MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Hydrogenobacter thermophilus TK-6 chromosome

Total Repeats: 35504

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15502	NC_017161	ATGCC	2	10	760777	760786	20 %	20 %	20 %	40 %	384128900
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15504	NC_017161	T	7	7	760946	760952	0 %	100 %	0 %	0 %	384128900
15505	NC_017161	ACCT	2	8	761000	761007	25 %	25 %	0 %	50 %	384128900
15506	NC_017161	GCT	2	6	761010	761015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384128900
15507	NC_017161	T	7	7	761161	761167	0 %	100 %	0 %	0 %	384128900
15508	NC_017161	ACC	2	6	761190	761195	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384128900
15509	NC_017161	GGT	2	6	761214	761219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384128900
15510	NC_017161	GCG	2	6	761226	761231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384128900
15511	NC_017161	CCT	2	6	761254	761259	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384128900
15512	NC_017161	CCT	2	6	761386	761391	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384128900
15513	NC_017161	CTC	3	9	761408	761416	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384128900
15514	NC_017161	CCCA	2	8	761441	761448	25 %	0 %	0 %	75 %	384128900
15515	NC_017161	AAG	2	6	761455	761460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384128900
15516	NC_017161	CTT	2	6	761506	761511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384128900
15517	NC_017161	TACCG	2	10	761522	761531	20 %	20 %	20 %	40 %	384128900
15518	NC_017161	TTG	2	6	761556	761561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384128900
15519	NC_017161	CCA	2	6	761676	761681	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384128900
15520	NC_017161	ATG	2	6	761814	761819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384128900
15521	NC_017161	AT	3	6	761846	761851	50 %	50 %	0 %	0 %	384128900
15522	NC_017161	ACGC	2	8	761859	761866	25 %	0 %	25 %	50 %	384128900
15523	NC_017161	T	6	6	761924	761929	0 %	100 %	0 %	0 %	384128900
15524	NC_017161	TAT	2	6	761942	761947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15525	NC_017161	TCTT	2	8	761954	761961	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15526	NC_017161	GA	3	6	761966	761971	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15527	NC_017161	TTC	2	6	762009	762014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384128901
15528	NC_017161	CT	3	6	762028	762033	0 %	50 %	0 %	50 %	384128901
15529	NC_017161	CCT	2	6	762113	762118	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384128901
15530	NC_017161	CTTC	2	8	762123	762130	0 %	50 %	0 %	50 %	384128901
15531	NC_017161	CTC	2	6	762156	762161	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384128901
15532	NC_017161	TCC	2	6	762181	762186	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384128901
15533	NC_017161	AC	3	6	762216	762221	50 %	0 %	0 %	50 %	384128901
15534	NC_017161	CTA	2	6	762227	762232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384128901
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15536	NC_017161	TAAGA	2	10	762268	762277	60 %	20 %	20 %	0 %	384128901
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15539	NC_017161	TAT	2	6	762363	762368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384128901
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15544	NC_017161	TAG	2	6	762479	762484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384128901
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15550	NC_017161	TC	4	8	762872	762879	0 %	50 %	0 %	50 %	384128901
15551	NC_017161	CCT	2	6	762905	762910	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384128901
15552	NC_017161	CTTT	2	8	762922	762929	0 %	75 %	0 %	25 %	384128901
15553	NC_017161	CT	3	6	763037	763042	0 %	50 %	0 %	50 %	384128901
15554	NC_017161	CAG	2	6	763055	763060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384128901
15555	NC_017161	AG	3	6	763098	763103	50 %	0 %	50 %	0 %	384128901
15556	NC_017161	AAG	2	6	763128	763133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384128901
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15560	NC_017161	CCTG	2	8	763547	763554	0 %	25 %	25 %	50 %	384128902
15561	NC_017161	CTT	2	6	763560	763565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384128902
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15563	NC_017161	CTT	2	6	763749	763754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384128902
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15573	NC_017161	A	7	7	764123	764129	100 %	0 %	0 %	0 %	384128903
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15583	NC_017161	GCAT	2	8	764683	764690	25 %	25 %	25 %	25 %	384128904
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15589	NC_017161	TACC	2	8	764859	764866	25 %	25 %	0 %	50 %	384128904
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15593	NC_017161	ACC	2	6	764986	764991	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384128904
15594	NC_017161	CCA	2	6	765041	765046	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384128904
15595	NC_017161	TA	3	6	765118	765123	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15604	NC_017161	TCT	2	6	765526	765531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384128905
15605	NC_017161	ATCC	2	8	765653	765660	25 %	25 %	0 %	50 %	384128905
15606	NC_017161	CCA	2	6	765669	765674	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384128905
15607	NC_017161	ATA	2	6	765806	765811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384128905
15608	NC_017161	AGA	2	6	765829	765834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384128905
15609	NC_017161	GA	3	6	765847	765852	50 %	0 %	50 %	0 %	384128905
15610	NC_017161	A	6	6	765883	765888	100 %	0 %	0 %	0 %	384128905
15611	NC_017161	TGG	2	6	765891	765896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384128905
15612	NC_017161	ATC	2	6	765920	765925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384128905
15613	NC_017161	GTA	2	6	765932	765937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384128905
15614	NC_017161	A	6	6	765937	765942	100 %	0 %	0 %	0 %	384128905
15615	NC_017161	GGA	2	6	766038	766043	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384128905
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15617	NC_017161	AAGGCA	2	12	766154	766165	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384128905
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15619	NC_017161	AG	3	6	766219	766224	50 %	0 %	50 %	0 %	384128905
15620	NC_017161	CT	3	6	766247	766252	0 %	50 %	0 %	50 %	384128905
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