644826	1644831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384129855
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33533	NC_017161	TTAG	2	8	1645490	1645497	25 %	50 %	25 %	0 %	384129855
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33537	NC_017161	GCTGAA	2	12	1645760	1645771	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384129855
33538	NC_017161	GGA	2	6	1645807	1645812	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384129855
33539	NC_017161	GAAA	2	8	1645825	1645832	75 %	0 %	25 %	0 %	384129855
33540	NC_017161	GGT	2	6	1645879	1645884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384129855
33541	NC_017161	TTG	2	6	1645887	1645892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384129855
33542	NC_017161	CT	3	6	1645925	1645930	0 %	50 %	0 %	50 %	384129855
33543	NC_017161	AGG	2	6	1645940	1645945	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384129855
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33551	NC_017161	CCG	2	6	1646396	1646401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384129855
33552	NC_017161	GAG	2	6	1646464	1646469	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384129855
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33556	NC_017161	ACT	2	6	1646741	1646746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384129856
33557	NC_017161	CT	3	6	1646745	1646750	0 %	50 %	0 %	50 %	384129856
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33573	NC_017161	TCTT	2	8	1647530	1647537	0 %	75 %	0 %	25 %	384129856
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33592	NC_017161	CAT	2	6	1648311	1648316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384129856
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33599	NC_017161	TGT	2	6	1648659	1648664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384129856
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33601	NC_017161	A	6	6	1648833	1648838	100 %	0 %	0 %	0 %	384129856
33602	NC_017161	AGG	2	6	1648948	1648953	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384129856
33603	NC_017161	AAAG	2	8	1648957	1648964	75 %	0 %	25 %	0 %	384129856
33604	NC_017161	CTA	3	9	1648983	1648991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384129856
33605	NC_017161	CTT	2	6	1649065	1649070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384129856
33606	NC_017161	GTG	2	6	1649071	1649076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384129856
33607	NC_017161	CTG	2	6	1649116	1649121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384129856
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33609	NC_017161	TGGG	2	8	1649150	1649157	0 %	25 %	75 %	0 %	384129856
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33612	NC_017161	AG	4	8	1649283	1649290	50 %	0 %	50 %	0 %	384129856
33613	NC_017161	AGG	2	6	1649306	1649311	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384129856
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33616	NC_017161	CT	3	6	1649477	1649482	0 %	50 %	0 %	50 %	384129856
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