MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Hydrogenobacter thermophilus TK-6 chromosome

Total Repeats: 35504

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_017161	CATC	2	8	48468	48475	25 %	25 %	0 %	50 %	384128132
1003	NC_017161	CTT	2	6	48478	48483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384128132
1004	NC_017161	ACC	2	6	48494	48499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384128132
1005	NC_017161	TGCG	2	8	48507	48514	0 %	25 %	50 %	25 %	384128132
1006	NC_017161	TCC	2	6	48522	48527	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384128132
1007	NC_017161	CTT	2	6	48552	48557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384128132
1008	NC_017161	AGG	2	6	48585	48590	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384128132
1009	NC_017161	ATC	2	6	48613	48618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384128132
1010	NC_017161	ATG	2	6	48620	48625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384128132
1011	NC_017161	CCTTC	2	10	48668	48677	0 %	40 %	0 %	60 %	384128132
1012	NC_017161	TAT	2	6	48679	48684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384128132
1013	NC_017161	TTA	2	6	48774	48779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384128132
1014	NC_017161	TCC	3	9	48860	48868	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384128132
1015	NC_017161	TCC	2	6	48896	48901	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384128132
1016	NC_017161	TTTC	2	8	48936	48943	0 %	75 %	0 %	25 %	384128132
1017	NC_017161	CTTC	2	8	48960	48967	0 %	50 %	0 %	50 %	384128132
1018	NC_017161	CT	3	6	48992	48997	0 %	50 %	0 %	50 %	384128132
1019	NC_017161	CT	4	8	49003	49010	0 %	50 %	0 %	50 %	384128132
1020	NC_017161	TC	3	6	49015	49020	0 %	50 %	0 %	50 %	384128132
1021	NC_017161	CT	3	6	49072	49077	0 %	50 %	0 %	50 %	384128132
1022	NC_017161	TC	3	6	49099	49104	0 %	50 %	0 %	50 %	384128132
1023	NC_017161	TC	3	6	49184	49189	0 %	50 %	0 %	50 %	384128132
1024	NC_017161	CTTCT	2	10	49190	49199	0 %	60 %	0 %	40 %	384128132
1025	NC_017161	CTT	2	6	49224	49229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384128132
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1030	NC_017161	A	6	6	49462	49467	100 %	0 %	0 %	0 %	384128132
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1033	NC_017161	TGA	2	6	49564	49569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384128133
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1040	NC_017161	CT	3	6	50042	50047	0 %	50 %	0 %	50 %	384128133
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1042	NC_017161	CCT	2	6	50102	50107	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1043	NC_017161	AGG	2	6	50113	50118	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1049	NC_017161	GGCAG	2	10	50275	50284	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1050	NC_017161	CTT	2	6	50411	50416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384128134
1051	NC_017161	CCA	3	9	50530	50538	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384128134
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1060	NC_017161	GAT	2	6	51098	51103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384128134
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1062	NC_017161	GAAG	2	8	51174	51181	50 %	0 %	50 %	0 %	384128134
1063	NC_017161	TGT	2	6	51205	51210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384128134
1064	NC_017161	TCT	2	6	51231	51236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384128134
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1066	NC_017161	TCC	2	6	51351	51356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384128134
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1070	NC_017161	GGA	2	6	51578	51583	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384128134
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1075	NC_017161	TC	3	6	51840	51845	0 %	50 %	0 %	50 %	384128134
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1082	NC_017161	TCT	2	6	52052	52057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384128134
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1084	NC_017161	TCC	2	6	52188	52193	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384128134
1085	NC_017161	ACA	2	6	52266	52271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384128134
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1087	NC_017161	CCCA	2	8	52391	52398	25 %	0 %	0 %	75 %	384128134
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1093	NC_017161	CTT	2	6	52732	52737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384128135
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1099	NC_017161	GGA	2	6	52989	52994	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384128135
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1101	NC_017161	CCA	2	6	53114	53119	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384128135
1102	NC_017161	CAT	2	6	53250	53255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384128135
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1105	NC_017161	TGA	2	6	53427	53432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384128135
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1108	NC_017161	TGA	2	6	53644	53649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384128136
1109	NC_017161	AAG	2	6	53663	53668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384128136
1110	NC_017161	CCA	2	6	53821	53826	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384128136
1111	NC_017161	ATG	2	6	53853	53858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384128136
1112	NC_017161	CTC	2	6	53892	53897	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384128136
1113	NC_017161	CCT	2	6	53960	53965	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384128136
1114	NC_017161	TAT	2	6	53975	53980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384128136
1115	NC_017161	ATA	2	6	53997	54002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384128136
1116	NC_017161	TCA	2	6	54063	54068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384128136
1117	NC_017161	AG	4	8	54117	54124	50 %	0 %	50 %	0 %	384128136
1118	NC_017161	T	6	6	54162	54167	0 %	100 %	0 %	0 %	384128136
1119	NC_017161	CCT	2	6	54201	54206	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384128136
1120	NC_017161	ATA	2	6	54225	54230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384128136
1121	NC_017161	TCA	2	6	54271	54276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384128136
1122	NC_017161	ATTA	2	8	54314	54321	50 %	50 %	0 %	0 %	384128136
1123	NC_017161	CT	3	6	54345	54350	0 %	50 %	0 %	50 %	384128136
1124	NC_017161	CAT	2	6	54368	54373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384128136
1125	NC_017161	TAC	2	6	54393	54398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_017161	GA	3	6	54453	54458	50 %	0 %	50 %	0 %	384128137
1127	NC_017161	TAG	2	6	54459	54464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384128137
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1129	NC_017161	CTA	2	6	54481	54486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384128137
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1254	NC_017161	TGG	2	6	60452	60457	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384128143
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1256	NC_017161	TA	3	6	60670	60675	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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