MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Hydrogenobacter thermophilus TK-6 chromosome

Total Repeats: 35504

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
33001	NC_017161	GA	3	6	1619823	1619828	50 %	0 %	50 %	0 %	384129826
33002	NC_017161	TAC	2	6	1619857	1619862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384129826
33003	NC_017161	AGG	2	6	1619998	1620003	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33004	NC_017161	ATGC	2	8	1620006	1620013	25 %	25 %	25 %	25 %	384129827
33005	NC_017161	CTA	2	6	1620025	1620030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384129827
33006	NC_017161	GGA	2	6	1620102	1620107	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384129827
33007	NC_017161	TTC	2	6	1620214	1620219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384129827
33008	NC_017161	T	6	6	1620238	1620243	0 %	100 %	0 %	0 %	384129827
33009	NC_017161	TCA	2	6	1620253	1620258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384129827
33010	NC_017161	TGG	2	6	1620324	1620329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384129827
33011	NC_017161	AC	3	6	1620337	1620342	50 %	0 %	0 %	50 %	384129827
33012	NC_017161	ATAC	2	8	1620372	1620379	50 %	25 %	0 %	25 %	384129827
33013	NC_017161	TGG	2	6	1620413	1620418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384129827
33014	NC_017161	GGGA	2	8	1620472	1620479	25 %	0 %	75 %	0 %	384129827
33015	NC_017161	AG	3	6	1620488	1620493	50 %	0 %	50 %	0 %	384129827
33016	NC_017161	ACA	2	6	1620500	1620505	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384129827
33017	NC_017161	AC	3	6	1620541	1620546	50 %	0 %	0 %	50 %	384129827
33018	NC_017161	TGG	2	6	1620579	1620584	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384129827
33019	NC_017161	GT	3	6	1620653	1620658	0 %	50 %	50 %	0 %	384129827
33020	NC_017161	TGG	2	6	1620701	1620706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384129827
33021	NC_017161	CT	3	6	1620725	1620730	0 %	50 %	0 %	50 %	384129827
33022	NC_017161	CT	3	6	1620769	1620774	0 %	50 %	0 %	50 %	384129827
33023	NC_017161	CAA	2	6	1620795	1620800	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384129827
33024	NC_017161	AAAG	2	8	1620896	1620903	75 %	0 %	25 %	0 %	384129827
33025	NC_017161	CAT	2	6	1620954	1620959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384129827
33026	NC_017161	GTG	2	6	1620998	1621003	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384129827
33027	NC_017161	ACAGC	2	10	1621076	1621085	40 %	0 %	20 %	40 %	384129827
33028	NC_017161	ACA	2	6	1621106	1621111	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384129827
33029	NC_017161	TGGCA	2	10	1621142	1621151	20 %	20 %	40 %	20 %	384129827
33030	NC_017161	AAC	2	6	1621198	1621203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384129827
33031	NC_017161	TTG	2	6	1621211	1621216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384129827
33032	NC_017161	CAA	2	6	1621224	1621229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384129827
33033	NC_017161	TAA	2	6	1621286	1621291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384129827
33034	NC_017161	TAC	2	6	1621486	1621491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384129827
33035	NC_017161	TGA	2	6	1621536	1621541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384129827
33036	NC_017161	AAC	2	6	1621558	1621563	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384129827
33037	NC_017161	T	6	6	1621636	1621641	0 %	100 %	0 %	0 %	384129828
33038	NC_017161	TAT	2	6	1621662	1621667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384129828
33039	NC_017161	CCTT	2	8	1621669	1621676	0 %	50 %	0 %	50 %	384129828
33040	NC_017161	CTT	2	6	1621704	1621709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384129828
33041	NC_017161	CTTC	2	8	1621808	1621815	0 %	50 %	0 %	50 %	384129828
33042	NC_017161	TCA	2	6	1621987	1621992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384129828
33043	NC_017161	AGG	2	6	1622028	1622033	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384129828
33044	NC_017161	CTC	2	6	1622049	1622054	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384129828
33045	NC_017161	AAGG	2	8	1622193	1622200	50 %	0 %	50 %	0 %	384129828
33046	NC_017161	CTC	2	6	1622211	1622216	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384129828
33047	NC_017161	TTC	2	6	1622382	1622387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384129828
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33049	NC_017161	CTGAG	2	10	1622426	1622435	20 %	20 %	40 %	20 %	384129828
33050	NC_017161	ATGTT	2	10	1622438	1622447	20 %	60 %	20 %	0 %	384129828
33051	NC_017161	AT	3	6	1622457	1622462	50 %	50 %	0 %	0 %	384129828
33052	NC_017161	GTGA	2	8	1622463	1622470	25 %	25 %	50 %	0 %	384129828
33053	NC_017161	CT	3	6	1622569	1622574	0 %	50 %	0 %	50 %	384129829
33054	NC_017161	ATC	2	6	1622621	1622626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384129829
33055	NC_017161	T	6	6	1622657	1622662	0 %	100 %	0 %	0 %	384129829
33056	NC_017161	CAG	2	6	1622763	1622768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384129829
33057	NC_017161	GT	4	8	1622776	1622783	0 %	50 %	50 %	0 %	384129829
33058	NC_017161	GT	3	6	1622788	1622793	0 %	50 %	50 %	0 %	384129829
33059	NC_017161	CTAC	2	8	1622814	1622821	25 %	25 %	0 %	50 %	384129829
33060	NC_017161	TCC	2	6	1622838	1622843	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384129829
33061	NC_017161	TCA	2	6	1622850	1622855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384129829
33062	NC_017161	CAGGG	2	10	1622860	1622869	20 %	0 %	60 %	20 %	384129829
33063	NC_017161	TTTC	2	8	1622965	1622972	0 %	75 %	0 %	25 %	384129829
33064	NC_017161	GAT	2	6	1623017	1623022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384129829
33065	NC_017161	CCAT	2	8	1623039	1623046	25 %	25 %	0 %	50 %	384129829
33066	NC_017161	ACC	2	6	1623087	1623092	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384129829
33067	NC_017161	CTC	3	9	1623101	1623109	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384129829
33068	NC_017161	GACA	2	8	1623131	1623138	50 %	0 %	25 %	25 %	384129829
33069	NC_017161	CAT	2	6	1623164	1623169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384129829
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33071	NC_017161	TC	3	6	1623289	1623294	0 %	50 %	0 %	50 %	384129830
33072	NC_017161	GTA	2	6	1623331	1623336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384129830
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33074	NC_017161	CT	5	10	1623545	1623554	0 %	50 %	0 %	50 %	384129830
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33081	NC_017161	CTCC	2	8	1624101	1624108	0 %	25 %	0 %	75 %	384129830
33082	NC_017161	GAA	2	6	1624160	1624165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384129830
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33084	NC_017161	GGA	2	6	1624198	1624203	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384129830
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33086	NC_017161	GA	3	6	1624309	1624314	50 %	0 %	50 %	0 %	384129830
33087	NC_017161	AG	3	6	1624377	1624382	50 %	0 %	50 %	0 %	384129830
33088	NC_017161	AAAG	2	8	1624409	1624416	75 %	0 %	25 %	0 %	384129830
33089	NC_017161	A	7	7	1624493	1624499	100 %	0 %	0 %	0 %	384129830
33090	NC_017161	GAA	2	6	1624533	1624538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384129830
33091	NC_017161	CAG	2	6	1624623	1624628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384129831
33092	NC_017161	TCC	2	6	1624726	1624731	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384129831
33093	NC_017161	TGTACA	2	12	1624748	1624759	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384129831
33094	NC_017161	AAGA	2	8	1624833	1624840	75 %	0 %	25 %	0 %	384129831
33095	NC_017161	C	6	6	1624942	1624947	0 %	0 %	0 %	100 %	384129831
33096	NC_017161	CTG	2	6	1624991	1624996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384129831
33097	NC_017161	AG	3	6	1625003	1625008	50 %	0 %	50 %	0 %	384129831
33098	NC_017161	AGA	2	6	1625013	1625018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384129831
33099	NC_017161	ATC	2	6	1625032	1625037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384129831
33100	NC_017161	GGA	2	6	1625112	1625117	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384129831
33101	NC_017161	CAT	2	6	1625157	1625162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384129831
33102	NC_017161	GTA	2	6	1625211	1625216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384129831
33103	NC_017161	CTTG	2	8	1625217	1625224	0 %	50 %	25 %	25 %	384129831
33104	NC_017161	AG	3	6	1625234	1625239	50 %	0 %	50 %	0 %	384129831
33105	NC_017161	CAG	2	6	1625285	1625290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384129831
33106	NC_017161	TG	3	6	1625343	1625348	0 %	50 %	50 %	0 %	384129831
33107	NC_017161	AAAT	2	8	1625442	1625449	75 %	25 %	0 %	0 %	384129831
33108	NC_017161	GTAAGC	2	12	1625478	1625489	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384129831
33109	NC_017161	ATG	2	6	1625491	1625496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384129831
33110	NC_017161	AAG	2	6	1625530	1625535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384129831
33111	NC_017161	TTG	2	6	1625551	1625556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384129831
33112	NC_017161	CCTT	2	8	1625567	1625574	0 %	50 %	0 %	50 %	384129831
33113	NC_017161	AGA	2	6	1625627	1625632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384129831
33114	NC_017161	A	6	6	1625660	1625665	100 %	0 %	0 %	0 %	384129831
33115	NC_017161	AAGA	2	8	1625889	1625896	75 %	0 %	25 %	0 %	384129831
33116	NC_017161	AGA	2	6	1625925	1625930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384129831
33117	NC_017161	CTT	2	6	1625962	1625967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384129831
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33477	NC_017161	TG	3	6	1642761	1642766	0 %	50 %	50 %	0 %	384129849
33478	NC_017161	TAA	2	6	1642805	1642810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384129849
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