MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Hydrogenobacter thermophilus TK-6 chromosome

Total Repeats: 35504

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_017161	GGT	2	6	217997	218002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384128301
4502	NC_017161	AAGCC	2	10	218083	218092	40 %	0 %	20 %	40 %	384128301
4503	NC_017161	C	6	6	218221	218226	0 %	0 %	0 %	100 %	384128301
4504	NC_017161	TC	3	6	218240	218245	0 %	50 %	0 %	50 %	384128301
4505	NC_017161	CTC	2	6	218271	218276	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384128301
4506	NC_017161	AGA	3	9	218304	218312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384128301
4507	NC_017161	AGG	2	6	218355	218360	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384128301
4508	NC_017161	TTC	2	6	218409	218414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384128301
4509	NC_017161	CTACC	2	10	218444	218453	20 %	20 %	0 %	60 %	384128301
4510	NC_017161	CT	3	6	218476	218481	0 %	50 %	0 %	50 %	384128301
4511	NC_017161	TC	3	6	218497	218502	0 %	50 %	0 %	50 %	384128301
4512	NC_017161	CCAC	2	8	218518	218525	25 %	0 %	0 %	75 %	384128301
4513	NC_017161	TCT	2	6	218597	218602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384128301
4514	NC_017161	TCCT	2	8	218714	218721	0 %	50 %	0 %	50 %	384128301
4515	NC_017161	CT	3	6	218735	218740	0 %	50 %	0 %	50 %	384128301
4516	NC_017161	TCT	2	6	218742	218747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384128301
4517	NC_017161	ACC	2	6	218886	218891	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384128302
4518	NC_017161	CA	4	8	218914	218921	50 %	0 %	0 %	50 %	384128302
4519	NC_017161	GTT	2	6	218942	218947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384128302
4520	NC_017161	TGG	2	6	219031	219036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384128302
4521	NC_017161	CA	4	8	219043	219050	50 %	0 %	0 %	50 %	384128302
4522	NC_017161	CCT	2	6	219071	219076	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4523	NC_017161	ATT	2	6	219085	219090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384128303
4524	NC_017161	TCT	3	9	219115	219123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384128303
4525	NC_017161	TGT	2	6	219196	219201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384128303
4526	NC_017161	CTG	2	6	219263	219268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384128303
4527	NC_017161	TCC	2	6	219318	219323	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384128303
4528	NC_017161	CCT	2	6	219348	219353	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384128303
4529	NC_017161	CCT	2	6	219376	219381	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4530	NC_017161	AAG	2	6	219419	219424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4531	NC_017161	GAT	2	6	219429	219434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4532	NC_017161	ATT	3	9	219447	219455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4533	NC_017161	AAG	2	6	219494	219499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4534	NC_017161	ACC	2	6	219540	219545	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4535	NC_017161	T	6	6	219586	219591	0 %	100 %	0 %	0 %	384128304
4536	NC_017161	CGG	2	6	219717	219722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384128304
4537	NC_017161	GA	3	6	219728	219733	50 %	0 %	50 %	0 %	384128304
4538	NC_017161	AG	3	6	219749	219754	50 %	0 %	50 %	0 %	384128304
4539	NC_017161	A	6	6	219790	219795	100 %	0 %	0 %	0 %	384128304
4540	NC_017161	GGT	2	6	219824	219829	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384128304
4541	NC_017161	AG	3	6	219843	219848	50 %	0 %	50 %	0 %	384128304
4542	NC_017161	ATG	2	6	219929	219934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384128304
4543	NC_017161	CTT	2	6	220000	220005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384128304
4544	NC_017161	GATA	2	8	220012	220019	50 %	25 %	25 %	0 %	384128304
4545	NC_017161	CCT	2	6	220022	220027	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384128304
4546	NC_017161	CTC	2	6	220127	220132	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384128305
4547	NC_017161	TTC	2	6	220186	220191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384128305
4548	NC_017161	CCT	2	6	220264	220269	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384128305
4549	NC_017161	TCC	2	6	220293	220298	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384128305
4550	NC_017161	CTTC	2	8	220300	220307	0 %	50 %	0 %	50 %	384128305
4551	NC_017161	TC	3	6	220326	220331	0 %	50 %	0 %	50 %	384128305
4552	NC_017161	CTGC	2	8	220332	220339	0 %	25 %	25 %	50 %	384128305
4553	NC_017161	AG	3	6	220533	220538	50 %	0 %	50 %	0 %	384128305
4554	NC_017161	TGCA	2	8	220607	220614	25 %	25 %	25 %	25 %	384128305
4555	NC_017161	CT	3	6	220655	220660	0 %	50 %	0 %	50 %	384128305
4556	NC_017161	AAT	2	6	220903	220908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384128306
4557	NC_017161	GAG	2	6	220919	220924	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384128306
4558	NC_017161	GAA	2	6	221071	221076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384128306
4559	NC_017161	GTG	3	9	221078	221086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384128306
4560	NC_017161	CATGGG	2	12	221095	221106	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384128306
4561	NC_017161	GAT	2	6	221168	221173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384128306
4562	NC_017161	ACC	2	6	221177	221182	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384128306
4563	NC_017161	AG	3	6	221198	221203	50 %	0 %	50 %	0 %	384128306
4564	NC_017161	CAA	2	6	221260	221265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384128306
4565	NC_017161	A	6	6	221276	221281	100 %	0 %	0 %	0 %	384128306
4566	NC_017161	TAT	2	6	221300	221305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384128306
4567	NC_017161	AGAT	2	8	221328	221335	50 %	25 %	25 %	0 %	384128306
4568	NC_017161	TC	3	6	221448	221453	0 %	50 %	0 %	50 %	384128307
4569	NC_017161	TGA	2	6	221493	221498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384128307
4570	NC_017161	GGA	2	6	221511	221516	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384128307
4571	NC_017161	GAAA	2	8	221542	221549	75 %	0 %	25 %	0 %	384128307
4572	NC_017161	GGA	2	6	221652	221657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384128307
4573	NC_017161	GAAG	2	8	221756	221763	50 %	0 %	50 %	0 %	384128307
4574	NC_017161	A	7	7	221784	221790	100 %	0 %	0 %	0 %	384128307
4575	NC_017161	GAT	2	6	221803	221808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384128307
4576	NC_017161	AG	3	6	221809	221814	50 %	0 %	50 %	0 %	384128307
4577	NC_017161	AG	3	6	221833	221838	50 %	0 %	50 %	0 %	384128307
4578	NC_017161	GAAG	2	8	221842	221849	50 %	0 %	50 %	0 %	384128307
4579	NC_017161	ATC	2	6	221911	221916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384128308
4580	NC_017161	TCT	2	6	222024	222029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384128308
4581	NC_017161	TTC	2	6	222030	222035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384128308
4582	NC_017161	TAT	2	6	222051	222056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384128308
4583	NC_017161	T	7	7	222065	222071	0 %	100 %	0 %	0 %	384128308
4584	NC_017161	TCT	2	6	222077	222082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384128308
4585	NC_017161	T	6	6	222097	222102	0 %	100 %	0 %	0 %	384128308
4586	NC_017161	TCT	2	6	222137	222142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384128308
4587	NC_017161	CAT	2	6	222207	222212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384128308
4588	NC_017161	TGG	2	6	222218	222223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384128308
4589	NC_017161	CTG	2	6	222255	222260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384128308
4590	NC_017161	A	6	6	222326	222331	100 %	0 %	0 %	0 %	384128308
4591	NC_017161	CCT	2	6	222389	222394	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384128308
4592	NC_017161	CCACC	2	10	222407	222416	20 %	0 %	0 %	80 %	384128308
4593	NC_017161	CCAT	2	8	222427	222434	25 %	25 %	0 %	50 %	384128308
4594	NC_017161	CTT	2	6	222497	222502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384128308
4595	NC_017161	ATAA	2	8	222525	222532	75 %	25 %	0 %	0 %	384128308
4596	NC_017161	CTC	2	6	222570	222575	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384128308
4597	NC_017161	CTC	2	6	222582	222587	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384128308
4598	NC_017161	CCTT	2	8	222634	222641	0 %	50 %	0 %	50 %	384128308
4599	NC_017161	TCA	2	6	222688	222693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384128308
4600	NC_017161	CTGGAG	2	12	222732	222743	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384128308
4601	NC_017161	TCT	2	6	222756	222761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384128308
4602	NC_017161	TGG	2	6	222827	222832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384128308
4603	NC_017161	CAC	2	6	222896	222901	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384128308
4604	NC_017161	CAG	2	6	222947	222952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384128308
4605	NC_017161	CTT	2	6	222999	223004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384128308
4606	NC_017161	ACA	2	6	223018	223023	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384128308
4607	NC_017161	TC	3	6	223137	223142	0 %	50 %	0 %	50 %	384128308
4608	NC_017161	ATTA	2	8	223164	223171	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4609	NC_017161	ATA	2	6	223214	223219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384128309
4610	NC_017161	TTC	2	6	223237	223242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384128309
4611	NC_017161	GGT	2	6	223244	223249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384128309
4612	NC_017161	GGT	2	6	223282	223287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384128309
4613	NC_017161	CAG	2	6	223307	223312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384128309
4614	NC_017161	TCC	2	6	223334	223339	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384128309
4615	NC_017161	TA	3	6	223404	223409	50 %	50 %	0 %	0 %	384128309
4616	NC_017161	TCCCG	2	10	223417	223426	0 %	20 %	20 %	60 %	384128309
4617	NC_017161	AGA	2	6	223482	223487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384128309
4618	NC_017161	TTC	2	6	223502	223507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384128309
4619	NC_017161	AT	3	6	223521	223526	50 %	50 %	0 %	0 %	384128309
4620	NC_017161	CATATA	2	12	223542	223553	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384128309
4621	NC_017161	TC	3	6	223568	223573	0 %	50 %	0 %	50 %	384128309
4622	NC_017161	ATA	2	6	223684	223689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384128309
4623	NC_017161	TGT	2	6	223706	223711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384128309
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4625	NC_017161	CATC	2	8	223805	223812	25 %	25 %	0 %	50 %	384128309
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4752	NC_017161	CTC	2	6	229751	229756	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384128316
4753	NC_017161	T	6	6	229785	229790	0 %	100 %	0 %	0 %	384128316
4754	NC_017161	TAT	2	6	230003	230008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384128316
4755	NC_017161	CCT	2	6	230009	230014	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384128316
4756	NC_017161	AAG	2	6	230054	230059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384128316
4757	NC_017161	CTT	2	6	230141	230146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384128316
4758	NC_017161	TA	3	6	230157	230162	50 %	50 %	0 %	0 %	384128316
4759	NC_017161	T	6	6	230172	230177	0 %	100 %	0 %	0 %	384128316
4760	NC_017161	TGG	2	6	230243	230248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384128316
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4765	NC_017161	GT	3	6	230428	230433	0 %	50 %	50 %	0 %	384128316
4766	NC_017161	TCCTT	2	10	230455	230464	0 %	60 %	0 %	40 %	384128316
4767	NC_017161	CCA	2	6	230467	230472	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384128316
4768	NC_017161	A	6	6	230510	230515	100 %	0 %	0 %	0 %	384128316
4769	NC_017161	CCT	2	6	230549	230554	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384128316
4770	NC_017161	TGT	2	6	230579	230584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384128316
4771	NC_017161	ATGC	2	8	230600	230607	25 %	25 %	25 %	25 %	384128316
4772	NC_017161	T	6	6	230672	230677	0 %	100 %	0 %	0 %	384128316
4773	NC_017161	CT	3	6	230713	230718	0 %	50 %	0 %	50 %	384128316
4774	NC_017161	TCTTCC	2	12	230730	230741	0 %	50 %	0 %	50 %	384128316
4775	NC_017161	TG	3	6	230754	230759	0 %	50 %	50 %	0 %	384128316
4776	NC_017161	TCC	2	6	230808	230813	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384128316
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4783	NC_017161	AG	5	10	231053	231062	50 %	0 %	50 %	0 %	384128316
4784	NC_017161	CTTT	2	8	231115	231122	0 %	75 %	0 %	25 %	384128316
4785	NC_017161	T	6	6	231154	231159	0 %	100 %	0 %	0 %	384128316
4786	NC_017161	CAA	2	6	231232	231237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384128316
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4788	NC_017161	CTTT	2	8	231353	231360	0 %	75 %	0 %	25 %	384128316
4789	NC_017161	CT	3	6	231462	231467	0 %	50 %	0 %	50 %	384128316
4790	NC_017161	CCT	2	6	231484	231489	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384128316
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4792	NC_017161	CTT	2	6	231523	231528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384128317
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4794	NC_017161	CCCT	2	8	231749	231756	0 %	25 %	0 %	75 %	384128317
4795	NC_017161	CAA	2	6	231783	231788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384128317
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4800	NC_017161	TGG	2	6	232088	232093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384128318
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4811	NC_017161	GTA	2	6	232341	232346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384128318
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4826	NC_017161	CTT	2	6	233180	233185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384128319
4827	NC_017161	TATG	2	8	233204	233211	25 %	50 %	25 %	0 %	384128319
4828	NC_017161	CTTT	2	8	233232	233239	0 %	75 %	0 %	25 %	384128319
4829	NC_017161	T	6	6	233237	233242	0 %	100 %	0 %	0 %	384128319
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4833	NC_017161	GA	3	6	233339	233344	50 %	0 %	50 %	0 %	384128319
4834	NC_017161	TCT	2	6	233361	233366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384128319
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4840	NC_017161	AGA	2	6	233622	233627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384128319
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4842	NC_017161	TAAAG	2	10	233723	233732	60 %	20 %	20 %	0 %	384128320
4843	NC_017161	CTA	2	6	233795	233800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384128320
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4846	NC_017161	CCA	2	6	233888	233893	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384128320
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4848	NC_017161	ATG	2	6	233917	233922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384128320
4849	NC_017161	AGCC	2	8	234059	234066	25 %	0 %	25 %	50 %	384128320
4850	NC_017161	GTC	2	6	234141	234146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384128320
4851	NC_017161	TCC	3	9	234149	234157	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384128320
4852	NC_017161	TA	3	6	234294	234299	50 %	50 %	0 %	0 %	384128320
4853	NC_017161	GCT	3	9	234443	234451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384128320
4854	NC_017161	TTTATG	2	12	234517	234528	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384128320
4855	NC_017161	A	6	6	234561	234566	100 %	0 %	0 %	0 %	384128320
4856	NC_017161	TAT	2	6	234586	234591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4857	NC_017161	TCAC	2	8	234593	234600	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4858	NC_017161	GA	3	6	234686	234691	50 %	0 %	50 %	0 %	384128321
4859	NC_017161	TTG	2	6	234748	234753	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384128321
4860	NC_017161	ACAA	2	8	234802	234809	75 %	0 %	0 %	25 %	384128321
4861	NC_017161	TC	3	6	234824	234829	0 %	50 %	0 %	50 %	384128321
4862	NC_017161	GTT	2	6	234843	234848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384128321
4863	NC_017161	ACT	2	6	234865	234870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384128321
4864	NC_017161	CTT	2	6	235043	235048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384128321
4865	NC_017161	T	6	6	235131	235136	0 %	100 %	0 %	0 %	384128321
4866	NC_017161	TGT	2	6	235157	235162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384128321
4867	NC_017161	TCT	2	6	235303	235308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384128321
4868	NC_017161	GA	3	6	235317	235322	50 %	0 %	50 %	0 %	384128321
4869	NC_017161	GTG	2	6	235386	235391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384128321
4870	NC_017161	GTA	2	6	235423	235428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384128322
4871	NC_017161	ATC	2	6	235430	235435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384128322
4872	NC_017161	TCT	2	6	235483	235488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384128322
4873	NC_017161	TCCTC	2	10	235500	235509	0 %	40 %	0 %	60 %	384128322
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