MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Hydrogenobacter thermophilus TK-6 chromosome

Total Repeats: 35504

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017161	TC	4	8	22460	22467	0 %	50 %	0 %	50 %	384128113
502	NC_017161	AGA	3	9	22619	22627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384128113
503	NC_017161	A	8	8	22678	22685	100 %	0 %	0 %	0 %	384128114
504	NC_017161	GAA	2	6	22723	22728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384128114
505	NC_017161	AAAAG	2	10	22780	22789	80 %	0 %	20 %	0 %	384128114
506	NC_017161	TAC	3	9	22865	22873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384128114
507	NC_017161	CAG	2	6	22910	22915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384128114
508	NC_017161	CTT	2	6	23062	23067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384128114
509	NC_017161	AATG	2	8	23125	23132	50 %	25 %	25 %	0 %	384128114
510	NC_017161	AAG	2	6	23162	23167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384128114
511	NC_017161	GTG	2	6	23300	23305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384128114
512	NC_017161	ACT	2	6	23316	23321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384128114
513	NC_017161	ATC	2	6	23334	23339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384128114
514	NC_017161	AGGA	2	8	23359	23366	50 %	0 %	50 %	0 %	384128114
515	NC_017161	A	6	6	23386	23391	100 %	0 %	0 %	0 %	384128114
516	NC_017161	TACAGA	2	12	23393	23404	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384128114
517	NC_017161	T	6	6	23420	23425	0 %	100 %	0 %	0 %	384128114
518	NC_017161	GGA	2	6	23446	23451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384128114
519	NC_017161	GTG	2	6	23468	23473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384128114
520	NC_017161	AGA	2	6	23483	23488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384128114
521	NC_017161	T	6	6	23516	23521	0 %	100 %	0 %	0 %	384128114
522	NC_017161	CCA	2	6	23705	23710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384128114
523	NC_017161	ACC	2	6	23723	23728	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384128114
524	NC_017161	TTC	2	6	23745	23750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384128114
525	NC_017161	AAG	2	6	23914	23919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384128114
526	NC_017161	TA	3	6	23940	23945	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_017161	TCA	2	6	23992	23997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_017161	TAT	2	6	24007	24012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_017161	GCC	2	6	24047	24052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
530	NC_017161	ATGT	2	8	24137	24144	25 %	50 %	25 %	0 %	384128115
531	NC_017161	AG	3	6	24269	24274	50 %	0 %	50 %	0 %	384128115
532	NC_017161	ACA	2	6	24295	24300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384128115
533	NC_017161	AGC	2	6	24361	24366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384128115
534	NC_017161	A	6	6	24484	24489	100 %	0 %	0 %	0 %	384128115
535	NC_017161	AT	3	6	24506	24511	50 %	50 %	0 %	0 %	384128115
536	NC_017161	AGG	2	6	24720	24725	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384128115
537	NC_017161	AAG	2	6	24808	24813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384128115
538	NC_017161	GAT	2	6	24854	24859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384128115
539	NC_017161	A	6	6	25145	25150	100 %	0 %	0 %	0 %	384128115
540	NC_017161	CTT	2	6	25226	25231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384128115
541	NC_017161	TAC	2	6	25238	25243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384128115
542	NC_017161	GAG	2	6	25289	25294	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384128115
543	NC_017161	GAG	2	6	25298	25303	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384128115
544	NC_017161	AG	3	6	25322	25327	50 %	0 %	50 %	0 %	384128115
545	NC_017161	A	6	6	25343	25348	100 %	0 %	0 %	0 %	384128115
546	NC_017161	CAA	2	6	25450	25455	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384128115
547	NC_017161	AGA	2	6	25528	25533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384128115
548	NC_017161	GAA	2	6	25570	25575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384128115
549	NC_017161	TGG	2	6	25587	25592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384128115
550	NC_017161	ACT	2	6	25698	25703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384128115
551	NC_017161	ACT	2	6	25773	25778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384128115
552	NC_017161	GAA	2	6	25786	25791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384128115
553	NC_017161	AGA	2	6	25810	25815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384128115
554	NC_017161	GA	3	6	25892	25897	50 %	0 %	50 %	0 %	384128115
555	NC_017161	AGA	2	6	25960	25965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384128115
556	NC_017161	CAA	2	6	25993	25998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384128115
557	NC_017161	AGG	2	6	26022	26027	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384128115
558	NC_017161	CTT	2	6	26057	26062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384128115
559	NC_017161	CCTC	2	8	26085	26092	0 %	25 %	0 %	75 %	384128115
560	NC_017161	AGG	2	6	26142	26147	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384128115
561	NC_017161	TAC	2	6	26381	26386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384128115
562	NC_017161	AGA	2	6	26413	26418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384128115
563	NC_017161	AGG	2	6	26440	26445	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384128115
564	NC_017161	CAAG	2	8	26496	26503	50 %	0 %	25 %	25 %	384128116
565	NC_017161	TAA	2	6	26545	26550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384128116
566	NC_017161	AG	3	6	26676	26681	50 %	0 %	50 %	0 %	384128116
567	NC_017161	AGG	2	6	26805	26810	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384128116
568	NC_017161	ACTCTT	2	12	26817	26828	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384128116
569	NC_017161	GTG	2	6	26849	26854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384128116
570	NC_017161	ACT	2	6	26883	26888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384128116
571	NC_017161	GAG	2	6	26966	26971	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384128116
572	NC_017161	CTT	2	6	27037	27042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384128116
573	NC_017161	ATT	2	6	27127	27132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384128116
574	NC_017161	ATAA	2	8	27278	27285	75 %	25 %	0 %	0 %	384128116
575	NC_017161	CT	3	6	27351	27356	0 %	50 %	0 %	50 %	384128116
576	NC_017161	GACT	2	8	27421	27428	25 %	25 %	25 %	25 %	384128116
577	NC_017161	GTA	2	6	27534	27539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
578	NC_017161	AGG	2	6	27543	27548	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
579	NC_017161	TGGA	2	8	27567	27574	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
580	NC_017161	GAA	2	6	27631	27636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384128117
581	NC_017161	TGCC	2	8	27709	27716	0 %	25 %	25 %	50 %	384128117
582	NC_017161	CCA	2	6	27742	27747	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384128117
583	NC_017161	AG	3	6	27770	27775	50 %	0 %	50 %	0 %	384128117
584	NC_017161	AG	3	6	27922	27927	50 %	0 %	50 %	0 %	384128117
585	NC_017161	A	6	6	27993	27998	100 %	0 %	0 %	0 %	384128117
586	NC_017161	GTA	2	6	28052	28057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384128117
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588	NC_017161	AAG	2	6	28112	28117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384128117
589	NC_017161	GGT	2	6	28199	28204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384128117
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591	NC_017161	TGA	2	6	28303	28308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384128117
592	NC_017161	AGT	2	6	28342	28347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384128117
593	NC_017161	AGA	3	9	28389	28397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384128117
594	NC_017161	CT	3	6	28455	28460	0 %	50 %	0 %	50 %	384128117
595	NC_017161	A	6	6	28517	28522	100 %	0 %	0 %	0 %	384128117
596	NC_017161	CTT	2	6	28539	28544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384128117
597	NC_017161	AGG	2	6	28581	28586	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384128117
598	NC_017161	ACC	2	6	28593	28598	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384128117
599	NC_017161	CCA	2	6	28639	28644	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384128117
600	NC_017161	CCT	2	6	28650	28655	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384128117
601	NC_017161	CT	3	6	28717	28722	0 %	50 %	0 %	50 %	384128117
602	NC_017161	CGG	2	6	28727	28732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384128117
603	NC_017161	GAG	2	6	28758	28763	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384128117
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607	NC_017161	TA	3	6	28949	28954	50 %	50 %	0 %	0 %	384128117
608	NC_017161	ATC	2	6	29004	29009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384128117
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611	NC_017161	GTAG	2	8	29127	29134	25 %	25 %	50 %	0 %	384128118
612	NC_017161	GAA	2	6	29176	29181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384128118
613	NC_017161	AAAG	2	8	29230	29237	75 %	0 %	25 %	0 %	384128118
614	NC_017161	CT	4	8	29244	29251	0 %	50 %	0 %	50 %	384128118
615	NC_017161	TGG	2	6	29355	29360	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384128118
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617	NC_017161	ATC	2	6	29501	29506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384128118
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620	NC_017161	AGGT	2	8	29573	29580	25 %	25 %	50 %	0 %	384128118
621	NC_017161	TC	3	6	29607	29612	0 %	50 %	0 %	50 %	384128118
622	NC_017161	CTT	2	6	29614	29619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384128118
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