MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Hydrogenobacter thermophilus TK-6 chromosome

Total Repeats: 35504

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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27002	NC_017161	CCA	2	6	1320760	1320765	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384129501
27003	NC_017161	GCGCAG	2	12	1320771	1320782	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384129501
27004	NC_017161	CAC	2	6	1320854	1320859	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384129501
27005	NC_017161	ACC	2	6	1320951	1320956	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384129501
27006	NC_017161	CT	3	6	1321004	1321009	0 %	50 %	0 %	50 %	384129501
27007	NC_017161	AGGG	2	8	1321060	1321067	25 %	0 %	75 %	0 %	384129501
27008	NC_017161	GC	3	6	1321075	1321080	0 %	0 %	50 %	50 %	384129501
27009	NC_017161	CCA	2	6	1321132	1321137	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384129501
27010	NC_017161	TTTTC	2	10	1321179	1321188	0 %	80 %	0 %	20 %	384129502
27011	NC_017161	TC	3	6	1321200	1321205	0 %	50 %	0 %	50 %	384129502
27012	NC_017161	CTT	2	6	1321221	1321226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384129502
27013	NC_017161	T	6	6	1321293	1321298	0 %	100 %	0 %	0 %	384129502
27014	NC_017161	CAC	2	6	1321402	1321407	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384129502
27015	NC_017161	TA	3	6	1321511	1321516	50 %	50 %	0 %	0 %	384129502
27016	NC_017161	CCT	2	6	1321553	1321558	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27017	NC_017161	A	6	6	1321606	1321611	100 %	0 %	0 %	0 %	384129503
27018	NC_017161	TGA	2	6	1321629	1321634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384129503
27019	NC_017161	ATC	2	6	1321662	1321667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384129503
27020	NC_017161	A	6	6	1321785	1321790	100 %	0 %	0 %	0 %	384129504
27021	NC_017161	CAG	2	6	1321842	1321847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384129504
27022	NC_017161	GATAA	2	10	1321864	1321873	60 %	20 %	20 %	0 %	384129504
27023	NC_017161	CTC	2	6	1321886	1321891	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384129504
27024	NC_017161	AGA	2	6	1321938	1321943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384129504
27025	NC_017161	ACA	2	6	1321979	1321984	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384129504
27026	NC_017161	CAC	2	6	1322004	1322009	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384129504
27027	NC_017161	ATG	2	6	1322048	1322053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384129504
27028	NC_017161	AG	3	6	1322064	1322069	50 %	0 %	50 %	0 %	384129504
27029	NC_017161	CTT	2	6	1322151	1322156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384129504
27030	NC_017161	GGGT	2	8	1322193	1322200	0 %	25 %	75 %	0 %	384129504
27031	NC_017161	G	6	6	1322205	1322210	0 %	0 %	100 %	0 %	384129504
27032	NC_017161	CTG	2	6	1322213	1322218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384129504
27033	NC_017161	AGG	2	6	1322265	1322270	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384129504
27034	NC_017161	CTT	2	6	1322360	1322365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384129504
27035	NC_017161	GGA	2	6	1322400	1322405	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384129504
27036	NC_017161	AAGG	2	8	1322496	1322503	50 %	0 %	50 %	0 %	384129504
27037	NC_017161	T	6	6	1322539	1322544	0 %	100 %	0 %	0 %	384129504
27038	NC_017161	AG	3	6	1322571	1322576	50 %	0 %	50 %	0 %	384129504
27039	NC_017161	GAG	2	6	1322623	1322628	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384129504
27040	NC_017161	TAT	2	6	1322665	1322670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384129504
27041	NC_017161	AGA	2	6	1322809	1322814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384129504
27042	NC_017161	TTA	2	6	1322847	1322852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384129504
27043	NC_017161	TTA	2	6	1322859	1322864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384129504
27044	NC_017161	A	6	6	1322978	1322983	100 %	0 %	0 %	0 %	384129504
27045	NC_017161	GCCA	2	8	1323048	1323055	25 %	0 %	25 %	50 %	384129504
27046	NC_017161	GCTTT	2	10	1323071	1323080	0 %	60 %	20 %	20 %	384129504
27047	NC_017161	TGA	2	6	1323120	1323125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384129504
27048	NC_017161	TCA	2	6	1323226	1323231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384129505
27049	NC_017161	CAGT	2	8	1323258	1323265	25 %	25 %	25 %	25 %	384129505
27050	NC_017161	GAT	2	6	1323288	1323293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384129505
27051	NC_017161	TAT	2	6	1323302	1323307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384129505
27052	NC_017161	CTT	2	6	1323312	1323317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384129505
27053	NC_017161	G	7	7	1323349	1323355	0 %	0 %	100 %	0 %	384129505
27054	NC_017161	ATG	2	6	1323364	1323369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384129505
27055	NC_017161	TG	3	6	1323368	1323373	0 %	50 %	50 %	0 %	384129505
27056	NC_017161	AGA	2	6	1323389	1323394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384129505
27057	NC_017161	A	6	6	1323431	1323436	100 %	0 %	0 %	0 %	384129505
27058	NC_017161	TAG	2	6	1323472	1323477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384129505
27059	NC_017161	TGA	2	6	1323494	1323499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384129505
27060	NC_017161	TGG	2	6	1323502	1323507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384129505
27061	NC_017161	TAT	2	6	1323675	1323680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384129505
27062	NC_017161	TGG	2	6	1323700	1323705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384129505
27063	NC_017161	CAT	2	6	1323719	1323724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384129505
27064	NC_017161	GCTCA	2	10	1323855	1323864	20 %	20 %	20 %	40 %	384129505
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27066	NC_017161	AT	3	6	1323951	1323956	50 %	50 %	0 %	0 %	384129505
27067	NC_017161	ATG	2	6	1324054	1324059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384129505
27068	NC_017161	TCA	2	6	1324094	1324099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384129505
27069	NC_017161	GGT	2	6	1324107	1324112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384129505
27070	NC_017161	GA	3	6	1324139	1324144	50 %	0 %	50 %	0 %	384129505
27071	NC_017161	GGA	2	6	1324154	1324159	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384129505
27072	NC_017161	GAA	2	6	1324179	1324184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384129505
27073	NC_017161	GAA	2	6	1324187	1324192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384129505
27074	NC_017161	TAG	2	6	1324243	1324248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384129505
27075	NC_017161	GGT	2	6	1324292	1324297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384129505
27076	NC_017161	ACC	2	6	1324340	1324345	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384129505
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27083	NC_017161	GAG	2	6	1324482	1324487	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384129505
27084	NC_017161	TC	3	6	1324493	1324498	0 %	50 %	0 %	50 %	384129505
27085	NC_017161	GGA	2	6	1324583	1324588	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384129505
27086	NC_017161	AGGA	2	8	1324608	1324615	50 %	0 %	50 %	0 %	384129505
27087	NC_017161	TCA	2	6	1324633	1324638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384129505
27088	NC_017161	GCAG	2	8	1324674	1324681	25 %	0 %	50 %	25 %	384129505
27089	NC_017161	CTT	2	6	1324709	1324714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384129505
27090	NC_017161	AGG	2	6	1324738	1324743	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384129505
27091	NC_017161	GA	3	6	1324762	1324767	50 %	0 %	50 %	0 %	384129505
27092	NC_017161	AG	3	6	1324769	1324774	50 %	0 %	50 %	0 %	384129505
27093	NC_017161	AGG	2	6	1324805	1324810	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384129505
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27096	NC_017161	AGGA	2	8	1324915	1324922	50 %	0 %	50 %	0 %	384129505
27097	NC_017161	GGTG	2	8	1325009	1325016	0 %	25 %	75 %	0 %	384129505
27098	NC_017161	TAA	2	6	1325020	1325025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384129505
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27100	NC_017161	GACCTG	2	12	1325096	1325107	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384129506
27101	NC_017161	AGGA	2	8	1325132	1325139	50 %	0 %	50 %	0 %	384129506
27102	NC_017161	AC	3	6	1325171	1325176	50 %	0 %	0 %	50 %	384129506
27103	NC_017161	GAA	2	6	1325195	1325200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384129506
27104	NC_017161	CTGAT	2	10	1325205	1325214	20 %	40 %	20 %	20 %	384129506
27105	NC_017161	CTT	2	6	1325216	1325221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384129506
27106	NC_017161	ACG	2	6	1325241	1325246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384129506
27107	NC_017161	AGAGT	2	10	1325276	1325285	40 %	20 %	40 %	0 %	384129506
27108	NC_017161	CAT	2	6	1325299	1325304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384129506
27109	NC_017161	GAA	2	6	1325327	1325332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384129506
27110	NC_017161	TC	3	6	1325351	1325356	0 %	50 %	0 %	50 %	384129506
27111	NC_017161	GAT	2	6	1325363	1325368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384129506
27112	NC_017161	CTT	2	6	1325399	1325404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384129506
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27114	NC_017161	A	6	6	1325618	1325623	100 %	0 %	0 %	0 %	384129506
27115	NC_017161	CTT	2	6	1325845	1325850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384129507
27116	NC_017161	GGAA	2	8	1325892	1325899	50 %	0 %	50 %	0 %	384129507
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27118	NC_017161	TCCT	2	8	1325980	1325987	0 %	50 %	0 %	50 %	384129507
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27225	NC_017161	GAGGT	2	10	1331551	1331560	20 %	20 %	60 %	0 %	384129513
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27234	NC_017161	TGT	2	6	1332170	1332175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384129513
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27472	NC_017161	GAAA	2	8	1345409	1345416	75 %	0 %	25 %	0 %	384129526
27473	NC_017161	T	6	6	1345452	1345457	0 %	100 %	0 %	0 %	384129526
27474	NC_017161	CCT	3	9	1345462	1345470	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384129526
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