MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Hydrogenobacter thermophilus TK-6 chromosome

Total Repeats: 35504

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6002	NC_017161	GTG	2	6	292738	292743	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384128369
6003	NC_017161	GGT	2	6	292794	292799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384128369
6004	NC_017161	A	7	7	292826	292832	100 %	0 %	0 %	0 %	384128369
6005	NC_017161	GCAAAA	2	12	292905	292916	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384128369
6006	NC_017161	TAAC	2	8	292952	292959	50 %	25 %	0 %	25 %	384128369
6007	NC_017161	CCG	2	6	293041	293046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384128369
6008	NC_017161	AAGA	2	8	293057	293064	75 %	0 %	25 %	0 %	384128369
6009	NC_017161	A	6	6	293146	293151	100 %	0 %	0 %	0 %	384128369
6010	NC_017161	A	6	6	293169	293174	100 %	0 %	0 %	0 %	384128369
6011	NC_017161	TGCTT	2	10	293180	293189	0 %	60 %	20 %	20 %	384128369
6012	NC_017161	CAA	2	6	293199	293204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384128369
6013	NC_017161	GAAA	2	8	293247	293254	75 %	0 %	25 %	0 %	384128369
6014	NC_017161	TGA	3	9	293394	293402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384128369
6015	NC_017161	CT	3	6	293452	293457	0 %	50 %	0 %	50 %	384128369
6016	NC_017161	AGA	2	6	293478	293483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384128369
6017	NC_017161	AAAAG	2	10	293499	293508	80 %	0 %	20 %	0 %	384128369
6018	NC_017161	A	6	6	293513	293518	100 %	0 %	0 %	0 %	384128369
6019	NC_017161	TAT	2	6	293589	293594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384128369
6020	NC_017161	AG	3	6	293643	293648	50 %	0 %	50 %	0 %	384128369
6021	NC_017161	AGA	2	6	293658	293663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384128369
6022	NC_017161	ATA	2	6	293762	293767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384128369
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6024	NC_017161	GAA	2	6	293800	293805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384128369
6025	NC_017161	CT	3	6	293826	293831	0 %	50 %	0 %	50 %	384128369
6026	NC_017161	GAA	2	6	293881	293886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384128369
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6028	NC_017161	TG	3	6	293964	293969	0 %	50 %	50 %	0 %	384128369
6029	NC_017161	CAA	2	6	293983	293988	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384128369
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6031	NC_017161	TAT	2	6	294100	294105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384128369
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6033	NC_017161	CAA	2	6	294199	294204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384128369
6034	NC_017161	AAAC	2	8	294311	294318	75 %	0 %	0 %	25 %	384128369
6035	NC_017161	AAGC	2	8	294325	294332	50 %	0 %	25 %	25 %	384128369
6036	NC_017161	AAC	2	6	294353	294358	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384128369
6037	NC_017161	GAA	2	6	294397	294402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384128369
6038	NC_017161	AAATA	2	10	294420	294429	80 %	20 %	0 %	0 %	384128369
6039	NC_017161	TGA	2	6	294430	294435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384128369
6040	NC_017161	TGA	2	6	294446	294451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384128370
6041	NC_017161	AGA	3	9	294479	294487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384128370
6042	NC_017161	GAG	2	6	294544	294549	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_017161	TG	3	6	294550	294555	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6044	NC_017161	GAA	2	6	294709	294714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384128371
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6048	NC_017161	TTA	2	6	295021	295026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384128371
6049	NC_017161	ACTG	2	8	295105	295112	25 %	25 %	25 %	25 %	384128371
6050	NC_017161	GAAA	2	8	295134	295141	75 %	0 %	25 %	0 %	384128371
6051	NC_017161	AAT	2	6	295147	295152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384128371
6052	NC_017161	TTG	2	6	295154	295159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384128371
6053	NC_017161	AGA	2	6	295221	295226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384128371
6054	NC_017161	GGA	2	6	295237	295242	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384128371
6055	NC_017161	TAC	2	6	295258	295263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384128371
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6057	NC_017161	GAA	2	6	295333	295338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384128371
6058	NC_017161	ATT	2	6	295374	295379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384128371
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6062	NC_017161	TTA	2	6	295427	295432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384128371
6063	NC_017161	TGA	2	6	295448	295453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384128371
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6065	NC_017161	TCT	2	6	295596	295601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384128371
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6069	NC_017161	TTG	2	6	295691	295696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384128371
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6071	NC_017161	A	6	6	295870	295875	100 %	0 %	0 %	0 %	384128371
6072	NC_017161	GT	3	6	295897	295902	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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6074	NC_017161	A	6	6	295918	295923	100 %	0 %	0 %	0 %	384128372
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6081	NC_017161	AAAT	2	8	296403	296410	75 %	25 %	0 %	0 %	384128373
6082	NC_017161	AAT	2	6	296454	296459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384128373
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6092	NC_017161	A	6	6	297030	297035	100 %	0 %	0 %	0 %	384128374
6093	NC_017161	AAGG	2	8	297077	297084	50 %	0 %	50 %	0 %	384128374
6094	NC_017161	T	6	6	297093	297098	0 %	100 %	0 %	0 %	384128374
6095	NC_017161	ATG	2	6	297117	297122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384128374
6096	NC_017161	GAT	2	6	297135	297140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384128374
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6098	NC_017161	A	6	6	297280	297285	100 %	0 %	0 %	0 %	384128374
6099	NC_017161	TAA	2	6	297352	297357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6100	NC_017161	AGCA	2	8	297404	297411	50 %	0 %	25 %	25 %	384128375
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6104	NC_017161	GAT	2	6	297571	297576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384128375
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6107	NC_017161	A	6	6	297644	297649	100 %	0 %	0 %	0 %	384128375
6108	NC_017161	GCA	2	6	297652	297657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384128375
6109	NC_017161	GGAAG	2	10	297683	297692	40 %	0 %	60 %	0 %	384128375
6110	NC_017161	GAG	3	9	297938	297946	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384128375
6111	NC_017161	TAC	2	6	297959	297964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384128375
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6114	NC_017161	TGG	2	6	298083	298088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384128375
6115	NC_017161	ATAC	2	8	298156	298163	50 %	25 %	0 %	25 %	384128375
6116	NC_017161	GC	3	6	298298	298303	0 %	0 %	50 %	50 %	384128375
6117	NC_017161	AGGCA	2	10	298347	298356	40 %	0 %	40 %	20 %	384128375
6118	NC_017161	CTT	2	6	298388	298393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384128375
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6121	NC_017161	AAG	2	6	298505	298510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384128375
6122	NC_017161	GGT	2	6	298522	298527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384128375
6123	NC_017161	GGA	2	6	298528	298533	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384128375
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6125	NC_017161	TGGA	2	8	298583	298590	25 %	25 %	50 %	0 %	384128375
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6239	NC_017161	TGA	2	6	304027	304032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384128380
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6242	NC_017161	CTG	2	6	304370	304375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384128380
6243	NC_017161	AGA	2	6	304388	304393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384128380
6244	NC_017161	GGTTA	2	10	304395	304404	20 %	40 %	40 %	0 %	384128380
6245	NC_017161	AG	3	6	304510	304515	50 %	0 %	50 %	0 %	384128380
6246	NC_017161	ATG	2	6	304574	304579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384128380
6247	NC_017161	AAAG	2	8	304588	304595	75 %	0 %	25 %	0 %	384128380
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6351	NC_017161	T	7	7	310343	310349	0 %	100 %	0 %	0 %	384128386
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6367	NC_017161	TCT	2	6	310983	310988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384128387
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6498	NC_017161	AGAGTA	2	12	317389	317400	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384128394
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6500	NC_017161	TTC	2	6	317488	317493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384128394

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