MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Hydrogenobacter thermophilus TK-6 chromosome

Total Repeats: 35504

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_017161	CTC	2	6	121514	121519	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384128208
2502	NC_017161	TCCA	2	8	121535	121542	25 %	25 %	0 %	50 %	384128208
2503	NC_017161	CCT	2	6	121592	121597	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384128208
2504	NC_017161	CTC	2	6	121694	121699	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384128208
2505	NC_017161	CAGA	2	8	121717	121724	50 %	0 %	25 %	25 %	384128208
2506	NC_017161	CCT	2	6	121802	121807	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384128208
2507	NC_017161	TCTA	2	8	121835	121842	25 %	50 %	0 %	25 %	384128208
2508	NC_017161	CTTT	2	8	121889	121896	0 %	75 %	0 %	25 %	384128208
2509	NC_017161	AT	3	6	122048	122053	50 %	50 %	0 %	0 %	384128208
2510	NC_017161	GCA	2	6	122073	122078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384128208
2511	NC_017161	CTC	2	6	122140	122145	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384128208
2512	NC_017161	GCCAT	2	10	122154	122163	20 %	20 %	20 %	40 %	384128208
2513	NC_017161	TC	3	6	122187	122192	0 %	50 %	0 %	50 %	384128208
2514	NC_017161	AGGT	2	8	122253	122260	25 %	25 %	50 %	0 %	384128208
2515	NC_017161	GTT	2	6	122261	122266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384128208
2516	NC_017161	CAG	2	6	122281	122286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384128208
2517	NC_017161	GCTT	2	8	122339	122346	0 %	50 %	25 %	25 %	384128208
2518	NC_017161	TCC	2	6	122394	122399	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384128208
2519	NC_017161	C	6	6	122398	122403	0 %	0 %	0 %	100 %	384128208
2520	NC_017161	CTC	2	6	122462	122467	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384128208
2521	NC_017161	CTC	2	6	122483	122488	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384128208
2522	NC_017161	TCT	2	6	122512	122517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384128208
2523	NC_017161	CTC	2	6	122555	122560	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384128208
2524	NC_017161	TCTT	2	8	122690	122697	0 %	75 %	0 %	25 %	384128208
2525	NC_017161	TCC	2	6	122700	122705	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384128208
2526	NC_017161	GCCA	2	8	122770	122777	25 %	0 %	25 %	50 %	384128208
2527	NC_017161	TCC	2	6	122802	122807	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384128208
2528	NC_017161	CAAG	2	8	122811	122818	50 %	0 %	25 %	25 %	384128208
2529	NC_017161	CTCC	2	8	122917	122924	0 %	25 %	0 %	75 %	384128208
2530	NC_017161	TAT	2	6	122966	122971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384128208
2531	NC_017161	GAA	2	6	122990	122995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384128208
2532	NC_017161	TC	3	6	123092	123097	0 %	50 %	0 %	50 %	384128208
2533	NC_017161	ATC	2	6	123386	123391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384128208
2534	NC_017161	T	7	7	123448	123454	0 %	100 %	0 %	0 %	384128209
2535	NC_017161	CTT	2	6	123557	123562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384128209
2536	NC_017161	TCA	2	6	123610	123615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384128209
2537	NC_017161	GGAA	2	8	123625	123632	50 %	0 %	50 %	0 %	384128209
2538	NC_017161	CTT	2	6	123794	123799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384128209
2539	NC_017161	ATA	2	6	123801	123806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384128209
2540	NC_017161	T	6	6	123838	123843	0 %	100 %	0 %	0 %	384128209
2541	NC_017161	TCC	2	6	123845	123850	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384128209
2542	NC_017161	TC	3	6	123851	123856	0 %	50 %	0 %	50 %	384128209
2543	NC_017161	CCT	2	6	123860	123865	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384128209
2544	NC_017161	CCT	2	6	124007	124012	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384128209
2545	NC_017161	TGT	2	6	124026	124031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384128209
2546	NC_017161	TAT	2	6	124038	124043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384128209
2547	NC_017161	GTA	2	6	124143	124148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384128209
2548	NC_017161	AG	3	6	124149	124154	50 %	0 %	50 %	0 %	384128209
2549	NC_017161	TCA	2	6	124177	124182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384128209
2550	NC_017161	TCC	2	6	124216	124221	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384128209
2551	NC_017161	AAG	2	6	124255	124260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384128209
2552	NC_017161	CACC	2	8	124298	124305	25 %	0 %	0 %	75 %	384128209
2553	NC_017161	CTT	2	6	124316	124321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384128209
2554	NC_017161	AAG	2	6	124352	124357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384128209
2555	NC_017161	AG	3	6	124356	124361	50 %	0 %	50 %	0 %	384128209
2556	NC_017161	TCT	2	6	124375	124380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384128209
2557	NC_017161	TTA	2	6	124412	124417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384128209
2558	NC_017161	CT	3	6	124429	124434	0 %	50 %	0 %	50 %	384128209
2559	NC_017161	AAAG	2	8	124491	124498	75 %	0 %	25 %	0 %	384128209
2560	NC_017161	CACCTG	2	12	124581	124592	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384128209
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2562	NC_017161	GAT	2	6	124674	124679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384128209
2563	NC_017161	CA	3	6	124701	124706	50 %	0 %	0 %	50 %	384128209
2564	NC_017161	AGG	2	6	124724	124729	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384128209
2565	NC_017161	CT	4	8	124775	124782	0 %	50 %	0 %	50 %	384128209
2566	NC_017161	GC	4	8	124795	124802	0 %	0 %	50 %	50 %	384128209
2567	NC_017161	CAT	2	6	124811	124816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384128209
2568	NC_017161	AC	3	6	124839	124844	50 %	0 %	0 %	50 %	384128209
2569	NC_017161	CA	3	6	124845	124850	50 %	0 %	0 %	50 %	384128209
2570	NC_017161	AGG	2	6	125111	125116	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384128209
2571	NC_017161	CCTT	2	8	125215	125222	0 %	50 %	0 %	50 %	384128209
2572	NC_017161	TC	3	6	125264	125269	0 %	50 %	0 %	50 %	384128209
2573	NC_017161	CTT	2	6	125292	125297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384128209
2574	NC_017161	TGT	2	6	125340	125345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2575	NC_017161	TAT	2	6	125346	125351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2576	NC_017161	TTA	2	6	125395	125400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2577	NC_017161	GAA	2	6	125411	125416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384128210
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2582	NC_017161	AGA	2	6	125936	125941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384128211
2583	NC_017161	TGG	2	6	125954	125959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384128211
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2588	NC_017161	CAG	2	6	126259	126264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384128211
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2591	NC_017161	TA	3	6	126381	126386	50 %	50 %	0 %	0 %	384128211
2592	NC_017161	GAG	2	6	126393	126398	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384128211
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2594	NC_017161	ACC	2	6	126651	126656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384128211
2595	NC_017161	AGT	2	6	126665	126670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384128211
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2599	NC_017161	TGG	2	6	126791	126796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384128211
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2603	NC_017161	TA	3	6	126999	127004	50 %	50 %	0 %	0 %	384128211
2604	NC_017161	GAA	2	6	127064	127069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384128211
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2607	NC_017161	GTA	2	6	127112	127117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384128211
2608	NC_017161	AGA	2	6	127255	127260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384128212
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2611	NC_017161	AAG	2	6	127398	127403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384128213
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2615	NC_017161	CCTT	2	8	127701	127708	0 %	50 %	0 %	50 %	384128213
2616	NC_017161	GAGATA	2	12	127720	127731	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384128213
2617	NC_017161	TCT	2	6	127779	127784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384128213
2618	NC_017161	GGA	2	6	127917	127922	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384128213
2619	NC_017161	A	6	6	127927	127932	100 %	0 %	0 %	0 %	384128213
2620	NC_017161	T	6	6	127955	127960	0 %	100 %	0 %	0 %	384128213
2621	NC_017161	GGA	2	6	127964	127969	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2622	NC_017161	GAAA	2	8	128015	128022	75 %	0 %	25 %	0 %	384128214
2623	NC_017161	GA	3	6	128071	128076	50 %	0 %	50 %	0 %	384128214
2624	NC_017161	TCA	3	9	128150	128158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384128214
2625	NC_017161	GGT	2	6	128170	128175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384128214
2626	NC_017161	TGG	2	6	128237	128242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384128214
2627	NC_017161	TAC	2	6	128245	128250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384128214
2628	NC_017161	TAC	2	6	128293	128298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384128214
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2630	NC_017161	GAT	2	6	128344	128349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384128214
2631	NC_017161	AG	3	6	128399	128404	50 %	0 %	50 %	0 %	384128214
2632	NC_017161	GGGA	2	8	128409	128416	25 %	0 %	75 %	0 %	384128214
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2640	NC_017161	T	6	6	128767	128772	0 %	100 %	0 %	0 %	384128214
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2870	NC_017161	AAAG	2	8	138897	138904	75 %	0 %	25 %	0 %	384128226
2871	NC_017161	A	6	6	138991	138996	100 %	0 %	0 %	0 %	384128227
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2998	NC_017161	TGG	2	6	145118	145123	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384128232
2999	NC_017161	CTTG	2	8	145140	145147	0 %	50 %	25 %	25 %	384128232
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